MATERI GENETIK DAN EKSPRESI GENETIK :

STRUKTUR DNA, KOMPONEN DNA, TRANSKRIPSI DAN TRANSLASI

PAPER
Disusun untuk memenuhi tugas Matakuliah Genetika

OLEH :
NAMA MAHASISWA : MOH. MASNUR
NIM : 2017-05-0007

DOSEN PENGAMPU : DR. IR. PARJANTO, MP

PRODI AGROTEKNOLOGI
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS ISLAM BATIK SURAKARTA
2018
 PENDAHULUAN

Genetika disebut juga ilmu keturunan, berasal dari kata genos (bahasa latin),
artinya suku bangsa-bangsa atau asal-usul. Secara “Etimologi” kata genetika berasal
dari kata genos dalam bahasa latin, yang berarti asal mula kejadian. Namun, genetika
bukanlah ilmu tentang asal mula kejadian meskipun pada batas-batas tertentu memang
ada kaitannya dengan hal itu juga. Genetika adalah ilmu yang mempelajari seluk beluk
alih informasi hayati dari generasi ke generasi. Oleh karena cara berlangsungnya alih
informasi hayati tersebut mendasari adanya perbedaan dan persamaan sifat diantara
individu organisme, maka dengan singkat dapat pula dikatakan bahwa genetika adalah
ilmu tentang pewarisan sifat. Dalam ilmu ini dipelajari bagaimana sifat keturunan
(hereditas) itu diwariskan kepada anak cucu, serta variasi yang mungkin timbul
didalamnya.
Genetika adalah ilmu yang mempelajari sifat keturunan. Keturunan adalah
proses biologis dimana orang tua atau induk mewariskan gen kepada anaknya atau
keturunannya. Genetika adalah cabang biologi yang mempelajari pewarisan sifat pada
organisme maupun sub-organisme (seperti virus dan prion). Secara singkat dapat juga
dikatakan bahwa genetika adalah ilmu tentang gen dan segala aspeknya. Dalam
biologi, ilmu genetika mempelajari gen, pewarisan sifat, dan keanekaragaman
organisme hidup. Genetika dapat diaplikasikan dalam berbagai studi tentang
kehidupan seperti bacteria, plantae, animalia, dan manusia.
Genetika perlu dipelajari, agar kita dapat mengetahui sifat-sifat keturunan kita
sendiri serta setiap makhuk hidup yang berada dilingkungan kita. kita sebagai manusia
tidak hidup autonom dan terinsolir dari makhuk lain sekitar kita tapi kita menjalin
ekosistem dengan mereka. karena itu selain kita harus mengetahui sifat-sifat menurun
dalam tubuh kita, juga pada tumbuhan dan hewan. Lagi pula prinsip-prinsep genetika
itu dapat disebut sama saja bagi seluruh makluk. Karena manusia sulit dipakai sebagai
objek atau bahan percobaan genetis, kita mempelajari hukumhukumnya lewat sifat
menurun yang terkandung dalam tubuh-tumbuhan dan hewan sekitar. Sifat menurun
tersebut terkandung dalam gen yang terdapat dalam DNA.
Dalam kaitannya dengan genetika, DNA yang terdapat dalam kromosom
memiliki peran/ kontribusi yang amat penting. DNA adalah bahan genetik mendasar
yang mengontrol sifat-sifat makhluk hidup, terekspresikan dalam bentuk polipeptida,
meskipun tidak seluruhnya adalah protein (dapat diekspresikan sebagai RNA yang
memiliki reaksi katalitik, seperti SNRPs).
Francis Crick menjelaskan aliran informasi yang dibawa oleh DNA dalam
rangkaian The Central Dogma, yang berbunyi: Aliran informasi DNA dapat diterukan
ke sel-sel maupun individu lainnya dengan replikasi, dapat diekspresikan menjadi
suatu sinyal perantara dalam bentuk RNA, yang kemudian dapat ditranslasikan
menjadi polipeptida, unit pembangun suatu fenotipe dari organisme yang ada.
Kita tahu bahwa setiap sel memiliki satu paket utuh DNA yang merupakan resep
genetik. Semua resep genetik manusia ada di situ, mulai dari resep membuat rambut,
otak, mata, enzim amilase di air liur, membuat jantung, paru-paru hingga selsel kuku
jempol kaki semuanya ada. DNA dalam setiap sel tubuh identik, DNA yang dianalisa
dari alis bulu mata seseorang akan persis sama dengan DNA yang diambil dari
darahnya, dan ini sama dengan DNA pada sel zygote-nya ketika telur sang ibu berhasil
dibuahi sperma sang ayah.
Meskipun resep genetik (DNA) di dalam setiap sel sama/identik (dengan
beberapa pengecualian tentunya), tapi tidak semua bagian resep itu dibaca dan
diterjemahkan secara serabutan. Setiap sel hanya membaca bagian tertentu resep yang
menjadi miliknya saja secara selektif, dan setiap sel tahu kapan resep tersebut
digunakan dan berapa banyak protein yang harus dibuat dari resep tersebut.
Begitu pula ketika sel tunggal zygote berkembang menjadi organisme
multiseluler kompleks yang tersusun atas triliunan sel dengan variasi yang berbeda,
mekanisme kerja mesin genetik dalam sel-sel kita pastilah melibatkan proses yang
memiliki regulasi yang rumit. Inilah yang disebut sebagai ekspresi genetik.
Berdasarkan informasi tersebut, maka pada paper ini akan dibahas mengenai
