Pra-bukti jurnal

COVID-19, SARS dan MERS: apakah mereka terkait erat?

Nicola Petrosillo, Giulio Viceconte, Onder Ergonul, Giuseppe Ippolito, Eskild Petersen

PII: S1198-743X (20) 30171-3

DOI: https://doi.org/10.1016/j.cmi.2020.03.026
Referensi: CMI 1988

Muncul di: Mikrobiologi Klinik dan Infeksi

Tanggal Diterima: 16 Februari 2020

Diperbaiki Tanggal: 9 Maret 2020
Tanggal Diterima: 21 Maret 2020

Silakan kutip artikel ini sebagai: Petrosillo N, Viceconte G, Ergonul O, Ippolito G, Petersen E, COVID-
19, SARS dan MERS: apakah mereka terkait erat ?, Mikrobiologi Klinik dan Infeksi,
https://doi.org/10.1016/ j.cmi.2020.03.026.

Ini adalah file PDF dari artikel yang telah mengalami peningkatan setelah penerimaan, seperti
penambahan halaman sampul dan metadata, dan pemformatan agar dapat dibaca, tetapi ini belum
menjadi versi rekaman yang pasti. Versi ini akan mengalami penyalinan tambahan, penyusunan
huruf dan ulasan sebelum diterbitkan
dalam bentuk akhir, tetapi kami menyediakan versi ini untuk memberikan visibilitas awal artikel.
Harap perhatikan bahwa, selama proses produksi, kesalahan dapat ditemukan yang dapat
memengaruhi konten, dan semua penafian hukum yang berlaku untuk jurnal tersebut.

© 2020 Diterbitkan oleh Elsevier Ltd atas nama Masyarakat Mikrobiologi Klinik Eropa dan Penyakit
Menular.
COVID-19, SARS dan MERS: apakah mereka terkait erat?

Nicola Petrosillo1, Giulio Viceconte2, Onder Ergonul3,4, Giuseppe Ippolito1,

Eskild Petersen.5,6,7
1
Institut Nasional untuk Penyakit Menular “L. Spallanzani ”, IRCCS, Roma, Italia
2
Universitas "Federico II", Departemen Kedokteran dan Bedah Klinis, Naples, Italia
3
Universitas Koc, Fakultas Kedokteran, Istanbul, Turki
4
Komite Eksekutif ESCMID
5
Direktorat Jenderal Pengawasan dan Pengendalian Penyakit, Departemen Kesehatan, Muscat, Oman

6
ESCMID, Satuan Tugas Infeksi Berkembang, ESCMID, Basel
7
Institut Kedokteran Klinis, Fakultas Ilmu Kesehatan, Universitas Aarhus, Denmark

11

1
12

ABSTRAK

Latar Belakang: Coronavirus novel 2019 (SARS-CoV-2) adalah virus corona manusia baru

menyebar dengan fitur epidemi di Cina dan negara-negara Asia lainnya dengan kasus yang dilaporkan

di seluruh dunia. Novel ini Penyakit Coronavirus (COVID-19) dikaitkan dengan penyakit pernapasan
yang

dapat menyebabkan pneumonia berat dan sindrom gangguan pernapasan akut (ARDS). Meskipun
terkait dengan

Sindrom Pernafasan Akut Parah (SARS) dan Sindrom Pernafasan Timur Tengah (MERS),

COVID-19 menunjukkan beberapa fitur patogenetik, epidemiologis dan klinis yang tidak dimiliki

sepenuhnya dipahami sampai saat ini.

Tujuan: Kami memberikan ulasan tentang perbedaan dalam hal patogenesis, epidemiologi dan

fitur klinis antara COVID-19, SARS dan MERS.

Sumber: Literatur terbaru dalam bahasa Inggris mengenai COVID-19 telah ditinjau

dan data yang diekstraksi telah dibandingkan dengan bukti ilmiah terkini tentang SARS dan

Epidemi MERS.

Kandungan: COVID-19 tampaknya tidak jauh berbeda dari SARS mengenai fitur klinisnya.

Namun, ia memiliki tingkat kematian 2,3%, lebih rendah dari SARS (9,5%) dan jauh lebih rendah
daripada MERS

(34,4%). Tidak dapat dikecualikan bahwa karena COVID-19 gambaran klinis yang kurang parah itu bisa

menyebar di komunitas lebih mudah daripada MERS dan SARS. Angka reproduksi dasar aktual

(R0) dari COVID-19 (2-2.5) masih kontroversial. Ini mungkin sedikit lebih tinggi daripada R0 dari SARS (1,7-

1.9) dan lebih tinggi dari MERS (<1) ,. Rute gastrointestinal penularan SARS-CoV-2, yang

telah diasumsikan untuk SARS-CoV dan MERS-CoV, tidak dapat dikesampingkan dan perlu lebih jauh

diselidiki.
Implikasi: Masih banyak yang perlu diketahui tentang COVID-19, terutama terkait dengan kematian

dan kapasitas penyebaran pada tingkat pandemi. Meskipun demikian, semua pelajaran yang kami
pelajari di

masa lalu dari epidemi SARS dan MERS adalah senjata budaya terbaik untuk menghadapi ancaman
global baru ini.

