Ascorbate oxidase

Ascorbate oxidase adalah enzim multi-tembaga yang mengkatalisasi

oksidasi asam askorbat menjadi asam dehidroaskorbat. Tembaga yang mengandung
enzim biru ini ditemukan pada tanaman cucurbitaceous seperti labu, mentimun, dan
melon. Ini dapat menghilangkan asam askorbat, yang memiliki kekuatan reduksi
tinggi dalam analisis klinis, dan mendeteksi kadar asam askorbat. Fungsi biologis
askorbat oksidase masih belum jelas. Satu saran adalah bahwa enzim berpartisipasi
dalam sistem redoks yang melibatkan asam askorbat. Ini mungkin terlibat dalam
reorganisasi dinding sel. Pada labu, ekspresi oksidase askorbat meningkat dengan
cepat selama pertumbuhan kalus, perkembangan buah-buahan, dan pemanjangan
benih. Ascorbate oxidase hadir pada jaringan tembakau yang muda dan sedang
tumbuh. Ini diinduksi oleh auksin fitohormon yang menunjukkan bahwa ia terlibat
dalam pertumbuhan sel.
Ascorbate oksidase terdiri dari tiga pusat tembaga yang berbeda secara
spektroskopi yang terdiri dari satu tipe I, satu tipe II, dan dua atom tembaga tipe III.
Subunit dari residu 552 masing-masing dibangun dari tiga domain yang disusun
berurutan pada rantai polipeptida dan terkait erat di ruang angkasa. Setiap subunit
terdiri dari empat atom tembaga yang terikat sebagai spesies mononuklear dan
trinuklear, tipe I dan kombinasi tipe II dan tipe III. Atom tembaga tipe 1 memiliki dua
histidin (His), sistein (Cys), dan gugus alkil (R) sebagai ligan untuk atom tembaga
pusat dan terletak di domain tiga. Cluster trinuklear memiliki delapan ligan histidin
yang secara simetris dipasok dari domain satu dan tiga dan dua atom oksigen terikat
sebagai alkohol (OH) atau sebagai diatomik (O2). Cluster dapat dibagi menjadi dua
kelompok, tembaga diduga tipe III dan tembaga spektroskopi diduga tipe II.
Kelompok tipe II terdiri dari atom tembaga tunggal dengan dua ligan histidin dan
atom oksigen yang ditransformasikan ke pasangan tembaga tipe III. Sepasang atom
tembaga terikat pada enam histidin, tiga ligan pada masing-masing tembaga.
Dijembatan oleh atom oksigen, kedua tembaga membentuk atom tembaga tipe III.
Phenolase
Phenolase terlibat dalam biosintesis lignin dan alkaloid dan dalam
pembentukan substansi brown melanotic yang kadang terbentuk bila jaringan terluka.
Proses browning enzimatis disebabkan karena adanya aktivitas enzim pada bahan
pangan segar, seperti pada susu segar, buah-buahan dan sayuran. Pencoklatan
enzimatik terjadi pada buahbuahan yang banyak mengandung substrat fenolik, di
samping katekin dan turunnya seperti tirosin, asam kafeat, asam klorogenat, serta
leukoantosiain dapat menjadi substrat proses pencoklatan. Senyawa fenolik dengan
jenis ortodihidroksi atau trihidroksi yang saling berdekatan merupakan substrat yang
baik untuk proses pencoklatan.
Reaksi ini dapat terjadi bila jaringan tanaman terpotong, terkupas dan
karena kerusakan secara mekanis yang dapat menyebabkan kerusakan integritas
jaringan tanaman. Hal ini menyebabkan enzim dapat kontak dengan substrat yang
biasanya merupakan asam amino tirosin dan komponen fenolik seperti katekin, asam
kafeat, dan asam klorogena sehingga substrat fenolik pada tanaman akan
dihidroksilasi menjadi 3,4-dihidroksifenilalanin (dopa) dan dioksidasi menjadi kuinon
oleh enzim phenolase. Wiley-Blackwell (2012).
Pencoklatan enzimatis pada bahan pangan memiliki dampak
menguntungkan dan juga dampak yang merugikan. Reaksi pencoklatan enzimatis
bertanggung jawab pada warna dan flavor yang 4 terbentuk. Dampak yang
menguntungkan, misalnya enzim polifenol oksidase bertanggung jawab terhadap
karakteristik warna coklat keemasan pada buah-buahan yang telah dikeringkan seperti
kismis, buah prem dan buah ara.
