LAPORAN TUTORIAL I

BLOK 2 │STRUKTUR TUBUH MANUSIA

Skenario 2

Tutor : drg. Amandia Dewi Permana Shita, M. Biomed

Kelompok F :

1. Ketua : Zahradena Shafira Putri T. (201610101052)

2. Scriber : Shabrina Tuhva Chaliqi (201610101054)
3. Anggota : Aura Sekar Asmarani S. (201610101051)
Evelyn Naftalie Sitakar (201610101053)
Rona Nahda Nazifa (201610101055)
Hilma Andriani (201610101056)
Raras Kurniasih (201610101057)
Ilham Firdaus Kurniawan (201610101058)
Lintang Kawuryan (201610101059)
Titian Apta Ilona (201610101060)

FAKULTAS KEDOKTERAN GIGI

UNIVERSITAS JEMBER
2020

i
 KATA PENGANTAR

Puji syukur atas kehadirat Tuhan Yang maha Esa atas rahmat dan karunia-Nya kami
dapat menyelesaikan laporan yang berjudul “Struktur Molekuler Protein”. Dalam penulisan
laporan ini, kami mendapat bantuan dari berbagai pihak. Oleh karena itu, kami ingin
mengucapkan terima kasih kepada :

1. drg. Amandia Dewi Permana Shita, M. Biomed selaku dosen tutor kelas F
2. Semua anggota pada kelas tutorial F yang telah berpartisipasi dalam pembuatan
laporan ini

Kami sadar bahwa laporan ini masih jauh dari kesempurnaan, hal itu dikarenakan
keterbatasan kemampuan dan pengetahuan kami. Oleh karena itu, kami sangat mengharapkan
kritik dan saran yang bersifat membangun dari pembaca. Semoga laporan ini dapat berguna
bagi kita.

Akhir kata, kami mohon maaf apabila dalam pembuatan laporan ini terdapat banyak
kesalahan.

Jember, 28 Oktober 2020

Penyusun

i
 DAFTAR ISI

Kata Pengantar……………………………………………………………………….…..i
Daftar Isi….……………………………………………………………………………...ii
BAB I PENDAHULUAN
1.1 Latar Belakang Permasalahan..………………………………………………..…1
1.2 Skenario…………………………………………………………………………..2
1.3 Identifikasi Istilah Sulit…………………………………………………………..2
1.4 Klarifikasi Istilah Sulit…………………………………………………………...2
1.5 Permasalahan yang Muncul……………………………………………………...4
BAB II PEMBAHASAN PERMASALAHAN………………………………………….5
BAB III TUJUAN PEMBELAJARAN DAN MAPPING
3.1 Penentuan Tujuan Pembelajaran………………………………………………….7
3.2 Mapping…………………………………………………………………………..7
BAB IV PEMBAHASAN TUJUAN PEMBELAJARAN……………………………….8
BAB V KESIMPULAN………………………………………………………………….29
Daftar Pustaka…………………………………………………………………………….30

ii
 BAB I
PENDAHULUAN

1.1 Latar Belakang Masalah

Protein (protos yang berarti ”paling utama”) adalah senyawa organik kompleks yang
mempunyai bobot molekul tinggi yang merupakan polimer dari monomer-monomer asam
amino yang dihubungkan satu sama lain dengan ikatan peptida. Peptida dan protein
merupakan polimer kondensasi asam amino dengan penghilangan unsur air dari gugus
amino dan gugus karboksil. Protein memiliki fungsi selular penting dalam tubuh karena
berpartisipasi dalam biosintesis porfirin, purin, pirimidin dan urea. Rantai protein
merupakan jenis polipeptida yang terdiri atas L-α-asam amino. Polimer asam amino yang
memiliki rantai lebih pendek dinamakan dengan peptida yang berperan penting sebagai
hormon. Protein merupakan makromolekul yang terdiri dari 1 (satu) rantai polipeptida dan
terkadang dua atau lebih polipeptida. Protein juga dapat ditemukan dalam setiap sel dan
molekulnya terdiri dari unsur C, H, N, O, S dan terkadang P, Fe, Zn dan Co.
Berdasarkan jumlah asam amino yang menyusun polipeptida, peptida merupakan
polipeptida yang tersusun atas kurang dari 50 asam amino sedangkan protein tersusun atas
lebih dari 50 asam amino. Ada lebih dari 300 jenis asam amino yang dapat ditemukan di
alam, tetapi hanya 20 jenis asam amino yang menyusun protein. Manusia dan hewan tingkat
tinggi hanya bisa mensintesis 10 dari 20 jenis asam amino tersebut sehingga membutuhkan
tambahan nutrisi yang mengandung asam amino dari sumber makanannya. Sel dapat
memproduksi protein dengan susunan dan fungsi yang berbeda menggunakan kombinasi
dari 20 jenis asam amino.
Oleh karena building blocks yang berbeda, organisme dapat menghasilkan protein
dengan banyak fungsi seperti enzim, hormon, antibodi, transport, jaringan otot, protein
pembentuk lensa mata, bulu, jaring laba-laba, tanduk badak, antibiotik, protein susu, bisa
ular dan aktivitas biologi lainnya.

