Sejauh ini, dalam pengobatan genetika transmisi di eukariota, kita dapat

mengetahui yang mana kromosom dan gen nuklir. Tentu saja, DNA nuklir adalah

yang paling penting dan sangat hampir mendekati materi genetik universal.

Meskipun demikian, sebelum sejarah genetika, sporadis melaporkan telah

mengindikasikan bahwa unsur-unsur ekstrem atau sitoplasma juga bertindak

sebagai agen untuk pengiriman turun-temurun. Namun sebagian besar contoh yang

awalnya dikaitkan dengan warisan nuklir tambahan pada akhirnya telah dijelaskan

oleh gen nuklir. Beberapa kasus yang muncul pertama-tama bergantung pada gen

sitoplasma dan digolongkan sebagai warisan keturunan yang lemah ditunjukkan

oleh penyelidikan lebih lanjut terkait dengan gen ibu. Penotipe diekspresikan pada

keturunannya, dan kasus ini diklasifikasikan ulang sebagai efek ibu. Karena pola

penularan untuk efek ibu mirip dengan warisan sitoplasma, efek maternal dibahas

di akhir bab ini.

Kriteria apa yang membedakan ekstranuclear dari warisan nuklir? Kriteria

untuk mengidentifikasi kelompok sifat heterogenic ini adalah konsekuensi dari

definisi pewarisan ekstra nuklir atau sitoplasma dan juga jenis organisme dan

mekanisme yang terlibat. Warisan kromosom tambahan diidefinisikan sebagai

pewarisan non mendelian, biasanya melibatkan DNA dalam mereplikasi organel

sitoplasma seperti mitokondria dan plastida. Beberapa bakteri dan virus juga

merupakan agen untuk pewarisan ekstranuclear. Panduan umum dapat

dikemukakan sejak awal, dan kriteria untuk kasus tertentu dapat menunggu isi dari

contoh-contoh tertentu. Karena kriteria harus bergantung pada fenotipe yang terkait

dengan pola mendelian akan menyarankan pewarisan ekstranuclear.

KRITERIA UNTUK INHERITASI EKSTRANUCLEAR

Lima kriteria utama dapat digunakan untuk membedakan antara sifat yang

dikendalikan oleh gen nuklir dan sifat yang dikendalikan oleh gen ekstranuclear.

Ini dirangkum dalam daftar berikut:

1.Differensi dalam hasil persilangan timbal balik akan menyarankan penyimpangan

dari pola transmisi gen autosom Mendelian. Untuk melakukan persilangan timbal

balik, betina dari strain A dikawinkan dengan jantan dari strain B dan jantan dari

strain A dikawinkan dengan betina dari strain B. Jika hubungan seks dilepas,

perbedaan hasil persilangan timbal balik akan menunjukkan bahwa satu orang tua

(biasanya ibu) mengerahkan pengaruh yang lebih besar daripada yang lain pada

sifat tertentu.

2. Sel reproduksi wanita biasanya membawa lebih banyak sitoplasma dan organel

sitoplasma daripada sel laki-laki dan diharapkan memiliki sifat-sifat non-Mendel

yang tidak penting. Organel dan simbion di sitoplasma mungkin diisolasi dan

dianalisis untuk mendapatkan bukti lebih spesifik mengenai transmisi ibu dalam

warisan. Kemudian tambahan DNA nuklir dapat dikaitkan dengan transmisi ciri-

ciri tertentu, kasus pewarisan ekstranuclear ditetapkan.

3. Gen kromosom menempati lokus dan peta tertentu di tempat-tempat tertentu

berkenaan dengan gen lain yang dapat menyingkirkan pewarisan kromosom dan

menyarankan adanya ekstranuclear dalam warisan jika data yang cukup dapat

diperoleh.

4. Kembalinya pemisahan Mendelian dan karakteristik Rasio Mendel yang

bergantung pada transmisi kromosom dalam meiosis akan menyarankan transmisi

kromosom ekstra.
5. Penggantian eksperimental inti bisa memperjelas pengaruh relatif nukleus dan

sitoplasma. Transmisi sifat tanpa transmisi gen nuklir akan menyarankan pewarisan

ekstranuclear. Garis pembedaan yang halus mungkin diperlukan untuk

membedakan antara infeksi persisten dan DNA sitoplasma. Tapi fenotipe dari

keduanya bisa memenuhi syarat untuk mendapatkan warisan ekstranuclear.

