SEL

DAN

ORGANISME

SEJARAH PENEMUAN SEL

ROBERT HOOKE, 1665 MENEMUKAN RONGGA-RONGGA (KAMAR KECIL) = UTRICULUS = VESICULUS PADA IRISAN GABUS TUTUP BOTOL DI BAWAH MIKROSKOP ANTHONY VAN LEEUWENHOEK, 1674 ORANG YANG PERTAMAKALI MENDISKRIPSIKAN MIKROORGANISME SCHLEIDE,1838 MENELITI IRISAN TUMBUHAN: SEMUA TUMBUHAN TERSUSUN DARI SEL

SEJARAH PENEMUAN SEL

THEODORA SCHWAN, 1839 MENELITI IRISAN HEWAN: SEMUA HEWAN TERSUSUN DARI SEL

RUDOLF VIRCHOW, ABAD 19 MENYATAKAN BAHWA SEL HANYA DAPAT MUNCUL DARI PEMBELAHAN SEL YANG SUDAH ADA SEBELUMNYA. OMNIS CELLULAE CELLULA

TEORI SEL

SEL MERUPAKAN KESATUAN STRUKTURAL SUATU MAKHLUK HIDUP SEL MERUPAKAN KESATUAN FUNGSIONAL DARI KEHIDUPAN SEL MRP KESATUAN PERTUMBUHAN MAKHLUK HIDUP SEL MERUPAKAN KESATUAN HEREDITAS

SIFAT DASAR SEL

SEL SANGAT KOMPLEKS DAN TERORGANISASI SEL MEMILIKI PROGRAM GENETIK SEL MEMPUNYAI KEMAMPUAN UNTUK MEMPERBANYAK DIRI SEL MEMERLUKAN DAN MENGGUNAKAN ENERGI

SIFAT DASAR SEL

SEL MELAKUKAN BERBAGAI REAKSI KIMIA SEL MELAKUKAN BERBAGAI AKTIVITAS MEKANIK SEL MAMPU MEMBERIKAN RESPON TERHADAP STIMULAN SEL MAMPU MENGATUR DIRI SENDIRI

The Cells Heritable Information

Cells contain chromosomes made partly of DNA, the substance of genes

Which program the cells production of proteins and transmit information from parents to offspring
Sperm cell Nuclei containing DNA Fertilized egg with DNA from both parents

Egg cell
Figure 1.6

Embyros cells with copies of inherited DNA

Offspring with traits inherited from both parents

CELL
Overview: The Importance of Cells All organisms are made of cells The cell is the simplest collection of matter that can live

Cell structure is correlated to cellular function

Figure 6.1

10 m

BENTUK-BENTUK SEL

Two Main Forms of Cells

All cells share certain characteristics

They are all enclosed by a membrane They all use DNA as genetic information Eukaryotic Prokaryotic

There are two main forms of cells

TIPE SEL
Sel Bakteri
Prokarotik Sel alga biru Tipe sel

Sel tumbuhan

Eukariotik

Sel Hewan
Sel protista

PERBEDAAN SEL PROKARIOT DAN EUKARIOT

Eukaryotic cells

Are subdivided by internal membranes into various membrane-enclosed organelles

SEL BAKTERI

Pili: attachment structures on the surface of some prokaryotes Nucleoid: region where the cells DNA is located (not enclosed by a membrane) Ribosomes: organelles that synthesize proteins Plasma membrane: membrane enclosing the cytoplasm Cell wall: rigid structure outside the plasma membrane Capsule: jelly-like outer coating of many prokaryotes 0.5 m Flagella: locomotion organelles of some bacteria (b) A thin section through the bacterium Bacillus coagulans (TEM)

Bacterial chromosome (a) A typical rod-shaped bacterium

Figure 6.6 A, B

Prokaryotic cells have a variety of shapes The three most common of which are spheres (cocci), rods (bacilli), and spirals

1 m (a) Spherical (cocci) Figure 27.2ac

2 m (b) Rod-shaped (bacilli)

5 m (c) Spiral

Eukaryotic cells

Are subdivided by internal membranes into various membrane-enclosed organelles

SEL HEWAN

A animal cell
ENDOPLASMIC RETICULUM (ER)

Nuclear envelope Nucleolus Chromatin

Rough ER Flagelium Centrosome

Smooth ER

NUCLEUS

Plasma membrane

CYTOSKELETON Microfilaments Intermediate filaments Microtubules Microvilli Golgi apparatus Peroxisome Figure 6.9 Mitochondrion Lysosome
In animal cells but not plant cells: Lysosomes Centrioles Flagella (in some plant sperm)

