+

PROTEIN
MATA KULIAH: Biokimia DASAR

LABORATORIUM Biokimia NUTRISI

Fakultas Peternakan UGM
+
PROTEIN
 The Central Dogma di Biologi:

DNA RNA Protein

DNA: AAA GGA GAA TAG TGT GGC CAT

RNA: UUU CCU CUU AUC AUA CCG GUA

protein: Phe Pro leu Ile Ile Pro Val

+
PROTEIN

Phe Pro leu Ile Ile Pro Val Ala

• makromolekul / polimer
• Terbuat dari berbagai asam L-amino dihubungkan
dengan ikatan peptida
• linear rantai (bercabang)
molekul protein yang terdiri dari rantai polipeptida
tunggal dikatakan monomer
Protein terdiri dari rantai lebih dari satu
polipeptida disebut oligomer
+ 1. Fungsi Klasif
ikasi p
Sebuah. Mengikat rotein
 sebagai contoh: antibodi
b. struktur sel
 protein struktural memberikan kekuatan untuk sel
 sebagai contoh: kolagen. keratin
c. katalisis enzimatik
 umumnya sangat spesifik (Reaksi dengan hanya satu
substrat untuk membentuk satu produk)
 biasanya dinamai berdasarkan reaksi yang mereka
mengkatalisasi (akhiran: -ase)
o protease (tripsin. kimotripsin. carboxypeptidases)
o laktase (Menghidrolisis gula susu)

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

+
+
d. dukungan mekanik
 kontraksi otot
o aktin dan myosin pada otot hewan
 mesin molekuler ...
o tubulin
e. Peraturan
 protein regulator mempengaruhi tingkah laku atau
kelimpahan enzim (langsung atau tidak langsung)
 mengatur proses seluler berdasarkan kemampuan
mereka untuk mengikat makromolekul lain, seperti
reseptor, DNA, RNA, dll
 juga dikenal contoh: insulin

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

f. Penyimpanan
 protein penyimpanan bertindak sebagai
reservior biologis untuk nutrisi tertentu
 Contoh klasik: feritin . mengikat dan toko besi
g. Mengangkut
 protein transport memberikan zat-zat tertentu
 juga dikenal contoh: hemoglobin. mioglobin
banyak orang lain yang terikat membran protein
yang membantu dalam bolak nutrisi atau
metabolit (glukosa, vitamin, asam amino) di
membran sel; saluran ion [impor nutrisi serta
ekspor limbah]

3/22/15 Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi

+ 2. Kelarutan

Kelarutan dalam air, larutan garam atau etanol

etanolmu 70-
H2H larutan
80%
AI garam tlak
etanol
Albumin + +
globulin (+) +
Prolamines - - +

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

3. Jenis

struktur tiga dimensi dan peran

fungsional

1. Membran protein

• peran:
o transportasi molekul / ion dalam atau
keluar dari sel
o Pengakuan sel, reseptor, sel komunikasi
sel

3/22/15 Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi

+
2. protein berserat (struktural dan
kontraktil)
• khas tidak larut air , Relatif "hidrofobik" asam
amino (misalnya Ala, Val, Leu, Ile, Met, Phe)
Terletak baik dalam domain protein interior dan
eksterior
• fisik pemikiran manusia, menanamkan
kekuatan dan / atau elastisitas
o kolagen
o elastin
o α-keratin

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

+
3. protein Globular
 mereka melakukan sebagian besar pekerjaan
metabolik seperti peraturan, transportasi,
katalisis dan perlindungan
o semua enzim dan protein regulasi yang
globular
 khas larut dalam air, Kira-kira bola dan erat
dilipat

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

+
ASAM AMINO

 Protein terdiri dari asam amino yang dihubungkan oleh peptida obligasi
 Setiap asam amino terdiri dari:
 Sebuah atom karbon pusat (Asymmetric)
 Gugus amino
 Sebuah kelompok karboksil
 Sebuah rantai samping
 Perbedaan rantai samping membedakan berbagai asam amino
+
 Asam amino dianggap sebagai molekul kiral:

