CONTOH NEOKLASIK DALAM PERKEMBANGAN YANG DIATUR

EKSPRESI GEN, TRANSKRIP POPULASI GEN YANG BERBEDA

DALAM JENIS SEL YANG BERBEDA

RESUME 1
Untuk Memenuhi Tugas Mata Kuliah Genetika II
yang Dibina oleh Prof. Dr. A.Duran Corebima, M.Pd.

Disusun Oleh:
Kelompok 2/Offering A
Desnaeni Wahyuningtyas (140341606222)
Fiqih Dewi Maharani (140341606456)

UNIVERSITAS NEGERI MALANG

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
JURUSAN BIOLOGI
September 2016
CONTOH NEOKLASIK DALAM PERKEMBANGAN YANG DIATUR
EKSPRESI GEN
Adanya ledakan informasi baru tentang regulasi ekspresi gen pada
eukariot yang telah dihasilkan dari penerapan DNA rekombinan dan teknologi
kloning gen seharusnya tidak menyebabkan kita mengabaikan beberapa studi
neoklasik dalam perkembangan yang diatur oleh gen.

Transkripsi pada kromosom lampbrush pada oosit amfibi

Pada organisme tingkat tinggi, fertilisasi (pembuahan) telur matang oleh
sperma akan memicu peningkatan sintesis protein, yang diikuti dengan
pembelahan sel pada tahap awal embriogenesis. Pada kebanyakan eukariot,
sintesis protein tidak disertai dengan sintesis RNA. Sebagai gantinya, semua
komponen yang diperlukan untuk sintesis protein selama tahap awal
embriogenesis diperoleh dari sel telur sebelum terjadi pembuahan.
Transkrip gen dalam bentuk mRNA dan molekul pre mRNA harus
disimpan di dalam telur dengan keadaan tidak aktif. Translasi dari molekul pre
mRNA ini harus dipicu oleh peristiwa yang terkait dengan fertilisasi/pembuahan.
Oleh karena itu, molekul informasi yang mengarahkan sintesis protein selama
tahap awal pembelahan setelah fertilisasi harus disintesis selama oogenesis.
Studi oogenesis pada vertebrata khususnya amfibi mengungkapkan bahwa
transkripsi ekstensif terjadi selama profase 1 meiosis. Selama tahap ini, disebut
sebagai struktur lampbrush chromosomes. Sebagian besar DNA pada kromosom
lampbrush berwujud sangat kental, transkripsi terjadi pada keadaan tidak aktif
sehingga disebut sebagai daerah aksial kromosom. Segmen tertentu dari DNA di
setiap kromosom lampbrush terwujud dalam loop lateral yang diperpanjang yang
mengandung molekul inti DNA dan diselubungi oleh matriks RNA dan protein
yang baru disintesis.
Kromosom oosit lampbrush menjadi contoh yang baik dari hubungan
antara struktur dan fungsi morfologi lampbrush dengan struktur transkripsi
serangkaian gen tertentu. Transkripsi gen dari kromosom lampbrush ternyata
merupakan produk yang diperlukan dalam tahap embriogenesis. Transkripsi gen
disintesis selama oogenesis harus disimpan dalam “bentuk tidak aktif tapi stabil”
(mungkin dalam kompleks protein RNA) sampai terjadi pembuahan. Selain itu,
transkrip gen tertentu dan produk gen lainnya harus ditempatkan di daerah
tertentu dari sitoplasma sel telur selama oogenesis.
Terbukti dari percobaan yang menunjukkan bahwa nasib sel tertentu
tergantung pada bagian yang menerima sitoplasma sel telur pada tahap
pembelahan awal. Pada amfibi dan vertebrata lain, program genetik
mengendalikan perkembangan awal (hingga tahap blastula) ditetapkan selama
oogenesis. Tahap akhir perkembangan ketika diferensiasi sel dimulai (tahap
gastrula) memerlukan program baru dari ekspresi gen.