1
1.2 Skenario

STRUKTUR MOLEKULER PROTEIN

(Dr. drg. I Dewa Ayu Susilawati, M. Kes)

Protein merupakan makro molekul utama penyusun struktur tubuh manusia. Terdapat
ribuan jenis protein dalam tubuh manusia, salah satunya adalah antibodi (imunogloblin)
yang berperan pada respons imun. Protein adalah polimer asam-asam amino yang
dihubungkan satu dengan yang lain oleh ikatan peptida. Jenis, jumlah dan urutan asam amino
yang menyusun protein disebut sebagai struktur primer protein, hal ini yang membedakan
protein satu dengan protein lainnya. Struktur primer dapat terorganisasi membentuk struktur
sekunder, tersier dan kuarterner. Tugas mahasiswa pada tutorial ini adalah:

1) Mengkaji jenis dan struktur molekuler asam-asam amino penyusun protein

2) Mengkaji organisasi struktur molekuler protein.
3) Menjelaskan struktur molekuler salah satu jenis protein (antibodi).

1.3 Identifikasi Istilah Sulit

1) Protein
2) Makromolekul
3) Antibodi
4) Imun
5) Polimer
6) Asam amino
7) Ikatan peptida
8) Struktur primer protein
9) Immunoglobulin
10) Kuartener
11) Tersier
12) Sekunder

1.4 Klarifikasi Istilah Sulit

1) Protein
▪ kumpulan polimer yang memiliki fungsi-fungsi spesifik.

2
 ▪ makronutrien yang dibutuhkan oleh tubuh dalam jumlah yang besar yang
berfungsi sebagai pembangun tubuh.
▪ zat makanan berupa asam amino yang berfungsi sebgai pembangun dan pengatur
tubuh.
▪ jaringan panjang yang terdiri dari beberapa molekul asam amino yang terikat.
2) Makromolekul
▪ molekul yang sangat besar.
▪ polimer yang tersusun atas beberapa monomer.
3) Antibodi
▪ zat kimia yang berada di dalam tubuh dan merupakan system kekebalan tubuh.
▪ zat dalam darah untuk menghancurkan bakteri/virus atau menghancurkan racun
yang dihasilkan oleh bakteri.
4) Imun
▪ daya tahan tubuh.
▪ pertahanan pada organisme untuk melindungi tubuh dari pengaruh biologis luar
dengan membunuh pathogen.
▪ suatu kondisi kebal terhadap penyakit.
5) Polimer
▪ senyawa molekul berbentuk rantai.
▪ rantai berulang dari atom yang Panjang terbentuk dari pengikat yang berupa
molekul identic yang disebut monomer.
6) Asam amino
▪ senyawa penyusun protein
▪ senyawa organik terdiri dari nitrogen, karbon, hydrogen, oksigen, dan unsur
lainnya.
7) Ikatan peptida
▪ pertautan antara gugus amin dan gugus karboksil.
8) Struktur primer protein
▪ ikatan peptida dari asam amino pembentuk protein.
9) Immunoglobulin
▪ bagian dari protein/jenis protein yang memiliki fungsi spesifik pertahanan tubuh
dari pathogen.

3
 ▪ sekelompok glikoprotein yang terdapat dalam cairan tubuh pada hamper semua
mammalia.
▪ system pertahanan tubuh yang bersifat spesifik terhadap penyakit.
10) Kuartener
▪ struktur yang melibatkan beberapa peptida untuk membentuk protein.
▪ agregasi dari polipeptida yang membentuk protein.
▪ atom c yang mengikat 4 atom c lainnya.
▪ memiliki 4 tingkatan.
11) Tersier
▪ gabungan dari aneka ragam struktur sekunder.
▪ atom c yang mengikat 3 atom c lainnya.
▪ memiliki 3 tingkatan.
12) Sekunder
▪ tingkatan kedua.
▪ atom c yang mengikat 2 atom c lainnya.

1.5 Permasalahan yang Muncul

1) Jelaskan bagaimana proses struktur primer protein membentuk struktur sekunder
protein dan struktur tersier protein.
2) Jelaskan apa itu respon imun dan mekanismenya.
3) Jelaskan bagaimana struktur primer protein.
4) Bagaimana struktur antibodi.
5) Jelaskan jumlah dan urutan asam amino yang menyusun protein.
6) Apa saja jenis asam amino penyusun protein.
7) Bagaimana struktur dari asam amino.

