BIOMOLEKULER
VIRUS
Rani Afifah Nur Hestiyani, S.Si., M.Biotech
Mikrobiologi FK Unsoed
Tropmed 2016
REFERENSI
Ryan, J.K. 2004. Sherris Medical
Microbiology, An Introduction of Infectious
disease. 4th Ed. The Mcgraw-Hill
Companies, Inc. US of America.
Jawetz, E., et al., 1992. Mikrobiologi
Kedokteran. Edisi 20. Penerbit Buku
Kedokteran EGC. Jakarta
Cane, J. Alan. 2005. Principles of Molecular
Virology. Elsevier Academic Press.
Dll...
Pokok Bahasan
Pendahuluan
Struktur & Genom virus
Genetika virus
Multiplikasi virus
Patogenesis virus
Pendahuluan (1)
Virus?????
Pendahuluan (2)
Bakteri
Riketsia
Mikoplasm
a
Virus
Viroid
Diameter
300 nm
Pertumbuhan
pada media
buatan
Pembelahan
biner
+c
Asam Nukleat
Infeksius
+a
Ribosom
Metabolisme
Sensitivitas
terhadap
antibiotik
_b
Komponen
Protein
A. Konversi lisogeni
sifat laten bakteriofaga pada sel bakteri disebut lisogeni.
Perubahan
lisogenik terjadi apabila selain protein penekan,
terjadi ekspresi faga lain
sehingga bakteri menjadi virulen.
contoh : antigen O Salmonella dan pembentukan toksin
botulinum,
toksin eritrogenik S. pyogenes (SPE-A, B atau C)
dan toksin difteri
B. Infeksi rekuren
sifat laten pada virus manusia memungkinkan terjadinya
infeksi rekuren. Virus manusia yang laten meliputi
Herpesviridae dan sebagian Arenaviridae.
C. Onkogenesis
Virus laten mungkin berperan dalam pembentukan kanker pada
manusia, melalui :
c.1. pembentukan protein onkogenik dini (HPV)
c.2. insersi DNA yang menyebabkan mutagenesis suatu gen
regulatorik sel dan menyebabkan hilangnya kontrol
pertumbuhan
c.3. Up-regulation, melalui insersi suatu aktivator
transkripsional virus seperti LTR HIV dekat dengan gen manusia
A. Pencampuran fenotip
apabila geometri kepala serupa, maka terbentuk virus
dengan kapsid dari kapsomer hijau dan merah, hanya
satu jenis DNA yang terdapat dalam kapsid
B. Penyamaran fenotip
terjadi apabila terbentuk kapsid yang seluruhnya merah
mengelilingi genom virus hijau, virus ini disebut
composite virus. Cara mendapatkan composite virus
(kapsid dari satu jenis virus dan asam nukleat dari jenis
lain) adalah sel terinfeksi oleh genom kedua jenis virus
REPLIKASI VIRUS
Ada beberapa type replikasi virus:
Virus DNA untai ganda
Linear (herpesvirus, adenovirus,
poxvirus)
Sirkuler (Papovirus)
POX
VIRUS
(DNA
virus)
VIRUS
INFLUENZAE
REPLIKASI PARAMYXOVIRUS
A. Perlekatan, Penetrasi, Uncoating
Perlekatan menggunakan protein
hemaglutinin
Envelop fusi pada membran sel
nukleokapsid masuk
sel.
