Suhu annealing adalah suhu yang diperlukan untuk primer berhasil menempel pada DNA target.

Suhu
annealing yang optimum adalah salah satu faktor penting yang menentukan keberhasilan proses PCR.
Suhu annealing yang terlalu rendah dari suhu optimum akan menyebabkan terjadinya false priming, dan
jika suhu annealing lebih tinggi dari suhu optimumnya maka primer tidak dapat menempel pada DNA
target sehingga proses PCR tidak berhasil.