4
 BAB II
PEMBAHASAN PERMASALAHAN

1) Jelaskan bagaimana proses struktur primer protein membentuk struktur sekunder

protein dan struktur tersier protein.
▪ Jawaban :
Asam amno berikatan dan membentuk sebuah rantai. Ikatan ini terjadi pada saat
proses sintesis protein, struktur primer kemudian akan melipat dan terbentuk struktur
sekunder, struktur tersier akan terbentuk dari kombinasi struktur sekunder protein.
kemudian, struktur tersier terbentuk kerena struktur tersier yang saling berikatan dan
membentuk struktur kuartener protein. struktur kuartener akan terbentuk karena struktur
tersier yang saling berikatan.
2) Jelaskan apa itu respon imun dan mekanismenya.
▪ Jawaban :
Respons imun adalah respons tubuh berupa suatu urutan kejadian yang kompleks
terhadap antigen, untuk mengeliminasi antigen tersebut.
3) Jelaskan bagaimana struktur primer protein.
▪ Jawaban :
Struktur primer protein merupakan urutan asam amino penyusun protein yang
dihubungkan melalui ikatan peptida (amida). Frederick Sanger merupakan ilmuwan yang
berjasa dengan temuan metode penentuan deret asam amino pada protein, dengan
penggunaan beberapa enzim protease yang mengiris ikatan antara asam amino tertentu,
menjadi fragmen peptida yang lebih pendek untuk dipisahkan lebih lanjut dengan bantuan
kertas kromatografik. Urutan asam amino menentukan fungsi protein, pada tahun 1957,
Vernon Ingram menemukan bahwa translokasi asam amino akan mengubah fungsi
protein, dan lebih lanjut memicu mutasi genetik.
4) Bagaimana struktur antibodi.
▪ Jawaban :
Molekul antibodi tersusun atas dua rantai yaitu rantai berat dan rantai ringan yang
diikat oleh rantai peptide.
5) Jelaskan jumlah dan urutan asam amino yang menyusun protein.
▪ Jawaban :

5
 Terdapat 20 jenis asam amino penyusun protein. alanin, arginin, asparagine,asam
aspartat, sistein,glutamin, asamglutamat, glisin, histidin,isoleusin,leusin,lisin,methionin,
proline,serin,threonin,triptofan, tyrosin, fenil alanin, valin
6) Apa saja jenis asam amino penyusun protein.
▪ Jawaban :
1. Asam amino non esensial :alanin,arginin,asparagin,asam
aspartat,sistein,tirosin,serin,glisin,prolin,glutamin,asam glutamat.
2. Asam amino esensial :
Histidin,Isoleupan,Treonin,Fensin,Valin,Triptoilalanin,Leusin,Lisin,Metionin
7) Bagaimana struktur dari asam amino.
▪ Jawaban :
Satu atom C yang mengikat empat gugus: gugus amina, gugus karboksil, atom
hydrogen, dan satu gugus sisa (residu).

6
 BAB III
TUJUAN PEMBELAJARAN DAN MAPPING

3.1 Penentuan Tujuan Pembelajaran

1) Mengkaji jenis dan struktur molekuler asam-asam amino penyusun protein.
2) Mengkaji organisasi struktur molekuler protein.
3) Menjelaskan struktur molekuler salah satu jenis protein (antibodi).

3.2 Mapping

PROTEIN

STRUKTUR STRUKTUR STRUKTUR

TERSIER
SEKUNDER KUARTENER

STRUKTUR
PRIMER
PROTEIN
IKATAN
PEPTIDA

ASAM
AMINO

C; H; O; N; S;
P

7
 BAB IV
PEMBAHASAN TUJUAN PEMBELAJARAN

1) Mengkaji jenis dan struktur molekuler asam-asam amino penyusun protein.

Jawaban :

Anatomi Asam Amino

Asam amino memiliki dua gugus fungsi yaitu – NH2 dan – COOH.

Pada keadaan zwitter ion, biasanya gugus tersebut dalam keadaan – NH4+ dan – COO-. Kecuali
prolin, 20 jenis asam amino pembentuk protein memiliki gugus karboksil bebas dan gugus
amino bebas tidak tersubstitusi yang terikat pada atom karbon α sehingga dinamakan dengan
α-asam amino. Berdasarkan strukturnya, 20 jenis asam amino pembentuk protein, 19
diantaranya merupakan amina primer dan 1 amina sekunder (prolin). Selain itu, 19 asam amino
memiliki C kiral dan 1 akiral (glisin).

Berdasarkan jumlah asam amino penyusunnya, rantai asam amino dibagi menjadi:

1. Peptida. Terdiri dari asam amino yang jumlahnya kurang dari 50.
a) Dipeptida. Terdiri dari 2 asam amino.
b) Tripeptida. Terdiri dari 3 asam amino.
c) Polipeptida. Terdiri lebih dari 10 asam amino.

8
 2. Protein. Terdiri dari asam amino yang jumlahnya lebih dari 50. Biasanya protein terdiri
dari 100 – 10000 asam amino.
Untuk membentuk peptida dan protein, asam amino akan membentuk ikatan peptida dengan
molekul asam amino lainnya. Peptida terbentuk karena adanya ikatan antara amida pada gugus
amino dengan gugus hidroksil pada molekul lainnya melalui proses kondensasi. Di lain pihak,
pemecahan ikatan peptida dinamakan dengan hidrolisis. Pembentukan ikatan peptida dapat
dilihat dibawah ini

Pada pembentukan protein ada asam amino yang berfungsi sebagai N-terminus dan

C-terminus. Asam amino yang masih memiliki gugus amino dalam rangkaian protein

dinamakan N-terminus sedangkan yang masih memiliki gugus karboksilat dinamakan

Cterminus. Berdasarkan konvensi, penggambaran peptida dan protein selalu dimulai

dengan N-terminus kemudian diakhiri dengan C-terminus.