Ada ada molekul lain yang komposisi identik tetapi yang diatur dalam
gambar cermin. Kehadiran atom karbon asimetrik sering fitur yang
menyebabkan chirality dalam molekul.
+
isomer LD

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

+ Klasifikasi asam amino
residu dibebankan

arginin, histidin, lisin

positif o rantai samping dasar
dibebank o NH-kelompok
an terprotonasi pada pH
fisiologis
aspartat, asam glutamat
negatif o rantai samping asam
dibebank o gugus karboksil (COO-)
an Dengan muatan negatif
pada pH fisiologis
Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15
+

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

+
residu polar (hidrofilik)

 memiliki kelompok hidrofilik, seperti karbonil (C =

O). hidroksil (OH) atau amina (NH) kelompok
 baik membentuk ikatan hidrogen dengan residu
polar lainnya di protein atau dengan air
 misalnya, kelompok OH serin bisa baik menyumbangkan serta menerima
ikatan hidrogen

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

+

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

+

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

 +
residu non-polar
(hidrofobik)

 memiliki CH-obligasi
 tidak menguntungkan berinteraksi dengan air
 inti
pusat dari kebanyakan protein terdiri hampir
secara eksklusif dari residu non-polar, distabilkan
oleh banyak van der Waals interaksi
 sejumlah
besar residu non-polar juga ditemukan
pada permukaan protein

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

+

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

+

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

+
peptida BOND
 Bahan kimia linkage -CO-NH- dibentuk oleh head-to-tail
kondensasi dari kelompok α-amino (-NH2) dari satu asam amino
dan kelompok α-karboksil (-COOH) dari amino lain AC id.
+
protein vs polipeptida
+
PROTEIN STRUKTUR
+ STRUKTUR PROTEIN

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

+

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

3/22/15 Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi
+

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

+ protein Denaturasi

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

+
 Protein denaturasi: konfigurasi molekul terorganisir terganggu
 Fungsi dari protein (kecuali ketika menjabat sebagai makanan)
benar-benar tergantung pada struktur tiga-dimensi
 Ketika protein terdenaturasi, kehilangan fungsinya
 Seringkali ketika protein telah lembut terdenaturasi dan kemudian
dikembalikan ke kondisi fisiologis normal suhu, pH, konsentrasi
garam, dll, secara spontan mendapatkan kembali fungsi (misalnya
kegiatan atau kemampuan untuk mengikat antigen yang
enzimatik) nya

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

+
 Sejumlah agen dapat mengganggu struktur ini sehingga denaturasi
protein:
 Perubahan dalam pH (alter interaksi elektrostatik antara asam
amino bermuatan)
 perubahan konsentrasi garam (melakukan hal yang sama)
 perubahan suhu (suhu yang lebih tinggi mengurangi kekuatan
ikatan hidrogen)
 Kehadiran pereduksi (memutuskan ikatan SS antara cysteines)

 Tak satu pun dari agen ini istirahat ikatan peptida, Sehingga
struktur utama protein tetap utuh ketika didenaturasi

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15

+ Contoh soal protein:
 Sebutkan Dan Jelaskan Klasifikasi protein berdasarkan fungsinya !
 Sebutkan Dan Jelaskan Klasifikasi protein berdasarkan kelarutannya !
 Sebutkan Dan Jelaskan Klasifikasi protein berdasarkan tipenya !
 Mengapa asam amino disebut sebagai molekul Yang bersifat kiral? Jelaskan !
 Sebutkan Klasifikasi asam amino berdasarkan muatannya Serta berikan
contoh masing-masing !
 Sebutkan Dan Jelaskan Empat macam Struktur protein!
 Sebutkan macam-macam Ikatan Yang Terdapat PADA Struktur kuarterner
Suatu protein! Diantara Ikatan tersebut manakah Yang memucat Lemah Dan
Mudah terdegradasi ?
 Apakah Yang Saudara ketahui TENTANG Proses denaturasi protein?
 Sebutkan beberapa faktor Yang DAPAT menyebabkan terjadinya Proses
denaturasi. Jelaskan pula pengaruhnya sehingga Terjadi Proses denaturasi !

Biokimia Dasar Mgg 6 Lab. Biokimia Nutrisi 3/22/15