ORGANEL DAN SIMPAN CYTOPLASMIK

Warisan ekstranuclear yang terkait dengan organel sitoplasma memenuhi

persyaratan sebelumnya dan memerlukan penjelasan meskipun organel hanya

mewakili proposisi materi genetik yang sangat kecil, mungkin beberapa ratus gen,

berdasarkan jumlah DNA fungsional yang terlibat. Bagaimana dan mengapa

kantong DNA ekstranuclear independen ini tersimpan di alam? Tampaknya seluler

lokal, seluler yang kurang lebih independen telah menguntungkan beberapa

fenotipe khusus.

Perlu dicatat bahwa organel sitoplasma sangat penting dan mendasar bagi

fungsi dan, memang, adanya makhluk hidup yang terus berlanjut. Enzim untuk

respirasi seluler dan produksi energi, misalnya, terletak di mitokondria, dan bahan

makanan dioksidasi untuk menghasilkan adenosine triphophate (ATP), bahan bakar

untuk reaksi biokimia. Klorofil dan pigmen tanaman lainnya disintesis dalam

plastida. Namun, tidak mungkin, bagaimanapun, bahwa banyak, jika ada, gen

otonom DNA mitokondria dan plastid secara langsung berhubungan dengan fenotip

dasar dan vital ini. Kemungkinan menarik yang disarankan oleh beberapa peneliti

sebelumnya, dan baru-baru ini diuraikan oleh Margulis, mitokondria adalah bakteri

yang hidup bebas. Dalam jangka waktu yang lama, mereka membentuk simbiosis

herediter dengan sel inang eukariota mereka dan akhirnya berevolusi menjadi
organel dalam sel hewan dan tumbuhan. Mereka membawa serta dari negara yang

hidup bebas DNA mereka sendiri dan peralatan lain untuk mekanisme genetika.

Pabrik pengolahan mereka, yang sebagian terlepas dari kontrol gen nuklir, pastinya

telah disukai dalam evolusi dan dianggap layak untuk dimiliki secara berkelanjutan

di sel eukariota.

Secara simultan, kloroplas pada sel tanaman hijau didalilkan untuk berasal

dari alga bebas yang membentuk hubungan simbiosis dengan sel eukariota awal.

Mereka banyak berkontribusi pada sel inangnya. Klorofil - pigmen penting untuk

fotosintesis, dengan mesin penggabungannya, termasuk DNA, mRNA, tRNA,

ribosom, dan mesin untuk produksi klorofil yang spesifik - telah dikumpulkan di

alga bebas. Selain itu, plastida alga hijau diduga membawa mekanisme genetik lain

seperti resistensi streptomisin, yang ditemukan di alga Chlamydomonas.

Bakteri symbiont telah ditemukan di sitoplasma prekioan Paramecium

aurelia, di mana mereka menghasilkan zat beracun yang membunuh paramecia

rentan lainnya yang ditempatkan pada kultur medium yang sama. Simbion ini, yang

sekarang bermartabat dengan nama latin tertentu, Caedobacter taeniospiralis, telah

berhasil masuk ke dalam sistem genetik inangnya, namun hanya dapat bereproduksi

dengan adanya genotipe inang tertentu.

DNA di mitokondria

Mitokondria pada organisme hidup saat ini timbul dari mitokondria yang sudah ada

sebelumnya. Mereka biasanya merupakan organel sitoplasma kecil (Gambar 20.1)

dengan lapisan internal lipatan atau krista yang berbeda yang timbul sebagai

invaginasi dari membran mitokondria bagian dalam. Ukurannya sama dengan

bakteri dan terjadi pada sel eukariota tapi tidak pada bakteri dan virus.
 Mitokondria menyediakan hewan dan tumbuhan yang lebih tinggi dengan

energi seluler yang mendukung kehidupan melalui proses oksidatif asam sitrat dan

siklus asam lemak, serta proses gabungan fosforilasi oksidatif dan transpor

elektron. Mereka mengandung sejumlah kecil DNA unik yang tetap otonom di luar

genom nuklir sepanjang sejarah evolusi hewan dan tumbuhan yang panjang. Genom

mitokondria kecil dan hanya berlaku untuk sejumlah struktur dan fungsi.

Mitokondria mengandung protein distictive-mensintesis aparatus dengan ribosom

khusus, tRNA, aminoasilil-tRNA sintetase; Aparatus ini menunjukkan kepekaan

terhadap antibiotik seperti bakteri. Mesin sintetis protein mitokondria berbeda

secara signifikan dari mesin sitoplasma untuk tujuan yang sama. Sebagai contoh,

ribosom dalam aparatus sintesis protein mitokondria seperti yang ditemukan pada

bakteri namun sangat berbeda dari sitoplasma sel eukariota. Molekul rRNA

mitokondria berukuran sama dengan bakteri dan secara konsisten lebih kecil

daripada sel eukariota.