Ribosomes

A plant cell
Nuclear envelope NUCLEUS Nucleolus Chromatin Rough endoplasmic reticulum Smooth endoplasmic reticulum Centrosome

Ribosomes (small brwon dots)

Central vacuole Tonoplast Golgi apparatus Microfilaments Intermediate filaments Microtubules

CYTOSKELETON

Mitochondrion Peroxisome Plasma membrane Chloroplast Cell wall Plasmodesmata Wall of adjacent cell
In plant cells but not animal cells: Chloroplasts Central vacuole and tonoplast Cell wall Plasmodesmata

Figure 6.9

MACAM-MACAM ORGANEL SEL DAN FUNGSINYA

STRUKTUR A Nukleus Nukleolus Mitokondria Ribosom R.E. kasar R.E. halus Badan golgi Sentrosom Membran sel

FUNGSI mengendalikan kegiatan sel mengendalikan penggandaan kromosom tempat pembangkit tenaga sel tempat sintesis protein menyalurkan hasil ribosom ke sel- sel yang lain Sintesis protein dan proses detoksifikasi Memproses protein yang akan disekresikan Membentu proses pembelahan sel pengendali lalu lintas zat keluar / masuk sel

MACAM-MACAM ORGANEL SEL DAN FUNGSINYA

B

Lisosom Miofibril Neurofibril Cilia, flagel V. makanan V. berdenyut

penyimpan enzim hidrolitik kontraksi konduksi lokomotio organ digesti organ ekskresi dan osmoregulator

MACAM-MACAM ORGANEL SEL DAN FUNGSINYA

C Dinding sel Kloroplast Amiloplast Elaioplast Kromoplast Vakuola

penguat, pelindung dan pemberi bentuk sel berlangsungnya fotosintesis pembentuk / penyimpan amilum pembentuk / penyimpan minyak penyimpan zat2 warna penyimpan air sel, senyawa anorganik dan senyawa organik

A B untuk sel hewan, AC untuk sel tumbuhan

PERBEDAAN STRUKTUR SEL HEWAN DAN SEL TUMBUHAN

The plasma membrane

Functions as a selective barrier Allows sufficient passage of nutrients Outside of cell and waste
Carbohydrate side chain

Hydrophilic region Inside of cell

0.1 m Hydrophobic region

Figure 6.8 A, B

(a) TEM of a plasma membrane. The plasma membrane, here in a red blood cell, appears as a pair of dark bands separated by a light band.

Hydrophilic region

Phospholipid

Proteins

(b) Structure of the plasma membrane

The nuclear envelope

Encloses the nucleus, separating its contents Nucleus from the cytoplasm
1 m Nucleolus Chromatin Nucleus

Nuclear envelope: Inner membrane Outer membrane

Nuclear pore

Pore complex
Rough ER Surface of nuclear envelope.
0.25 m

Ribosome

1 m

Close-up of nuclear envelope

Figure 6.10

Pore complexes (TEM).

Nuclear lamina (TEM).

Ribosomes Carry

ER out protein synthesis

Cytosol Endoplasmic reticulum (ER) Free ribosomes

Bound ribosomes Large subunit Small subunit

Diagram of a ribosome

0.5 m
TEM showing ER and ribosomes

Figure 6.11

The ER membrane

Is continuous with the nuclear envelope

Smooth ER Rough ER Nuclear envelope

ER lumen Cisternae Ribosomes Transitional ER Transport vesicle Smooth ER Rough ER 200 m

Figure 6.12

Functions of Smooth ER

The smooth ER

Synthesizes lipids Metabolizes carbohydrates Stores calcium Detoxifies poison

Functions of Rough ER

The rough ER

Has bound ribosomes Produces proteins and membranes, which are distributed by transport vesicles

Functions of the Golgi apparatus

Golgi apparatus

cis face (receiving side of Golgi apparatus)

1 Vesicles move 2 Vesicles coalesce to 6 Vesicles also form new cis Golgi cisternae from ER to Golgi transport certain Cisternae proteins back to ER 3 Cisternal maturation: Golgi cisternae move in a cisto-trans direction 4 Vesicles form and leave Golgi, carrying specific proteins to other locations or to the plasma membrane for secretion

0.1 0 m

Figure 6.13
5 Vesicles transport specific proteins backward to newer Golgi cisternae

trans face (shipping side of Golgi apparatus)