materi genetika berupa kromosom, gen, asam nukleat (DNA dan RNA), serta
bagaimana gen dapat diekspresikan.
 STRUKTUR MATERI GENETIK
(DNA)
A. Apakah DNA?
Deoxyribonucleic acid (DNA)
merupakan makromolekul berupa
benang sangat panjang yang
terbentuk dari sejumlah besar
deoksiribonukleotida, yang
masingmasing tersusun dari satu
basa, satu gula dan satu gugus fosfat.
Apabila kita ibaratkan suatu tubuh,
maka DNA diibaratkan sebagai otak
yang dapat mengatur segala proses
di dalam tubuh. Di samping itu,
DNA juga mempunyai peran
penting dalam pewarisan sifat. DNA
merupakan suatu senyawa kimia
yang penting pada makhluk hidup.
Tugas utamanya membawa materi
genetik dari suatu generasi ke
generasi berikutnya. DNA juga
merupakan senyawa polinukleotida
yang membawa sifat-sifat keturunan
yang khas pada kromosom. DNA
penting dalam hal hereditas. Paket
semua informasi genetik dan
dibagikan pada generasi berikutnya.
Dasar untuk ini terletak pada
kenyataan bahwa DNA membuat
gen dan gen membuat kromosom.
Manusia memiliki 23 pasang
kromosom – total 46 kromosom.
Dua puluh dua dari pasangan ini,
yang disebut autosom, terlihat sama
pada laki-laki dan perempuan. Ke 23
Pasangan disebut kromosom seks
dan berbeda antara pria dan wanita.
Wanita memiliki dua salinan dari
kromosom X atau XX, sedangkan
pria memiliki satu X dan satu
kromosom Y. Kedua orang tua
memiliki sel reproduksi – sperma di
dalam ayah dan ovum atau telur
pada ibu. Sperma dan telur
mengandung setengah jumlah
kromosom 23 masing-masing.
Ketika telur dan sperma membuahi,
ini menimbulkan sebuah sel yang
memiliki set lengkap. Jadi seseorang
mewarisi setengahnya gen dari
masing-masing orang tua.
Jadi, DNA adalah singkatan
dari Deoxyribonucleic Acid. DNA
adalah perintah genetik, sistematika
keturunan, manual regenerasi, peta
biologis, cetak-biru individu dari
setiap makhluk hidup secara unik.
DNA hanya dapat ditemukan di
dalam nukleus, yaitu di dalam
kromosom,mitokondria, plastida,
dan sentriol. DNA merupakan cetak
biru individu karena DNA memiliki
instruksi genetik yang membentuk
sel-sel dalam organisme. Peran
utama molekul DNA adalah
penyimpanan informasi jangka
panjang.
B. Komponen dan Struktur DNA yaitu ribosa dan deoksiribosa; dan 2
Asam nukleat merupakan salah kelompok basa yaitu purin dan
satu makromolekul yang terdapat di pirimidin. Kelompok purin terdiri
dalam sel. Makromolekul ialah dari adenin (A) dan guanin (G),
molekul besar (berat molekul lebih sedangkan pirimidin terdiri dari
dari 1000) yang disusun oleh sitosin (C), timin (T) dan urasil (U).
molekul-molekul dasar atau subunit DNA dan RNA dibedakan oleh gula
yang lebih kecil. Di dalam sel dan basa yang dikandungnya.
dikenal 4 jenis makromolekul Deoksiribosa dan timin hanya
penting, yaitu : Polinukleotida, dikandung oleh DNA sedangkan
Polipeptida, Polisakarida, dan ribosa dan urasil hanya dikandung
Lemak. Polinukleotida adalah oleh RNA. Gula dengan basa
makromolekul dengan nukelotida membentuk ikatan antara C1 pada
sebagai molekul dasarnya. Asam gula dengan N1 basa purin atau N9
nukleat merupakan senyawa basa pirimidin; dan senyawa yang
polinukleotida, dan terdapat dua dibentuknya disebut nukleosida.
jenis asam nukleat yaitu asam Selanjutnya fosfat membentuk ester
Deoksiribonukelat dan asam dengan nukleosida tersebut melalui
Ribonukleat. Polipeptida pembentukan ikatan pada C5 pada
merupakan rangkaian asam amino, gula. Ester fosfat-5 nukleosida ini
dan polipeptida merupakan rantai disebut nukleotida. Berdasarkan
dasar penyusun molekul protein. kandungan gulanya terdapat 2 jenis
Polisakarida merupakan molekul nukleotida, yaitu ribonukleotida
yang mencakup berbagai senyawa (dikandung oleh RNA) dan
yang dilibatkan dalam reaksi deoksiribonukleotida (dikandung
metabolisme. Sakarida merupakan oleh DNA).
bahan dasar penyusun rantai ini. Dalam keadaan bebas,
Lemak : merupakan rangkaian asam nukleotida-nukleotida berada dalam
lemak. bentuk nukleosidatrifosfat. Juga
Nukleotida merupakan molekul dapat ditemukan dalam bentuk
dasar dari polinukleotida. nukleotida difosfat serta monofosfat.
Nukleotida itu sendiri disusun oleh 3 Nukleotida trifosfat merupakan
komponen utama yaitu: gula, basa, bentuk yang paling stabil. Salah satu
dan fosfor. Terdapat dua jenis gula, contoh nukleotida yang banyak
dikenal ialah ATP, yaitu molekul
yang berperan penting dalam proses
respirasi. Bentuk molekul lainnya
yang merupakan turunan nukleotida
tersebut adalah ADP dan AMP.
Dalam rantai polinukleotida,
nukleotida-nukleotida
digambungkan satu dengan yang
