Secara umum proses yang terlibat dalam BF bekerja dengan mengalirkan air dari
sungai melalui lapisan tanah dengan adanya daya isap pompa dari sumur produksi
yang dibuat tak jauh dari sungai seperti tampak pada gambar di atas. Setelah
melewati sumur produksi, air dipompakan ke pusat pengolahan air. Di sini air
diaerasi guna mengendapkan senyawa besi dan sebagainya yang umum terdapat
dalam air tanah. Kemudian air dialirkan ke kolom sorbsi karbon aktif untuk
menghilangkan sisa partikel, senyawa organik dan mikroorganisme yang mungkin
masih terkandung dalam air. Sorbsi dengan karbon aktif atau proses lainnya
mungkin saja diperlukan untuk menghilangkan organik polutan yang persisten.