Pelayaran kedua EIC di pimpin oleh Sir Henry Middleton di tahun 1604.

Dia
kemudian berhasil mencapai Ternate, Tidore, Ambon, dan Belanda.

Antara 1611 – 1617, mereka mendirikan kantor-kantor dagang di Sukadana

(Kalimantan Barat Daya), Makassar, Jayakarta, Jepara, Aceh, Pariaman, dan Jambi.

Melihat kenyataan ini Belanda kemudian marah dan berkomplik dengan Inggris.

Belanda menganggap bahwa cita-ci