lainnya melalui ikatan fosfodiester
yaitu antar fosfat pada C5 dari suatu
nukelotida dengan C3 dari
nukleotida yang lain. Dengan aturan
seperti ini, maka pada ujung-ujung
rantai polinukleotida akan
ditemukan fosfat pada ujung 5 dan
radikal OH pada ujung 3.
DNA pertama kali ditemukan
oleh F. Miescher (1869) dari sel
spermatozoa dan sel eritrosit
burung, selanjutnya dinamakan
sebagai nuklein. Penemuan lain
dilakukan oleh Fischer (1880), yaitu
tentang adanya zat pirimidin (yang
berupa Sitosin dan Timin) dan dua
purin (Adenin dan Guanin). Setelah
penemuan tersebut, dilengkapi pula
dengan penemuan Levine (1910)
tentang gula 5 karbon ribosa, gula
deoksiribosa, dan asam fosfat dalam
inti. Keberadaan DNA tersebut
sebagian besar di dalam nukleus (inti
sel). Tetapi ada juga yang terdapat
pada mitokondria. Pada tahun 1953,
Frances Crick dan James Watson
menemukan model molekul DNA
sebagai suatu struktur heliks
beruntai ganda, atau yang lebih
dikenal dengan heliks ganda
Watson-Crick.DNA merupakan
makromolekul polinukleotida yang
tersusun atas polimer nukleotida
yang berulang-ulang, tersusun
rangkap, membentuk DNA haliks
ganda dan berpilin ke kanan. Setiap
nukleotida terdiri dari tiga gugus
molekul, yaitu; (1) gula 5 karbon (2-
deoksiribosa), (2) basa nitrogen
yang terdiri golongan purin yaitu
adenin (Adenin = A) dan guanin
(guanini = G), serta golongan
pirimidin, yaitu sitosin (cytosine =
C) dan timin (thymine = T), dan (3)
gugus fosfat. Basa pada molekul
DNA membawa informasi genetik,
sedangkan gula dan gugus fosfat
mempunyai peranan struktural. Gula
dalam deoksiribonukleotida
merupakan deoksiribosa. Awalan
deoksi menunjukkan bahwa gula ini
kekurangan satu atom oksigen yang
ada pada ribosa, senyawa induknya.
Basa nitrogen merupakan derivat
purin dan pirimidin. Purin dalam
DNA adalah adenin (A) dan Guanin
(G), serta pirimidinnya adalah timin
(T) dan sitosin (C). Sebuah
nukleosida terdiri dari basa dan
purin atau pirimidin yang berikatan
dengan gula. Keempat unit nukletida gugus-gugus fosfat. Khususnya 3'-
dalam DNA disebut deoksiadenosin, hidroksil pada bagian gula sebuah
deoksiguanosin, deoksitimidin, dan deoksiribonukleotida disambungkan
deoksitidin. Dalam sebuah pada 5’-hidroksil gula yang
deoksiribonukleosida, N-9 dalam berdekatan melalui jembatan
purin atau N-1 dalam pirimidin fosfodiester. Bagian yang bervariasi
terikat pada C-1 deoksiribosa. pada DNA adalah urutan keempat
Konfigurasi ikatan N-glikosida ini macam basa (A, G, C dan T). Unit-
adalah ikatan β (basanya terletak di unit nukleotida tersebut dinamakan
atas bidang gulanya). Suatu dioksidenilat, deoksiguanilat,
nukleotida merupakan sebuah ester deoksisitidilat, dan deoksitimidilat.
fosfat dari suatu ester fosfat dari Dengan demikian, DNA
suatu nukleosida. Tempat memiliki 3 komponen penyusun
esterifikasi yang paling umum rangkaiannya. Berikut adalah tiga
dalam nukleotida yang terdapat di komponen penyusun rangkaian
alam secara alamiah adalah gugus DNA, yaitu sebagai berikut :
hidroksil C-5 pada gula. Senyawa 1. Gula Pentosa
seperti itu disebut nukleosida 5- Gula deoksiribosa (2-
fosfat atau 5-nukleotida. Misalnya, deoksiribosa) adalah
deoksiadenosin 5’-trifosfat (dATP) monosakarida dengan rumus
merupakan prekursor yang molekul H-(C=O)-(CH2)-
diaktifkan pada sintesis DNA; (CHOH)3-H. Gula ini memiliki
nukleotida itu diaktifkan kalau ada lima karbon dan merupakan gula
dua ikatan fosfoanhidrida dalam unit ribosa yang kehilangan satu atom
trifosfatnya. Bilangan dengan tanda oksigen. Deoksiribosa mengikat
menunjukkan atom pada gula, gugus fosfat dan basa nitrogen
sedangkan bilangan tanpa tanda (sitosin, timin, adenin, atau
menunjukkan bahwa gulanya berupa guanin).
deoksiribosa untuk membedakan 2. Gugus Fosfat
senyawa ini dari ATP gula dalam Fosfat adalah unsur non-organik
bentuk ribosa. Tulang punggung dengan rumus molekul PO43−.
DNA, yang bersifat tetap di Unsur ini berperan sebagai agen
sepanjang molekul, terdiri dari buffer.
deoksiribosa yang berikatan dengan
3. Basa Nitrogen membetuk tiga ikatan
a. Sitosin (cytosine) adalah hidrogen. Dalam gen,
salah satu dari empat basa guanin dilambangkan
nitrogen. Dalam gen, sitosin dengan huruf G.
dilambangkan huruf C. Di DNA berfungsi sebagai
DNA, sitosin berikatan penyimpan informasi genetik. DNA
dengan guanin dan memiliki komposisi N yang
membentuk tiga ikatan berbeda-beda Berdasarkan
hidrogen (pada gambar penelitian Erwin Chargaff dkk
berupa garis titik-titik). (1940) hasilkan 4 hal yang berkaitan