Pada sel ragi, 10-20 persen DNA seluler dilokalisasi dalam satu

mitokondria. DNA mitokondria memiliki sifat yang berbeda dengan DNA inti

dalam densitas dan proporsi cekungan GC dan AT. Satu studi ragi menunjukkan

bahwa DNA mitokondria memiliki kerapatan 1,683 g/cm3 dan kadar GC 21 persen,

sedangkan DNA nuklir memiliki kepadatan 1.699 g/cm3 dan kadar GC 40 persen.

Siklus hidup ragi baker normal, Saccharomyces cerevisiae, termasuk fase

haploid dan diploid. Kawin biasanya terjadi antara sel haploid vegetatif dengan tipe

kawin yang berlawanan (A atau a). Sel-sel ini melebur membentuk sel diploid

vegetatif yang membelah oleh mitosis. Pembelahan sel biasanya tidak sama, dengan

sel kecil "anak perempuan" berkembang dari "ibu" yang lebih besar. Kedua sel,
bagaimanapun, identik dalam komposisi nuklir. Sel diploid vegetatif dapat

mengalami proses sporatulasi kompleks dimana meiosis terjadi. Empat ascospores

yang dihasilkan membelah untuk membentuk kloning.

Mutan pertama ditemukan di ragi, jenis koloni kecil yang disebut

"petite/mungil", telah memberikan bukti terbaik yang sekarang ada untuk mutasi

mitokondria. Petite rusak dalam kemampuan mereka memanfaatkan oksigen dalam

metabolisme karbohidrat. Misalnya, ketika glukosa berada di medium, ragi mungil

akan tumbuh hanya pada koloni berukuran kecil. Analisis enzim menunjukkan

bahwa mitokondria kekurangan enzim sitokrom oksidase pernafasan yang biasanya

berhubungan dengan mitokondria. Kekurangan ini tidak hanya menghasilkan

pertumbuhan yang cacat, tapi juga mencegah terbentuknya spora petina. Strain

mungil yang telah dianalisis menunjukkan hanya sebagian kecil G dan C dan

sebagian besar pasangan basa AT berulang. DNA jenis ini tidak mengkodekan

informasi biologis yang berarti. Tidak adanya sitokrom oksidase dari mitokondria

tidak berarti bahwa enzim ini dikodekan oleh DNA mitokondria menyebabkan

perubahan genetik pada fenotip mitokondria.

Mutasi selain yang menyebabkan petites dapat diinduksi dalam ragi dan

ditransmisikan oleh sitoplasma. Misalnya, resistensi terhadap antibiotik

kloramfenikol dan eritromisin telah diinduksi. Antibiotik ini memiliki afinitas

selektif untuk protein mitokondria ribosom, yang menunjukkan bahwa gen

struktural hadir untuk beberapa protein ribosom.

W.L. Prancis telah menunjukkan bukti bahwa sterilitas pada nyamuk Culex

hibrida disebabkan oleh interaksi yang melibatkan DNA mitokondria. Beberapa

peneliti lain telah menunjukkan bahwa DNA mitokondria diwariskan secara

maternal pada katak. J.B David telah membandingkan DNA mitokondria dalam

kultur sel dari mamalia yang berbeda, termasuk tikus besar, tikus kecil, dan

manusia; Dia juga memiliki sel hibridisasi mamalia yang berbeda dalam budaya.

Pada tikus hibrida dan sel manusia, misalnya, ia telah menunjukkan bahwa tidak

hanya DNA homogen dan DNA mitokondria manusia homogen yang dapat

dideteksi namun juga DNA hibrida heterogen, dalam satu rangkaian eksperimen,

20 persen dari setiap unit DNA melingkar adalah tikus dan 80 persen adalah DNA

mitokondria manusia. DNA heterogen ditunjukkan akibat rekombinasi DNA

mitokondria pada hibrida.

Gen kromosom ragi harus menentukan sebagian besar enzim yang terkait

dengan mitokondria. Strain ragi kawin dengan DNA rusak berlanjut mensintesis

DNA mitokondria yang abnormal. Ini menunjukkan bahwa protein yang

dibutuhkan untuk replikasi DNA mitokondria tidak dikodekan oleh DNA

mitokondria. Demikian pula, strain mungil terus mensintesis enzim siklus Krebs

yang berada di mitokondria. Kontrol harus berasal dari gen kromosom.