Laccase
Laccases adalah enzim oksidase yang mengandung tembaga yang
ditemukan di banyak tanaman, jamur, dan mikroorganisme. Laccases bekerja pada
fenol dan substrat yang serupa, melakukan oksidasi satu elektron, yang mengarah
pada pengikatan silang. Misalnya lakase berperan dalam pembentukan lignin dengan
mempromosikan kopling oksidatif dari monolignol, sebuah keluarga fenol yang
terbentuk secara alami. Lakase lain, seperti yang diproduksi oleh jamur Pleurotus
ostreatus, berperan dalam degradasi lignin, dan karenanya dapat digolongkan sebagai
enzim pemodifikasi lignin. Laccases mengkatalisis pembelahan cincin senyawa
aromatik.
Situs aktif terdiri dari empat pusat tembaga, yang mengadopsi struktur yang
diklasifikasikan sebagai tipe I, tipe II, dan tipe III. Sebuah ansambel tricopper berisi
tembaga tipe II dan III (lihat gambar). Pusat inilah yang mengikat O2 dan
menguranginya menjadi air. Setiap pasangan Cu (I, II) menghasilkan satu elektron
yang diperlukan untuk konversi ini. Tembaga tipe 1 tidak mengikat O2, tetapi
berfungsi hanya sebagai situs transfer elektron. Tembaga tipe III dapat diganti dengan
Hg (II), yang menyebabkan penurunan aktivitas lakase. Sianida menghilangkan
semua tembaga dari enzim, dan menanam kembali dengan tipe I dan tembaga tipe II
telah terbukti tidak mungkin. Namun, tembaga tipe III dapat ditanam kembali ke
dalam enzim. Berbagai macam anion lain menghambat laccase.
Situs tricopper ditemukan dalam banyak lacase, perhatikan bahwa setiap
pusat tembaga terikat ke sidechains histidin imidazol (kode warna: tembaga berwarna
coklat, nitrogen berwarna biru). Laccases mempengaruhi reaksi reduksi oksigen pada
kelebihan potensial yang rendah. Enzim telah diperiksa sebagai katoda dalam sel
biofuel enzimatik. Mereka dapat dipasangkan dengan mediator elektron untuk
memfasilitasi transfer elektron ke kawat elektroda padat. Laccases adalah beberapa
oksidoreduktase yang dikomersialkan sebagai katalis industri.
Amine oksidase
Amine oksidase adalah kelompok dari enzim amina oksidase yang
mencakup baik primer-amina oksidase dan diamine oksidase; Enzim ini
mengkatalisasi oksidasi berbagai amina biogenik termasuk banyak neurotransmiter,
histamin dan amina xenobiotik. Mereka bertindak sebagai homodimer terkait
disulfida. Amine oksidase mengkatalisasi oksidasi amina primer menjadi aldehida,
dengan pelepasan amonia dan hidrogen peroksida selanjutnya, yang membutuhkan
satu ion tembaga per subunit dan topaquinone sebagai kofaktor.
Amina oksidase yang mengandung tembaga ditemukan pada bakteri, jamur,
tanaman dan hewan. Pada prokariota, enzim ini memungkinkan berbagai substrat
amina untuk digunakan sebagai sumber karbon dan nitrogen. Enzim ini milik
oksidoreduktase, khususnya yang bekerja pada kelompok donor CH-NH2 dengan
oksigen sebagai akseptor. Nama sistematis dari kelas enzim ini adalah amina: oksigen
oksidoreduktase (deaminating) (mengandung tembaga). Enzim ini berpartisipasi
dalam 8 jalur metabolisme: siklus urea dan metabolisme gugus amino, glisin, serin
dan metabolisme treonin, metabolisme histidin, metabolisme tirosin, metabolisme
fenilalanin, metabolisme triptofan, metabolisme beta-alanin, dan biosintesis alkaloid.
Struktur 3-dimensi tembaga amina oksidase ditentukan melalui kristalografi
sinar-X. Copper amine oksidase terjadi sebagai homodimer berbentuk jamur dari 70-
95 kDa, masing-masing monomer mengandung ion tembaga dan kofaktor redoks
yang terikat secara kovalen, topaquinone (TPQ). TPQ dibentuk oleh modifikasi
pasca-translasi residu tirosin yang dikonservasi. Ion tembaga dikoordinasikan dengan
tiga residu histidin dan dua molekul air dalam geometri piramida persegi terdistorsi,
dan memiliki fungsi ganda dalam katalisis dan biogenesis TPQ. Domain katalitik
adalah yang terbesar dari 3-4 domain yang ditemukan dalam oksida tembaga amina,
dan terdiri dari sandwich beta 18 untai dalam dua lembar. Situs aktif dimakamkan
dan membutuhkan perubahan konformasi untuk memungkinkan akses media.