C. Maturasi
Nukleokapsid terbentuk dalam sitoplasma
budding melalui membran sel yang membawa
Orthomyxovirus Paramyxovirus
Influenza tipe A, B, C
Genome
RNA nukleokapsid
Sensitiv nuklease
Resisten nuklease
Endosom
Membran plasma
Transkripsi
Perubahan genetik
Sangat sering
Jarang terjadi
Frekuensi Perubahan
antigen
Tinggi
Rendah
Inner
Ribonukleoprotein
helix
Diameter 9 nm
Diameter 18 nm
RETROVIR
US
PATOGENESIS VIRUS
INFEKSI VIRUS
PERMUKAA
N
Kulit, faring,
sal
pencernaan
SALURAN
LIMFA
DARAH
ORGAN
TUBUH
Liver, bone marrow,
spleen, endotelium,
ginjal, otak, paru
PERMUKAA
N
Kulit, mukosa
(oral, nasal),
kelenjar ludah
INFEKSI VIRUS
*Permukaan
(kulit, faring, saluran pencernaan)
*Kelenjar Limfa
Darah
*Organ tubuh
(liver, spleen, endothelium,muscle)
Darah
*Target organs
(kulit, mukosa (oral, nasal), kelenjar ludah,
ginjal, otak)
Respon host
Death of organism
Clasical and
severe disease
Moderate severity /
mild illness
Sel
Adsorpsi
Replikasi primer
Penetrasi
Pelepasan selubung
Transkripsi
Translasi
Replikasi sekunder
Replikasi
Kerusakan sel
Penyusunan virion
Persisten
Pelepasan virion
Adsorpsi
Virus berikatan dengan reseptor (104-105 per
sel)pada permukaan sel target.
Pada umumnya reseptor: glikoprotein
Jika virus diadsorbsi pada membran sel
inaktiv (disebut eclipse)
Fusi
Penetrasi langsung
vesikel
lisosom
Direct fusion
Viropexis
(receptormediated
endocytosis
)
Route of infect
Virus family
Example
Skin
Minor breaks
Papovirus
Herpesviridae
Hepadnaviridae
Papiloma virus
HSV-1
Hepatitis B
Animal bite
Vector bite
(mechan)
Vector bite
(biologic)
Injection
Rhabdoviridae
Poxviridae
Flaviviridae
Flaviviridae
Retroviridae
Hepadnaviridae
Herpesviridae
Rabies
Rabbit myxoma
Yellow fever
Hepatitis C
HIV
Hepatitis B
Cytomegalovirus
Conjunctiva
Contact
Adenoviridae
Adenovirus
Genital tract
Contact
Flaviviridae
Retroviridae
Papoviridae
Hepadnaviridae
Herpesviridae
Hepatitis C
HIV
Papillomavirus
Hepatitis B
Herpes simplex 2
Localization of
disease
Virus family
Example
Gastrointeritis
Calciviridae
Rotaviridae
Adenoviridae
Norwalk
Rotavirus
Adenovirus 40, 41
No enteric illness
Picornaviridae
Poliovirus
Enterovirus
Hapatitis A
Hepatitis E
Calciviridae
Example
Picornaviridae
Adenoviridae
Rhinovirus
Adenovirus
Orthomyxoviridae
Paramyxoviridae
Influenza
Respiratory syncytial
No respiratory illness
Togaviridae
Paramyxoviridae
Bunyaviridae
Reoviridae
Herpesviridae
Poxviridae
Rubella
Mumps
Hantavirus
Reovirus
Varicella zoster
Variola
Replikasi virus
Virus menginveksi sel replikasi
infeksi lokal / infeksi sistemik
VIRUS
PRIMARY REPLIC.
SECONDARY
REPLIC.
LOCALIZED
INFECTION
Rhinovirus
Rotavirus
Intestinal
epithelium
Papilomavirus
Epidermis
SYSTEMIC
INFECTION
Enterovirus
Intestinal
epithelium
Lymphoid tissues,
CNS
Herpesvirus
Oropharynx / GU
tract
Lymphoid cells,
CNS
PENYEBARAN
Setelah replikasi awal
Penyebaran melalui aliran darah
Penyebaran melalui sistem syaraf
PENYEBARAN
Virus dalam darah:
dapat berada bebas dalam plasma
(Togavirus, Enterovirus)
berhubungan dengan sel darah merah
(Orbivirus)
platelets (HSV)
Lymphocytes (EBV, CMV)
monocytes (Lentivirus)
penyebaran
Penyebaran melalui sistem syaraf
didahului viraemia
kontak langsung dengan neuron pada
infeksi primer.