Amplifikasi Gen rRNA pada Oosit Amfibi

Meskipun terjadi inisiasi sintesis protein yang cepat, tidak ada rRNA yang
disintesis pada embrio amfibi sampai tahap gastrula. Sejumlah besar rRNA harus
disintesis selama oogenesis, sel telur amfibi berisi sejumlah besar ribosom dengan
1012 per sel telur matang. Pada oosit amfibi, gen rRNA secara selektif diperkuat
sekitar seribu kali lipat untuk memfasilitasi sintesis dari sejumlah besar rRNA
yang disimpan dalam sel telur matang.
Gen rRNA terletak di dalam wilayah nukleolus dari kromosom. Ada
sekitar 500 salinan gen rRNA di masing-masing dua daerah nukleolus dari inti
diploid dari Xenopus laevis. Prekursor rRNA disintesis dan diproses di nukleolus.
Sekitar 1000 gen rRNA per nukleus diploid, telah memperkirakan bahwa perlu
lebih dari 450 tahun untuk mensintesis sejumlah besar molekul rRNA yang ada
pada sel telur matang Xenopus, hampir situasi yang tidak masuk akal mengingat
harapan hidup rata-rata katak. Masalah ini telah diselesaikan dengan evolusi
mekanisme dimana gen rRNA secara selektif direplikasi pada oosit.
Inti oosit dari Xenopus laevis berisi ratusan nukleolus. Masing-masing
berisi molekul circular DNA yang membawa salinan gen rRNA. Sekali terbentuk
molekul DNA ekstrakromosomal ini muncul untuk mengkopi dengan mekanisme
lingkaran bergulir/rolling circle. Replikasi selektif gen rRNA di oosit adalah
contoh paling terkenal dari jenis ini amplifikasi gen tertentu.
TRANSKRIP POPULASI GEN YANG BERBEDA DALAM JENIS SEL
YANG BERBEDA
Pada eukariot tingkat tinggi, hanya sebagian kecil dari genom diwakili
antara molekul mRNA di setiap jenis sel tertentu. Ini telah dibuktikan pada
percobaan saturasi dihibridisasi RNA-DNA. RNA diekstrak dari sel-sel dari jenis
tertentu dan dibiarkan berhibridisasi dengan DNA total nuklir (terdenaturasi).
RNA yang ditambahkan ke reaksi hibridisasi lebih besar (relatif terhadap
konsentrasi DNA) sehingga semua urutan DNA coplementary ke urutan diwakili
dalam populasi RNA akan membentuk DNA-RNA hibrida.
Percobaan hibridisasi RNA-DNA jenuh telah dilakukan pada sejumlah
spesies eukariotik menggunakan RNA dari beberapa jenis sel yang berbeda. Hasil
penelitian ini menunjukkan bahwa kurang dari 10 persen dari DNA dalam
genom diwakili oleh molekul mRNA dalam sitoplasma pada semua jenis
organisme satu sel. Pada tikus, misalnya, dari 2 sampai 5 persen dari urutan
DNA mewakili dalam precent molekul RNA di dalam sel hati. Sel otak
mengandung berbagai maksimum transkrip RNA. Di Xenopus kodok, 8 persen
dari urutan DNA diwakili dalam mRNA dari sel-sel otak.
Set yang berbeda dari gen ditranskripsi dan transkrip primer yang berbeda
diproses dibedakan menjadi mRNA dalam berbagai jenis sel. Biasanya, beberapa
gen yang sama dan beberapa gen yang berbeda ditranskripsi dalam jaringan yang
berbeda. Ini dapat ditunjukkan oleh percobaan RNA-DNA hibridisasi kompetitif.
Dalam percobaan ini, salah satu jumlah ukuran RNA berlabel radioaktif dari satu
jenis sel yang total DNA genom (1) di hadapan dan (2) dengan tidak adanya
kelebihan RNA nonradioactive dari jenis sel yang kedua. Jika dua jenis sel isi
populasi RNA berbeda sekali ("nonoverlapping"), jumlah RNA yang berlabel
sama akan berhibridisasi dengan DNA dengan ada atau tidak adanya RNA
competing. RNA-DNA percobaan hibridisasi kompetitif jenis ini menunjukkan
bahwa urutan RNA hadir dalam populasi RNA diambil dari jaringan yang berbeda
atau jenis sel yang berbeda berbeda dengan dari 10 sampai hampir 100 persen. E.
Devidson dan rekan terdeteksi ada urutan mRNA hadir di kedua oosit dan
blastulae dari xenopus laevis. Hati, limpa, dan ginjal sel tikus mengandung
populasi mRNA diperkirakan berbeda dalam komposisi urutan oleh 15-17 persen.
Meskipun ini relatif mentah diperkirakan, mereka menunjukkan bahwa set yang
berbeda dari gen ditranskripsi dan transkrip yang berbeda diolah menjadi mRNA
di jenis sel yang berbeda.
Karena lebih dari 90 persen dari urutan DNA dalam genom tidak terwakili
di antara populasi mRNA dalam sel yang diberikan, telah dihipotesiskan bahwa
gen eukariotik di kromatin dalam keadaan nonspesifik, dan bahwa regulasi
transkripsi dan / atau pengolahan transkrip occours dengan mekanisme yang
positif melibatkan aktivator gen tertentu. Aktivator ini berfungsi untuk dengan
bagaimana menghidupkan atau "mengaktifkan" transkripsi gen-gen tertentu, atau
set gen, pada waktu yang tepat dalam sel appropriete. Dalam beberapa kasus,
aktivasi diketahui melibatkan cis-acting urutan peraturan yang disebut enhancer.
Evedince menunjukkan bahwa protein nonhistone kromosom tertentu berfungsi
sebagai aktivator spesifik transkripsi dalam beberapa kasus. Bukti lain
menunjukkan bahwa regulasi pengolahan RNA transkrip penting dalam
mengendalikan diferensiasi pada eukariot.
Histone dianggap bertanggung jawab, setidaknya sebagian, untuk represi
nonspesifik gen eukariotik. Histon yang sama biasanya hadir dalam kromatin dari
berbagai jenis sel berbeda, sehingga banyak ilmuwan percaya bahwa histon tidak
fuction respressors atau aktivator transkripsi spesifik. Belum ilmuwan lain
percaya bahwa modifikasi tertentu histon, seperti fosforilasi asam amino, terlibat
dalam regulasi transkripsi.
Pertanyaan :
1. Mengapa oogenesis pada vertebrata khususnya amfibi peristiwa
transkripsi ekstensif terjadi selama profase 1 meiosis?
Jawab:
Karena selama tahap ini kromosom menyerupai struktur lampbrush. Sebagian
besar DNA pada kromosom lampbrush berwujud sangat kental, transkripsi
terjadi pada keadaan tidak aktif sehingga disebut sebagai daerah aksial
kromosom. Segmen tertentu dari DNA di setiap kromosom lampbrush
terwujud dalam loop lateral yang diperpanjang yang mengandung molekul inti
DNA dan diselubungi oleh matriks RNA dan protein yang baru disintesis.

2. Bagaimana hasil dari percobaan hibridisasi RNA-DNA jenuh?

Jawab:
Hasil penelitian menunjukkan bahwa kurang dari 10% dari DNA dalam genom
diwakili oleh molekul mRNA dalam sitoplasma pada semua jenis organisme
satu sel.