b. Timin (thymine) adalah salah dengan komposisi basa N pada
satu dari empat basa DNA:
nitrogen. Timin juga disebut a. Komposisi basa N DNA
5-metilurasil. Dalam RNA, umumnya bervariasi dari satu
timin digantikan oleh urasil. spesies dengan spesies yang
Pada DNA, timin berikatan lain.
dengan adenin membentuk b. DNA suatu spesimen yang
dua ikatan hidrogen. Dalam diisolasi dari jaringan yang
gen, timin dilambangkan berbeda dari suatu spesies yang
dengan huruf T. sama mempunyai komposisi
c. Adenin (adenine) adalah basa N yang sama.
salah satu dari empat basa c. Komposisi basa N pada DNA
nitrogen. Selain sebagai suatu spesies tidak berubah
salah satu komponen akibat umur organisme, status
penyusun DNA, adenin juga nutrisi atau perubahan
merupakan bagian dari ATP lingkungan.
(adenosin trifosfat) yang d. Semua DNA (tidak tergantung
kaya akan energi. Dalam spesiesnya) mempunyai jumlah
gen, adenin dilambangkan residu adenin (A) yang sama
dengan huruf A. dengan residu timin (A = T),
d. Guanin (guanine) adalah sedang jumlah residu guanin
salah satu dari empat basa akan sama dengan residu sitosin
nitrogen. Pada DNA, guanin (G = C). Jumlah punin sama
berikatan dengan sitosin dan dengan jumlah pinimidin atau A
 + G = T + C (rumusan fosfodiester 5’, 3’ yang berlawanan
Chargaff). (antiparalel) yakni 5’,3’ dan 3’,5’.
DNA dapat membentuk 3
struktur yang berbeda. DNA
mempunyai struktur yang fleksibel
tergantung dari posisi ikatan
fosfodiester yang menghubungkan
gula dan fosfat. Ada tiga struktur
DNA, yaitu:
a. Bentuk A, mempunyai jarak
uliran (koil) 0,23 m per
pasangan basa, tersusun oleh 11
pasang basa, dan arah uliran ke
kanan.
Komponen DNA b. Bentuk B, merupakan struktur
umum DNA, mempunyai jarak
DNA mempunyai struktur jalin uliran 0,34 nm per pasangan
ganda (double helix). Sifat-sifat basa, tersusun oleh 10,5 pasang
spesifik dari basa N pada DNA basa dan arah uliran ke kanan.
menentukan struktur rangkaian c. Bentuk Z, hanya dijumpai pada
DNA. DNA membentuk jalin ganda DNA yang berperan spesifik,
heliks yang berputar ke arah kanan jarak uliran 0,38 nm per
pada porosnya dengan pola yang pasangan basa, tersusun 12
teratur berupa 2 periode uliran pasang basa dan anah ulinan ke
(koil). Periode pertama uliran kiri.
berjarak 0,34 nm, sedangkan uliran Urutan basa N berupa adenin
kedua berjarak 3,6 nm. Adanya pola yang muncul Iebih dari 4 kali pada
uliran tersebut menyebabkan salah satu rantai DNA akan
terbentuknya struktur cekungan menyebabkan struktur yang
besar (major groove) dan cekungan melengkung, misalnya 6 adenin
kecil (minor groove). Dua rangkaian membentuk sudut 18°. Lengkungan
DNA yang membentuk jalin ganda tersebut berfungsi untuk mengikat
tersebut mempunyai arah ikatan protein. Urutan DNA spesifik yang
sering dijumpai adalah urutan
palindrom yakni urutan basa N pada 2. Setiap nukleotida terletak pada
salah satu rantai DNA yang dibaca bidang datar yang tegak lurus
ke arah kanan akan sama dengan seakan-akan membentuk anak
urutan basa N dan rantai DNA yang tangga, sedangkan phospat
lain yang dibaca ke arah kin. Urutan membentuk ibu tangganya.
spesifik tersebut merupakan sasaran 3. Antara 2 rantai polinukleotida
bekerjanya enzim endonuklease dihubungkan oleh ikatan
(enzim yang memotong rantai hidrogen pada masingmasing
DNA). Urutan spesifik lainnya akan pasangan basa nitrogennya.
membentuk berbagai struktur DNA, 4. Basa purin selalu berkaitan
misalnya struktur jepit rambut dengan basa pirimidin, dengan
(hairpin), struktur cruciform atau pasangan yang selalu tetap.
struktur triple helix. Adenin (A) dari kelompok
DNA merupakan suatu polimer purin selalu berpasangan dengan
nukleotida ganda yang berpilin Timin (T) dari kelompok
(double heliks). Setiap nukleotida pirimidin, sedangkan Guanin (G)
terdiri dari 1 gugus phospat, 1 basa selalu berpasangan dengan Sitosin
nitrogen, dan 1 gula pentosa. Gula (S) dari kelompok pirimidin.
pentosa yang menyusun DNA terdiri
dari gula deoksiribosa yang
kekurangan satu molekul oksigen.
Basa nitrogen yang menyusun DNA
terdiri dari purin dan pirimidin.
Purin terdiri dari adenin dan guanin,
sedangkan pirimidin terdiri dari
sitosin dan timin. Nukleotida
merupakan ikatan antara basa
nitrogen dengan gula pentosa.
Menurut Watson dan Crick,
susunan DNA adalah:
1. Setiap DNA terdiri dari 2 rantai
polinukleotida yang berpilin
(double heliks). Struktur DNA
C. Struktur Double Helix DNA menetapkan satu model struktural
Friederich Miescher untuk yang pada dasarnya terbukti benar.
pertama kali memisahkan DNA dari Konfigurasi menyeluruh dari heliks rangkap

