TUGAS BIOLOGI SEL

Nama

: Rizqi Fauzia

NIM

: 142210101091

KELAS : A
1. Gen 1
source 1..1473
mol_type="genomic DNA"
promoter2..7
note="-35 region"
promoter23..30
note="-10 region"
RBS 50..55
note="pot. ribosome binding site"
CDS 61..1383
terminator1417..1459
note="pot. stem-loop structure; pot. Transcription terminator"
1.

tataaaatta ttatgttatt ctaataatgg ggattgaaac ttaactttta ggaggtttct

61.

atgaaaaatt acttatctat tggagtgatt gcactgctgt ttgcattaac atttggaaca

121.

gtcaagtcgg tccaagctat tgctgggtat ggatggctac cagaccgtcc acctatcaat

181.

aacagccagt tagttgttag tatggccggt atcgttgaag gtaccgataa aaaagttttt

241.

ataaattttt ttgaaatcga tctaacatca caacctgctc acggaggaaa gacagagcag

301.

ggcttaagtc caaaatcaaa accatttgct acagataatg gcgcaatgcc acataaactt

361.

gaaaaagctg acttattaaa agctattcaa aaacagctga tcgctaacgt tcacagtaac

421.

gacggctact ttgaggtcat tgattttgca agcgatgcaa ccattactga tcgaaacggc

481.

aaggtctact ttgctgacaa agatggttcg gtaaccttgc cgacccaacc tgtccaagaa

541.

tttttggtta aaggacatgt gcgcgttaga ccatataaag aaaaaccagt acaaaatcaa

601.

gcaaaatctg ttgatgtaga atatactgta cagtttactc ctttaaaccc tgatgacgat

661.

ttcagaccag ggctcaaaga tactaagcta ttgaaaacac tagctatcgg tgacaccatc

721.

acatctcaag aattactagc tcaagcacaa agcattttaa acaaaaccca cccaggctat

781.

acgatttatg aacgtgactc ctcaatcgtc actcatgaca atgacatttt ccgtacgatt

841.

ttaccaatgg atcaagagtt tacttaccat gtcaaaaatc gggaacaagc ttatgagatc

901.

aatcctaaaa caggtattaa agaaaaaacg aacaacactg atctggtctc tgagaaatat

961.

tacgtcctta aacaagggga aaagccgtat gatccctttg atcgcagtca cttgaaactg

1021. ttcaccatca aatacgttga tgtcaacacc aacgaattgc taaaaagcga gcagctctta

1081. acagctagcg aaggtaactt agacttcaga gatttatacg atcctcgtga taaggctaaa

1141. ctactctaca acaatctcga tgcttttgat atcatgaact ataccttaac tggaaaagta

1201. gaggataatc acgataagaa taatcgtgtc gttacagttt atatgggcaa gcgccctaaa
1261. ggggcaaagg gtagctatca tttagcttat gataaagatc tctataccga agaagaacga
1321. aaagcttaca gctacctgcg ttatacaggg acacctatac ctgataaccc taacgacaaa
1381. taaccacgat cttctaaaat gatgagatta actgacaaaa aaagcaagca acatgctatc
1441. aacagttgct tgcttttttc taacctctta gtt
Keterangan :

Merah = promoter
Biru = RBS
Hijau = terminator
Abu- abu = CDS

atg aug = kodon start

taa uaa = kodon stop

Jawaban :
1. Promoter, fungsinya adalah sebagai tempat RNA polymerase menempel dan memulai
transkripsi
CDS, fungsinya adalah sebagai daerah yang akan diterjemahkan
Terminator, fungsinya adalah sebagai tempat pemberhentian pada proses translasi
RBS, fungsinya adalah sebagai tempat menempelnya ribosom
2. ATG AAA AAT TAC TTA AUG AAA AAU UAC UUA
Met Lys Asn Tyr Leu
61.

augaaaaauu acuuaucuau uggagugauu gcacugcugu uugcauuaac auuuggaaca

121.

gucaagucgg uccaagcuau ugcuggguau ggauggcuac cagaccgucc accuaucaau

181.

aacagccagu uaguuguuag uauggccggu aucguugaag guaccgauaa aaaaguuuuu

241.

ataaauuuuu uugaaaucga ucuaacauca caaccugcuc acggaggaaa gacagagcag

301.

ggcuuaaguc caaaaucaaa accauuugcu acagauaaug gcgcaaugcc acauaaacuu

361.

gaaaaagcug acuuauuaaa agcuauucaa aaacagcuga ucgcuaacgu ucacaguaac

421.

gacggcuacu uugaggucau ugauuuugca agcgaugcaa ccauuacuga ucgaaacggc

481.