PENGANTAR

Coronavirus novel 2019 (SARS-CoV-2) adalah coronavirus manusia baru yang muncul pada akhirnya

Desember 2019 di Wuhan, Cina. Saat ini sedang menyebar dengan fitur epidemi di Cina dan Taiwan

negara-negara Asia lainnya, dengan kasus yang dilaporkan di Eropa, Australia dan Amerika Utara. Saat
ini di

tanggal 8 Maret 2020, 105 586 kasus yang dikonfirmasi telah dilaporkan di 101 negara dengan

jumlah total 3.584 kematian.1

COVID-19 (Penyakit Coronavirus) adalah sindrom klinis yang terkait dengan infeksi SARS-CoV-2,

yang ditandai oleh sindrom pernapasan dengan derajat keparahan yang bervariasi, mulai dari a

penyakit pernapasan atas ringan hingga pneumonia interstitial berat dan gangguan pernapasan akut

sindrom (ARDS) .2–4

Meskipun SARS-CoV-2 milik gen betacoronavirus yang sama dari coronavirus yang bertanggung jawab

untuk sindrom pernafasan akut yang parah (SARS) dan Sindrom Pernafasan Timur Tengah (MERS)

(yaitu SARS-CoV dan MERS-CoV, masing-masing), virus novel ini tampaknya terkait dengan lebih
ringan

infeksi. Selain itu, SARS dan MERS terutama terkait dengan penyebaran nosokomial, sedangkan

SARS-CoV-2 banyak ditransmisikan di masyarakat.5

Dalam ulasan ini kami bertujuan untuk menganalisis perbedaan dalam hal patogenesis, epidemiologi
dan

fitur klinis antara COVID-19, SARS dan MERS.

FILLOGEN

Analisis urutan genom telah menunjukkan bahwa SARS-CoV-2 milik betacoronavirus genus, itu

termasuk virus korona kelelawar SARS, SARS-CoV, dan MERS-CoV.6

SARS-CoV-2 memiliki struktur genomik yang khas dari betacoronavirus lainnya. Demikian pula untuk

virus korona lainnya, genomnya mengandung 14 frame pembacaan terbuka (ORF), yang dikodekan
untuk 27

protein: ORF1 dan ORF2 di daerah terminal 5''kode genom untuk 15 non-struktural

protein penting untuk replikasi virus. 7,8 Wilayah 3'-terminal dari genom dikodekan untuk
protein struktural, yaitu spike (S), protein amplop (E), protein membran (M) dan

nucleocapsid (N), ditambah 8 protein tambahan.7,8

Analisis pohon filogenetik dari coronavirus novel menunjukkan bahwa SARS-CoV-2 milik bersama

dengan coronavirus seperti SARS-CoV dan Bat SARS, ke clade berbeda dari MERS-CoV dan lebih

terkait secara filogenetik dengan virus korona kelelawar SARS seperti yang diisolasi di Cina dari
kelelawar tapal kuda

antara 2015 dan 2018 dibandingkan dengan SARS-CoV (Tabel 1). Ini menunjukkan evolusi virus yang
berbeda

dari SARS dan MERS, melibatkan kelelawar sebagai reservoir liar. 9–14 Perbandingan genom antara
SARS dan

SARS-CoV2 telah menunjukkan bahwa hanya ada 380 substitusi asam amino antara SARS-CoV-2 dan

Coronavirus seperti SARS, sebagian besar terkonsentrasi pada gen protein nonstruktural, sedangkan
27

mutasi telah ditemukan pada gen yang mengkode protein S lonjakan virus yang bertanggung jawab
atas reseptor

mengikat dan entri sel.8 Mutasi ini mungkin menjelaskan patogenisitas yang lebih rendah dari SARS-

CoV-2 dari SARS-CoV, tetapi studi lebih lanjut diperlukan. 9

PATOGENISITAS

Mengumpulkan bukti berdasarkan analisis genom menunjukkan bahwa SARS-CoV-2 memiliki hal yang
sama

reseptor sel manusia dengan SARS-CoV, enzim pengonversi angiotensin 2 (ACE2), sedangkan MERS-
CoV

menggunakan dipeptidyl peptidase 4 (DPP4) untuk masuk ke dalam sel inang (Tabel 1) .15 Sudah
diketahui bahwa

SARS-CoV muncul sebagai patogen manusia berkat mutasi yang menguntungkan pada ikatan reseptor
domain (RBD) dari protein S, yang meningkatkan patogenisitasnya dengan memperkuat afinitasnya
terhadap

reseptor; oleh karena itu diasumsikan bahwa SARS-CoV-2 memiliki perilaku yang serupa.15 Namun,
dalam

SARS-CoV-2 tidak ada pengganti asam amino yang hadir dalam RBD yang langsung berinteraksi
dengan manusia

reseptor ACE2 dibandingkan dengan SARS-CoV, tetapi enam mutasi terjadi di daerah lain di Asia

RBD.8 Peran substitusi semacam itu pada patogenisitas SARS-CoV-2 harus lebih jauh

diselidiki. Analisis afinitas reseptor menunjukkan bahwa SARS-CoV-2 mengikat ACE2 lebih efisien
daripada

strain SARS-CoV 2003, meskipun kurang efisien dibandingkan strain 2002. 15 Selain itu, sudah
telah diprediksi bahwa mutasi nukleotida tunggal pada RBD SARS-CoV-2, jika terjadi, dapat lebih jauh

meningkatkan patogenisitasnya.15

ACE2 adalah ektoenzim yang ditambatkan ke membran plasma sel beberapa jaringan,

terutama saluran pernapasan bawah, jantung, ginjal, dan saluran pencernaan.16 Inokulasi

2019-nCoV ke lapisan permukaan sel epitel saluran napas manusia secara in vitro menyebabkan efek
sitopatik

dan penghentian gerakan silia.17 SARS-CoV sangat bereplikasi dalam tipe I dan II

pneumosit dan enterosit, dan regulasi down-regulasi reseptor ACE2 yang diinduksi oleh SARS di

epitel paru berkontribusi terhadap patogenesis cedera paru akut dan ARDS berikutnya.16,18

harus diselidiki lebih lanjut jika afinitas reseptor yang lebih tinggi dari SARS-CoV-2 dari SARS-CoV
untuk ACE2

dapat menyebabkan keterlibatan paru yang lebih parah pada COVID-19 dibandingkan pada SARS.