TEM of Golgi apparatus

Lysosomes carry out intracellular digestion by

Nucleus 1 m

Phagocytosis

Lysosome

Lysosome contains active hydrolytic enzymes

Food vacuole fuses with lysosome Digestive enzymes

Hydrolytic enzymes digest food particles

Lysosome Plasma membrane Digestion Food vacuole

Figure 6.14 A

(a) Phagocytosis: lysosome digesting food

Autophagy
Mitochondrion fragment

Lysosome containing two damaged organelles

1m

Peroxisome fragment

Lysosome fuses with vesicle containing damaged organelle

Hydrolytic enzymes digest organelle components

Lysosome

Vesicle containing damaged mitochondrion

Digestion

Figure 6.14 B

(b) Autophagy: lysosome breaking down damaged organelle

Central vacuoles

Are found in plant cells Hold reserves of important organic compounds and water

Central vacuole Cytosol

Tonoplast

Nucleus Cell wall

Central vacuole

Chloroplast
5 m

Figure 6.15

Relationships among organelles of the endomembrane system

1 Nuclear envelope is connected to rough ER, which is also continuous with smooth ER

Nucleus

Rough ER

Membranes and proteins produced by the ER flow in the form of transport vesicles to the Golgi

Smooth ER Nuclear envelop

cis Golgi

Golgi pinches off transport Vesicles and other vesicles that give rise to lysosomes and Vacuoles
trans Golgi

Plasma membrane

4 Figure 6.16

Lysosome available for fusion with another vesicle for digestion

5 Transport vesicle carries 6

proteins to plasma membrane for secretion

Plasma membrane expands by fusion of vesicles; proteins are secreted from cell

Mitochondria are enclosed by two membranes

A smooth outer membrane An inner membrane folded into cristae

Mitochondrion Intermembrane space Outer membrane

Free ribosomes in the mitochondrial matrix Inner membrane Cristae Matrix Mitochondrial DNA

100 m

Figure 6.17

Chloroplasts

Are found in leaves and other green organs of plants and in algae

Chloroplast

Ribosomes Chloroplast DNA Stroma

Inner and outer membranes Granum

1 m Thylakoid

Figure 6.18

VIRUS
Terdiri dari : Material genetik Capsid Lapisan lemak Berukuran antara 450 nanometer 30 nanometers Tidak dapat bereproduksi di luar sel hidup

STRUKTUR VIRUS

Enzim di dalam sel banyak yang mengalami pemusatan di tempat-tempat tertentu Tujuan mengoptimumkan kerjasama antarenzim dalam suatu rangkaian metabolisme Contoh:1. kompleks piruvat dehidrogenase, terdiri atas 3 enzim utama yang beriaktan satu sama lain dan kompleks glutamat dehidrogenase . Bagaimana masing-masing mekanismenya ??

BAKTERIOPHAGE

VIRUS INFLUENZA

HUMAN IMUNODEFICIENCY VIRUS (HIV)

MEKANISME TRANSPORT MELALUI MEMBRAN

Difusi Berpindahnya zat terlarut melalui membran dari konsentrasi yang tinggi ke konsentrasi yang rendah, mis: gerakan oksigen masuk ke dalam sel Difusi terfasilitasi / terbantu Molekul berikatan dengan karier protein yang ada di membran kemudian ditransport masuk ke dalam sel; gerakan molekul ini dari yang kadarnya tinggi ke yang kadarnya rendah. Mis: gerakan molekul glukosa masuk ke dalam sel Osmosis Berpindahnya zat pelarut melalui selaput semipermiabel dari zat yang pelarutnya tinggi ke yang pelarutnya rendah

MEKANISME TRANSPORT MELALUI MEMBRAN

Transport aktif Diperlukan energi untuk memindahkan zat dari konsentrasi rendah ke konsentrasi yang lebih tinggi di dalam organisme. Selain memerlukan energi, juga memerlukan enzim yang terdapat dalam membram sel yang berguna untuk memindahkan ion-ion dari tempat yang konsentrasinya rendah ke tempat yang konsentrasinya tinggi

PROSES TRANSPOT AKTIF

KOMPOSISI KIMIA SEL

SEL, JARINGAN DAN ORGAN TERSUSUN ATAS ZAT-ZAT KIMIA. SENYAWA-SENYAWA KIMIA TERSEBUT DIBAGI ATAS 2 KELOMPOK, YAITU 1. SENYAWA ANORGANIK 2. SENYAWA ORGANIK

