OPTION 5 Informasi Dasar

diadaptasi dari aslinya Genepop 4.0 dokumentasi ditulis oleh Francois Rousset
opsi ini 5 memberikan informasi seperti frekuensi alel, frekuensi genotipe,
perkiraan Fis untuk setiap alel, estimasi global Fis menurut Weir dan
Cockerham (1984) dan Robertson dan Hill (1984), dan keanekaragaman gen.

Suboption 2 memungkinkan seseorang untuk menghitung heterozygosities

multilokus per individu, yang mungkin berguna misalnya dalam studi
tentang depresi perkawinan. Mereka akan muncul pada tabel terakhir dari
file output jika Anda measukkan setiap individu sebagai 'sampel',
(dipisahkan oleh 'Pop') dalam file input.

Suboption 3 juga akan menghitung rata-rata multilokus dari

kuadrat perbedaan antara ukuran dua alel dari individu.
Suboption 1 Alel dan frekuensi genotipe
Opsi ini memberikan informasi dasar tentang kumpulan data.
Untuk setiap lokus di setiap sampel, beberapa variabel yang dihitung:
 frekuensi alel
 proporsi genotype yang diamati dan diharapkan.
 Estimasi Fis untuk setiap alel
 estimasi global
 jumlah homozigot dan heterozigot yang diamati dan 'diharapkan'.
'Diharapkan' di sini berarti angka yang diharapkan, tergantung pada jumlah
alel yang diamati, di bawah keseimbangan HW; perbedaan dari produk
frekuensi alel yang diamati kadang-kadang disebut koreksi Levene, setelah
Levene (1949).
 matriks genotipe.
 Suboption 2 Identitas berdasarkan keragaman gen dan Fis
Opsi ini menghitung keragaman dalam individu ( '1Qintra'), dan di antara individu
dalam sampel ( '1Qinter') per lokus per sampel, dan rata-rata dari sampel yang lebih
atau lokus yang lebih. Sesuai perkiraan Fis juga dihitung.

Estimasi Onelocus FIS juga dihitung dengan cara yang konsisten . Tidak ada perkiraan yang
diberikan ketika tidak ada informasi yang tersedia (misalnya tidak ada perkiraan keragaman
antar individu dalam sampel ketika hanya satu individu telah genotipe) .

untuk data haploid, hanya keragaman gen antar individu yang dihitung. perkiraan multilokus
mengabaikan lokus haploid, atau sebaliknya mengabaikan lokus diploid jika pengaturan
EstimationPloidy = haploid yang digunakan.
Suboption 3Ukuran Alel berdasarkan keragaman gen dan Fis
Opsi ini menghitung langkah-langkah keragaman berdasarkan ukuran alel, yaitu
berarti perbedaan ukuran kuadrat alel dalam individu ( 'MSDintra'), dan di antara
individu dalam sampel ( 'MSDinter'), per lokus per sampel, dan rata-rata lebih dari
sampel atau lebih lokus.

Untuk data haploid, hanya rata-rata kuadrat selisih MSDinter antara individu
yang dihitung. Perkiraan multilokus mengabaikan lokus haploid, atau sebaliknya
mengabaikan lokus diploid jika pengaturan EstimationPloidy = haploid
digunakan. dan diploid lokus terlepas dari pengaturan ini

Untuk semua suboptions, hasilnya dikembalikan melalui web browser yang kemudian
dapat menyimpan hasil dan dapat dikirim ke email.