TRANSMISSIBILITAS

Angka reproduksi (R0) dari infeksi baru diperkirakan oleh Organisasi Kesehatan Dunia

(WHO) berkisar antara 2 dan 2.5, yang lebih tinggi dari SARS (1.7-1.9) dan MERS (<1), menyarankan

bahwa SARS-CoV-2 memiliki potensi pandemi yang lebih tinggi.19–23 Namun, perlu dicatat bahwa
beberapa di antaranya

penelitian yang diterbitkan memperkirakan R0 untuk SARS mencapai nilai 4,24 Menariknya, baru-baru
ini
Ulasan oleh Liu dan rekannya menunjukkan bahwa jumlah reproduksi rata-rata SARS-CoV-2 adalah

diperkirakan 3,28, dengan nilai median 2,79, sehingga melebihi perkiraan WHO.25

Meskipun demikian, pada Tabel 1 kami hanya melaporkan data WHO, karena estimasi R0 tergantung
pada

metode estimasi yang digunakan dan estimasi saat ini dapat bias dengan data yang tidak mencukupi
dan singkat

waktu permulaan penyakit, seperti Liu dan rekan juga nyatakan.

Menurut penelitian deskriptif besar baru-baru ini yang dilakukan oleh Pusat Pengendalian Penyakit China

dan Pencegahan (CCDC) pada 44.672 orang yang didiagnosis dengan COVID-19 di Cina, tingkat kematian

infeksi coronavirus baru diperkirakan 2,326, lebih rendah dari SARS (9,5%) dan jauh lebih rendah
daripada

MERS (34,4%). 5,27 Menariknya, menurut CCDC, tingkat kematian kasus di provinsi Hubei,
di mana epidemi telah dimulai, adalah 7 kali lipat lebih tinggi dari provinsi lain.26 Ini bisa terkait dengan

fakta bahwa, di antara 44.672 kasus yang dilaporkan oleh CCDC, 10.667 (14,6%) kasus didiagnosis

hanya secara klinis dan eksklusif di provinsi Hubei. Karena itu, tidak dapat dikecualikan secara klinis

diagnosis didiagnosis dengan gambaran klinis yang lebih parah, sehingga meningkatkan kasus
kematian

rate.26 Setelah perubahan definisi kasus, jumlah kasus meningkat karena dimasukkannya

kasus terakumulasi selama beberapa minggu terakhir. Pertanyaannya adalah: apakah kasus-kasus
ringan terdaftar sama sekali? Itu bukan

masalah kecil, karena termasuk kasus-kasus ringan akan mengurangi tingkat kematian. Memang,
jumlah

yang terinfeksi di luar Cina saat ini 24.727 dengan 484 hasil fatal, dan tingkat kematian

1,9% 1. Yang menarik, tingkat fatalitas infeksi coronavirus baru meningkat hingga perkiraan

14% ketika mempertimbangkan hanya kasus rawat inap, mencapai tingkat fatalitas kasus SARS
keseluruhan itu

diperkirakan sekitar 15% .28,29

FITUR KLINIS

Hingga saat ini, data klinis lengkap tentang COVID-19 telah dilaporkan untuk 458 kasus di Australia
Sastra berbahasa Inggris, yang 415 dari provinsi Hubei di Cina 2-4,30, 17 di Cina lainnya

provinsi31,32, 25 di Korea33,34 dan 1 di USA35. Pada Tabel 2 karakteristik klinis utama dari

tiga seri kasus COVID-19 yang paling signifikan didaftar dan dibandingkan dengan yang paling banyak

data terakhir yang tersedia tentang SARS dan MERS. Usia rata-rata kasus COVID-19 berkisar dari

49 hingga 57 tahun, mirip dengan SARS dan MERS, lebih tinggi pada mereka yang dirawat di ICU;
hingga 50% pasien

melaporkan penyakit komorbid kronis dalam persentase yang sedikit lebih rendah dibandingkan dengan
pasien yang didiagnosis

dengan MERS. Gejala penyajian yang paling umum adalah demam, diikuti oleh batuk, sakit
tenggorokan dan

dispnea; semua pasien yang terinfeksi memiliki setidaknya satu gejala. Namun, menurut CCDC

melaporkan, 81% kasus memiliki gejala ringan dan 1,2% tidak menunjukkan gejala.26

Temuan laboratorium pada pasien yang didiagnosis dengan COVID-19 tidak jauh berbeda dari itu

didiagnosis dengan infeksi coronavirus lainnya, dengan limfopenia sebagai temuan paling umum,
bersama-sama dengan jumlah trombosit yang rendah, penurunan kadar albumin dan peningkatan
aminotransferase,

dehidrogenase laktat, kreatin kinase, dan kadar protein C-reaktif. Tidak ada data tersedia di

tingkat subpopulasi limfosit, tetapi dapat menarik untuk mengetahui apakah virus terkait

limfopenia mempengaruhi subpopulasi CD4 + dan CD8 + dengan cara yang berbeda, untuk
memprediksi kemungkinan

pengembangan infeksi bakteri atau infeksi oportunistik, yang saat ini telah terjadi

dilaporkan dalam sejumlah kecil kasus sampai saat ini.2

Presentasi radiologis COVID-19 tidak jauh berbeda dari dua coronavirus lainnya.

