-merupakan suatu alternatif sebagai katup pelepas untuk memindahkan intermidiet
primer yang tidak dibutuhkan -memegang peranan penting sebagai system pertahanan terhadap virus (bakteri dan fungi), herbivora (molusca, anthropoda dan vertebrata), tanaman lain (melalui allelopati), sebagai atractan bagi binatang membantu polinasi dan penyerbukan, penyimpanan nitrogen, sistem transport nitrogen dan proteksi terhadap sinar UV. -digunakan organisme untuk berinteraksi dengan lingkungannya.
Metabolit yang dihasilkan dari metabolism sekunder digunakan untuk