Mutasi merupakan sumber utama adanya variasi. Mutasi adalah suatu
peristiwa perubahaan kandungan gen maupun struktur kromosom suatu individu, yang dapat menimbulkan variasi dalam populasi. Pada umumnya terdapat dua macam kejadian mutasi yaitu: 1) mutasi titik (point mutation), apabila terjadi perubahan pada urutan basa-basa rantai DNA asal; dan 2) mutasi kromosom, apabila terjadi perubahan pada bentuk kromosom yang menyangkut ratusan bahkan ribuan pasang nukleotida. Mutasi titik, ada dua macam yaitu, mutasi subtitusi terdiri dari dua macam yakni, mutasi transisi, dan mutasi transversi. Kemudia mutasi Addisi terbagi menjadi dua juga yakni mutasi insersi dan mutasi delesi. Mutasi kromosom ada empat macam bentuk yaitu delesi, duplikasi, inversi dan translokasi.