terkait pneumonia, meskipun proporsi kasus dengan temuan bilateral tampaknya

lebih tinggi pada COVID-19 kasus. Temuan CT yang paling umum pada COVID-19 adalah paru bilateral

lesi paru parenkim, konsolidasi, atau “pengerasan gila”, seringkali dengan a

bentuk bulat dan distribusi perifer.36 Menariknya, dalam penelitian terbaru pada 167 pasien

dari provinsi Hubei dengan dugaan COVID-19 yang menjalani CT scan dada dan usap pernafasan

untuk mendeteksi SARS-CoV-2, lima subjek (3%) memiliki CT scan yang sangat sugestif
COVID-19, tetapi reaksi polimerase real-time (RT-PCR) awalnya negatif. Pasien-pasien ini

diisolasi untuk pneumonia COVID-19 yang diperkirakan dan swab pernapasan diulangi antara 2 dan 8

hari kemudian berubah positif.37

Pasien yang didiagnosis dengan COVID-19 mungkin memiliki perjalanan klinis yang tidak
menguntungkan dengan timbulnya

dispnea dalam 5 hari, ARDS dalam 8 hari pada 30% kasus dan kebutuhan mekanik invasif

ventilasi dan oksigenasi membran ekstrakorporeal (ECMO) pada 17% dan 4% kasus,

masing-masing.3 Temuan ini sejalan dengan persentase SARS, sementara perjalanan klinis MERS

tampaknya ditandai oleh perkembangan ARDS yang lebih sering dan membutuhkan kehidupan invasif

mendukung, terutama pada usia lanjut dan perokok. Khususnya, cedera ginjal akut (AKI), yang jarang
terjadi

terjadi pada SARS dan COVID-19, tampaknya merupakan komplikasi khas MERS. Meskipun ini bisa
jadi

dijelaskan oleh efek sitopatik ginjal langsung yang disebabkan oleh virus, karena reseptor DDP4
sebagian besar diwakili dalam tubulus dan glomeruli, tampaknya lebih mungkin bahwa persentase AKI
yang tinggi

dilaporkan disebabkan oleh kegagalan multi-organ, yang terjadi lebih sering pada MERS daripada yang
lain

infeksi coronavirus.39

KESIMPULAN

COVID-19 tampaknya tidak jauh berbeda dari SARS mengenai fitur klinis; sepertinya begitu

kurang mematikan dibandingkan MERS, yang kurang terkait dengan dua coronavirus lainnya baik dari
segi

fitur filogenetik dan patogenesis.

COVID-19 umumnya memiliki gambaran klinis yang kurang parah, dan dengan demikian dapat
menyebar di masyarakat

lebih mudah daripada MERS dan SARS, yang telah sering dilaporkan dalam pengaturan nosokomial.

Pengetahuan sebelumnya yang dipelajari dari pelajaran SARS dan MERS mungkin telah berkontribusi
pada

lembaga tindakan pencegahan yang lebih efisien dalam pengaturan kesehatan.

Apa penyebab perbedaan kemampuan untuk menyebar di antara ketiga virus ini? Yang pertama
hipotesis adalah tropisme virus yang berbeda untuk saluran pernapasan, menghasilkan lebih ringan
tetapi sangat

penyakit menular ketika virus bereplikasi di saluran pernapasan bagian atas dan parah

pneumonia dengan potensi penyebaran yang lebih rendah ketika tropisme virus lebih tinggi untuk yang
lebih rendah

saluran pernafasan. Hipotesis ini berasal dari contoh virus influenza, yaitu

virus influenza musiman H1N1 dan H3N2. Mereka lebih disukai mengikat asam sialat alfa 2,6-linked

reseptor pada saluran pernapasan bagian atas, biasanya menyebabkan yang kurang parah tetapi lebih
menular

penyakit daripada flu burung H5N1 atau H7N9, yang lebih disukai mengikat asam sialat alfa 2,3-terkait
dalam

alveoli paru-paru, menyebabkan pneumonia berat.40 Di sisi lain, SARS-CoV-2, SARS-CoV dan

MERS-CoV menggunakan reseptor yang telah ditemukan di pernapasan atas dan bawah

sistem. Terlebih lagi, virus korona manusia lainnya, seperti NL63-CoV, menyebabkan penyakit ringan
sekalipun mereka

mengikat reseptor yang sama dari SARS-CoV-2 dan SARS-CoV5. Jadi, menurut pendapat kami, ada
kemungkinan bahwa dosis inokulum berbeda pada saat infeksi membuat perbedaan dalam hal tingkat
keparahan penyakit; eksposur inokulum berat tampaknya terkait dengan penetrasi yang lebih tinggi di
bagian bawah

saluran pernapasan, memberikan pneumonia berat, sedangkan paparan inokulum yang lebih rendah
memungkinkan virus

hanya mencapai jalan napas atas, menyebabkan infeksi yang lebih ringan.

Viral load lebih tinggi pada saat gejala timbul dan hidung lebih tinggi daripada di tenggorokan

spesimen.41,42 Selanjutnya, pada pasien yang terkena COVID-19, viral load semakin menurun

dalam beberapa hari, mengikuti pola yang berbeda dari SARS, di mana penumpahan tertinggi dicatat

setelah 10 hari sejak timbulnya gejala.41-43 Temuan ini menunjukkan bahwa SARS-CoV-2 dapat
menyebar

lebih mudah di masyarakat daripada SARS bahkan ketika gejala awal ringan atau tidak ada gejala

menyajikan.

Perbedaan dalam virulensi intrinsik dari virus itu sendiri dapat menjelaskan perbedaannya

kapasitas penyebaran. MERS-CoV memiliki mortalitas yang lebih tinggi tetapi kemungkinan
transmisibilitas yang lebih rendah

karena menyebabkan gambaran klinis yang lebih parah daripada COVID-19 dan SARS, yang
membutuhkan rawat inap

lebih sering, sehingga mengurangi penyebaran komunitas infeksi dan meningkatkan

transmisi nosokomial.5,21 Di sisi lain, mortalitas MERS yang lebih tinggi dapat menjadi bias oleh

fakta bahwa data terbesar yang tersedia pada MERS berasal dari pasien yang dirawat di rumah sakit,
dengan demikian

melibatkan gambaran klinis yang lebih parah daripada kasus yang didapat masyarakat. Hipotesis ini adalah

diperkuat oleh pengamatan bahwa, ketika kohort pasien dengan MERS berasal

masyarakat dan bukan dari wabah rumah sakit, angka kematian menurun hingga 10%, seperti yang
terjadi

telah diamati dalam studi kohort yang dilakukan pada tahun 2015 di Arab Saudi.44

Menariknya, meskipun memiliki kesamaan virologi yang tinggi antara SARS-CoV-2 dan SARS-CoV,

gejala gastrointestinal (GI) dan diare tampaknya jauh lebih umum pada SARS

proporsi pasien SARS dengan gejala GI bervariasi di antara penelitian yang berbeda, dari 23% menjadi