inti sel dalam tahun 1896 dan

menamakan zat yang baru
ditemukan itu "nuklein", suatu awal
dari istilah asam nukleat. Walaupun
DNA secara luas dipelajari selama
tahun-tahun berikutnya, namun
peranan biologiknya sebagai
pembawa informasi genetik tetap
DNA. Perhatikan bahwa kedua untaian adalah
tidak jelas hingga selama masa akhir
komplementer dan anti-paralel. Ikatan
tahun 1940-an ketika Averi dan
Hidrogen antara dua basa.
kawan-kawan menunjukkan bahwa
DNA yang dimurnikan dapat Ciri-ciri penting model DNA
memindahkan khasiat keturunan mereka adalah:
dari suatu turunan bakteri ke yang 1. Dua rantai heliks polinukleotida
lain. Pada tahun 1953, penelitian melingkar mengelilingi satu
kristalografik dengan sinar-X oleh sumbu. Kedua rantai memiliki
James Watson dan Francis Crick arah yang berlawanan.
mengungkapkan struktur tiga 2. Basa purin dan pirimidin terdapat
dimensi DNA dan segera di bagian dalam heliks,
menyimpulkan replikasinya. sedangkan unit-unit fosfat dan
Pencapaian yang menakjubkan ini deoksiribosa terdapat di bagian
merupakan salah satu yang paling luar. Bidang-bidang basa tegak
berarti dalam sejarah biologi karena lurus terhadap sumbu heliks.
membuka jalan untuk pemahaman Bidang-bidang gula hampir
tentang fungsi gen pada tingkat tegak lurus terhadap bidang basa.
molekul. Watson & Crick 3. Diameter heliks adalah 20 A.
melakukan analisis gambaran Jarak antara basa yang
difraksi sinar-X serat-serat DNA bersebelahan ialah 3,4 A pada
yang dibuat oleh Rosalind Franklin poros heliks dengan sudut rotasi
dan Maurice Wilkins dan sebesar 36°. dengan demikian,
 putaran heliks berulang setelah
10 residu pada setiap rantai, yaitu
pada interval 3,4 A.
4. Kedua rantai saling berhubungan
melalui ikatan hidrogen antara
pasanganpasangan basa. Adenin
selalu berpasangan dengan timin;
guanin selalu berpasangan
dengan sitosin.
5. Urutan basa sepanjang rantai
polinukleotida tidak dibatasi
dengan cara apapun.
Urutan yang tepat basa-basa itu
mengandung informasi genetik.
Ikatan hidrogen antar dua basa
Aspek yang paling penting pada
DNA heliks ganda adalah pasangan
basa yang spesifik. Watson dan
Crick menyimpulkan bahwa adenin
harus berpasangan dengan timin,
dan guanin dengan sitosisn, karena
faktor-faktor sterik ikatan hidrogen.
Pembatasan sterik ini disebabkan
oleh sifat heliks tulang punggung
gula fosfat yang teratur pada setiap
rantai polinukleotida. lkatan-ikatan
glikosidik antara gula dan. basa yang
berpasangan berjarak kira-kira 10,8
A. Pasangan basa purin-pirimidin
sesuai benar dalam ruangan itu.
Sebaliknya disitu tidak terdapat
cukup ruangan untuk dua purin.
Terdapat ruangan lebih dari cukup
untuk dua pirimidin, tetapi keduanya
akan terlalu jauh terpisah untuk
memberikan ikatan hidrogen.
Karena itu satu anggota pasangan
basa dalam suatu heliks DNA harus
selalu berupa purin dan yang lain
berupa pirimidin, karena faktor-
faktor sterik. Pasangan basa ini lebih
jauh dibatasi oleh kebutuhan
pengikatan hidrogen. Atom-atom
hidrogen dalam basa purin dan
pirimidin mempunyai posisi yang
sudah tertentu. Adenin tidak dapat
berpasangan dengan sitosin karena
akan terdapat dua hidrogen di dekat
salah satu tempat pengikatan dan
tidak ada hidrogen di tempat yang
lainnya. Demikian pula guanin tidak
berpasangan dengan timin.
Sebaliknya adenin membentuk dua
ikatan hidrogen dengan timin,
sedangkan guanin membentuk tiga
ikatan hidrogen dengan sitosin.
Daya tarik antara kedua pasangan
basa paling kuat pada orientasi dan
jarak ikatan hidrogen ini.
Model molekul DNA heliks ganda yang
memperlihatkan tiga pasangan basa.
Perhatikan bahwa arah kedua untai
berlawanan. DNA bentuk B, heliks ganda
klasik Watson-Crick, digambarkan disini.
Dalam bentuk ini, bidang basa-basa
tersebut tegak lurus terhadap sumbu
heliks.
diamati. Arti penemuan ini baru
menjadi nyata pada waktu Watson-
Crick dikemukakan. Baru pada
waktu itu dapat dilihat bahwa
penemuan-penemuan di atas
mencerminkan segi esensial struktur
dan fungsi DNA species pasangan
basa. Struktur DNA heliks ganda
yang diperlihatkan pada Gambar 3.3
adalah DNA bentuk B (B-DNA).
Model heliks ganda segera
menyarankan metode replikasi
DNA. Watson & Crick
mengemukakan hipotesis sebulan
setelah mereka menyajikan model
struktural DNA dalam risalah
sederhana dan mudah dimengerti
sebagai berikut.
“Bila susunan basa yang
sebenarnya pada salah satu rantai
diketahui, dapat dituliskan dengan
tepat susunan basa pada rantai
pasangannya karena pembentukan
pasangan adalah spesifik. Jadi, satu
rantai merupakan komplemen rantai

Skema pasangan basa ini sangat yang lain, dan inilah gambaran yang

didukung oleh hasil kajian terdahulu menunjukkan bagaimana molekul

asam deoksiribonukleat dapat
tentang komposisi basa DNA pada
berbagai species. Pada tahun 1950, melakukan duplikasi.”

Erwin Chargaff menemukan bahwa Bahasan-bahasan terdahulu

rasio adenin terhadap timin dan mengenai duplikasi diri biasanya

guanin terhadap sitosin mendekati mengemukakan konsep cetakan.