Penggambaran N-terminus dan C-terminus pada dipeptida dan protein:

4) dipeptida
9
5) protein

10
Rantai Samping Asam Amino

Berdasarkan rantai samping penyusunnya, asam amino diklasifikasikan menjadi 4 kelas

yaitu:

a) Gugus R nonpolar atau hidrofobik

b) Gugus R netral (tidak bermuatan) polar
c) Gugus R bermuatan positif
d) Gugus R bermuatan negatif

11
12
Stereoisomer

Selain glisin, α-karbon pada asam amino merupakan C kiral. Oleh sebab itu, struktur
tetrahedral asam amino memiliki dua bentuk yang merupakan bayangan cermin yang
dinamakan dengan enantiomer. Semua molekul yang memiliki C kiral merupakan optikal aktif
yang bisa memutar bidang cahaya terpolarisasi sehingga membentuk sistem D dan L.

Desain L dan D digunakan untuk menjelaskan levorotatory (memutar cahaya ke kiri) dan
dextrorotatory (memutar cahaya ke kanan). Asam amino penyusun molekul protein adalah
yang memiliki stereoisomer L. D-asam amino dapat ditemukan pada penyusun peptida rantai

13
pendek yang menyusun dinding sel bakteri dan peptida yang berfungsi sebagai antibiotik.

Titik Isoelektrik

Asam amino jika dilarutkan dalam air dapat membentuk ion dengan dua kutub polar
(dipolar) yang sering dinamakan dengan zwitterion. Dalam bahasa Jerman, zwitterions
memiliki arti ion hibrit. Zwitterion dapat berfungsi sebagai asam (donor proton) dan juga basa
(akseptor proton). Oleh karena sifatnya yang dipolar dan dapat berfungsi sebagai asam dan
basa, asam amino sering disebut sebagai amfoter atau amfolit (amfoter elektrolit). Ion amonium
( -NH3+) berfungsi sebagai asam dan ion karboksilat ( - COO-) berfungsi sebagai basa.

14
Titrasi asam basa dapat digunakan untuk menentukan titik isoelektrik asam amino. Titik
isoelektrik (pI) adalah pH dimana asam amino bersifat netral atau bermuatan 0 (bentuk
zwitterion).

Asam Amino Esensial dan Nonesensial

15
Berdasarkan kemampuan tubuh mensintesis, asam amino dibagi menjadi asam amino essensial,
nonesensial dan kondisional.

a) Asam amino esensial adalah asam amino yang tidak dapat disintesis oleh
tubuh sehingga harus diperoleh dari makanan yang dikonsumsi.
b) Asam amino nonesensial adalah asam amino yang dapat disintesis oleh tubuh.
c) Asam amino esensial kondisional adalah asam amino yang tidak dapat
disintesis oleh tubuh karena pada keadaan sakit atau kurangnya prekursor.
Contohnya adalah bayi yang lahir prematur enzim yang digunakan untuk
mensintesis arginin belum berkembang dengan baik.

2) Mengkaji organisasi struktur molekuler protein

Jawaban :
1. Sruktur Primer Protein

Struktur primer atau primary structure suatu protein adalah sekuens unik asam-asam
aminonya. Struktur primer protein terdiri atas satu rantai protein dengan susunan asam amino
yang tidak membentuk ikatan. Misalnya, pada transtiretin, yakni sejenis proteinglobular dalam
darah, yang mentranspor vitamin A dan salah satu hormon tiroid ke seluruh tubuh. Masing-
masing dari keempat rantai polipeptida identik yang menyusun transtilretin, terdiri atas 127
asam amino. Masing-masing dari ke-127 posisi sepanjang rantai ditempati oleh satu asam
amino spesifik dari 20 macam yang ada, diindikasikan oleh singkatan tiga huruf. Struktur
primer bagaikan urutan huruf dalam suatu kata yang sangat panjang. Jika dilihat, akan ada 20127
cara yang berbeda untuk membuat suatu rantai polipeptida sepanjanjang 127 asam amino. Akan

16
tetapi, struktur primer tepat pada suatu protein tidak ditentukan oleh pertautan asam-asam
amino secara acak, tetapi oleh informasi genetik yang diwariskan. Struktur primer protein
menentukan struktur protein sekunder dan tersier karena sifat kimiawi dari bagian belakang
dan samping rantai (gugus R) dari asam amino di sepanjang polipeptida.