70% dalam wabah Toronto dan dalam wabah komunitas Hong Kong, masing-masing.43,45 Seperti

perbedaan dapat dikaitkan dengan fakta bahwa wabah Hong Kong tampaknya berasal dari a
kontaminasi tinja dari kompleks tempat tinggal karena sistem pembuangan limbah yang rusak,
sedangkan Toronto

wabah ini terutama disebabkan oleh transmisi tetesan rumah sakit nosokomial. 43,45 rute GI

penularan juga telah dihipotesiskan untuk MERS-CoV, melalui konsumsi yang terinfeksi

susu unta; Selain itu, transmisi GI telah diperlihatkan dalam model hewan melalui

reseptor DPP4 usus.46 Menurut temuan ini, deteksi yang dilaporkan dari RNA SARS-CoV-2

dalam tinja yang longgar dari pasien US pertama dengan COVID-19 tidak mengejutkan.35 SARS-CoV
bereplikasi di

epitel enterik dengan mengikat reseptor ACE2 dan tidak dapat dikecualikan bahwa SARS-CoV-2

akan berperilaku dengan cara yang sama.18 Ini dapat berkontribusi pada hipotesis bahwa SARS-CoV-2
bisa

juga ditransmisikan melalui rute ini, bersama dengan bukti bahwa SARS-CoV dan MERS-CoV

tetap layak dalam kondisi lingkungan yang dapat memfasilitasi penularan feses-oral.47 Dalam Tabel

3 kami menyediakan sintesis tentang apa yang pasti saat ini tentang COVID-19 dan apa yang perlu
lebih jauh

ditangani.

Kesimpulannya, masih banyak yang perlu diketahui tentang COVID-19, terutama epidemiologisnya

fitur, seperti kematian dan kapasitas penyebaran pada tingkat pandemi. Pelajaran yang kami miliki

dipelajari di masa lalu dari epidemi SARS dan MERS adalah senjata budaya terbaik untuk menghadapi
ini

ancaman global baru.

224

2
2 Asal Temp Menenga Reseptor R0
5
filogenetik at h tuan
pena rumah Tingkat fatalitas
mpun kasus
gan
hewa
n
SARS-CoV- Clade I, Kel Tidak angiotensi 2,3% 2-2.519
2 ela dikenal n- 26
war
klaster mengkonv
IIa ersi
enzim 2
(ACE2)
SARS-CoV Clade I, Kel Musang angiotensi 9,5% 1.7-1.9
ela palem n-
war
klaster mengkonv
IIb ersi
enzim 2
(ACE2)
MERS-CoV Clade II Kel Unta dipeptidil 34,4% 0,7
ela
war
peptidase
4
(DPP4)

2 Tabel 1 - Karakteristik filogenetik, patogenetik dan epidemiologi

2
6
2
2
7
2
2
8

12
229

230
COVID-191–3 SARS45,48–50 MERS38,51,52
Tanggal kemunculan populasi manusia
2019 2002 2012
Jumlah kasus absolut
80 239 80962.260
Demografis dan umum karakteristik,% kasus
Pria 40-60 38-42 59.5-
64
Perempuan 40-55 64-68 35-
40
Penyakit 10-46 8 9.1
kardiovaskular
Penyakit paru-paru 1-2 1-2 10.2
kronis
Diabetes 10 16 18.8
Keganasan 2-4 6 15.5

Demam 81-91 99-100 81.7

-98
Batuk 48-68 57-75 56.9
-83
Dispnea 19-31 40-42 22-
72
Sakit tenggorokan 29 13-25 9.1-
14
Pusing dan 22 4-43 5.4
kebingungan
Diare 16 23-70 19.4
-26
Mual dan muntah 6 20-35 14-
21

Leukopenia 35 33.9 14
Limfopenia 35-72 54-70 32
Trombositopeni 12 44.8 36
a
Tinggi 28-35 23 11-
aminotransferas 40
es
Tanda dan gejala, % kasus

Unit perawatan intensif 24 23-34 53-89

penerimaan
Gangguan Pernafasan 18-30 20 20-30
Temuan laboratorium tentang penerimaan, % kasus
13
 Radiologis temuan dada saat masuk, % kasus
Infiltrat unilateral 10 46-54 14.3-62.6
Menyusup bilateral 84-90 29-45 37.4-75
Tidak ada temuan 14 13-25 4.3-30
Komplikasi, % kasus
229
Akut
Sindroma
Cedera Ginjal Akut 3 6.7 41-50
Kematian di rumah 10-11 3.6-15.7 30-40
sakit
2 Tabel 2 - Karakteristik klinis
3
1
2
3
2
2
3
3