SENYAWA ANORGANIK

AIR 60 95 % ISI SEL TERDIRI ATAS AIR. AIR MRP MEDIUM BAGI SEMUA REAKSI BIOKIMIA, JUGA MRP ZAT PELARUT ASAM DAN BASA ASAM SBG DONOR PROTON DAN BASA SBG AKSEPTOR PROTON GARAM GARAM-GARAM MINERAL YANG TERLARUT DALAM AIR TERDAPAT DI SEL DALAM BENTUK ION-ION POSITIF MAUPUN NEGATIF. MIS , KATION: Na+, K+; ANION: HCO3, HPO4GAS, misalnya : O2, CO2 dan H2S

SENYAWA ORGANIK
KARBOHIDRAT LIPID PROTEIN ASAM NUKLEAT PIGMEN ENZIM VITAMIN HORMON ANTIBODI

KARBOHIDRAT
BERDASARKAN JUMLAH GULANYA, DIBEDAKAN MENJADI 3 KLAS, YAITU:

MONOSAKARIDA, YG PENTING: RIBOSA, DEOKSIRIBOSA, GLUKOSA, FRUKTOSA, GALAKTOSA DISAKARIDA, YANG PENTING: SUKROSA, LAKTOSA, MALTOSA POLISAKARIDA, YANG PENTING: AMILUM, GLIKOGEN, INULIN, SELLULOSA, KHITIN, LIGNIN

LIPID
BERDASARKAN STRUKTUR KIMIANYA, DIBEDAKAN MENJADI 5 KLAS, YAITU: TRIASILGLISEROL / TRIGLISERIDA/ LEMAK / LEMAK NETRAL LILIN FOSFOLIPIDA SPINGOLIPID, TERDAPAT 3 SUBKLAS: SPINGOMIELIN, SEREBROSIDA DAN GANGLIOSIDA STEROL DAN TURUNAN ESTERNYA

PROTEIN
BERDASARKAN FUNGSINYA DIBEDAKAN MENJADI 7, YAITU: ENZIM PROTEIN TRANSPORT PROTEIN NUTRIEN DAN PENYIMPANAN PROTEIN KONTRAKTIL DAN MOTIL PROTEIN STRUKTURAL PROTEIN PERTAHANAN PROTEIN PENGATUR

DENATURASI PROTEIN

ADALAH:PECAHNYA IKATAN HIDROGENDAN IKATAN NON POLAR DALAM MOL. PROTEIN, SEHINGGA TERJADI PERUBAHAN STRUKTUR SEKUNDER, TERSIER DAN KUARTENER YANG BERAKIBAT BERUBAHNYA SIFAT FISIK DAN FAAT SUATU PROTEIN DISEBABKAN OLEH: ASAM, BASA KUAT, LOGAM BERAT, PEMANASAN, ALKOHOL, SINAR X, SINAR ULTRAVIOLET DAN ZAT-ZAT KIMIA MISALNYA UREA AKIBAT PERUBAHAN2 YG TERJADI MENYEBABKAN BERKURANGNYA DAYA LARUT PROTEIN, HILANGNYA AKTIVITAS ENZIM ATAU HORMON, PERUBAHAN DAN HILANGNYA SIFAT ANTIGEN

PROTEIN

NILAI GIZI PROTEIN DITENTUKAN OLEH BANYAKNYA ASAM AMINO ESENSIAL YANG DIKANDUNGNYA. MAKIN BANYAK AA ESENSIAL DI DALAM MOL. PROTEIN MAKIN TINGGI NILAI GIZINYA. MAKIN SEDIKIT AA ESENSIAL MAKIN RENDAH NILAI GIZINYA AA ESENSIAL ADALAH AA YANG MUTLAK DIPERLUKAN OLEH TUBUH, KRN TDK DPT DISINTESIS TUBUH. AA TSB ADALAH: ILE, LEU; LYS, MET, PHE, THR, TRP, VAL, ARG DAN HIS. AA YANG DPT DISINTESIS TB DISBT AA NONESENSIAL. YANG TERMASUK INI ADALAH: GLU, GLN, PRO, ASP, ASN, ALA, GLY, SER, TYR DAN CYS.