Kerusakan sel/jaringan
Immune exclusion:
Barier terhadap infeksi yang merupakan
kombinasi antibodi dan selaput mukosa
yang menyelimuti / menutupi epitel
saluran pernafasan
Mempunyai 2 fungsi:
* menghalangi virus mencapai
target
* netralisasi partikel virus
Agen
Antibodi
Mekanisme
Blok ikatan dg sel
Blok masuk ke sel
Blok uncoating
Virus
Produk virus
Mekanisme
EBV
Vaccinia
RNA
elF2 homolog
Komplemen
Vaccinia
HSV-1
Sitokin
Myxoma
EBV
Memblok fungsi
Fungsi IFN trn
MHC kelas I
Adenovirus
CMV murin
E3
Protein awal
IFN
Virus
Limfosit B
Epstein-Barr
Murine gamma Herpes
Limfosit T
Makrofag
Visna, HIV
CMV
11 Maret 2006
11 Maret 2006
11 Maret 2006
11 Maret 2006
11 Maret 2006
11 Maret 2006
INFEKSI HIV
Tahap infeksi HIV:
Infeksi primer
Penyebaran virus ke organ limfoid
Latensi klinik
Induksi ekspresi HIV
Tampak gejala penyakit
Kematian
Durasi dari infeksi gejala penyakit : 10 th
Kematian 2 th setelah tampak gejala klinis
Patogenesis HIV
Setelah infeksi:
Terjadi replikasi virus dan viremia (terdeteksi 8-12
minggu)
Virus menyebar keseluruh tubuh dan menempati
organ limfoid
Pada beberapa pasien (50-75%) terjadi
mononukleosis-like syndrome pada minggu 36setelah infeksi
Terjadi penurunan CD4- sel T
Respon immune terjadi 1minggu-1bulan setelah
infeksi
Virus dalam darah berkurang, level CD4 naik
Sistem imunitas tidak mampu mengeliminasi
seluruh virus infeksi persisten dalam kelenjar
Patogenesis HIV
Periode laten:
Periode laten berlangsung 10 th
Hanya sedikit sel yang terinfeksi ada
dalam darah perifer
Sebenarnya tidak betul2 laten ada
ekspresi virus di organ limfoid
Sistem imunitas menurun tampak dari
penurunan sel CD4
Patogenesis HIV
Stadium lanjut:
Pasien akan mengalami peningkatan
gejalapenyakit: infeksi oportunis,
neoplasma
Pada stadium lanjut ini, Virus dapat
dideteksi
HIV yang didapatkan pada pasien stadium
lanjut, biasanya lebih virulen dan sitopatik
Pergeseran strain HIV-1 dari monocyte-/
macrophage-tropic ke lymphocyte-tropic
HIV
Pengurangan CD4limfosit T
Reseptor HIV: CD4 yang punya afinitas tinggi dengan
envelop virus
Beberapa monosit dan makrofag punya CD4 dapat
diinfeksi HIV
Penurunan CD4 selT pada fase asimtomatik tidak
hanya karena sitopatogenitas virus.
Mekanisme lain
Gp120 (mol HIV) pada sel yang terinfeksi berikatan
dengan CD4 sel yang belum terinfeksi sel
multinukleus
CD4 sel T yang tidak terinfeksi dapat berikatan
dengan gp120 bebas dibunuh dengan sitotoksis
selular
Kompleks gp120-antibodi berikatan dengan CD4
Organ limfoid
Peran utama pada infeki HIV : organ
limfoid
Limfosit di darah perifer hanya 2% dari
total limfosit yang terkumpul di organ
limfoid
Pada periode laten:
sel yang terinfeksi HIV di darah sangat sedkit.
Terjadi replikasi virus di organ limfoid
RETROVIR
US
Pathogenesis HBV
(1)
Pathogenesis HBV
(2)
Akibat infeksi
A. Uncomplicated influenza
*
*
*
B. Reyes syndrome
* adalah acute encephalopathy pada anak dan
remaja
(2-16 th), dengan mortalitas 10-40 %
* merupakan komplikasi influenza A dan B dan
herpes
varicella-zoster
C. Pneumonia
pneumonia karena komplikasi infeksi
influenza
dengan virus lain / bakteri /
keduanya
terjadi pneumonia karena kenaikkan
sekresi mukus virus bergerak ke
saluran respirasi
bawah
komplikasi biasa terjadi pada orang tua/
debil/ ada penyakit kronis
infeksi influenza menyebabkan :
silia hilang
disfungsi sel fagosit
alveolar exudates merupakan
media kaya