Tahap selanjutnya adalah penambahan 175 l neutralization solution kedalam suspensi bakteri, kemudian tabung dikocok dengan cara

dibolak-balik 4-6 kali lalu disentrifugasi pada kecepatan 10000 x g selama 5 menit. Proses pengocokan harus dilakukan secara perlahan untuk mencegah terbentuknya endapan debris bakteri. Dengan penambahan neutralization solution yang dilanjutkan dengan proses sentrifugasi ini dapat terlihat membran-mebran yang telah lysis menggumpal dan menyatu. Sementara lisat bakteri yang telah dinetralkan akan berwarna keruh dan kental. Kemudian supernatan yang berisi DNA dipipet kedalam kolom spin GeneJET dan tabung kolektornya. Endapan yang terdapat pada dasar tabung jangan sampai terpipet karena akan berpengaruh pada kemurnian DNA plasmid yang nantinya diperoleh, karena didalam endapan tersebut terkandung komponen-komponen seperti DNA kromosom dan protein-protein. Proses pemipetan digunakan dengan menggunakan mikropipet. Supernatan yang telah dipisahkan..............................