aaggucuacu uugcugacaa agaugguucg guaaccuugc cgacccaacc uguccaagaa

541.

uuuuugguua aaggacaugu gcgcguuaga ccauauaaag aaaaaccagu acaaaaucaa

601.

gcaaaaucug uugauguaga auauacugua caguuuacuc cuuuaaaccc ugaugacgau

661.

uucagaccag ggcucaaaga uacuaagcua uugaaaacac uagcuaucgg ugacaccauc

721.

acaucucaag aauuacuagc ucaagcacaa agcauuuuaa acaaaaccca cccaggcuau

781.

acgauuuaug aacgugacuc cucaaucguc acucaugaca augacauuuu ccguacgauu

841.

uuaccaaugg aucaagaguu uacuuaccau gucaaaaauc gggaacaagc uuaugagauc

901.

aauccuaaaa cagguauuaa agaaaaaacg aacaacacug aucuggucuc ugagaaauau

961.

uacguccuua aacaagggga aaagccguau gaucccuuug aucgcaguca cuugaaacug

1021. uucaccauca aauacguuga ugucaacacc aacgaauugc uaaaaagcga gcagcucuua

1081. acagcuagcg aagguaacuu agacuucaga gauuuauacg auccucguga uaaggcuaaa
1141. cuacucuaca acaaucucga ugcuuuugau aucaugaacu auaccuuaac uggaaaagua
1201. gaggauaauc acgauaagaa uaaucguguc guuacaguuu auaugggcaa gcgcccugaa

1261. ggggcaaagg guagcuauca uuuagcuuau gauaaagauc ucuauaccga agaagaacga

1321. aaagcuuaca gcuaccugcg uuauacaggg acaccuauac cugauaaccc uaacgacaaa
1381. uaa
3. Da = 439 x 110 = 48290
kDa = 48290 / 1000 = 48.29

2. Gen 2
source 1..1095
/mol_type="genomic DNA"
promoter41..45
/note="-35 region"
promoter63..69
/note="-10 region"
RBS 106..111
/note="pot. ribosome binding site"
CDS 118..918
terminator1017..1049
/note="pot. stem-loop structure"
1.

atcattaaat ataattaatt ttcttttaat atttttttaa ttgaatattt aagattataa

61.

gatatattta aagtgtatct agatactttt tgggaatgtt ggatgaagga gataaaaatg

121.

aataagagtc gatttatttc atgcgtaatt ttgatattcg cacttatact agttcttttt

181.

acacccaacg tattagcaga gagccaacca gaccctacgc cagatgagtt gcacaaagcg

241.

agtaaattca ctggtttgat ggaaaatatg aaagttttat atgatgatca ttatgtatca

301.

gcaactaaag ttaagtctgt agataaattt ttggcacatg atttaattta taacattagt

361.

gataaaaaac tgaaaaatta tgacaaagtg aaaacagagt tattaaatga aggtttagca

421.

aagaagtaca aagatgaagt agttgatgtg tatggatcaa attactatgt aaactgctat

481.

ttttcatcca aagataatgt aggtaaagtt acaggtggca aaacttgtat gtatggagga

541.

ataacaaaac atgaaggaaa ccactttgat aatgggaact tacaaaatgt acttataaga

601.

gtttatgaaa ataaaagaaa cacaatttct tttgaagtgc aaactgataa gaaaagtgta

661.

acagctcaag aactagacat aaaagctagg aattttttaa ttaataaaaa aaatttgtat

721.

gagtttaaca gttcaccata tgaaacagga tatataaaat ttattgaaaa taacggcaat

781.

actttttggt atgatatgat gcctgcacca ggcgataagt ttgaccaatc taaatattta

841.

atgatgtaca acgacaataa aacggttgat tctaaaagtg tgaagataga agtccacctt

901.

acaacaaaga atggataatg ttaatccgat tttgatataa aaagtgaaag tattagatat

961.

atttgaaagg taagtacttc ggtgcttgcc tttttaggat gcatatatat agattaaacc

1021. gcacttctat attaatagaa agtgcggtta tttatacact caatctaaac tataataatt

1081. ggaatcatct tcaaa

Keterangan :