Organisasi Genom Mitokondria

Meskipun genom DNA mitokondria (mtDNA) umumnya membentuk sebagian

kecil dari total DNA seluler (kurang dari 1 persen pada sel somatik hewan yang

lebih tinggi), mtDNA ini biasanya ada sebagai molekul melingkar yang relatif kecil,

yang dapat dengan mudah diisolasi dan ditandai. Dengan demikian, tersedia banyak

informasi mengenai struktur genom mitokondria. Ukuran mtDNA ini berkisar dari

sekitar 16 kb pada mamalia hingga beberapa ratus kilobase-pasang di tanaman yang

lebih tinggi (misalnya, 570 kb pada jagung). MtDNA biasanya hadir dalam banyak

salinan per organel. Sel HeLa manusia (garis kultur sel manusia yang dipelajari
secara ekstensif) mengandung sekitar 10 salinan mtDNA per mitokondria dan

memiliki sekitar 800 mitochondria per sel. Dengan demikian, sel HeLa

mengandung sekitar 8000 eksemplar genom mitokondria per sel. Perkiraan jumlah

mtDNA serupa telah diperoleh untuk jenis sel somatik mamalia lainnya. Dalam sel

telur mamalia raksasa, yang mengandung sejumlah besar mitokondria, mtDNA

dapat membentuk sepertiga dari total DNA seluler.

Sedangkan struktur mtDNA sangat dilestarikan pada hewan yang lebih

tinggi, keragaman yang cukup besar diamati pada tanaman dan terutama pada

eukariota yang lebih rendah, mtDNA dari beberapa protozoa bersilia bersifat linier

dan bukan melingkar.

Struktur yang dilestarikan dari genom mitokondria spesies terkait dapat

diilustrasikan dengan membandingkan organisasi mtDNA manusia, tikus, dan sapi

- tiga mtDNA pertama yang diurutkan dalam toto. MtDNA yang berurutan pada

manusia, tikus, dan ternak masing-masing adalah 16.569, 16.275, dan 16.338

nukleotida-pasang. Yang terpenting, ketiga mtDNA tersebut menunjukkan

organisasi informasi genetik yang sama (gambar 20.2). Masing-masing berisi gen

2 rRNA, 22 gen tRNA, dan 13 protein struktural putatif. Lima gen mengkodekan

protein yang dikenal, namun produk dan fungsi gen putatif lainnya belum

teridentifikasi. Bingkai bacaan yang terakhir terbuka dirancang URFs (untuk

bingkai bacaan yang belum ditetapkan).

Seluruh genom mitokondria mamalia ditranskripsikan sebagai satu unit dari

satu situs promotor tunggal, dan transkrip utama raksasa kemudian dibelah secara

endonukleolitik untuk menghasilkan molekul tRNA, rRNA, dan mRNA individual.

Dengan demikian, seluruh mtDNA, pada dasarnya, setara dengan satu operon pada

bakteri.

Genom mitokondria melingkar dari ragi Saccharomyces cerevisiae lebih

dari lima kali lebih besar (sekitar 84 kb) daripada mtDNA mamalia. Meskipun

demikian, rongga mitochondrial menunjukkan organisasi genom yang mirip

dengan mtDNA mamalia. Dua gen mtDNA ragi, mengkodekan sitokrom b dan sub

unit 1 dari sitokrom oksidase, sangat besar - hampir sama besarnya dengan mtDNA

mamalia secara keseluruhan. Kedua gen ini mengandung beberapa rangkaian intron

yang sangat panjang. Ragi mtDNA mengandung sekelompok gen 16 tRNA dalam

satu segmen genom pendek, ditambah sekitar 10 gen tRNA yang tersebar di seluruh

genom. Dengan demikian, gen tRNA mitokondria ragi tidak begitu seragam

didistribusikan sebagai gen tRNA mitokondria mamalia. Bagian dari perbedaan

ukuran antara mtDNA mamalia dan mtDNA ragi jelas karena genom mitokondria

ragi sangat besar yang juga mengkodekan lebih banyak protein daripada mtDNA

mamalia, namun ini belum terbentuk.

