PENGUJIAN PRIMER DARI PRIMER

DESIGN SENDIRI
 FASTA di copy ke Ms.Word

Accession
number
MEMILIH UNTAIAN BASA UNTUK FORWARD

Pilih urutan untuk Forward yang

banyak terdapat basa G dan C,
kira-kira sepangjang 18 – 30.
lalu cek di Oligo Calc
 PENGECEKAN DESIGN PRIMER FORWARD
(Oligo Calc: Oligonucleotide Properties Calculator)
Standar
Length :18 - 30
GC content : 40-60%
TM : 50 - 60˚C

GC content : 60%

TM : 45,9˚C

Length : 20
Check Self-Complementarity

Ketiganya “ None !” berarti

bagus
MEMILIH UNTAIAN BASA UNTUK RESERVE

Pilih urutan untuk Reserve yang

banyak terdapat basa G dan C,
kira-kira sepangjang 18 – 30.
lalu cek di Oligo Calc
 PENGECEKAN DESIGN PRIMER RESERVE
(Oligo Calc: Oligonucleotide Properties Calculator)

GC content : 46%

Standar
TM : 59,9˚C Length :18 - 30
GC content : 40-60%
TM : 50 - 60˚C

Length : 28
Check Self-Complementarity

Ketiganya “ None !” berarti

bagus
 KESIMPULAN ANALISIS DESIGN PRIMER

Primer Forward Primer Reverse

• GC content, Length, • GC content, Length,
dan TM memenuhi dan TM memenuhi
syarat syarat
• Self- • Self-
complementarity, complementarity,
ketiganya “None !” ketiganya “None !”
TERIMA KASIH