1,0 pada semua species yang Baik salah satu cetakan dianggap
menyalin dirinya secara langsung
atau cetakan itu menghasilkan suatu EKSPRESI GENETIK
cetakan "negatif” yang akan menjadi
cetakan untuk menghasilkan A. Pengertian Ekspresi Genetik
"positif' yang asli lagi. Sama sekali Ekspresi genetik merupakan
tidak dijelaskan secara rinci proses dimana informasi yang
bagaimana itu kiranya terjadi dikode di dalam gen diterjemahkan
dipandang dari segi atom dan menjadi urutan asam amino selama
molekul. sintesis protein. Ekspresi Gen juga
Kini kita pelajari model untuk dapat diartikan bagaimana sel
asam deoksiribonukleat, yang pada mengatur untuk memperlihatkan
hakikatnya, merupakan sepasang ciri-ciri mahluk hidup tersebut
cetakan, yang saling komplementer. berdasarkan gen-gen yang di miliki.
Kita bayangkan bahwa sebelum Ekspresi gen ini berkaitan dengan
duplikasi ikatan-ikatan hidrogen sintesis protein, yaitu proses
terputus, dan kedua rantai membuka transkripsi dan translasi. DNA akan
dan berpisah. Kemudian masing- mengkode informasi genetik sesuai
masing rantai berperan sebagai kebutuhannya. Pada prokariotik,
cetakan untuk pembentukan rantai seperti bakteri akan mengekspresi
pasangan yang baru bagi dirinya gen secara selektif. Sebagai contoh
sendiri sehingga akhirnya di dapat terkait dengan ketersedian bahan
dua pasangan rantai, yang makanan di lingkungannya, bakteri
sebelumnya hanya ada satu pasang akan mengaktifkan (switch on) dan
rantai. Selain itu, urutan-urutan menonaktifkan (switch off) gen yang
pasangan basa tersebut akan di mengkode enzim yang berperan
duplikasi secara tepat. dalam mencerna makanan.
Sedangkan pada eukariotik,
mekanisme ekspresi gen dikontrol
oleh sistem yang lebih kompleks.
Ekspresi gen adalah proses
penentuan sifat suatu organism oleh
gen. Suatu sifat yang dimiliki oleh
organisme merupakan hasil
metabolisme yang terjadi di dalam
sel. Proses metabolisme dapat
berlangsung karena adanya enzim Sifat fenotipe makhluk hidup
yang berfungsi sebagai katalisator merupakan sifat hasil ekspresi gen
proses-proses biokimia. Enzim dan yang terlihat. Contoh fenotipe
protein lainnya diterjemahkan dari adalah berbagai keaneragaman
urutan nukleotida yang ada pada anjing yang memiliki jenis bulu,
molekul mRNA, dan molekul ukuran, warna yang berbeda. Pada
mRNA itu sendiri disintesis bayi anjing yang baru dilahirkan,
berdasarkan utas cetakan DNA. Gen tampak anjing memiliki ciri-ciri
tersusun dari molekul DNA, yang sama antara satu dengan yang
sehingga gen menentukan sifat suatu lain, tetapi seiring pertumbuhan dan
organisme. Pada waktu perkembangannya ciri-ciri yang
membicarakan berbagai pengaruh tampak sudah menunjukkan
dari gen-gen tertentu terhadap perbedaannya. Hal inilah yang
fenotipe kerap kali digunakan 2 disebut dengan ekspresi gen.
istilah ialah ekspreipitas dan Anjing-anjing tersebut memiliki
penetrasi. Gen dikatakan kemiripan yang besar pada susunan
mempunyai ekpresipitas variabel DNA nya, tetapi ciri-ciri yang
apabila derajat ekspresi fenotip tampak berbeda ( seiring
berbeda dari satu individu ke pertumbuhannya ) tersebut
individu lainnya. Apabila hadirnya disebabkan adanya ekspresi gen
gen yang memiliki ekspresipitas yang mengaktifkan atau
variabel itu tidak selalu menonaktifkan gen-gen tertentu.
memperlihatkan pengaruh fenotip
yang tidak dapat diketahui, maka B. Mekanisme Ekspresi Genetik
gen tersebut dkatakan memiliki Karena sel berkembang biak
penetrasi tak komplit. Namun faktor menurut proses pembelahan, maka
lingkungan kadang-kadang juga DNA harus membiak dalam bentuk
