CD bersifat multisistem, merupakan gangguan inflamasi dengan dasar etiologi yang kompleks
yang diyakini melibatkan interaksi genetik, imunologi, dan faktor lingkungan . Telah dinyatakan
bahwa perubahan dalam sistem kekebalan tubuh dan paparan faktor risiko dari lingkungan
adalah pemicu penting timbulnya penyakit ini. Teori yang semakin diterima adalah bahwa CD
merupakan hasil dari penyimpangan respon inflamasi pada mukosa terhadap bakteri usus dalam
berbagai predisposisi genetik. Meskipun organisme spesifik belum secara konsisten diidentifikasi
pada pasien CD, kehadiran bakteri tampaknya menjadi sesuatu yang pasti dalam patogenesis
gangguan ini. Hal ini didukung oleh model murine in vivo dari CD , di mana induksi peradangan
mukosa tergantung pada stimulasi mikroba. Sebagai akibatnya, hasilnya menunjukkan bahwa
peradangan tidak terjadi pada tikus yang dibesarkan di lingkungan yang bebas bakteri.
Meskipun pengamatan serupa telah dilaporkan dalam studi terhadap manusia, peran bakteri
sebagai penyebab dalam penyelidikan ini masih bersifat spekulatif. Perlu dicatat bahwa
mikrobiota di usus sangatlah kompleks dan terdiri dari organisme yang berpotensi dapat
memberi efek pro dan anti - inflamasi. Pergeseran ke arah keadaan peradangan pada CD diyakini
disebabkan oleh perubahan dalam flora usus dan respon mukosa pada host, yang dipengaruhi
familial dan konkordansi kembar di antara pasien yang terkena. Suatu keluarga dengan riwayat
hasil yang positif merupakan faktor risiko independen yang paling penting terhadap
berkembangnya CD hingga saat ini. Baru-baru ini, studi analisis genome-wide telah
mengungkapkan lebih dari 30 lokus yang terkait dengan CD. Kemungkinan signifikansi
polimorfisme genetik yang mengubah kekebalan adaptif dan mutasi yang terkait dengan
pengawasan yang tidak memadai dari bakteri oleh mukosa usus. Efek kumulatif dari
abnormal terhadap antigen usus. Penyimpangan respon inflamasi mukosa yang terjadi adalah
kemungkinan hasil dari disregulasi sistem kekebalan tubuh. Mekanisme imunologi dalam CD
termasuk gangguan dari sistem kekebalan tubuh bawaan, yang mengarah ke lingkungan
proinflamasi berkelanjutan di usus; aktivasi berlebihan dan diferensiasi subset sel-T terhadap
antigen mukosa; dan penyimpangan sekresi dari sitokin. Secara khusus, hadirnya sitokin IFN - γ
memainkan peran kunci dalam menjaga lingkungan inflamasi dalam usus. Temuan tersebut
Terakhir, faktor lingkungan tertentu terlibat dalam patogenesis CD. Hal ini berkaitan dengan
tempat tinggal di daerah perkotaan; faktor-faktor geografis seperti paparan iklim utara; dan
faktor gaya hidup seperti merokok, penggunaan kontrasepsi oral, dan stres psikologis.
Telah dilaporkan terdapat 3,1-14,6 kasus CD per 100.000 orang/tahun di Amerika Utara dan
menunjukkan distribusi usia bimodal, puncak pertama terjadi pada awal masa dewasa dan
puncak kedua pada usia 50 sampai 70 tahun. Lokasi yang paling banyak terlibat pada diagnosis
awal adalah terminal ileum, katup ileocecal, dan sekum. Namun, setiap area saluran gastro-
intestinal dapat terpengaruh, termasuk daerah lain usus kecil dan besar serta saluran pencernaan
bagian atas dan rongga mulut. Gejala klinis CD dapat bervariasi dari pasien ke pasien dan
tergantung terutama pada lokasi dan perilaku lesi, keparahan dan aktivitas penyakit, dan
keterlibatan lokasi ekstraintestinal. Gejala yang paling umum termasuk nyeri pada daerah
periumbilikalis atau area sebelah kanan yang terletak lebih bawah, diare tidak berdarah dari
durasi lebih dari enam bulan, dan penurunan berat badan disertai dengan demam ringan, malaise,
dan kelelahan. Keseluruhan temuan ini diyakini mewakili gejala penyakit, terutama pada anak.
Selain gejala-gejala tersebut, pasien anak mungkin mengalami demam yang tidak diketahui
laboratorium sering tidak spesifik tetapi mungkin menunjukkan bukti malabsorpsi GI (mis:
rendahnya jumlah albumin, kalsium, folat, zat besi, dan sel darah merah), peningkatan
erythrocyte sedimentation rate (ESR), peningkatan jumlah trombosit, anemia, dan peningkatan
reaktan fase akut seperti protein C-reaktif. Sebagaimana kelainan system imun yang khas, CD
CD bersifat kronis, dapat berkurang dan berulang. Bagaimanapun, sifat kronis peradangan pada
akhirnya menjadi predisposisi ditemukannya komplikasi local pada pasien seperti striktur,
fistula, intra – abdominal abses, dan obstruksi usus. Komplikasi ini dapat membahayakan fungsi
usus dalam jangka panjang dan mungkin sewaktu-waktu memerlukan koreksi bedah.
Kambuhnya CD setelah operasi adalah umum dan didukung oleh sejumlah faktor seperti riwayat
masuknya penyakit, pasien berusia muda, penyakit ileokolonik, dan perokok. Terakhir, pada
pasien CD beresiko terjadinya dysplasia atau adenokarsinoma pada usus kecil atau mukosa
kolorektal.