Karena mitokondria adalah organel kompleks yang mengandung sejumlah

besar protein berbeda - jauh di atas 13 yang berpotensi dikodekan oleh genom

mitovidural mamalia - mayoritas jika protein mitokondria harus dikodekan oleh gen

inti. Memang, sejumlah besar protein terlarut seperti enzim biosintesis asam amino

dan protein struktural mitokondria diketahui disintesis pada ribosom sitoplasma

dengan spesifikasi yang diberikan oleh transkrip gen inti. Protein ini kemudian

diangkut inti mitokondria, di mana fungsinya berada. Pengangkutan produk

terjemahan sitoplasma ke dalam mitokondria diarahkan oleh peptida transit khusus

pada terminologi amino dari polipeptida yang baru lahir. Peptida transit ini biasanya
membelah polipeptida prekursor selama pengangkutannya melintasi membran

mitokondria. Dengan demikian, genom mitokondria menentukan molekul rRNA

dan tRNA yang dibutuhkan untuk sintesis protein mitokondria dan beberapa protein

dikodekan oleh gen nuklir.

DNA di Plastids

Carl Correns (tahun 1908) mengamati perbedaan hasil persilangan timbal balik dan

merupakan yang pertama menggambarkan penyimpangan keturunan Mendelian.

Nuansa warna yang berbeda dari putih (albino) menjadi hijau gelap pada daun

beberapa tanaman diselidiki. Alih-alih warisan yang sama dari biji induk dan serbuk

sari, seperti yang ditunjukkan oleh Mendel di kebun kacang polong, Correns

menunjukkan pada penelitian pada pukul empat, Mirabilis jalapa bahwa warisan

ciri tertentu berasal sepenuhnya dari benih induknya. Perbedaan warna

berhubungan dengan plastida sitoplasma, yang terpenting adalah kloroplas

(Gambar 20.3), yang membawa klorofil. Kloroplas timbul dari partikel sitoplasma

yang disebut proplastida yang mengandung DNA dan menduplikat dirinya terlepas

dari bagian sel lainnya. Mereka didistribusikan lebih atau kurang sama selama

pembelahan sel. Meskipun beberapa proplastida ditularkan di sitoplasma telur,

sedikit jika ada yang ditransmisikan dalam serbuk sari sebagian besar tanaman.

Dengan demikian, beberapa karakteristik kloroplas diwarisi dari sitoplasma benih-

orang tua.

Banyak penyidik telah mengikuti petunjuk awal Correns, dan sekarang

hampir semua hal yang diketahui tentang genetika plastid berasal dari studi tentang

variegasi pada tanaman bibit. Setiap tanaman yang mengembangkan bercak warna

berbeda pada daun atau bagian vegetatif lainnya dikatakan beraneka ragam. Banyak
variasi tidak diwariskan; beberapa dikendalikan oleh gen nuklir, dan yang lainnya

bergantung pada pewarisan plastid. Interaksi terjadi, dan sulit untuk membedakan

contoh yang hanya bergantung pada pewarisan plastid. Pola figuratif (pita marjinal,

bintik-bintik yang menyebar, vena dan garis menonjol pada daun) yang benar-

pembiakan biasanya mewakili modifikasi fisiologis yang mempengaruhi regulasi

plastida normal dan mutan ke dalam pola warna dapat bergantung pada mutasi pada

plastida.

Ovula, serta sel somatik tanaman berbintik-bintik (mis., Pukul empat), dapat

membawa plastida normal dan hampir tidak berwarna dan kloroplas hijau normal

di sitoplasma mereka (gambar 20.4). Efek berbintik-bintik ditransmisikan melalui

garis ibu, generasi demi generasi. Karena serbuk sari jam empat memiliki sedikit

jika ada sitoplasma, pengaruhnya terhadap variegasi dapat diabaikan. Tanaman

tunggal dengan cabang hijau, putih, dan beraneka ragam hanya mengandung

primordia untuk plastida yang tidak berwarna, pada cabang hijau hanya hijau, dan

cabang beraneka ragam mungkin mengandung kloroplas berwarna atau hijau atau

kombinasi keduanya.

Pada tanaman seperti primrose, P. sinensis, chimeras (sektor yang

mengandung jenis plastid yang berbeda) kadang terbentuk, dengan hanya sebagian

tanaman mengandung klorofil. Daerah dengan plastida abnormal yang kekurangan

klorofil dapat mengandalkan bagian hijau tanaman untuk produk fotosintesis dan

oleh karena itu dapat terus hidup. Setiap bagian chimera dapat menghasilkan sel

reproduksi dan dengan demikian mentransmisikan jenis plastida melalui gamet

betina.
 Kloroplas kini telah diisolasi dan terbukti mampu melakukan sintesis

protein dengan adanya adenosine triphosphate atau light. Produknya identik dengan

protein kloroplas asli, menunjukkan bahwa kloroplas terisolasi memiliki mesin

sintesis protein fungsional sepenuhnya dimana mRNA diterjemahkan secara akurat.