2. Sruktur Sekunder Protein

Struktur sekunder adalah rangkaian asam amino yang membentuk struktur membelit,
melingkar, dan melipat. Bentuk struktur ini dikelompokkan menjadi struktur alpha-helix (H),
beetha-sheet (B), dan coil (C). Adapun struktur tersier merupakan gabungan dari berbagai
struktur sekunder yang terjadi setelah proses pelipatan (folding). Prediksi struktur sekunder
protein menjadi riset yang menarik untuk dilakukan di bidang bioinformatika. Penelitian terkait
yang dengan prediksi struktur protein banyak dilakukan karena berkaitan dengan fungsi dan
peranan protein itu sendiri. Selain itu, pendekatan prediksi struktur protein berbasis komputasi
ini merupakan pendekatan heuristic sehingga meskipun tidak akan mendapatkan struktur baru
seperti layaknya menggunakan NMR atau kristalografi sinar-X namun diyakini membutuhkan
waktu yang relatif lebih cepat. Struktur sekunder protein merupakan label dari setiap asam
amino yang membentuknya. Sebagai ilustrasi, Gambar 5 menunjukkan ilustrasi prediksi
struktur protein sekunder. Dalam konteks klasifikasi, struktur sekunder H, B dan C merupakan
kelas target sementara asam amino akan memberikan informasi sebagai penciri untuk
memprediksi struktur sekunder tersebut.

17
 3. Struktur Tersier Protein

Struktur ini merupakan campuran dari struktur sekunder yang menyusun satu rantai
polipeptida. Lapisan tumpeng tindih di atas pola sekunder adalah struktur tersier, yang terdiri
atas pemutarbalikan tak beraturan dari ikatan antar rantai-rantai samping (gugus R) berbagai
asam amino. Ikatan yang membentuk struktur tersier adalah ikatan hidrogen, interaksi
hidrofobik, jembatan disulfida dan ikatan ionik.

Salah satu ikatan yang ada dalam sturktur tersier protein adalah interaksi hidrofobik. Ketika
polipeptida melipat membentuk konformasi fungsionalnya, asam amino dengan rantai samping
hidrofobik (nonpolar) umumnya mengumpul membentuk kumpulan pada bagian inti protein
itu, menjauhi kontak dengan air. Itulah yang disebut sebagai interaksi hidrofobik. Dimulai oelh
perilaku air yang menjauhi substansi nonpolar ketika molekul-molekul air membentuk ikatan
hydrogen satu sama lain dan dengan bagian hidrofilik protein tersebut. Begitu rantai samping
asam amino nonpolar mendekat satu sama lain, gaya tarik van der Waals menguatkan Kembali
interaksi hidrofobik itu. Sementara itu, ikatan hydrogen antara rantai-rantai samping polar dan
ikatan ionik anatara rantai-rantai samping bermuatan positif dan rantai samping bermuatan
negative juga membantu menstabilkan struktur tersier. Semuanya ini merupakan interaksi
lemah, akan tetapi efek kumulatifnya membuat protein mempunyai bentuk spesifik.

Selain itu, struktur tersier juga diperkuat oleh jembatan disulfuda. Jembatan disulfia
merupakan ikatan kovalen kuat, terbentuk ketika dua monomer sistein, asam amino dengan
gugus sulfhidril (−−−SH) pada rantai sampingnya, saling mendekat satu sama lain melalui
pelipatan protein tersebut. Sulfur salah satu sistein itu berikatan dengan sulfur sistein kedua,
dan jembatan disulfida (−−S−−S−−) mematri bagian-bagian protein menjadi terikat bersama.

18
 4. Struktur Tersier Protein
Struktur kuartener adalah struktur protein keseluruhan yang dihasilkan dari agregasi subunit
polipeptida. Misalnya, protein transthyretin globular terdiri dari empat polipeptida. Contoh lainnya,
adalah kolagen yang merupakan protein berserat yang memiliki tiga polipeptida hliks identik terjalin
menjadi tripel yang lebih besar memberikan kekuatan besar peada serat panjang. Sehingga, serat
kolagen berfungsi sebagai penopang jaringan ikat di kulit, tulang, tendon, ligamen, dan bagian tubuh
lainnya. Hemoglobin, oksigen-protein pengikat sel darah merah, merupakan contoh lain dari protein
globular dengan struktur kuaterner. Hemoglobin terdiri dari empat subunit polipeptida, dua polipeptida
jenis (alfa) dan dua polipeptida lain dari jenis (beta). Alfa dan subunit Beta terdiri dari struktur heliks
sekunder.

3) Menjelaskan struktur molekuler salah satu jenis protein (antibodi).

Jawaban :
Sistem imun merupakan kumpulan mekanisme dalam suatu mahluk hidup yang
melindunginya terhadap infeksi dengan mengidentikasi dan membunuh substansi patogen.
Sistem ini dapat mendeteksi bahan patogen, mulai dari virus sampai parasit dan cacing serta
membedakannya dari sel dan jaringan normal.

