2.

Dasar kimia dari sel

Komponen penting dari sel (1)

2.1 Ikatan atom dan interaksi molekuler

2.2 Pembentukan makromolekul sel dari satuan yang lebih kecil

2

2.1 Ikatan atom dan interaksi molekuler

Geometri ikatan pada atom karbon

Tetrahedral

Satu bidang datar

Energi ikatan

Interaksi elektrostatik dan ikatan hidrogen

Ikatan hidrogen air dengan molekul lain (1)

Ikatan hidrogen air dengan molekul lain (2)

Interaksi hidrofobik

10

Molecular complementarity

11

2.2 Pembentukan makromolekul sel dari satuan yang lebih kecil

12

Monomer - polimer

13

Membran sel

14

15

Asam amino asam dan basa

16

17

18

19

20

21

22

Asam lemak & triasilgliserol

23

24

25

26

Istilah

Ikatan peptida Ikatan fosfodiester Ikatan glikosida Atom karbon Rantai samping Nukleotida Purin Pirimidin nukleosida

Gugus aldehid Gugus keto

27

2.3 Kesetimbangan kimia

28

Konstanta kesetimbangan

29

Perbedaan reaksi pada keadaan setimbang dgn keadaan steady state

30

Konstanta disosiasi menunjukkan afinitas antar molekul

Contoh interaksi molekul:

Ligan terikat pada resptor Protein (P) terikat pada DNA (D)

31

2.4 Biochemical energetics

32

Energi bebas Gibbs (G)

H (entalpi)

Energi ikatan Dalam K Ukuran ketidak teraturan

T (temperatur)

S (entropi)

Reaksi exotermik:

energi ikatan produk < substrat energi ikatan produk > substrat

Reaksi endotermik

33

Reaksi kimia

G negatif Kecepatan reaksi tergantung energi aktivasi

Keadaan transisi: keadaan selama proses reaksi kimia dengan tingkat energi tertinggi

Reaksi dalam sel menggabungkan reaksi yang membutuhkan energi dengan yang melepaskan energi
34

ATP

Hidrolisis ikatan fosfoanhidrida (fosfodiester)

G = -7,3 kcal/mol

35