TUGAS IV KOMPUTASI KIMIA

REVIEW JOURNAL
Oleh : Maulana Malik Al Ghofiqi (M0315036)

Artikel ini memberikan latar belakang untuk metode perhitungan yang digunakan dalam
kimia kuantum. Ada sejumlah paket perangkat lunak yang tersedia untuk perhitungan struktur
elektronik dan visualisasi molekul, Software yang sering digunakan adalah paket Gaussian
karena dapat dijalankan baik di lingkungan Unix atau MS Windows. Persamaan Schrdinger
adalah landasan dari mekanika kuantum. Persamaan ini menyediakan fungsi gelombang, , yang
menggambarkan perilaku elektron dalam atom dan molekul, serta nilai-nilai eigen, yaitu energi
terkait, E. Perhitungan dengan Gaussian dapat dilakukan untuk tingkat perkiraan energi. Input
untuk perhitungan tersebut memerlukan definisi dasar molekul yang akan ditetapkan, geometri
molekul, biaya, dan multiplisitas. Untuk (non-polimer) dengan berat molekul besar molekul itu
sering digunakan metode semiempirical. Metode semiempirical ini biasanya tidak handal tetapi
dapat menghasilkan hasil yang relevan, bahkan untuk molekul besar,

Perhitungan Ab Initio
Perhitungan Ab Initio adalah salah satu pendekatan yang sangat berguna yang dapat
dibuat untuk molekul adalah pendekatan Born-Oppenheimer. Hal ini menyatakan bahwa,
gerakan elektron dalam molekul jauh lebih cepat dibandingkan dengan inti, posisi inti dapat
diasumsikan tetap. Dari pernyataan tersebut dapat diasumsikan bahwa persamaan Schrdinger
yang digunakan dapat dipisahkan memungkinkan untuk diselesaikan untuk posisi tetap dari inti,
dan energi elektronik dapat dihitung pada berbagai jarak internuclear. Yang paling sederhana dari
ab initio prosedur adalah Hartree-Fock.

Basis Sets
Setiap perhitungan struktur elektronik pada molekul dapat diasumsikan bahwa fungsi
gelombang molekul dapat direpresentasikan sebagai kombinasi linear orbital atom (LCAO).
Fungsi orbital atom dapat diasumsikan solusi dari persamaan Schrdinger untuk atom hidrogen,
yang memiliki exp (-r) ketergantungan, di mana r adalah jarak dari inti. Sebagai contoh adalah :
STO-3G: Ini disebut "minimal basis set", 1s diberikan oleh tiga Gaussians dan 2s, 2px, 2py,
2pz setiap tiga lain.

Perbaikan lebih lanjut dapat ditemukan dengan menggunakan dua 1s fungsi untuk hidrogen (nilai
yang berbeda) dan dua 2s dan dua 2p. fungsi untuk atom baris 2 seperti karbon. Ini dikenal
sebagai split-valensi dasar set, dimana orbital valensi direpresentasikan dengan dua set fungsi
tetapi orbital inti direpresentasikan dengan satu set fungsi, misalnya,

3-21G karbon: 1s kombinasi tiga Gaussians, 2s dan 2p dua Gaussians yang sama; ditambah
2s' dan 2p' sama satu Gaussian.
6-31G karbon: 1s kombinasi enam Gaussians, 2s dan 2p tiga Gaussians yang sama; ditambah
2s' dan 2p' sama satu Gaussian.

Sistem notasi yang digunakan di sini adalah dari bentuk i-jk, di mana i adalah jumlah Gaussians
merepresentasikan masing-masing inti fungsi dasar dan j dan k jumlah Gaussians mewakili split-
valensi fungsi dasar.
Dalam perhitungan struktur elektronik umum sering ditingkatkan dengan menambahkan
fungsi yang sesuai untuk orbital dengan momentum sudut yang lebih tinggi daripada mereka
yang ditempati. Misalnya fungsi p dapat ditambahkan ke hidrogen, fungsi d ke C, N, O, dan
seterusnya, dan fungsi f untuk transisi logam. Ini ditandai dengan menambahkan tanda bintang
pada basis set atau menentukan p, fungsi d, dan seterusnya, misalnya,

6-31G * atau 6-31G (d): Menambahkan d fungsi untuk elemen baris ke-2 (C, N, O, dll).

6-31G ** atau 6-31G (d, p): Menambahkan fungsi d ke elemen baris 2 (C, N, O, dll) dan
fungsi p untuk H

Untuk anion dan atom dengan pasangan elektron bebas mungkin bahwa ada beberapa kerapatan
elektron jauh dari inti. Hal ini dapat ditangani dengan penambahan fungsi difusi. Fungsi-fungsi
ini direpresentasikan dalam spesifikasi basis set oleh tanda + atau ++.
Perhitungan yang melibatkan atom yang lebih berat, misalnya, logam transisi, bisa sangat
memakan waktu karena sejumlah besar elektron Terlibat dan fakta bahwa set dasar yang lebih
besar tidak tersedia untuk atom yang lebih berat. Permasalahan tersebut dapat dikurangi
ukurannya dengan membatasi penuh perhitungan untuk elektron valensi saja.

Metode Korelasi Elektron

Kekurangan utama dari metode HF-SCF adalah bahwa hal itu memperlakukan setiap
elektron sebagai bergerak di bawah pengaruh efek rata-rata semua elektron lainnya. Dalam
pendekatan ini probabilitas untuk menemukan salah satu elektron pada posisi tertentu di ruang
bergantung pada posisi elektron lainnya. Dengan kata lain gerak elektron dikatakan berkorelasi,
dan korelasi elektron menyebabkan elektron menjadi lebih jauh dari seperti yang dijelaskan oleh
pendekatan HF-SCF. korelasi elektron dapat ditangani dalam perhitungan kimia kuantum
menggunakan teori gangguan Moller-Plesset.