Dengan analisis DNA dan penggunaan restriksi endonuklease untuk

fragmentasi DNA, banyak yang telah dipelajari tentang DNA plastid. Sekitar 30-60

eksemplar genom kloroplas ditemukan di setiap kloroplas tanaman yang lebih

tinggi; sekitar 100 salinan genom terjadi di setiap plastid alga. DNA kloroplas yang

cukup unik telah ditemukan untuk kode sekitar 126 protein, dan sekitar 12 persen

dari kode sekuens plastid DNA untuk komponen plastid.

Kloroplas DNA dan Resistansi Narkoba

Ketika Ruth Sager menempatkan sel ganggang Chlamydomonas pada media kultur

yang mengandung antibiotik streptomisin, sebagian besar sel terbunuh, namun

sekitar satu per juta bertahan dan berlipat ganda, masing-masing membentuk

streptomisin yang dipilih dari alga yang sangat streptomisin. Sekitar 90 persen

mutan melibatkan gen nuklir (sr-1), dan mutasi semacam itu hanya ditunjukkan

oleh tantangan antibiotik. Kira-kira 10 persen mutasi (sr-2), bagaimanapun, adalah

uniparental dan non kromosom. Akhirnya, mutan non kromosom ditemukan dari

hampir setiap koloni. Mutasi DNA nonkromosom mengekspresikan fenotipe yang

sama dengan mutan DNA kromosom. Gen non kromosom ini diduga berada di

kloroplas.

Salib timbal balik (Gambar 20.5) menunjukkan bahwa resistensi antibiotik,

yang dikendalikan oleh gen non kromosom, bersifat uniparental pada warisan. Di

sisi lain, jenis kawin di alga uniselular seksual ini dikendalikan oleh gen kromosom,
yang ditetapkan oleh para peneliti kurang atau hanya ditambah (+) dan minus (-),

bukan perempuan dan laki-laki. Semua keturunan dari setiap kawin timbal balik

seperti tipe kawin plus (+) berkenaan dengan resistensi streptomisin relatif sehingga

menunjukkan warisan ibu. Bila jenis kawin plus (+; perempuan) tahan, semua

keturunan tahan; Bila tipe kawin plus (+) tidak bergejolak, semua keturunan tidak

berdaya. Hasil persilangan timbal balik ini menunjukkan pewarisan non-Mendel,

yang melibatkan sepasang sifat kontras yang berbeda. Gen nonkromosam, sr untuk

resistensi streptomisin dan s untuk sensitif streptomisin, didalilkan untuk

mengendalikan dua karakteristik alternatif ini.

Mutan lain, ac2, yang menghambat aktivitas fotosintesis, diinduksi dan

sepasang alel nonchromosomal, ac1, dan ac2, dengan demikian tersedia untuk

dipelajari pada strain Chlamydomonas yang sama. Mutan yang dibutuhkan asetat

dalam media pertumbuhan. Dengan dua pasang gen non kromosom yang tersedia,

umpan silang dihybrid dapat dilakukan dalam sistem yang sama untuk memeriksa

bukti rekombinasi. Persilangan tipe dihybrid ac1ss x ac2sr telah disiapkan, dan

keturunan diizinkan tumbuh untuk beberapa perkalian vegetatif. Setiap sel

kemudian diklasifikasikan untuk penanda segreging, baik non kromosom dan

kromosom (yaitu, jenis kawin dan lainnya yang dikenal sebagai kromosom). Baik

pasangan ac1 / ac2 dan sr / ss alel diamati untuk memisahkan, tapi tidak selalu di

pembagian yang sama. Setelah empat atau lima penggandaan mitosis, baik asidosis

(ac1ss dan ac2sr) dan rekombinan (ac1sr dan ac2ss) telah diperoleh. Hasilnya

menunjukkan bermacam-macam, menunjukkan bahwa dua pasang gen non

kromosom dibawa dalam plastida yang berbeda. Salib tiga dan empat titik dan

persilangan timbal balik telah dibuat dengan penambahan beberapa mutan, yang
diperkirakan akan dibawa ke dalam kloroplas dan mitokondria. Peta genetik gen

non Mendel di Chlamydomonas telah dibangun, namun ketidakpastian masih ada

mengenai apakah beberapa kelompok hubungan "kloroplas" hanya ada pada genom

kloroplas.