Ada 3 (tiga) fungsi penting yang harus dimiliki sistem imun yang sehat :

1. Kemampuannya untuk mengenali benda-benda asing seperti bakteri, virus, parasit,

jamur, sel kanker, dll. Fungsi ini sangat penting, karena harus bisa membedakan
mana kawan( bakteri yang menguntungkan dan sel tubuh yang baik )mana lawan (
virus, bakteri jahat, jamur, parasit, radikal bebas dan sel-sel yang bermutasi yang
bisa menjadi tumor/kanker ) dan mana yang orang biasa ( alergen, pemicu alergi )
yang harus dibiarkan lewat.
2. Bisa bertindak secara khusus untuk menghadapi serangan benda asing itu.
3. Sistem Imun mengingat penyerang-penyerang asing itu ( rupa & rumus kimiawi
antibodi yang digunakan untuk mengalahkan mereka yang disimpan didalam

19
 Transfer Factor tubuh ) sehingga bisa dengan cepat menolak serangan ulang di masa
depan.

Sistem imun yang sehat adalah sistem imun yang seimbangyang bisa meningkatkan
kemampuan tubuh dalam melawan penyakit. Sistem imun menyediakan kekebalan terhadap
suatu penyakit yang disebut imunitas. Respon imun adalah suatu cara yang dilakukan tubuh
untuk memberi respon terhadap masuknya patogen atau antigen tertentu ke dalam tubuh.

Sistem imun juga merupakan suatu sistem sirkulasi yang terpisah dari pembuluh darah yang
kesemuanya bekerja sama untuk menghilangkan infeksi dari tubuh. Organ sistem imun
terletak di seluruh tubuh, dan disebut organ limfoid

Sistem pertahanan tubuh terbagi atas 2 bagian yaitu :

1. Sistem Imun Non Spesifik (Innate Immunity System)

Innate Immunity adalah pertahanan tubuh yang mempunyai sifat tidak
spesifik dan merupakan bagian sistem imun yang berfungsi sebagai barier terdepan
pada awal terjadinya infeksi penyakit, oleh karena itu sering disebut natural atau
native immunity.

Yang termasuk innate immunity adalah : Makrofag, sel darah merah dan sel
assesories, selain itu juga bahan biokimia dan fisik barier seperti kulit yang
mensekresi lisosim dan dapat merusak bakteri seperti S.aureus. Sel lainnya adalah
natural killer, leukosit, sel ini cocok untuk mengenali perubahan permukaan pada
sel yang terinfeksi, seperti mengikat dan membunuh sel yang dipengaruhi oleh
interferon. Interferon adalah termasuk antibodi spesifik yang diproduksi oleh sel
target atau sel terinfeksi.

20
 Faktor lain yang termasuk innate immunity adalah protein serum yang merupakan
protein fase akut. Protein ini mempunyai efek sebagai perlindungan melalui interaksi
komplek dengan komplemen, yang selanjutnya diikuti lisisnya agen penyakit.

2. Sistem Imun Spesifik (Adaptive Immunity System)

Adaptive Immunity adalah merupakan sistem pertahanan tibuh lapis kedua,

jika innate immunity tidak mampu mengeliminasi agen penyakit. Hal ini terjadi jika
fagosit tidak mengenali agen infeksius sebab hanya sedikit reseptor yang cocok
untuk agen infeksius atau agen tidak bertindak sebagai faktor antigen terlarut (solube
antigen) yang aktif. Jika hal ini terus menerus, maka akan diperlukan molekul
spesifik yang akan berikatan langsung dengan antigen infeksius yang dikenal dengan
antibodi dan selanjutnya akan terjadi proses fagotosis.

Antibodi merupakan senyawa alam yang terdapat di dalam tubuh sebagai

bagian dari sistem pertahanan tubuh yang digunakan untuk mengurangi bahkan juga
dapat menghilangkan zat asing yang masuk ke dalam tubuh. Molekul antibodi
memiliki bagian yang dapat mengidentifikasi antigen atau benda asing yang ada
dalam tubuh dan bagian yang dapat menghancurkan benda asing melalui cara-cara
tertentu baik bekerja sendiri maupun bekerja sama dengan komponen pertahanan
tubuh yang lain. Antibodi juga merupakan suatu protein atau globulin dengan berat
molekul diatas 150.000 Da yang merupakan bagian dari sistem pertahanan tubuh dan
disebut immunoglobulin (Ig).

21
Mekanisme kerja antibodi dalam tubuh :

1. Molekul antibodi yang menempel pada permukaan limfosit akan berikatan dengan
molekul yang ada pada permukaan sel bakteri yang masuk ke dalam tubuh dan
merangsang pembentukan limfosit sehingga dihasilkan antibodi yang sama dalam
jumlah besar.
2. Antibodi dalam jumlah besar akan mengikat bakteri dan diikuti dengan mekanisme
pertahanan sekunder oleh makrofag fagositosis dan komplemen.

