Material Genetik

dan
Alur Informasi Genetik
 Definisi
• Gen (noun) /genetik (adjective):
– Unit herediter yang terdiri dari DNA sekuen yang
terletak pada lokasi khusus di kromosom dan
menentukan karakteristik tertentu padaorganisme
• Genom:
– Kandungan genetik total pada sebuah organisme
• Material genetik terdiri dari:
– Gen, Bagian dari gen, Kelompok gen
– Senyawa DNA, Fragmen DNA, Kelompok beberapa
senyawa DNA
– Genom suatu organisme
Struktur Sel Hewan
Struktur Nukleus
Kromatin dan Kromosom
 DNA
• DNA = deoxyribonucleic acid
– Material genetik pada manusia dan hampirsemua
organisme lain
– Setiap sel pada tubuh seseorang memiliki DNA yang sama
– Hampir semua DNA terletak di nukleus (DNA nuklear),
namun ada yang ditemukan di mitokondria (DNA
mitokondrial)
– Informasi di DNAdisimpan dari empat basa kimia,Adenine
(A), Guanine (G), Cytosine (C), dan Thymine (T)
– Empat basa berpasangan A dengan T,Cdengan G
membentuk pasangan basa
Struktur DNA
Struktur DNA
Struktur DNA
DNA Package
 Genom dan gen
(lihat www.ncbi.nlm.nih.gov)
 Genom dan gen
(lihat www.ncbi.nlm.nih.gov)
 Central Dogma
Alur Informasi Genetik (dari DNA ke Protein)
REPLIKASI, TRANSKRIPSIDAN
TRANSLASI
REPLIKASI DNA
DNA Structure
• James Watson and Francis Crick (1953)
 Semi-conservative Mechanism

• Tiap untai DNA berlaku sebagai template untuk

pembentukan untai baru, sehingga satu dsDNA
(double stranded DNA= DNA untai ganda)dapat
menjadi dua dsDNA yang memiliki urutan basa
yang sama persis dengan dsDNA induk
DNA Polymerase (DNA Pol)
• DNA Polimerase:
– Mensintesis DNA hanya
dari arah 5’ ke 3’,
menambah dNTP ke
gugus hidroksil 3’
– Hanya menambah
deoksiribonukleotida
baru pada primer strand
yang berikatan hidrogen
dengan template strand
 DNA Polymerases
• DNA Pol I
– DNA Pol yang pertama kali ditemukan
– Diisolasi dari E. coli oleh Arthur Kornberg tahun1950-
an
– Menghilangkan primer RNA dan mengisi celah
pada lagging strand
• DNA Pol II
– Polimerase yang berperan pada DNA repair
• DNA Pol III
– Berperan pada replikasi DNA
Enzymes involved in replication
Replication Fork
 Replication Fork
• Peristiwa yang terjadi pada replication
fork:
– Sintesis primer RNApada templatestrand
– Sintesis DNAdengan primer RNAyang
menempel pada ujung 5’-
– Bergeraknya replication fork dikoordinasi
oleh:
• Helicase: memutus ikatan hidrogenantara
pasangan basa
• DNA Topoisomerase I (DNA Topo I):
memungkinkan replication fork untuk maju
pada leading strand tanpa “memuntir”DNA
– Sintesis primer tambahan pada DNA
template strand menghasilkan bagian
pendek lagging strand
– Penghilangan primer RNAoleh aktivitas
enzim 5’-3’ exonuclease dari DNAPol
– Penggabungan lagging strand (disebut
fragmen Okazaki) oleh ligase
 Ori (Origin of Replication)
Titik dimulainya replikasi DNA
Ori Prokariot
• Origin of replication in bacteria
Video of Replication Process
Ekspresi Gen
TRANSKRIPSI RNA
TRANSKRIPSI RNA
 Struktur RNA
• DNA→
Thymine (T)
• RNA→
Urasil (U)
Jenis RNA
RNAPolimerase

• Prokariot

• Eukariot
 Transkripsi Prokariot vs Eukariot
Prokariot
• Awal transkripsi terjadi
pada:
– Sekuen antara -35 dan -10
• -10 : Pribnow box, TATAAT
• -35: recognition sequence,
TTGACA
• mRNA yang terbentuk
langsung digunakan untuk
sintesis protein
Eukariot
• Awal transkripsi terjadi
pada:
– Sekuen antara -25 dan -75
• -25: TATAbox, TATAAAA
• -75: CAATbox,GGCCAATCT
• mRNA yang terbentuk
mengalami beberapa
proses:
– 5’ capping
– 3’ polyadenilation
– splicing
 Tahapan Transkripsi (prokariot)
• Inisiasi :
– Subunit σ (regulatory subunit) berikatan spesifik
dengan sekuen promoter -35 dan -10 membentuk
komplek promoter tertutup
– Terurainya untai DNA di sekitar lokasiinisiasi
membentuk komplek promoter terbuka
– Inisiasi transkripsi dengan dilepaskannya subunit σ
• Elongasi
• Terminasi:
– Terjadi pada sekuen tertentu yang dapat membentuk
struktur ‘hairpin loop’
• Inisiasi →
1-5
• Elongasi
→6
• Terminasi
→7
 Termination sequence
Inverted
repeat GC-rich
sequence
followed by
approximately
seven A
residues
Transkripsi Video pada Eukariot
mRNA Eukariot
mRNA processing
TRANSLASI
 Kode Genetik
• Kode genetik terdiri
atas kodon (tiga
urutan basa)
• Terdiri dari 61 kodon:
– 2 aa memiliki satu
kodon, 9 aamemiliki
2 kodon, satu aa
memiliki 3 kodon, 5
aa memiliki 4 kodon
dan 3 aa memiliki 6
kodon)
– Terdapat startcodon
AUG (dan dalam
kasus langka GUG),
mengkode metionin
– Terdapat 3 stop
codon (terminasi
atau nonsense);UAA,
UAG UGA
rRNA
tRNA
Aminoasilasi tRNA
TRANSLASI
 INISIASI TRANSLASI
Prokariot Eukariot
• Terjadi ikatan antara • mRNApada 5’-7-
ribosom 30S pada Shine- metilguanosin caps
Dalgarno sekuen mRNA berikatan dengan subunit
yang mengandung AUG ribosom 40s upstreamAUG
start codon
Elongation
TERMINASI
• Ditandai
dengan
adanya stop
codon