ASAM NUKLEAT

RANTAI POLINUKLEOTIDA LINIER DAN TIDAK BERCABANG BM 25.000 50 MILYAR NUKLEOTIDA TERDIRI ATAS FOSFAT , GULA DAN BASA NITROGEN GULA YANG MENYUSUN ASAM NUKLEAT: RIBOSA DAN DEOSKIRIBOSA BASA NITROGEN: PURIN (TIMIN, CITOSIN, URASIL) DAN PIRIMIDIN ( ADENIN DAN GUANIN) ASAM NUKLEAT: DNA DAN RNA BASA NITROGEN DNA: ADENIN, GUANIN, CITOSIN DAN TIMIN. SEDANGKAN RNA: ADENIN, GUANIN, SITOSIN DAN URASIL

PIGMEN

PIGMEN PADA HEWAN 1. MELANIN (PIGMEN HITAM) 2. HEME(HEMOGLOBIN DAN MIOGLOBIN OTOT MENGANDUNG Fe); HEMOSIANIN (ARTHROPODA DAN MOLUSCA, MENGANDUNG Cu) 3. SITOKROM PIGMEN PADA TUMBUHAN 1. KLOROFIL 2. KAROTENOID 3. XANTHOFIL 4. ANTOSIANIN

ENZIM

ENZIM ADALAH PROTEIN MEMPUNYAI SIFAT2 SPT PROTEIN

FUNGSI: SBG BIOKATALISATOR BEKERJANYA SPESIFIK TDK SEMUA ENZIM HANYA TERDIRI DARI PROTEIN, ADA BBRP ENZIM YG MEMERLUKAN SENYAWA LAIN YAKNI KOFAKTOR (ION LOGAM ATAU SENY. ORGANIK KOMPLEKS DERIVAT DR VITAMIN) BILA KOFAKTOR SENY. ORGANIK KOMPLEKS MAKA BAG. ENZIM YG BUKAN PROTEIN DISBT KOENZIM SEDANGKAN BAG. PROTEINNYA DISBT APOENZIM. GAB. KEDUANYA HOLOENZIM GUGUS PROSTETIK: APABILA KOFAKTORNYA TERIKAT KUAT DENGAN PROTEIN ENZIM

VITAMIN

MIKRONUTRIEN ORGANIK YANG ESENSIAL PADA DIET MANUSIA DIBUTUHKAN DALAM JUMLAH KECIL YI BBRP MIKRO MILI GRAM SENYAWA ESENSIAL, KECUALI BEBERAPA VIT. YI VITAMIN K DAN VITAMIN D MEMPUNYAI PERAN SEBAGAI KOMPONEN ESENSIAL PADA KOENZIM DAN MERUPAKAN GUGUS PROSTETIK VITAMIN: YG LARUT DLM AIR (B DAN C) DAN YANG TDK LARUT DLM AIR TTP LARUT DLM LEMAK (A,D,E,K)

HORMON

DALAM SEL KADARNYA SANGAT RENDAH, NAMUN MEMPUNYAI PERAN YANG SANGAT PENTING YI BERSAMASAMA SARAF MENGKOORDINASI SEGALA PROSES AGAR BERJALAN NORMAL DALAM BEKERJANYA HORMON BERSAMA VITAMIN DAN ENZIM HORMON: ZAT ORGANIK YANG DIBENTUK OLEH KELENJAR ENDOKRIN YI KELENJAR YANG SEKRESINYA LANGSUNG MASUK KE DALAM PEREDARAN DARAH ADA 3 KELAS HORMON YI: HORMON PEPTIDA, HORMON AMINA DAN HORMON STEROID

ANTIBODI

PERANNYA DALAM SEL: MENYERANG ANTIGEN YANG DIHASILKAN BENDA ASING YG MASUK KE DALAM SEL ATAU BERADA PADA CAIRAN INTRASELULER

LIMFOSIT YANG DIBUAT PADA SUMSUM TULANG BELAKANG DAN DICADANGKAN PADA ORGAN AHATI, LIMPA, KELENJAR LIMFE DAN TIMUS ANTIBODI TERGOLONG GLOBULIN, ATAU DISEBUT IMUNOGLOBULIN

DIFERENSIASI SEL

ORGANISME UNISELULER TANPA DIFERENSIASI SEL, PEMBELAHAN SECARA BINER, KONYUGASI MULTISELULER: TERJADI DIFERENSIASI SEL, SETIAP SEL MENGALAMI PERUBAHAN BENTUK DAN FUNGSI SHG MEMPUNYAI STRUKTUR YANG BERBEDA DAN FUNGSI KHUSUS. MISAL: SEL-SEL PADA MANUSIA MRP TURUNAN DARI SEL YANG DIBUAHI (ZIGOT) YANG MEMBELAH MITOSIS SEL MENGALAMI PERUBAHAN BENTUK, STRUKTUR DAN FUNGSI SEHINGGA MENJADI SPESIALIS