menimbulkan perubahan fenotip tepat sama dalam tiap sel dari
yang tidak herediter. Keadaan generasi ke generasi. Tambahan
demikian dikenal dengan istilah pula berfungsinya suatu sel individu
fenekopi. Kerap kali akibat fenokopi yang normal diperlukan penggunaan
sulit dibedakan daripada akibat informasi genetik yang terkandung
adanya gen mutan. dalam DNA untuk mengarahkan
biosintesis dari protein enzim.
Kedua hal ini menentukan peranan satuan monomer RNA., atau
bahan genetik dalam sel dan ribo-nukleotida, dengan
menimbulkan dogma pusat genetika menggunakan suatu bagian khas
molekuler. Pendapat ini merupakan yang kecil (gene) dari untaian
garis besar mengenai peranan DNA DNA sebagai model. Molekul
dan RNA pada pewarisan informasi RNA tidak saja menyediakan
genetik dari satu bentuk simpanan cetakan kerja bagi biosintesis
menjadi struktur primer akhir dari protein, tetapi juga bekerja
suatu molekul protein. sebagai pembawa istimewa
Mekanisme ekspresi genetik untuk asam amino serta juga
mengikuti dogma sentral biologi memperlengkapi tempat tautan
molekular, yaitu aliran (transfer) di mana sintesis protein akan
informasi genetik dari urutan berlangsung. Berikut adalah
nukleotida DNA menjadi urutan proses transkripsi:
asam amino protein. Ekspresi a) Berlangsung dalam inti sel.
genetik mencakup dua proses b) Dimulai dengan
pokok, yaitu transkripsi dan membukanya pita "Double
translasi. Helix" oleh enzim DNA
polymerase.
c) Pita DNA yang berfungsi
sebagai pencetakan RNA
disebut pita template atau
sense (kodogen) dan pita
DNA yang tidak
mencetakan RNA disebut
Dogma pusat dari genetika
dengan pita antisense.
molekuler. Anak panah menggambarkan
arah arus informasi genetik. Garis
d) Pita RNA dibentuk
terputus-putus menunjukkan keadaan- sepanjang pita DNA
keadaan khusus yang menyimpang dari pencetak dengan urutan
bagan ini.
basa nitrogennya
komplementer dengan basa
1. Transkripsi
nitrogen yang ada pada pita
Transkripsi menyangkut
cetakan DNA.
perangkaian secara linier satuan-
 e) Pita RNA yang telah selesai tiga basa nitrogen pada
menerima pesan genetik kodon RNAd. Misalnya
dari pita DNA pencetak AUG pada kodon RNAd
segera meninggalkan inti berpasangan dengan UAC
nukleus menuju ke ribosom, pada antikodon RNAt,
tempat sintesis protein sehingga asam amino diikat
dalam sitoplasma. Pita RNA oleh RNAt adalah metionin.
menempatkan diri pada Dengan demikian nama
leher ribosom. asam amino merupakan
f) RNA yang ada dalam terjemahan dari basa-basa
sitoplasma bersiap untuk nitrogen yang ada pada
berperan dalam proses RNAd.
sintesis protein berikutnya. b) Ribosom dengan RNAd
Setiap satu RNA ini, bergerak satu dengan yang
mengikat satu asam amino lainnya.
yang mengandung ATP. c) Sebuah asam amino
ditambahkan pada protein
2. Translasi yang dibentuk.
Translasi meliputi d) Asam amino yang pertama
perangkaian secara linier (metionin) segera lepas dari
monomer-monomer asam RNAt kembali ke
amino, dengan menggunakan sitoplasma untuk
satu jenis khas RNA sebagai mengulang fungsinya
cetakan dan jenis khas RNA lain dengan cara yang sama.
sebagai pembawa dan pengubah RNAt berikutnya datang
asam amino. Ini sesuai dengan untuk berpasangan dengan
proses yang sesungguhnya kodon RNAd berikutnya.
dalam sintesis protein. Berikut e) Proses keseluruhan ini
adalah proses translasi : berkesinambungan sampai
a) RNAd dan RNAt setelah terbentuk polipeptida
sampai di ribosom tertentu yang terdiri dari
selanjutnya tiga basa asam amino dengan urutan
nitrogen pada antikodon basa nitrogen tertentu.
RNAt berpasangan dengan
 DAFTAR PUSTAKA

