Buku pembandingnya adalah MIKROBIOLOGI KEDOKTERAN EDISI 27.
Metabolisme, dari istilah Yunani metaballein, yang berarti perubahan, berkaitan dengan semua pekerjaan kimia dan fisik sel. Ini adalah istilah yang sangat berguna yang dapat digunakan untuk menunjuk hampir semua proses fisiologis. Meskipun metabolisme memerlukan ribuan reaksi yang berbeda, kebanyakan dari mereka bisa ditempatkan ke dalam salah satu dari dua kategori umum. Dalam kasus katabolisme, molekul yang lebih besar terdegradasi atau rusak menjadi molekul yang lebih kecil, biasanya dengan pelepasan energi. Dalam kasus anabolisme, juga disebut biosintesis, lebih besar molekul dibangun dari yang lebih kecil, yang menghasilkan pembentukan struktur sel. Biasanya didorong oleh energi berasal dari katabolisme. Meskipun mereka memiliki lawan efek, kedua bentuk metabolisme ini terkait erat dan sangat saling melengkapi. Seperti yang akan kita lihat, hasil dari mereka bekerja sama adalah semua metabolisme dikoordinasikan untuk sel untuk menjalankan fungsi kehidupan yang penting (Gambar 8.1). Jurusan fungsi metabolisme dalam sel dan bagian bab itu tutup semuanya tercantum di sini: 1. Enzim berfungsi sebagai katalis untuk aktivitas katabolik dan anabolik. Karena pentingnya mereka di semua bidang mikrobiologi, sisa bagian 8.1 dikhususkan untuk karakteristik enzim. 2. Sel memperoleh energi dari sumber eksternal (di luar sel) seperti nutrisi atau matahari. Ide ini pertama kali dibahas di Bab 7 dan berlanjut di bagian 8.2 dan 8.5. 3. Sel mengekstrak energi dan mentransfernya ke molekul berenergi tinggi, adenosine triphosphate (ATP), senyawa universal untuk mengelola energi. Ini dilakukan oleh beberapa yang berbeda jenis jalur katabolik, tercakup dalam bagian 8.3. 4. Sel menggunakan ATP untuk menggerakkan proses anabolik. Bangunan sederhana blok terikat ke dalam molekul yang lebih besar dan struktur sel, sehingga menciptakan kompleksitas yang lebih besar melalui masukan energi ini. Jalur anabolik tercakup bagian. Enzim: Mengkatalisasi Kimia Reaksi Kehidupan Sel mikroba dapat dilihat sebagai pabrik mikroskopis, lengkap dengan bahan bangunan dasar, sumber energi, dan genetik "Cetak biru" untuk menjalankan jaringan luas reaksi metaboliknya. Tetapi reaksi kimia kehidupan tidak akan pernah berlanjut tanpa kelas khusus protein yang disebut e nzymes. Enzim luar biasa contoh katalis, bahan kimia yang meningkatkan laju bahan kimia reaksi tanpa menjadi bagian dari produk atau dikonsumsi dalam reaksi. Jangan membuat kesalahan dengan berpikir bahwa enzim menciptakan reaksi. Karena energi bebas yang melekat pada molekul, suatu reaksi dapat terjadi secara spontan pada beberapa titik bahkan tanpa suatu enzim tetapi pada tingkat yang sangat lambat. Sebuah studi tentang enzim menunjukkan urease bahwa itu meningkatkan laju kerusakan urea oleh faktor 100 triliun dibandingkan dengan reaksi yang tidak terkatalisis. Karena kebanyakan reaksi metabolik tidak terakumulasi tidak terjadi cukup cepat untuk mempertahankan proses sel, enzim sangat diperlukan untuk hidup. Karakteristik utama lainnya enzim dirangkum dalam tabel 8.1. TABEL 8.1 Daftar Karakteristik Enzim • Sebagian besar terdiri dari protein; mungkin membutuhkan kofaktor • Bertindak sebagai katalis organik untuk mempercepat laju reaksi seluler • Turunkan energi aktivasi yang diperlukan untuk reaksi kimia lanjutkan (Wawasan 8.1) • Aktifkan reaksi metabolik untuk melanjutkan dengan kecepatan yang kompatibel dengan kehidupan • Memiliki karakteristik unik seperti bentuk, kota yang spesifik, dan fungsi • Menyediakan situs aktif untuk molekul target yang disebut substrat • Ukurannya jauh lebih besar dari substratnya • Kaitkan erat dengan