Organisasi Genom Plastid

Genom plastid dari lebih 200 spesies tanaman yang lebih tinggi dan alga hijau, biru-

hijau, dan merah banyak dikarakterisasi sebagian. Dalam spesies tertentu, genom

dari berbagai jenis platid-kloroplas, amiloplas (plastida yang menumpuk pati dalam

jaringan penyimpanan), dan kromoplast (pigmen yang mengandung plastida) -

semuanya identik pada organisme dimana mereka telah diteliti. Dengan demikian,

diskusi kita tentang struktur genom plastid akan dibatasi pada pengorganisasian

DNA kloroplas (cpDNA) - anggota keluarga plastid yang paling penting.

Pada tanaman yang lebih tinggi, ukuran cpDNA berkisar antara 120 sampai

160 kb. Dalam ganggang, kisaran ukuran genom kloroplas jauh lebih besar - dari

85 sampai 292 kb untuk spesies yang diketahui memiliki cpDNA melingkar. Dalam

dua spesies ganggang hijau dari genus Acetabularia, cpDNA telah terbentuk apakah

genom kloroplas besar ini linier atau melingkar. Seperti dalam kasus DNA

mitokondria, kloroplas sering mengandung banyak salinan cpDNA. Porcelata besar

Euglena gracilis mengandung sekitar 15 kloroplas masing-masing dengan sekitar

40 salinan cpDNA, memberikan total sekitar 600 eksemplar per organisme.

Semua genom kloroplas yang dianalisis sampai saat ini mengandung

kumpulan gen yang sama, namun gen ini disusun dengan cara yang sangat berbeda

pada cpDNA. Gen yang ada pada cpDNA dapat dikelompokkan menjadi dua kelas

utama: (1) komponen pengkodean dari peralatan biosintesis protein kloroplas

(subunit RNA polimerase, komponen struktural ribosom kloroplas, dan satu set

rRNA) dan (2) komponen yang menentukan dari mesin fotosintesis (foto-sistem I

dan II dan rantai transpor elektron).

Genom kloroplas dari tanaman yang lebih tinggi kira-kira berukuran satu

sampai dua puluh tiga ukuran genom organisme prokariotik (alga hijau biru atau

cyanobacteria) yang diyakini sangat bergantung pada gen nuklir dari kasus

mitokondria, komponen terakhir disintesis pada ribosom sitoplasma dan diimpor ke

dalam kloroplas dengan bantuan peptida transit terminal amino yang terbelah

selama pengangkutan melalui membran kloroplas.

Studi komparatif genom kloroplas telah memberikan informasi baru yang

penting tentang hubungan evolusioner spesies tanaman dan alga. J.D. Palmer telah

membedakan enam jalur utama evolusi kloroplas (Gambar 20.6). Genom kloroplas

hadir dalam garis evolusi yang berbeda, semuanya mengandung gen yang sama,

namun gen ini hadir dalam susunan yang berbeda pada molekul cpDNA. Gen rRNA

hadir dalam rangkap dua pada pengulangan inversi dalam cpDNA dari kebanyakan

spesies. Namun, dalam Euglena gracilis, gen 16S dan 23S rRNA hadir pada tiga

pengulangan tandem langsung, dengan salinan keempat terpisah dari gen 16S rRNA

yang terletak di dekat genom tersebut. Dengan membandingkan lokasi gen pada

genom kloroplas yang berbeda, Palmer telah mampu menunjukkan bahwa banyak

perubahan dalam organisasi cpDNA dihasilkan dari pembalikan segmen DNA.

Dalam kasus lain, penghapusan dan penyisipan DNA ditemukan terjadi di daerah

intergenik dan dalam intron gen. Namun, perubahan besar yang didokumentasikan

dalam struktur cpDNA tampaknya dihasilkan dari inversi besar

 Fotosintesis yang terjadi di dalam kloroplas menyediakan sumber energi

yang mendukung kehidupan untuk semua makhluk hidup di planet bumi. Karena

genom kloroplas mengkodekan banyak komponen kunci dari fotosistem I dan II

dan rantai transpor elektron, pengetahuan tentang struktur dan fungsi cpDNA

sangat penting dan mendapat banyak perhatian. Urutan nukleotida pasangan

lengkap dari cpDNA dari polymorpha Marchantia hati dan tembakau (Nicotiana

tobacum) telah ditentukan. CpDNA dari Marchantia dan tembakau masing-masing

adalah 121.024 dan 155.844 pasang nukleotida. Pengorganisasian gen single-copy

dalam genom kloroplas dari kedua tanaman ini sangat mirip karena keduanya

sangat jauh berbeda satu sama lain. Perbedaan utama antara kedua cpDNA ini

adalah daerah pengulangan terbalik yang mengandung gen rRNA lebih besar pada

tembakau. Perkiraan terbaik jumlah gen cpDNA adalah 136 pada Marchantia dan

150 pada tembakau. Lokasi gen yang dikenal dan bacaan terbuka ditunjukkan untuk

genom kloroplas Marchantia pada gambar. 20.7.