Dengan begitu antibodi memiliki fungsi, yaitu

1. Mengenali dan mengikat target spesifik dari bakteri (antigen)

2. Mengundang sistim pertahanan lain untuk menghancurkan bakteri, misalnya
makrofag dan komplemen.

Molekul antibodi terdiri atas 2 pasang struktur rangkaian yang masing-masing rangkaian
terdiri dari 2 rantai protein, yaitu rantai berat dan rantai ringan. Rantai berat (H) dan rantai
ringan (L) dihubungkan dengan ikatan disulfida, begitu pula antara struktur rangkaian yang
satu dengan yang lainnya.

Tiap rantai dibagi menjadi 2 area (domain), yaitu VL dan CL atau VH dan CH.

Gambar : Antibodi IgG

22
• VH dan VL mempunyai rangkaian asam amino yang sangat bervariasi sedangkan CH
dan CL mempunyai susunan asam amino yang relatif konstan.
• Perbedaan VH dan VL dari tiap antibodi menyebabkan antibodi mempunyai
spesifisitas yang berbeda untuk tiap jenis bakteri, sedangkan CH dan CL yang konstan
untuk tiap antibodi berfungsi sebagai mediator untuk fungsi sekunder sistim
imunologi.
• Tiap rantai terdiri dari 2 domain, domain bagian atas mempunyai terminal gugus amin
primer sedangkan domain bagian bawah merupakan terminal gugus karboksilat.

23
Molekul antibodi dapat difragmentasi sesuai dengan kebutuhan menggunakan enzim
papain dan pepsin.

• Fragmentasi/pemutusan rantai oleh papain terjadi diatas ikatan disulfida

rantai berat dan fragmen yang terjadi diberi nama Fab (bagian atas) dan Fc
(bagian bawah)
• Sedangkan fragmentasi oleh pepsin menyebabkan pemutusan rantai dibawah
ikatan disulfida rantai berat, dan fragmen yang terjadi disebut F(ab’)2.

Gambar : bagian molekul IgG yang diputus oleh enzim papain/pepsin

Unsur – unsur yang Berperan dalam Reaksi Imunoglobulin.Protein-protein yang

berfungsi untuk melindungi tubuh lewat proses kekebalan ini dinamakan “Imuno
globulin”, disingkat “Ig”.Protein paling khas pada sistem pertahanan, molekul
imuno globulin mengikatkan diri pada antigen untuk menginformasikan kepada sel-
sel kekebalan lainnya tentang keberadaan antigen tersebut atau untuk memulai
reaksi berantai perang penghancuran..

Diperkirakan terdapat 10(pangkat 8) jenis antibodi dalam tubuh dengan spesifisitas

yang berbeda. Di dalam tubuh antibodi dikelompokkan atas 5 jenis berdasarkan
perbedaan domain konstan, yaitu:

24
1. IgG

Imunoglobulin G adalah divalen antigen. Antibodi ini adalah

imunoglobulin yang paling sering/banyak ditemukan dalam sumsum tulang
belakang, darah, lymfe dan cairan peritoneal. Ia mempunyai waktu paroh
biologik selama 23 hari dan merupakan imunitas yang baik (sebagai serum
transfer). Ia dapat mengaglutinasi antigen yang tidak larut. IgG adalah satu-
satunya imunoglobulin yang dapat melewati plasenta.

Imunoglobulin G merupakan monomer , ditemukan utamanya pada serumdan

jarigan non mucosal yang dapat menginaktifkan patogen secara langsung
(Delves et al, 2017). Imunoglobulin G merupakan antibodi utama pada darah,
namun mampuuntuk memasuki celah antara jaringan, maupun lapis antigen.
Sekitar 80% IgG dapatditemukan pada serum (12,5 mg/ml). Terdapat empat
subtipe yaitu IgG1, IgG2, IgG3dan IgG4 (Elgert, 1998)

2. IgA

Imunoglobulin A adalah antibodi sekretori, ditemukan dalam saliva,

keringat, air mata, cairan mukosa, susu, cairan lambung dan sebgainya. Yang
aktiv adalah bentuk dimer (yy), sedangkan yang monomer (y) tidak aktif.
Jaringan yang mensekresi bentuk bentuk dimer ini ialah sel epithel yang
bertindak sebagai reseptor IgA, yang kemudian sel tersebut bersama IgA
masuk kedalam lumen.

Fungsi dari IgA ini ialah:

1. Mencegah kuman patogen menyerang permukaan sel mukosa

2. Tidak efektif dlam mengikat komplemen

25
 3. Bersifat bakterisida dengan kondisinya sebagai lysozim yang ada dalam
cairan sekretori yang mengandung IgA
4. Bersifat antiviral dan glutinin yang efektif

Imunoglobulin A terkonsentrasi pada cairan tubuh. Konsentrasi IgA

padamanusia hanya sekitar 13% (2,1,g/ml) dari serum darah, tetapi merupakan
klas antibodiutama yang ditemukan pada sekresi ekstravaskuler. IgA akan
ditemukan pada sekresiseperti air mata, saliva, sekresi nasal, bronkus, maupun
mukosa saluran cerna dansekresi kelenjar susu merupakan IgA sekretori
(Elgert, 1998). IgA terdiri atas 3 bentukterlarut, monomer dan sejumlah kecil
bentuk dimer IgA (dibentuk dari dua molekulyang diikat dengan poipetida
ekstra disebut rantai J (Delves et al, 2017).