14
234
Fakta tentang COVID-19
SARS-CoV-2 lebih terkait secara filogenetik ke
SARS-CoV daripada ke MERS-CoV.
Hanya sedikit perbedaan yang ditemukan
dalam urutan genom SARS-CoV-2
membandingkan dengan SARS-CoV.
Afinitas SARS-CoV-2 untuk reseptor
angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2)
adalah lebih tinggi dari pada SARS-CoV.
Tingkat kematian COVID-19 lebih rendah
dari itu ditemukan di SARS dan MERS.
SARS-CoV-2 RNA telah terdeteksi di tinja
pasien yang terinfeksi, mirip dengan SARS-
CoV dan MERS-CoV.
1,2% dari COVID-19 kasus tidak menunjukkan
gejala.
COVID-19 tidak jauh berbeda dari SARS dan
MERS mengenai karakteristik demografis,
temuan laboratorium dan radiologis.
Komplikasi klinis pada COVID-19 sama
seringnya dengan SARS, tetapi lebih jarang
daripada pada MERS.
Viral load pada pasien COVID-19 lebih tinggi
waktu timbulnya gejala dan semakin
menurun selama perjalanan klinis penyakit.
235 Tabel 3 - Fakta dan masalah terbuka tentang COVID-19
236
Pertanyaan perlu dinilai lebih lanjut
Yang merupakan peran substitusi asam amino
pada domain pengikatan reseptor SARS-CoV-
2 dalam hal patogenesis?
Apakah afinitas SARS-CoV-2 lebih tinggi dari
SARS-CoV untuk reseptor angiotensin-
converting enzyme 2 (ACE2) berimplikasi
pada komplikasi pernapasan?
Merupakan rute penularan fecal-oral
mungkin untuk COVID-19?
Yang merupakan peran COVID
asimptomatik 19 kasus dalam epidemiologi
penyakit?
Yang merupakan dasar sebenarnya
COVID-19 nomor reproduksi (R0)?
Apakah perbedaan dalam kinetika virus
dalam saluran pernapasan bertanggung
jawab atas berbagai potensi penyebaran
COVID-19, SARS dan MERS?
14
237

238

DEKLARASI TRANSPARANSI

• Konflik pengungkapan kepentingan: penulis tidak memiliki konflik kepentingan untuk diungkapkan.

• Pendanaan: tidak ada dana eksternal yang diterima.

• Ucapan Terima Kasih: pekerjaan yang didukung oleh Ricerca Corrente, IRCCS.

• Kontribusi: NP dan GV berkontribusi untuk pencarian literatur dan penulisan makalah. EP, OE dan GI

merevisi naskah dan memberikan pendapat akhir mereka untuk konten intelektualnya.

15
251

252

253

254 REFERENSI

255

1. Organisasi Kesehatan Dunia. Laporan Penyakit Coronavirus 2019 (COVID-19) -48, 08

Maret 2020. Tersedia dari: https: //www.who.int/docs/default-

sumber / coronaviruse / situasi-laporan / 20200308-sitrep-48-covid-19.pdf? sfvrsn = 16f7ccef_4

2. Chen N, Zhou M, Dong X, dkk. Karakteristik epidemiologis dan klinis dari 99 kasus

2019 novel coronavirus pneumonia di Wuhan, Cina: sebuah studi deskriptif. Lancet (London,

Inggris). 2020; 0 (0). doi: 10.1016 / S0140-6736 (20) 30211-7

3. Wang D, Hu B, Hu C, dkk. Karakteristik Klinis dari 138 Pasien Rawat Inap Dengan 2019

Novel Pneumonia-Infected Corona di Wuhan, Cina. JAMA. Februari 2020.

doi: 10.1001 / jama.2020.1585

4. Liu K, Fang YY, Deng Y dkk. Karakteristik klinis kasus baru coronavirus pada tersier

rumah sakit di Provinsi Hubei. Chin Med J (Engl). 2020. doi: 10.1097 / CM9.0000000000000744

5. Munster VJ, Koopmans M, van Doremalen N, van Riel D, de Wit E. A Novel Coronavirus

Emerging in China - Pertanyaan Kunci untuk Penilaian Dampak. N Engl J Med. Januari

2020: NEJMp2000929. melakukani: 10.1056 / NEJMp2000929

6. Chen Y, Liu Q, Guo D. Virus korona yang muncul: Struktur genom, replikasi, dan

patogenesis. J Med Virol. Februari 2020: jmv.25681. doi: 10.1002 / jmv.25681

7. Malik YS, Sircar S, Bhat S, dkk. Novel baru Coronavirus (2019-nCoV) - Skenario saat ini,

perspektif evolusi berdasarkan analisis genom dan perkembangan terkini. Dokter hewan Q.

Februari 2020: 1-12. doi: 10.1080 / 01652176.2020.1727993

16
8. Wu A, Peng Y, Huang B, dkk. Komposisi dan Divergensi Genom Komentar

Novel Coronavirus (2019-nCoV) Berasal dari Cina. Tuan Sel Mikroba. Februari 2020: 1-4.

doi: 10.1016 / j.chom.2020.02.001

9. Benvenuto D, Giovanetti M, Ciccozzi A, Spoto S, Angeletti S, Ciccozzi M. The 2019-new

epidemi coronavirus: Bukti untuk evolusi virus. J Med Virol. Februari 2020: jmv.25688.

doi: 10.1002 / jmv.25688

10. Fuk-Woo Chan J, Yuan S, Kok KH, et al. Sekelompok keluarga pneumonia yang terkait dengan

2019 novel coronavirus yang menunjukkan penularan dari orang ke orang: sebuah studi keluarga

ckilau. Lancet. 2020; 0 (0). doi: 10.1016 / S0140-6736 (20) 30154-9

11. Chan JF-W, Kok KH, Zhu Z, dkk. Karakterisasi genom dari novel 2019 manusia-

coronavirus patogen diisolasi dari pasien dengan pneumonia atipikal setelah mengunjungi

Wuhan. Emerg Microbies Menginfeksi. 2020; 9 (1): 221-236. doi: 10.1080 / 22221751.2020.1719902

12. Wu A, Peng Y, Huang B, dkk. Komposisi Genom dan Divergensi Novel

Coronavirus (2019-nCoV) Berasal dari Cina. Tuan Sel Mikroba. Februari 2020.

doi: 10.1016 / j.chom.2020.02.001

13. Lu R, Zhao X, Li J, dkk. Karakterisasi dan epidemiologi genomik novel 2019

coronavirus: implikasi untuk asal virus dan pengikatan reseptor. Lancet (London, Inggris).

2020; 0 (0). doi: 10.1016 / S0140-6736 (20) 30251-8

14. Paraskevis D, Kostaki EG, Magiorkinis G, Panayiotakopoulos G, Sourvinos G, Tsiodras S. Full-

analisis evolusi genom virus corona baru (2019-nCoV) menolak hipotesis tersebut

kemunculan sebagai akibat dari acara rekombinasi baru-baru ini. Genet Evol tidak sempurna.