Merah = promoter
Biru = RBS
Hijau = terminator
Abu - abu = CDS

atg aug = kodon start

taa uaa = kodon stop

Jawaban :
1. Promoter, fungsinya adalah sebagai tempat RNA polymerase menempel dan memulai
transkripsi
CDS, fungsinya adalah sebagai daerah yang akan diterjemahkan
Terminator, fungsinya adalah sebagai tempat pemberhentian pada proses translasi
RBS, fungsinya adalah sebagai tempat menempelnya ribosom
2. ATG AAT AAG AGT CGA AUG AAU AAG AGU CGA
Met Asn Lys Ser Arg
aug
aauaagaguc gauuuauuuc augcguaauu uugauauucg cacuuauacu aguucuuuuu
acacccaacg uauuagcaga gagccaacca gacccuacgc cagaugaguu gcacaaagcg
agtaaauuca ctgguuugau ggaaaauaug aaaguuuuau augaugauca uuauguauca
gcaacuaaag uuaagucugu agauaaauuu uuggcacaug auuuaauuua uaacauuagu
gauaaaaaac ugaaaaauua ugacaaagug aaaacagagu uauuaaauga agguuuagca
aagaaguaca aagaugaagu aguugaugug uauggaucaa auuacuaugu aaacugcuau
uuuucaucca aagauaaugu agguaaaguu acagguggca aaacuuguau guauggagga
auaacaaaac augaaggaaa ccacuuugau aaugggaacu uacaaaaugu acuuauaaga
guuuaugaaa auaaaagaaa cacaauuucu uuugaagugc aaacugauaa gaaaagugua
acagcucaag aacuagacau aaaagcuagg aauuuuuuaa uuaauaaaaa aaauuuguau
gaguuuaaca guucaccaua ugaaacagga uauauaaaau uuauugaaaa uaacggcaau
acuuuuuggu augauaugau gccugcacca ggcgauaagu uugaccaauc uaaauauuua
augauguaca acgacaauaa aacgguugau ucuaaaagug ugaagauaga aguccaccuu
acaacaaaga auggauaa
3. Da = 265 x 110 = 29150
kDa = 29150 / 1000 = 29,150

3. Gen 3
source 1..914
/mol_type="genomic DNA"
promoter148..177
/note="-35 and -10 regions"
RBS 340..344
/note="pot. ribosome binding site"
CDS 354..656
terminator668..713
/note="pot. stem-loop structure"
1 cagctggtgg ccgcgggagc gccgccgtcg ccgctggacg tgcccagtga cccgggtctg
61 cccgtgatgc aggggcaggt gcggtgaccc ggacattgca cctggcgtac ccggacacgc
121 tggcaaccag gaagcaaggg ggcgcccttg agtgctagca ctctcatgta tagagtgcta
181 gatggcaatc ggctaacccc tgcgtcggca cccgcgacga cggcgcgagg gcgcggacga
241 atgccgaatc acctggtaat tcggacggtt ccggggcacg ccccggaccg accgccaact
301 ccggtccggg cgagcgtccc gggctctgat ccaaatagtg gagggctcca atcgtggcga
361 aggtgaacat caagccact gaggacaaga ttctcgtgca ggccaacgag gccgagacca
421 cgaccgcgtc cggtctggtc attcctgaca ccgccaagga gaagccgcag gagggcaccg
481 tcgttgccgt cggccctggc cggtgggacg aggacggcga gaagcggatc ccgctggacg
541 ttgcggaggg tgacaccgtc atctacagca agtacggcgg caccgagatc aagtacaacg
601 gcgaggaata cctgatcctg tcggcacgcg acgtgctggc cgtcgtttcc aagtagtaga
661 gcgtgttccg ccccggcgat ccccgtgctc accacgggtg atttccgggg cggcatgcgt
721 tagcggacta gccctgcgta gaggagcctg atgagcaagc tgatcgaata cgacgaaacc
781 gcgcgtcgcg ccatggaggt cggcatggac aagctggccg acaccgtgcg ggtgacgctg
841 gggccgcgcg gccggcatgt ggtgctggcc aaggcgtttg gcggacccac ggttaccaac
901 gacggcgtca cggt

Keterangan :
Merah = promoter
Biru = RBS
Hijau = terminator

tag uag = kodon stop

 Abu - abu = CDS

Jawaban :
1.

Promoter, fungsinya adalah sebagai tempat RNA polymerase menempel dan memulai
transkripsi
CDS, fungsinya adalah sebagai daerah yang akan diterjemahkan
Terminator, fungsinya adalah sebagai tempat pemberhentian pada proses translasi
RBS, fungsinya adalah sebagai tempat menempelnya ribosom

2.

guggcga
aggugaacau caagccacuc gaggacaaga uucucgugca ggccaacgag gccgagacca
cgaccgcguc cggucugguc auuccugaca ccgccaagga gaagccgcag gagggcaccg
ucguugccgu cggcccuggc cggugggacg aggacggcga gaagcggauc ccgcuggacg
uugcggaggg ugacaccguc aucuacagca aguacggcgg caccgagauc aaguacaacg
gcgaggaaua ccugauccug ucggcacgcg acgugcuggc cgucguuucc aaguag

3.

Da = 99 x 110 = 10890
kDa = 10890 : 1000 = 10,890