IDENTIFIKASI MIKROBA

SECARA MOLEKULAR
 IDENTIFIKASI BERBASIS FENOTIP
VS GENOTIP
FENOTIP GENOTIP
hasil ekspresi materi genetik materi genetik

Morfologi DNA
Pewarnaan RNA
Biokimia
Uji sensitivitas
antibiotik
Uji imunobiologi
Identifikasi dengan
Metode
Konvensional
vs Molekular
IDENTIFIKASI DENGAN PEWARNAAN
IDENTIFIKASI DENGAN UJI BIOKIMIA, SENSITIVITAS
ANTIBIOTIK DAN REAKSI IMUNOLOGI

Reaksi Imunologi
(Kompleks Amtigen-
Antibodi)
 CARL WOESE, 1977 :
• Pencetus The Three Domain System,
• Yang mengenalkan adanya Archaea (prokariot
yang bukan bakteri),
• Pelopor teknik identifikasi berdasarkan gen
16S ribosomal RNA (16S rRNA) sequence,
yang saat ini sangat populer untuk identifikasi
berbasis molekular.
Skema Identifikasi Bakteri secara Molekuler Berbasis 16S rRNA
ALAT DAN KOMPONEN PCR
PCR
Elektroforesis hasil PCR
CONTOH URUTAN (SEQUENCE) GEN
16S rRNA
(National Center for Biotechnology Information)

NCBI adalah server yang memuat data base tentang

informasi kesehatan dan bioteknologi. Data base terus
menerus di update sesuai dengan penemuan-penemuan
terkini yang menyangkut DNA, Protein, Senyawa aktif dan
taksonomi. Ncbi juga menyediakan berbagai macam
software untuk analisis DNA, protein 3D, pencarian primer,
pencarian conserve doamain dan lain sebagainya.
BLAST
Membuat Pohon Filogenetik
Input Sequence
Klik SUBMIT
Contoh Pohon Filogenetik
SELAMAT MENCOBA