KELOMPOK DIURETIK

- HESTI MONIKASARI (1904010118)

- SHOFA FAUZIAH (1904010116)
- YULIANTI (1904010160)

KELAS: FARMASI D 2019

LOGBOOK PREPARASI LIGAN

NO PROSEDUR LAMPIRAN
1. Buka ChemDraw 2D, lalu
copy-kan ligan.

2. Paste-kan ligan tadi ke

aplikasi MarvinSketch.

3. Klik menu ‘Tools’, lalu klik

‘Protonation’, kemudian klik
‘Major Micropecies.
4. Pastikan pH-nya 7.4, lalu klik
OK.

5. Muncul tampilan
tersebut, lalu klik OK.

6. Muncul tampilan ligan yang

telah di protonasi.

7. Klik kanan pada gambar

struktur, lalku klik save as.
8. Beri nama ligan protonasi
dengan format (.mrv).

9. Buka file format (.mrv) yaitu

file hasil protonasi tadi.

10. Klik menu ‘Tools’, lalu klik

‘conformation’,
kemudian klik
‘conformers’.

11. Muncul tampilan

tersebut, lalu klik OK.
12. Muncul tampilan conformers,
lalu klik ‘file’, kemudian di
klik save as.

13. Beri nama file dengan format

(.mol2).

LOGBOOK VIRTUAL SCREENING

1. Buka aplikasi PyRx

2. Klik menu edit, lalu klik

preferences
3. Set folder kedalam
workspace dan Available
CPUs nya 7, kemudian klik
OK

4. Klik autodock wizard, klik

start kemudian klik add
ligand

5. Blok 50 ligan dengan

menekan ctrl dan mouse
sebelah kanan, klik open

6. Kemudian klik add

macromolecule, pilih file
protein, klik open

7. Klik forward, kemudian

masukkan nilai grid box, klik
run autogrid
8. Kemudian di docking
algaritma menggunakan
metode lamardian GA, klik
docing parameters
9. Kemudian atur GA runs nya
100 dan klik ok

10. Klik run autodock

11. Hasil screening yang di
dapatkan pada 50 senyawa
diuretik