Dalam menjalankan kewenangannya agar lebih efektif dan effisien maka diangkatlah pembatu presiden, yaitu seorang menteri yang membidangi urusan tertentu dalam pemerintahan.
1. Menteri Koordinator, yang bertugas melakukan sinkronisasi dan koordinasi urusan
kementrian yang ada didalam ruang lingkup tugasnya. A. Mentko Polhukam ; Mahfud MD a. Menteri Dalam Negeri b. Menteri Hukum dan HAM c. Menteri Luar Negeri d. Menteri Pertahanan e. Menteri Komunilasi dan Informatika B. Menko Perekonomia ; Airlangga Hartanto a. Menteri Keuangan b. Menteri Ketenagakerjaan c. Menteri Perindustrian d. Menteri Perdagangan e. Menteri Pekerjaan Umum dan Perumahan Rakyat f. Menteri Pertanian g. Menteri Lingkungan Hidup dan Kehutanan h. Menteri Agrarian dan Tata Ruang/BPN i. Menteri BUMN j. Menteri Koperasi dan UKM C. Menko PMK/ Pembangunan Manusia dan Kebudayaan ; Muhajir Effendy a. Menteri Agama b. Menteri Pendidikan dan Kebudayaan c. Menteri Riset dan Teknologi d. Menetri Kesehatan e. Menteri Sosial f. Menteri Desa, Pembangunan Daerah Tertinggal, dan Transmigrasi g. Menteri Pemberdayaan Perempuan dan Perlindungan Anak h. Menteri Pemuda dan Olah Raga D. Menko Kemaritiman dan Investasi ; Luhut BP a. Menteri Energi dan Sumber Daya Mineral b. Menteri Perhubungan c. Menteri Kelauatan dan Perikanan d. Menteri Pariwisata dan Ekonomi Kreatif. 2. Pejabat Negara setingkat Menteri; A. Jaksa Agung B. Panglima TNI C. Kapolri D. Sekretaris Kabinet 3. Lembaga Non Pemerintahan, yang diberikan hak keuangan, administrasi, dan fasilitas setingkat menteri ; A. Kepala BIN B. Kepala Badan Koordinasi Penanaman Modal.
4. Kepala Lembaga Nonstruktural, yang diberikan hak keuangan, administrasi, dan
fasilitas setingkat menteri ; A. Kepala Staf Kepresidenan B. Kepala Badan Pembinaan Ideologi Pancasila
LEMBAGA PEMERINTAH NON-KEMENTERIAN
Lembaga tersebut, sebelumnya dikenal sebagai Lembaga Pemerintah Non-Departemen.
LPNK merupakan lembaga negara yang dibentuk untuk membantu presiden dalam melaksanakan tugas pemerintahan tertentu. Lembaga Pemerintahan Non-Kementerian berada di bawah presiden dan bertanggung jawab langsung kepada presiden melalui menteri atau pejabat setingkat menteri lainnya; a. Arsip Nasional Republik Indonesia, di nawah koornidnasi Menteri Pendayagunaan Aparatur Negara dan Reformasi Birokrasi. b. Badan Informasi Geospasial (BIG) c. Badan Intelijen Negara (BIN) d. Badan Kepegawaian Negara (BKN), di bawah koordinasi Menteri Pedayagunaan Aparatur Negara dan Reformasi Birokrasi. e. Badan Kependudukan dan Keluarga Bencana Nasional (BKKBN), di bawah koordinasi Menteri Pemberdayaan Perempuan dan Perlindungan Anak. f. Badan Koordinasi Penanaman Modal (BKPM), di bawah koordinasi Menteri Koordinator Bidang Perekonomian. g. Badan Meteorologi, Klimatologi, dan Geofisika (BMKG) h. Badan Narkotika Nasional (BNN) i. Badan Nasional Penanggulangan Bencana (BNBP) j. Badan Nasional Penanggulangan Terorisme (BNPT) k. Badan Nasional Penempatan dan Perlindungan Tenaga Kerja Indonesia (BNP2TKI) l. Badan Pengawas Obat dan Makanan (BPOM), di bawah koordinasi Menteri Kesehatan m. Badan Pengawas Tenaga Nuklir (BAPETEN), di bawah koordinasi Menteri Riset, Teknologi, dan Pendidikan Tinggi. n. Badan Pengawas Keuangan dan Pembangunan (BPKP) o. Badan Pengendalian Dampak Lingkungan (BAPEDAL), di bawah koordinasi Menteri Riset dan Teknologi. p. Badan Pengkajian dan Penerapan Teknologi (BPPT), di bawah koordinasi Menteri Riset dan Teknologi. q. Badan Perencanaan Pembangunan Nasional (BAPPENAS), di bawah koordinasi Menteri Koordinator Bidang Perekonomian. r. Badan Pertanahan Nasional (BPN), di bawah koordinasi Menteri Dalam Negeri. s. Badan Pusat Statistik (BPS), di bawah koordinasi Menteri Bidang Perekonomian. t. Badan SAR Nasional (BASARNAS) Badan Standardisasi Nasional (BSN), di bawah koordinasi Menteri Riset dan Teknologi. u. Badan Tenaga Nuklir Nasional (BATAN), di bawah koordinasi Menteri Riset dan Teknologi. v. Badan Urusan Logistik (BULOG), di bawah koordinasi Menteri Koordinator Bidang Perekonomian. w. Lembaga Administrasi Negara (LAN), di bawah koordinasi Menteri Pendayagunaan Aparatur Negara dan Reformasi Birokrasi. x. Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia (LIPI), di bawah koordinasi Menteri Riset dan Teknologi. y. Lembaga Ketahanan Nasional (LEMHANAS) Lembaga Kebijakan Pengadaan Barang/Jasa Pemerintah (LKPP) z. Lembaga Penerbangan dan Anatariksa Nasional (LAPAN), di bawah koordinasi Menteri Riset dan Teknologi aa. Lembaga Sandi Negara (LEMSANEG), di bawah koordinasi Menteri Koordinator Bidang Politik, Hukum, dan Keamanan. bb. Perpustakaan Nasional Republik Indonesia (PERPUSNAS), di bawah koordinasi Menteri Pendidikan dan Kebudayaan.