Mungkin pemahaman lengkap tentang gen kloroplas dan produk yang

mereka encode akan memiliki aplikasi praktis penting di masa depan. Informasi

tentang mekanisme yang tepat dimana fungsi fotosistem I dan II suatu hari nanti

memungkinkan ilmuwan dan insinyur untuk "membangun" sistem sintetis yang

benar-benar mampu menduplikasi kapasitas tanaman hijau untuk menangkap

energi cahaya dan mengubahnya menjadi bentuk kimia yang berguna untuk

organisme hidup.

Bakteri Symbiont di Sitoplasma Paramecium

Paramecia adalah organisme favorit untuk penyelidikan genetik. Mereka adalah

protozoa berukuran besar dan uniseluler yang bereproduksi baik oleh proses
aseksual maupun seksual. Reproduksi aseksual terjadi melalui sel fisi untuk

menghasilkan klon sel generik identik. Pada fase seksual, paramecia konjugasi

secara berkala dan mentransfer materi genetik dari satu sel ke sel lainnya.

Paramecia dan ciliates lainnya memiliki dua jenis nukleus: macronucleus vegetatif

dan mikronukleus kecil, yang melewati urutan meiosis dan menghasilkan gamet

haploid. Sebuah mikronukleus juga menimbulkan macronucleus yang terbagi

dalam pembelahan sel aseksual. Ada kemungkinan di laboratorium untuk membuat

salib seksual yang dengannya DNA nuklir dipindahkan dari donor ke penerima,

yang menghasilkan keturunan heterozigot, yaitu AA x aa --> Aa. Sebuah proses

pembuahan diri, yang disebut autogami, menghasilkan homozigosis lengkap dari

keturunan yang dihasilkan (gambar 20.8). Mengikuti meiosis, sel-selnya haploid,

tapi melalui autogami mereka menjadi diploid homozigot. Ini memberikan dasar

untuk membandingkan pewarisan ekstranuklir dan nuklir, dan dengan demikian

untuk menunjukkan bahwa keturunan dapat berbeda dari jenis liar pada sifat yang

dikendalikan oleh gen nuklir dan ekstranuklir.

G.H. Beale menemukan bahwa resistensi eritromisin di Paramecium, seperti

yang terjadi pada ragi, berasal dari pewarisan non-Mendel. Sejumlah mutasi

sitoplasma dan nuklir tambahan yang mempengaruhi resistensi antibiotik telah

dipelajari oleh Beale abd J. Beisson. Ini adalah peneliti lain yang melakukan

transfer jika sitoplasma dan juga transfer mitokondria terisolasi di antara strain

paramecia dan menunjukkan bahwa mitokondria (mungkin DNA mitokondria)

mengendalikan resistansi tersebut. Studi juga menunjukkan bahwa meskipun

beberapa sifat mitokondria ditentukan oleh mitokondria itu sendiri, yang lain

bergantung pada unsur-unsur dalam protoplasma.

 T.M. Sonneborn dan lainnya telah menyelidiki efek ekstranuklir yang gigih

di Paramecium. Beberapa strain P. aurelia menghasilkan zat yang memiliki efek

mematikan pada anggota noda lain dari spesies yang sama. Paramecia dari strain

yang mampu memproduksi zat beracun ini disebut "pembunuh". Ketika pembunuh

tunduk pada suhu rendah, kapasitas membunuh mereka berangsur-angsur hilang.

Efek toksik juga menurun setelah perpecahan sel berulang. Elemen terpisah di

sitoplasma dipostulasikan untuk produksi zat beracun. Dari perhitungan matematis,

diperkirakan sekitar 400 partikel dibutuhkan untuk membuat pembunuh efektif.

Pembunuh kemudian diamati secara mikroskopis dan "partikel" yang disebut

"kappa" diamati pada jumlah yang diharapkan. "Partikel" ini, yang ditunjukkan

sebagai bakteri simbiotik, diberi nama Caedobacter taeniospiralis (bakteri

pembunuh dengan pita spiral).

Sebuah "zat beracun" (paramecin). Diproduksi oleh bakteri pembunuh,

difusibel dalam media cairan (Gambar 20.9). Ketika pembunuh diizinkan untuk

tetap berada dalam medium untuk sementara waktu dan digantikan oleh sensitivitas,

kepekaan terbunuh. Paramecin, yang tidak berpengaruh pada pembunuh, dikaitkan

dengan jenis kappa tertentu