substrat tetapi jangan terintegrasi ke dalam produk reaksi • Tidak digunakan atau diubah secara permanen oleh reaksi • Dapat didaur ulang, sehingga berfungsi dalam konsentrasi yang sangat rendah • Sangat dipengaruhi oleh suhu dan pH • Dapat diatur oleh umpan balik dan mekanisme genetik Bagaimana Cara Kerja Enzim? Kami telah mengatakan bahwa enzim mempercepat laju metabolisme reaksi, tetapi bagaimana cara melakukan ini? Selama reaksi kimia, reaktan dikonversi menjadi produk dengan pembentukan ikatan atau kerusakan. Sejumlah energi tertentu diperlukan untuk memulai setiap hal tersebut reaksi, yang membatasi laju. Ini perlawanan terhadap suatu reaksi, yang harus diatasi agar reaksi berlanjut, dapat diukur dan apa adanya disebut energi aktivasi atau energi aktivasi (Wawasan 8.1). Di laboratorium, mengatasi hambatan awal ini dapat terjadi dicapai oleh ? meningkatkan energi panas (pemanasan) untuk meningkatkan molekul kecepatan, ? meningkatkan konsentrasi reaktan untuk meningkatkan laju tabrakan molekuler, atau ? menambahkan katalis. Dalam kebanyakan sistem kehidupan, dua alternatif pertama tidak layak, karena meninggikan suhu berpotensi berbahaya dan lebih tinggi konsentrasi reaktan tidak praktis. Ini hanya menyisakan aksi katalis, dan enzim akan membutuhkan ini dengan efisien dan kuat. sebagai situs fisik di mana molekul reaktan, yang disebut substrat, dapat diposisikan untuk berbagai interaksi. Enzim jauh lebih besar ukurannya daripada substratnya, dan ia menyajikan kantong berbentuk unik yang hanya memiliki substrat tertentu. Meskipun enzim berikatan dengan substrat dan berpartisipasi langsung dalam perubahan substrat, itu tidak menjadi bagian dari produk, tidak digunakan oleh reaksi, dan dapat berfungsi berulang-ulang. Kecepatan enzim, didefinisikan sebagai jumlah molekul substrat yang diubah per enzim per detik, didokumentasikan dengan baik. Kecepatan berkisar dari beberapa juta untuk katalase hingga seribu untuk dehidrogenase laktat. Kunci untuk memahami peran enzim dalam metabolisme adalah strukturnya. Struktur Enzim, Struktur utama dari semua enzim adalah protein (dengan beberapa persepsi - Wawasan 8.2), dan enzim dapat diklasifikasikan sebagai sederhana atau konjugasi. Enzim sederhana terdiri dari protein saja, sedangkan enzim terkonjugasi (Gambar 8.2) mengandung molekul protein dan nonprotein. Enzim terkonjugasi, kadang-kadang disebut sebagai holoenzyme, adalah kombinasi dari protein, sekarang disebut apoenzyme, dan satu atau lebih cofactors (tabel 8.2). Kofaktor adalah molekul organik, yang disebut koenzim, atau unsur anorganik (ion logam) yang diperlukan banyak enzim untuk menjadi fungsional. Dalam beberapa enzim, kofaktor berhubungan secara longgar dengan apoenzim oleh ikatan nonkovalen; di lain, itu dihubungkan oleh ikatan kovalen. Apoenzim: Kota spesifik dan kisaran Situs Apoenzyme Aktif dalam ukuran dari polipeptida kecil dengan sekitar 100 asam amino dan berat molekul 12.000 hingga besar struktur enzim terkonjugasi polipeptida. Semua contoh : memiliki komponen apoenzim (polipeptida atau protein) dan satu atau lebih banyak cofactors. Koenzim Apoenzymes Substrat enzim reaksi. (a)Kapan enzim dan substrat datang bersama-sama, substrat (S) harus tunjukkan posisi dan posisi yang benar sehubungan dengan enzim (E). (B)Ketika kompleks ES adalah terbentuk,memasuki keadaan transisi. Selama ini sementara tapi ketat persatuan interlocking, enzim berpartisipasi langsung dalam melanggar atau membuat obligasi. (C)Setelah reaksi selesai, enzim melepaskan produk. (d)The model induced-fi t mengusulkan hal itu enzim mengakui nya substrat dan sedikit menyesuaikannya sehingga pengikatan terakhir itu seimbang lebih tepat.