Meliana Sanjaya – 170219014

Tugas Biokimia 02/09/2020 - Enzim

1. Write a definition for the following: the active site, substrate, and products
- The active site : kantung yang terbentuk pada protein (enzim) karena folding agar
molekul substrat spesifik dapat diikat dan reaksi kimia berjalan, terdapat residu
asam amino yang berfungsi sebagai penentu substrat yang diikat oleh enzim
- Substrate : molekul yang bekerja dengan enzim, dimana berikatan dengan residu
asam amino pada sisi aktif enzim (kompleks enzim-substrat) dan akan bereaksi
untuk menghasilkan produk
- Product : substrat yang melepas ikatan dari enzim karena telah bereaksi dengan
grup catalytic milik enzim, dimana struktur molekulnya berbeda dari awal saat
substrat diikat oleh enzim (substrat berubah saat dilepas karena proses katalisiss)

2. Explain how the structure of the protein is linked to its ability to act as an enzyme?
- Enzim adalah protein globular, yaitu molekul protein dimana struktur tertiernya
berbentuk bulat, seperti bola. Protein globular dapat menjadi katalis katif yang
sangat efisien. Protein tertier terdiri atas lebih dari 1 protein sekunder yang
terususun 3D, lebih dari 20 tipe asam amino. Globular protein dapat berperan
sebagai enzim karena bentuknya yang “spherical”, dimana sebuah enzim haru
memiliki struktur untuk membuat lekukan agar dapat membentuk active site untuk
tempat mengikatnya substrat.

3. Write a paragraph in your own words describing how enzymes act as catalysts by
lowering the activation energy.
Seluruh reaksi dalam tubuh berjalan secara fisiologis, yaitu berada dalam sel-
sel tubuh. Sel-sel ini tidak dapat merubah suhu dalam sel untuk menjalankan reaksi
tubuh, sehingga reaksi akan berjalan dengan sangat lama. Maka dari itu terdapat
enzim sebagai katalis untuk mempercepat terjadinya reaksi dalam tubuh dengan cara
menurunkan energi aktivasi.
Enzim tidak merubah nilai ∆G (energi bebas) dari reaktan/substrat maupun
produk, ∆G tidak berubah walau reaksi bersifat menyerap ataupun melepas energi.
Tetapi, enzim menurunkan energi dari transition state, yang merupakan keadaan tidak
stabil yang harus dicapai saat substrat akan dirubah / dipecah menjadi produk. Sisi
aktif enzim dikelilingi oleh residu-residu asam amino yang mengikat banyak substrat.
Energi aktivasi untuk membentuk transition state dan konversi dari substrat
intermediet menjadi produk lebih rendah dari energi aktivasi tanpa katalisis. Enzim
sebagai katalis biologis menjalankan reaksi kimia tanpa mengubah kondisi
equilibriumnya.

Transition state