Lignifikasi
Lignin merupakan komponen dinding sel tumbuhan berupa fenolik
heteropolimer yang dihasilkan dari rangkaian oksidatif di antara tiga unit monomer
penyusunnya yaitu p-coumaryl, coniferyl, dan sinapyl alcohol dalam reaksi yang
dimediasi oleh peroksida. Gullichsen dan Paulapuro (2000) menyatakan bahwa lignin
merupakan polimer amorf dengan struktur kimia yang jelas berbeda dari komponen
makromolekul lain pada kayu. Berbeda dengan karbohidrat, struktur kimia lignin
tidak teratur yang dapat digambarkan oleh perbedaan komponen strukturalnya yaitu
unit fenilpropana yang tidak terhubung satu sama lain.
Lignin terdapat di antara sel-sel dan di dalam dinding sel tumbuhan. Di
antara sel-sel, lignin berfungsi sebagai perekat antar sel-sel. Dalam dinding sel, lignin
sangat erat kaitannya dengan selulosa atau hemiselulosa dan berfungsi untuk
memberikan ketegaran pada sel, memperkecil perubahan dimensi sehubungan dengan
perubahan kadar air kayu, dan mempertinggi ketahanan kayu terhadap serangan
cendawan dan serangga melalui perannya sebagai physical barrier (Haygreen dan
Bowyer 1989). Lignin adalah salah satu komponen struktural utama dari dinding sel.
Selain sebagai struktur pendukung dan fungsi pertahanan terhadap patogen, lignin
juga berperan dalam pengangkutan air dari pembuluh floem dan sel xilem. Struktur
kimia lignin dapat mempengaruhi proses pulping dan mutu serat pulp yang
dihasilkan.

Alcalde M. 2007. Laccases: Biological functions, molecular structure and industrial

applications. In Polaina J, MacCabe AP. Industrial Enzymes. pp. 461–476.
Claus H. 2004. Laccases: structure, reactions, distribution. Micron 35 (1–2): 93–6.
Cohen R, Persky L, Hadar Y. 2002. Biotechnological applications and potential of
wood-degrading mushrooms of the genus Pleurotus. Microbiology and
Biotechnology 58 (5): 582–94.
Convery MA, Phillips SE, McPherson MJ, Yadav KD, Knowles PF, Parsons MR,
Wilmot CM, Blakeley V, Corner AS. 1995. Crystal structure of a quinoenzyme:
copper amine oxidase of Escherichia coli at 2 A resolution. Structure. 3 (11):
1171–1184.
Gullichsen J dan H Paulapuro. 2000. Chemical Pulping. USA: TAPPI Press.
Haygreen, J.G dan J.L. Bowyer. 1989. Hasil Hutan dan Ilmu Kayu. Gadjah Mada
University Press : Yogyakarta.
Kisu, Y.; Harada, Y.; Goto, M.; Esaka, M. 1997. Cloning of the Pumpkin Ascorbate
Oxidase Gene and Analysis of a Cis-Acting Region Involved in Induction by
Auxin. Plant Cell Physiol 38(5): 631-637.
Matthew S. Thorum, Cyrus A. Anderson, Jeremy J. Hatch, Andrew S. Campbell,
Nicholas M. Marshall, Steven C. Zimmerman, Yi Lu, Andrew A. Gewirth
2010. Direct, Electrocatalytic Oxygen Reduction by Laccase on Anthracene-2-
methanethiol Modified Gold. The Journal of Physical Chemical Letters: 2251–
2254.
Messerschmidt, A.; Ladenstein, R.; Huber, R.; Bolognesi, M.; Avigliano, L.;
Petruzzelli, R.; Rossi, A.; Finazzi-Agro, A. 1992. Refined Crystal Structure of
Ascorbate Oxidase at 1.9 Å Resolution. J. Mol. Biol 224: 179-205.
Murray JM, Convery MA, Phillips SE, McPherson MJ, Knowles PF, Parsons MR,
Wilmot CM, Blakeley V, Corner AS, Alton G, Palcic MM. 1997. Catalytic
mechanism of the quinoenzyme amine oxidase from Escherichia coli: exploring
the reductive half-reaction. Biochemistry. 36 (7): 1608–1620.
Solomon EI, Sundaram UM, Machonkin TE. 1996. Multicopper Oxidases and
Oxygenases. Chemical Reviews 96 (7): 2563–2606.
Tanizawa K, Guss JM, Freeman HC, Yamaguchi H, Wilce MC, Dooley DM,
Matsunami H, Mcintire WS, Ruggiero CE. 1997. Crystal structures of the
copper-containing amine oxidase from Arthrobacter globiformis in the holo and
apo forms: implications for the biogenesis of topaquinone. Biochemistry
36 (51): 16116–16133.
Wheeldon IR, Gallaway JW, Barton SC, Banta S. 2008. Bioelectrocatalytic hydrogels
from electron-conducting metallopolypeptides coassembled with bifunctional
enzymatic building blocks. Proceedings of the National Academy of Sciences
of the United States of America. 105 (40): 15275–80.