Menurut perundangan di Malaysia, status golongan transeksual masih lagi tidak jelas.
Jika diteliti dalam Perkara 8 Perlembagaan Persekutuan, ia menjelaskan berkaitan dengan
kesamarataan semua orang di sisi undang-undang dan tidaklah boleh ada perbezaan oleh
sebab agama, kaum, keturunan, tempat lahir atau jantina. Perkara ini menyebut “jantina”
merujuk kepada perbezaan lelaki dan perempuan sahaja manakala golongan transeksual
masih wujud ketidakjelasan daripada segi jantina. Ini termasuklah juga golongan khunsa yang
tidak disebut secara jelas dalam peruntukan tersebut. Sehingga kini, tiada satu peruntukan
pun di dalam undang-undang yang mentjelaskan “lelaki” dan “perempuan”. Akta Tafsiran
1967, Seksyen 4(2) hanya menyatakan, “Mana-mana perkataan dan perbahasan yang
ditujukan kepada kaum lelaki termasuklah perempuan”. Walaubagaimanapun, perkataan yang
ditujukan khusus kepada perempuan tidak termasuk dan meliputi lelaki. Perlu diingat bahawa
kebanyakan undang-undang di Malaysia membezakan antara lelaki dan perempuan
berdasarkan kepada butir-butir peribadi yang tercatat dalam sijil lahir atau kad pengenalan.
Sebarang pertukaran nama pada kad pengenalan adalah dibenarkan namun apabila ia
melibatkan pertukaran status jantina, maka ia akan melibatkan soal bidang kuasa
perundangan yang perlu diputuskan oleh Mahkamah.
Jika dilihat melalui perspektif Islam, adalah jelas perbuatan transeksual ini ditegah
oleh Islam. Ini berdasarkan kepada beberapa petikan ayat al-Quran antaranya yang
bermaksud, “Dan demi sesungguhnya, aku akan menyesatkan mereka (dari kebenaran) dan
demi sesungguhnya aku akan memperdayakan mereka dengan angan-angan kosong dan demi
sesungguhnya aku akan menyuruh mereka (mencacatkan binatang-binatang ternak), lalu
mereka membelah telinga binatang-binatang itu dan aku akan menyuruh mereka mengubah
ciptaan Allah dan (ingatlah) sesiapa yang mengambil syaitan menjadi pemimpin yang ditaati
selain daripada Allah, maka sesungguhnya rugilah dia dengan kerugian yang terang nyata…”
(Surah al-Nisa' ayat 119). Terdapat juga sebuah hadis yang bermaksud, “Rasulullah
melaknati lelaki yang menyerupai wanita dan wanita yang menyerupai lelaki” (Hadith
Riwayat al-Bukhari). Berdasarkan dalil-dalil tersebut jelas menunjukkan betapa Islam
menolak sekeras-kerasnya amalan transeksual di kalangan umat manusia. Majoriti ulama’
bersepakat bahawa Islam melarang perbuatan lelaki dilarang menyerupai wanita. Dr. Wahbah
al-Zuhaili merujuk kepada kitab Fiqh al-Islami wa Adillatuh, menegaskan bahawa haram ke
atas lelaki menyerupai wanita. Sabda Rasulullah SAW, yang bermaksud, “Daripada Ibn Anas
r.a berkata, Rasulullah SAW melaknat mereka yang menyerupai wanita daripada kalangan
lelaki dan mereka yang menyerupai lelaki daripada kalangan wanita” (HR al-Bukhari)
Maksud menyerupai dalam hadis di atas termasuklah daripada aspek gaya rambut, perhiasan,
penampilan, cara bercakap, cara berpakaian dan sebagainya. Al-Syeikh Muhammad bin
Soleh al-‘Uthaimin menerusi bukunya, Fatawa wa Rasai’il Lil Nisa’, menegaskan bahawa
haram ke atas lelaki menyerupai kaum wanita samada dari aspek tingkah laku, percakapan,
perhiasan, cara berpakaian dan sebagainya dalam perkara yang dikhususkan untuk wanita.
Sabda Rasulullah SAW yang bermaksud, “Daripada Abi Hurairah r.a berkata, Rasulullah
SAW telah melaknat orang lelaki yang memakai pakaian perempuan dan perempuan yang
memakai pakaian lelaki.”
Dalam agama Buddha, menjadi seorang “katoey”, istilah kasar untuk golongan tukar
jantina, dilihat sebagai sebahagian daripada karma seseorang. Hujahnya adalah sebagai satu
"kasihan" dan bukannya "menyalahkan". Katoey umumnya dilihat tidak cenderung untuk
membentuk hubungan yang berkekalan dengan manusia, dan penjelasan karma mereka
adalah bahawa mereka dihukum daripada tingkah laku tidak setia dalam kehidupan masa lalu.
Falsafah Hindu mempunyai konsep seks ketiga atau jantina ketiga. Kategori ini
mengenai individu yang mempunyai pelbagai sifat wanita seperti homoseksual, transeksual,
biseksual, dan sebagain. Orang seperti itu tidak dianggap lelaki atau perempuan sepenuhnya
dalam agama Hindu tradisional, namun mereka merupakan gabungan kedua-duanya . Mereka
disebut sebagai seks ketiga melalui kelahiran dan tidak dijangka untuk berkelakuan seperti
lelaki dan wanita biasa. Penyertaan mereka dalam upacara keagamaan, terutamanya sebagai
penari dan mereka juga penganut kuil dewa atau dewi tertentu. Beberapa Hindu percaya
bahawa orang seks ketiga mempunyai kuasa khas yang membolehkan mereka untuk
memberkati atau menyumpah orang lain. Walau bagaimanapun, kepercayaan ini tidak
ditegakkan dalam semua bahagian agama Hindu. Dalam agama Hindu, penciptaan alam
dihormati sebagai suatu kepelbagaian dan pengiktirafan seks ketiga adalah salah satu aspek
penciptaan alam.