2020; 79: 104212. doi: 10.1016 / j.meegid.2020.104212

15. Wan Y, Shang J, Graham R, Baric RS, Li F. Pengakuan reseptor oleh coronavirus baru dari

Wuhan: Analisis berdasarkan studi struktural selama satu dekade tentang SARS. J Virol. Januari 2020.

17
299 doi: 10.1128 / JVI.00127-20

300 16. Imai Y, Kuba K, Ohto-Nakanishi T, Penninger JM. Angiotensin-Converting Enzyme 2 (ACE2)
di

Disease Patogenesis. Circ J. 2010; 74 (3): 405-410. doi: 10.1253 / circj.CJ-10-0045

17. Zhu N, Zhang D, Wang W, dkk. Novel Coronavirus dari Pasien dengan Pneumonia di Indonesia

Tiongkok, 2019. N Engl J Med. Januari 2020. doi: 10.1056 / nejmoa2001017

18. Hamming I, Timens W, Bulthuis MLC, Lely AT, Navis GJ, van Goor H. Jaringan distribusi

Protein ACE2, reseptor fungsional untuk coronavirus SARS. Langkah pertama dalam pemahaman

Patogenesis SARS. J Pathol. 2004; 203 (2): 631-637. doi: 10.1002 / path.1570

19. Laporan Misi Bersama WHO-China tentang Penyakit Coronavirus 2019 (COVID-19), 16-24

Februari 2020. Tersedia dari: https: //www.who.int/docs/default-

source / coronaviruse / who-china-joint-mission-on-covid-19-final-report.pdf. Diakses Maret

09, 2020.

20. Li Q, Guan X, Wu P, dkk. Dinamika Transmisi Awal di Wuhan, Cina, dari Novel

Pneumona yang Terinfeksi Coronavirus. N Engl J Med. Januari 2020: NEJMoa2001316.

doi: 10.1056 / NEJMoa2001316

21 Chen J. Patogenisitas dan Transmisibilitas 2019-nCoV-A Tinjauan Singkat dan Perbandingan

dengan Virus Muncul Lainnya. Mikroba Menginfeksi. Februari 2020.

doi: 10.1016 / j.micinf.2020.01.004

22. Wu JT, Leung K, Leung GM. Sekarang menyiarkan dan memperkirakan potensi domestik dan

penyebaran internasional wabah 2019-nCoV yang berasal dari Wuhan, Cina: seorang pemodelan

319 belajar. Lancet (London, Engtanah). Januari 2020 doi: 10.1016 / S0140-6736 (20) 30260-9

320 23. Liu T, Hu J, Kang M, dkk. Dinamika transmisi 2019 novel coronavirus (2019-nCoV).

bioRxiv. Januari 2020: 2020.01.25.919787. doi: 10.1101 / 2020.01.25.919787

24. CT Bauch, Lloyd-Smith JO, Anggota Parlemen Kopi, Galvani AP. Memodelkan SARS dan Lainnya
secara dinamis
Penyakit Pernafasan Yang Baru Timbul. Epidemiologi. 2005; 16 (6): 791-801.

doi: 10.1097 / 01.ede.0000181633.80269.4c

25. Liu Y, Gayle AA, Wilder-Smith A, Rocklöv J. Jumlah reproduksi COVID-19 lebih tinggi

dibandingkan dengan coronavirus SARS. J Travel Med. Februari 2020. doi: 10.1093 / jtm / taaa021

26. Karakteristik Epidemiologis Wabah Penyakit Coronavirus Novel 2019

(COVID-19) - China, 2020. China CDC Wkly. 2020; 8 (2): 113-122.

http://weekly.chinacdc.cn/en/article/id/e53946e2-c6c4-41e9-9a9b-fea8db1a8f51. Diakses

20 Februari 2020.

27. Chen J. Patogenisitas dan Transmisibilitas 2019-nCoV-A Tinjauan Singkat dan Perbandingan

dengan Virus Muncul Lainnya. Mikroba Menginfeksi. Februari 2020.

doi: 10.1016 / j.micinf.2020.01.004

28. Wu P, Hao X, Lau EHY, dkk. Penilaian tentatif waktu-nyata epidemiologis

karakteristik infeksi coronavirus baru di Wuhan, Cina, pada 22 Januari 2020.

Eurosurveillance. 2020; 25 (3): 2000044. doi: 10.2807 / 1560-7917.ES.2020.25.3.2000044

29. Organisasi Kesehatan Dunia, Departemen Pengawasan Penyakit Menular dan

Tanggapan. Dokumen Konsensus tentang Epidemiologi Pernafasan Akut Parah

Sindrom (SARS), 16-17 Mei 2003.

30. Huang C, Wang Y, Li X, dkk. Gambaran klinis pasien yang terinfeksi novel 2019

341 coronavirus di Wuhan , Chdi sebuah. Lancet. 2020; 6736 (20): 1-10. doi: 10.1016 / S0140-

6736 (20) 30183-5

31. Wang Z, Chen X, Lu Y, Chen F, Karakteristik klinis dan prosedur terapi Zhang W.

untuk empat kasus dengan 2019 novel pneumonia coronavirus yang menerima kombinasi Cina dan

Perawatan obat barat. doi: 10.5582 / bst.2020.01030

32. Chang D, Lin M, Wei L, dkk. Karakteristik Epidemiologis dan Klinis Novel Coronavirus
Infeksi Melibatkan 13 Pasien Di Luar Wuhan, Cina. JAMA. Februari 2020.

doi: 10.1001 / jama.2020.1623

33. Kim JY, Choe PG, Oh Y, et al. Kasus Pertama dari 2019 Novel Coronavirus Pneumonia Diimpor

ke Korea dari Wuhan, Cina: Implikasi untuk Pencegahan dan Pengendalian Infeksi. J