Brigita; dkk. 2017. Bahan Genetik dan

Ekspresi Gen. (https://www
.scribd.com/document/3488893
22/Bahan-Genetik-danEkspresi-
gen) Diakses 19 Mei 2018 .
Elisa. 2010. Nukleotida dan Asam
Nukleat.(http://elisa.ugm.ac.id/u
ser/archive/download/37964/fd
822b3fd44fa88e0076de4a3142
9643) Diakses 19 Mei 2018.
Hartani. 2013. Sel DNA.
(https://www.academia.edu/735
0185/Makalah_Sel_DNA)
Diakses 19 Mei 2018 .
Raihan. 2012. Komposisi dan Struktur
dari DNA dan RNA.
(https://www.scribd.com/doc/11
4471056/Komposisi-Dan-
StrukturDari-Dna-Dan-Rna )
Diakses 19 Mei 2018 .
Rosana, D. 2014. Struktur dan Fungsi
DNA dan RNA.
(http://staffnew.uny.ac.id/upload
/132058092/pendidikan/modul-
3strukturdan-fungsi-dna-dan-
rna1.pdf) Diakses 19 Mei 2018 .
Sutisna, S. 2016. Materi Genetik dan
Ekspresi Gen.
(https://www.academia.edu/351
75714/MATERI_GENETIK_D
AN_EKSPRESI_GEN) Diakses
19 Mei 2018.