3. IgE
Imunoglobulin E (IgE) memiliki peranan yang sangat penting dalam reaksi
alergi dn berhubungan dengan reaksi alergi hipersensivitas tipe 1 yaitu reaksi
antar antigen spesifik dan antibodi spesifik (IgE) yang terikat pada sel mast.
Antigen merangsang sel B untuk membentuk sel T Helper (Th). IgE diikat
oleh sel mast atau basofil melalui reseptor Fce. Apabila tubuh terpajan ulang
dengan antigen yang sama, maka antigen tersebut akan diikat oleh lgE yang
sudah ada pada permukaan sel mast atau basofil. Akibat ikatan
Antigen-IgE, sel mast atau basofil mengalami degranulasi dan melepas
mediator antara lain histamin yang menimbulkan gejala reaksi hipersensivitas
tipe 1. (Bratawidjaya,2006)
4. IgD
Immunoglobulin D (IgD) adalah imunoglobulin unik dengan konsentrasi
dalam serum jauh lebih rendah dari IgG, IgA, dan IgM tetapi jauh lebih tinggi
dari pada

26
 IgE. Fungsi utama IgD belum diketahui tetapi merupakan imunoglobulin
permukaan sel limfosit B bersama IgM dan diduga berperan dalam
diferensiasi sel ini.

5. IgM.
Imunoglobulin M (IgM), salah satu jenis Imunoglobulin, merupakan antibodi
dalam respons imun primer terhadap kebanyakan antigen. IgM merupakan Ig
yang paling efisien dalam aktivasi komplemen (jalur klasik). Kebanyakan sel
B mengandung IgM pada permukaannya sebagai reseptor antigen. IgM
dibentuk paling dahulu pada respons imun primer dibanding dengan IgG,
karena itu kadar IgM yang tinggi dalam darahumbilikus merupakan petunjuk
adanya infeksi dini.

Kelima jenis Ig ini terdistribusi dalam peredaran darah, disamping itu

• IgG terdapat juga dalam cairan extravascular, sedangkan

• IgA terdapat juga dalam sekresi misalnya saliva dan kelenjar air mata serta
• IgE selain di dalam darah juga terdapat di saluran pernafasan dan pencernaan
dan kulit.

27
 Gambar : bentuk imunoglobulin

Sistem Imun ini disebut Spesifik karena : dilakukan hanya oleh sel darah
putih Limfosit, membentuk kekebalan tubuh, dipicu oleh antigen (senyawa asing)
sehingga terjadi pembentukan antibodi dan setiap antibodi spesifik untuk antigen
tertentu. Limfosit berperan dalam imunitas yang diperantarai sel dan antibodi.

28
 BAB V

KESIMPULAN

Protein adalah molekul makro yang mempunyai berat molekul antara limaribu
hingga beberapa juta. Protein terdiri atas rantai-rantai panjang asam aminoyang terikat
satu sama lain dalam ikatan peptida. Penggolongan protein berdasarkan bentuknya
yaitu protein globulardan protein serabut (fibrous). Dan struktur protein terdiri dari
protein primer, proteinsekunder, protein tersier, dan protein kuartener. Fungsi protein
antara lain ; sebagai biokatalisator (enzim), sebagai protein transport, sebagai pengatur
pergerakan, sebagai penunjang mekanis, pertahanan tubuh dalam bentuk antibodi,
sebagai media perambatan impulssaraf, sebagai pengendalian pertumbuhan. Dan
pencernaan protein, yaitu dari mulut, lambung, dan usus halus. Metabolisme protein
terdiri dari absorpsi dan transportasi protein, katabolisme protein, dan anabolisme
protein.

29
 DAFTAR ISI

Modul Asam Amino, Peptida dan Protein Jilid 1 th 2018

:https://diploma.chemistry.uii.ac.id

Campbell, et al. 2010. Biologi. Edisi ke Delapan Jilid 1. Diterjemahkan oleh: Damaring
Tyas Wulandari. Jakarta: Erlangga ____________. 2016. Biology. 11th edition.
California: Pearson Benjamin Cumming

Jurnal Edukasi dan Penelitian Informatika (JEPIN) Vol. 1, No. 2, (2015) oleh Toto
Haryanto dan Budiman Surya Ardi.

Modul asam amino, peptida, dan protein Jilid 1. diploma.chemistry.uii.ac.id

Reece, Mitchell. Campbell edisi kelima jilid 1
Campbell, et all. (2010). Biologi, (Alih bahasa: Damaring Tyas Wulandari). Edisi ke
delapan Jilid 1. Jakarta: Erlangga
Widyastuti. 2007. Radiofarmaka Berbasis Antibodi. Radioisotop dan Radiofarmaka.
Vol 10

Murray,Robert K,Daryl K Granner ,Peter A Mayes, Viktor W Rodwell.1995.

Biokimia Harper Edisi 22.Jakarta: EGC

30