Sci Med Korea. 2020; 35 (5): e61. doi: 10.3346 / jkms.2020.35.e61

34. Ki M, -nCoV TFF. Karakteristik epidemiologis dari kasus awal dengan 2019 novel coronavirus

(2019-nCoV) penyakit di Republik Korea. Kesehatan Epidemiol. 2020: e2020007.

doi: 10.4178 / epih.e2020007

35. Holshue ML, DeBolt C, Lindquist S, dkk. Novel Pertama Kasus 2019 Novel Coronavirus di Amerika

Serikat. N Engl J M.ed. Januari 2020: NEJMoa2001191. melakukani: 10.1056 / NEJMoa2001191

36. Chung M, Bernheim A, Mei X, dkk. Fitur Pencitraan CT 2019 Novel Coronavirus (2019-

ncov). Radiologi. Februari 2020: 200230. doi: 10.1148 / radiol.2020200230

37. Xie X, Zhong Z, Zhao W, Zheng C, Wang F, Liu J. Chest CT untuk Pneumonia Khas 2019-nCoV:

Hubungan dengan Pengujian RT-PCR Negatif. Radiologi. Februari 2020: 200343.

361 doi: 10.1148 / radiol.2020200343

362 38. Azhar EI, Hui DSC, Memish ZA, Drosten C, Zumla A. Sindrom Pernafasan Timur Tengah

(MERS). Infect Dis Clin North Am. 2019; 33 (4): 891-905. doi: 10.1016 / j.idc.2019.08.001

39. Cha RH, Joh JS, Jeong I, dkk. Komplikasi Ginjal dan Prognosisnya pada Pasien Korea

dengan Sindrom Pernafasan Timur Tengah-Coronavirus dari Central MERS-CoV

Rumah Sakit yang Ditunjuk. J Korea Sci Med. 2015; 30 (12): 1807-1814.

doi: 10.3346 / jkms.2015.30.12.1807

40. Yang W, Punyadarsaniya D, Lambertz RLO, dkk. Mutasi selama Adaptasi H9N2

Virus Avian Influenza ke Epitel Pernafasan Babi Meningkatkan Pengikatan Asam Sialat

Aktivitas dan Virulensi pada Tikus. J Virol. 2017; 91 (8). doi: 10.1128 / jvi.02125-16
41. Kim JY, Ko JH, Kim Y, et al. Viral Load Kinetics Infeksi SARS-CoV-2 pada Dua Pasien Pertama

di Korea. J Korea Sci Med. 2020; 35 (7). doi: 10.3346 / jkms.2020.35.e86

42. Zou L, Ruan F, Huang M, dkk. Viral load SARS-CoV-2 pada Spesimen Pernafasan Bagian Atas

Pasien yang terinfeksi. N Engl J Med. Februari 2020: NEJMc2001737.

doi: 10.1056 / NEJMc2001737

43. Peiris JSM, Chu CM, Cheng VCC, dkk. Perkembangan klinis dan viral load dalam suatu komunitas

KLB pneumonia yang berhubungan dengan coronavirus: Sebuah studi prospektif. Lanset.

2003; 361 (9371): 1767-1772. melakukani: 10.1016 / S0140-6736 (03) 13412-5

44. Bleibtreu A, Bertine M, Bertin C, Houhou-Fidouh N, Visseaux B. Fokus pada Timur Tengah

coronavirus syndrome pernafasan (MERS-CoV). Médecine Mal Menginfeksi. November 2019.

381 doi: 10.1016 / j.medmal.2019.10.004

382 45. Booth CM. Gambaran Klinis dan Hasil Jangka Pendek dari 144 Pasien Dengan SARS di
RSUP Dr

Greater Toronto Daerah. JAMA. 2003; 289 (21): 2801. doi: 10.1001 / jama.289.21.JOC30885

46. Zhou J, Li C, Zhao G, et al. Saluran usus manusia berfungsi sebagai rute infeksi alternatif

Koronavirus sindrom pernapasan Timur Tengah. Sci Adv. 2017; 3 (11): eaao4966.

doi: 10.1126 / sciadv.aao4966

47. Yeo C, Kaushal S, Yeo D. Keterlibatan enterik dari virus corona: adalah transmisi faecal-oral dari

SARS-CoV-2 halmungkin? Lancet Gastroenterol Hepatol. 2020; 0 (0). doi: 10.1016 / S2468-

389 1253 (20) 30048-0

390 48. Hui DSC, Zumla A. Sindrom Pernafasan Akut Parah. Infect Dis Clin North Am.

391 2019; 33 (4): 869-889. doi: 10.1016 / j.idc.2019.07.001

392 49. Lee N, Hui D, Wu A, dkk. Wabah Besar Sindrom Pernafasan Akut Parah di Hong

Kong. N Engl J M.ed. 2003; 348 (20): 1986-1994. melakukani: 10.1056 / NEJMoa030685

50. Chu KH, Tsang WK, Tang CS, dkk. Gangguan ginjal akut terkait coronavirus parah
sindrom pernapasan akut. Kidney Int. 2005; 67 (2): 698-705. doi: 10.1111 / j.1523-

1755.2005.67130.x

51. Choi WS, Kang CI, Kim Y, et al. Presentasi dan Hasil Klinis dari Timur Tengah

Sindrom pernapasan di Republik Korea. Chemothera Infeksi. 2016; 48 (2): 118.

doi: 10.3947 / ic.2016.48.2.118

52. Saad M, Omrani AS, Baig K, dkk. Aspek klinis dan hasil dari 70 pasien dengan Menengah

Infeksi coronavirus sindrom pernafasan timur: Pengalaman pusat tunggal di Arab Saudi.

402 Int J Infect Dis. 2014; 29: 301-306. doi: 10.1016 / j.ijid.2014.09.003

403

404

405