PLASMID DAN EPISOM

Plasmid adalah molekul DNA ekstrasromosom atau "minikromosom" yang dapat

mereplikasi secara independen kromosom seluler utama.
Tiga jenis utama plasmid:
a. Plasmid F  faktor F yang bertanggung jawab untuk transfer DNA selama konjugasi.
b. Plasmid R  molekul DNA yang membawa gen untuk ketahanan terhadap berbagai
antibiotik dan obat-obatan.
c. Col plasmid  plasmid yang menjadi kode protein yang disebut colicins yang
membunuh sel E coli yang sensitif.
Plasmid dapat dibagi menjadi dua kelompok :
a. Plasmid konjugatif  dapat ditranfer DNA melalui konjugasi (F+ dengan F-).
b. Plasmid non konjugatif  tidak dapat ditransmisikan adalah yang tidak memperantai
transfer DNA melalui konjugasi
Episom adalah unsur genetik yang dapat meniru salah satu dari dua keadaan alternatif
yaitu sebagai bagian gabungan dari kromosom inang utama atau sebagai unsur genetik
otonom, terlepas dari kromosom inang utama.
Struktur dan sifat plasmid dan episom diketahui bergantung pada adanya sekuens DNA
pendek yang disebut elemen IS. Elemen IS memperantai rekombinasi antara elemen genetika
nonomologi dimana mereka berada.

TRANSPOSABEL ELEMEN GENETIK

KETIDAKSTABILAN GENETIK DAN PENEMUAN ELEMEN TRANSPOSABEL
Elemen transposabel ditemukan oleh B. Mc-Cklintock melalui analisis ketidakstabilan
genetik pada jagung. Ketidakstabilan melibatkan kerusakan kromosom dan ditemukan terjadi
di tempat elemen transposabel berada. Dalam analisis McClintock, kejadian kerusakan
terdeteksi dengan mengikuti hilangnya beberapa penanda genetik tertentu. Dalam beberapa
percobaan, McClintock menggunakan penanda yang mengendalikan pengendapan pigmentasi
di aleuron.

TRANSPOSABEL ELEMENT PADA BAKTERI

Ketidakstabilan genetik juga ditemukan pada bakteri. Transposon bakteri yang paling
sederhana adalah urutan penyisipan. Ini biasanya berukuran kurang dari 1500 pasang
nukleotida dan hanya mengandung gen yang terlibat dalam mengatur transposisi. Terkadang
dua elemen IS homolog menggabungkan dengan gen lain dari transposon komposit,
dilambangkan dengan simbol Tn. Simbol ini juga digunakan untuk menunjukkan transposon
yang tidak mengandung elemen IS, seperti elemen yang dikenal sebagai Tn3.
ELEMEN IS
Elemen IS diatur secara kompak yang biasanya ada urutan pengkodean tunggal
dengan rangkaian pendek, identik, atau hampir identik pada kedua ujungnya. Urutan terminal
ini selalu berorientasi pada orientasi satu sama lain, sehingga disebut pengulangan terminal
terbalik. Panjangnya berkisar antara 9 sampai 40 pasangan nukleotida. Ketika elemen IS
dimasukkan ke dalam kromosom atau plasmid, mereka membuat duplikasi urutan dna di
lokasi penyisipan. Satu salinan duplikasi terletak di setiap sisi elemen. Pasangan pendek (3-
12 nukleotida-pasang) ini, secara langsung diulang oleh karenanya disebut duplikasi lokasi
sasaran.
TN3 FAMILY
Unsur-unsur dalam kelompok transposon ini memiliki pengulangan terminal terbalik
yaitu 38-40 pasang nukleotida panjang dan menghasilkan duplikasi lokasi sasaran dari 5
pasangan nukleotida pada insersi. Mereka lebih besar dari elemen IS (biasanya 5000
pasangan nukleotida yang panjang, atau lebih panjang) dan biasanya berisi gen aksesori serta
gen yang dibutuhkan untuk transposisi. genetik Tn3 Ada tiga gen, tnpA, trpR, dan bla,
pengkodean, masing-masing, sebuah transposase, resolvase atau represor, dan enzim yang
disebut beta lactamase. beta Lactamase memberikan ketahanan terhadap antibiotik ampisilin,
sedangkan dua protein lainnya memainkan peran penting dalam transposisi. Transposisi Tn3
terjadi dalam dua tahap yaitu Pertama, transposase menengahi perpaduan dua molekul
membentuk struktur yang disebut kointegrasi. Pada tahap kedua transposisi,
resolvase tnpR dikodekan menengahi rekombinasi lokasi tertentu antara dua elemen Tn3 .
Produk gen tnpR juga memiliki fungsi lain, yaitu untuk menekan sintesis protein transposase
dan resolvase.