MllerPlesset Perturbation Theory

MllerPlesset Perturbation Theory adalah metode dalam mekanika kuantum untuk
solusi dari persamaan Schrdinger. Metode ini digunakan untuk menentukan koreksi energi
korelasi. Dalam prakteknya, adalah kebiasaan untuk menggunakan metode hybrid SCF-DFT di
mana energi pertukaran dihitung dengan metode HF. Hybrid metode SCF-DFT pada umumnya
sangat menarik karena hanya memiliki komputasi yang lebih intensif daripada HF-SCF. Namun
memberikan hasil sebanding dengan data yang diperoleh dengan metode perturbasi MP.

Geometry Optimization
 Dalam setiap perhitungan kimia kuantum langkah pertama membutuhkan optimalisasi
geometri molekul. Kebanyakan hal ini dilakukan pada molekul terisolasi. Sebuah titik awal
dalam optimasi geometri adalah dengan menggunakan data eksperimen. Misalnya geometri
mungkin telah diperoleh dari fase gas gelombang mikro atau Raman data atau dalam keadaan
padat dari difraksi sinar X. Optimasi geometri melibatkan prosedur matematika yang disebut
optimasi nonlinear dari beberapa algoritma telah dikembangkan.
Energi dan fungsi gelombang dihitung untuk menebak awal dari geometri, yang
kemudian dimodifikasi iteratif sampai (i) minimum energi telah diidentifikasi dan (ii) kekuatan
di dalam molekul adalah nol.
Tabel 1 menunjukkan hasil perhitungan HF-SCF pada H 2O dengan berbagai basis set,
memberikan energi dan geometri molekul yang relevan. Arah energi yang lebih rendah seiring
dengan meningkatnya jumlah fungsi dasar, meskipun ganda dasar zeta set (DZ) memberikan
energi lebih rendah dari dasar split-valensi set 6-31G dan 6-311G. Energi diberikan dalam
Hartrees (1 Eh = 4,3597 1018J dan setara dengan 2.625,5 kJ mol1). Geometri molekul dapat
dibandingkan dengan nilai-nilai eksperimental r = 0,958 dan = 104,5 o. Basis set yang kecil
akan menghasilkan panjang ikatan yang terlalu besar, sedangkan basis set yang besar akan
membuat panjang ikatan terlalu pendek. Berbagai macam sudut ikatan diperoleh, yang
cenderung lebih besar dari nilai eksperimental.
Perhitungan yang cocok dengan eksperimen dapat dicapai dengan menggunakan
metode korelasi electron, seperti dalam Tabel 2 dan 3 yang menunjukkan hasil MP2 dan B3-LYP
perhitungan pada H2O. Hasilnya jauh lebih dekat dengan data eksperimen dibandingkan dengan
metode HF-SCF. Pada Gambar 3 kita membandingkan perhitungan energi, jarak ikatan, dan
sudut ikatan untuk H2O menggunakan tiga metode.

Molecular Properties
Sebuah banyak sifat molekul besar dapat diperoleh dengan mudah dari perhitungan kimia
kuantum, misalnya, dipole dan saat multipole, polarisabilitas, energi ionisasi, afinitas elektron,
dan sebagainya. Sifat-sifat lainnya mungkin memerlukan lebih banyak usaha; misalnya,
perhitungan mode getaran melibatkan perhitungan turunan kedua energi sehubungan dengan
pasang koordinat Cartesian atom, yaitu, konstanta gaya.

Pada perhitungan yang saya lakukan, hasil perhitungan HF-SCF pada H2O dengan basis
set 6-311+G* diperoleh energi sebesar -76.03775960 a.u., dengan r sebesar 0.940355 , dan
dengan sebesar 108.1365. Sedangkan dalam artikel, dengan basis set yang sama diperoleh
energi sebesar -76.038, r = 0.940 , dan = 108.1. Energi yang diperoleh dengan dibandingkan
artikel sama. Hal ini berarti perhitungan yang dilakukan sudah valid. Sehingga, metode HF-SCF
dengan basis set 6-311+G* bisa digunakan untuk molekul yang lain.
 Pembahasan

Berdasarkan praktek yang telah dilakukan, hasil perhitungan menggunakan metode HF-
SCF pada H2O dengan basis set 6-311+G* menunjukkan perbandingan yang sama dengan
artikel, yaitu diperoleh energi sebesar -76.03775960 a.u., jarak antara atom O dengan atom H
sebesar 0.940355 Angstrom dan = 108.1365. Hal itu terjadi karena perhitungan tersebut hanya
pada 1 molekul H2O sehingga tidak terjadi interaksi dengan molekul lain seperti terjadinya ikatan
hidrogen. Jadi, kemungkinan besar setiap perhitungan yang dilakukan pada 1 molekul H 2O
adalah sama. Berarti, perhitungan yang dilakukan sudah valid dan metode HF-SCF dengan basis
set 6-311+G* bisa digunakan untuk perhitungan molekul lain.
LAMPIRAN

Filename = D:/komputasi/HF-SCF/air1-d3.log
Title Card Required
File Name = air1-d3
File Type = .log
Calculation Type = FOPT
Calculation Method = RHF
Basis Set = 6-311+G(d)
Charge = 0
Spin = Singlet
E(RHF) = -76.03775960 a.u.
RMS Gradient Norm = 0.00002231 a.u.
Imaginary Freq =
Dipole Moment = 2.3789 Debye
Point Group = C2V
Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 3.3 seconds.

Z-MATRIKS

1 O
0.9403
2 H 1 55
0.9403 108.13
3 H 1 55 2 65