PENTINGNYA BAKTERI TRANSPOSON DALAM MEDIS

Transposon bakteri secara jelas bertanggung jawab atas transposisi gen yang
mengendalikan resistensi terhadap antibiotik (dan obat lain) dari satu molekul ke molekul
lainnya. Mereka diyakini berperan dalam perkembangan yang cepat dari plasmid R . Semua
plasmid R konjugasi memiliki setidaknya dua komponen, satu segmen membawa satu set gen
yang terlibat dalam transfer DNA konjugasi dan segmen kedua yang membawa gen dan gen
resistensi antibiotik dan atau gen. Segmen yang membawa gen transfer disebut komponen
RTF (resistance transfer factor), segmen yang membawa gen resistensi atau gen disebut
determinan R.
Pada beberapa plasmid R, determinan R diapit oleh elemen IS homolog. Dalam
beberapa kasus, ini hadir dalam orientasi yang sama, dan di lain pihak disisipkan dengan
orientasi yang berlawanan. Dalam kedua kasus tersebut, keduanya dapat memediasi
transposisi R-determinan dari satu plasmid R ke sel lainnya. Beberapa senyawa R plasmid
telah ditandai sebagai membawa dua atau lebih faktor penentu R, masing-masing diapit oleh
elemen IS. Unsur-unsur IS ini hampir pasti bertanggung jawab atas evolusi cepat plasmid
bakteri yang membawa banyak faktor resistensi antibiotik dan obat-obatan.
Transmisibilitas plasmid R, transposabilitas R-determinan, dan evolusi cepat plasmid
R, yang membawa gen untuk ketahanan terhadap keseluruhan antibiotik dan obat-obatan
terlarang, sangat memprihatinkan praktisi medis. Plasmid ini tidak hanya cepat menyebar
dalam spesies bakteri, tetapi juga ditransmisikan melintasi spesies dan bahkan jalur generik.
Sebagai contoh, plasmid E coli R diketahui dipindahkan ke beberapa genera, termasuk
Proteus, Salmonella, Hemophilus, Pasturella, dan Shigella, yang kesemuanya termasuk
spesies patogen. Peningkatan frekuensi bakteri yang membawa plasmid dengan faktor
penentu R, yang berakibat pada resistensi terhadap antibiotik seperti penisilin, tracycline,
streptomisin, dan kanamisin, pada populasi rumah sakit (yang terus terpapar antibiotik ini)
telah didokumentasikan secara luas. Perhatian yang lebih besar lagi adalah hasil penelitian di
Jepang yang menunjukkan bahwa, dalam waktu kurang dari 10 tahun, populasi bakteri alami
(di selokan dan di danau dan sungai yang tercemar) telah berevolusi dari frekuensi yang
sangat rendah (kurang dari persen) plasmid R yang dimediasi resistensi antibiotik terhadap
frekuensi yang relatif tinggi (50-80 persen)
Hasil dari penelitian ini membuatnya sangat jelas bahwa kita harus membatasi
penggunaan antibiotik kita terhadap infeksi bakteri serius dan tidak menggunakannya untuk
setiap infeksi minor yang menyertainya.