PemodelanDanKomputasiMolekulObat

Modul6
Hubungan Kuantitatif Struktur Aktivitas (QSAR) Bagian 03
MultipleLinearRegression

TujuanInstruksionalUmum:
Mahasiswa memahami konsep hunbungan kuantitatif antara
beberapasifatfisikokimiasenyawaobatdenganaktivitasbiologinya

TujuanInstruksionalKhusus:
1. Mahasiswa terampil menggunakan program Statistica
untukmembuatpemodelanmatematikadanmengerjakan
multi regresi linear antara satu variabel terikat dan dua
variabelbebas
2. Mahasiswa mampu membuat model matematika
(persamaan)linearyangmenyatakanhubungankuantitatif
antara dua parameter sifat elektronik (energi HOMO dan
LUMO) dan sifat lipofilik (log P) terhadap aktivitas biologi
danmenampilkannyadalambentukgrafik
3. Mahasiswa mampu memperkirakan aktivitas biologi suatu
senyawa berdasarkan model matematika yang dibuat bila
variabelbebasnyadiketahui

TeoriSingkat:
Aktivitas biologi suatu senyawa (obat) dapat dinyatakan sebagai
fungsidariberbagaiparameterstrukturmolekulsenyawatersebut.
Parameter tersebut lazimnya merupakan berbagai karakteristika
fisikokimia senyawa yang karena dapat berfungsi untuk
mendeskripsikan molekul tersebut, dinamakan deskriptor. Secara
sederhanaaktivitasbiologidapatdinyatakansebagaiberikut:

AktivitasBiologi=f(Str.molekul)=f(Karakt.Fisikokimia)=f(Deskriptor)..............(1)

Fenolfenol mempunyai aktivitas sitotoksik terhadap sel leukemia

akibatkemampuannyamembentukradikalbebasyangsangataktif
setelah diinduksi oleh radikal bebas oksigen hasil metabolisme sel
leukimia. Aktivitas senyawa fenolik bergantung pada substituen
fauzanzein@yahoo.com

PemodelanDanKomputasiMolekulObat
yang terikat pada cincin aromatiknya. Substituen ini dapat
mempengaruhisifatelektronikdansifatlipofiliksenyawafenol.
Pada praktikum kali ini, hubungan sifat elektronik (energi
HOMO=Highest Occupied Molecular Orbital, dan energi
LUMO=LowestUnoccupiedMolecularOrbital)dansifatlipofilik(Log
P) 14 senyawa fenol yang tersubstitusi pada posisi para dengan
aktivitassitotoksiknyadimodelkandenganpersamaanregresimulti
linearmenggunakanpendekatanHKSA(QSAR)Hansch.

Modelmatematikaakanberbentuk:
Log1/C=alogP+bEHOMO+cELUMO+d
Log1/C =logaritmakebalikankonsentrasisitotoksiksenyawafenol
LogP =logaritmakoefisienpartisi
EHOMO =energiHOMO
ELUMO =energiLUMO
a,b,c =konstanta
d
=intercept

Tabel1Aktivitasturunanfenolthdselleukemia
ELUMO
Senyawa
EHOMO
Substituen(X) Log1/C LogP
(eV)
(eV)
No
1
H
3,27
1,47
9,49
0,052
2
4Me
3,85
1,94
9,31
0,035
3
4C2H5
3,86
2,47
9,336
0,047
4
4C3H7
4,04
3
9,296
0,066
5
4C4H9
4,33
3,64
9,293
0,067
6
4C5H11
4,47
4,06
9,296
0,067
7
4C7H15
4,49
5,15
9,296
0,067
8
4C8H17
4,62
5,68
9,298
0,063
9
4C9H19
4,75
6,21
9,296
0,066
10
4C(CH3)3
4,09
3,31
9,333
0,059
11
4OH
4,59
0,59
9,055
0,048
12
4OCH3
4,48
1,34
9,089
0,053
13
4CHO
3,08
1,35
9,631
0,539
14
4CN
3,11
1,7
9,59
0,47

fauzanzein@yahoo.com

PemodelanDanKomputasiMolekulObat
TUGASPRAKTIKUM
1. BukaprogramStatistica7.0
2. MasukkansatupersatudatadariTabel1(jenissubstituen,log
1/C,logP,EHOMO,danELUMO)kedalamprogramStatistica7.0
3. Klik tulisan statistics pada toolbar, kemudian klik Multiple
Regression.
4. KliktombolVariables.PilihLog1/Csebagaivariabeldependen
danlogP,EHOMO,danELUMOsebagaivariabelindependen.Lalu
klikOKuntukmemilihlebihdarisatuvariabel,tekandantahan
tombol Ctrl pada keyboard sambil memilih variabel yang
diinginkan.
5. Klik tulisan Advanced pada kotak dialog yang terbuka,
kemudian klik Summary:Regression result. Akan tampak nilai
nilai kriteria statistik, yaitu r (R), r2 (R2), F, dan s (Std. Error of
estimate). Nilai konstanta (intercept) dan nilainilai koefisien
darilogP,EHOMO,danELUMOtampakpadakolomketigadarikiri
yaitu kolom B pada masingmasing baris variabel tersebut.
Kolom di sebelah kolom B berisi nilai standar deviasi dan
interceptdankoefisienlogP,EHOMO,danELUMO.
6. Untuk melihat selisih antara log 1/C hasil eksperimen dengan
log 1/C hasil perhitungan, klik tombol dengan tulisan Multiple
Regressionyangberadadibagiankiribawahlayar.
7. Klik tombol Summary:Residuals & Predicted. Catat nilainilai
pada kolom Observed value (1), Predicted value (2), dan
Residual (3). Kolom (1) adalah nilai log 1/C hasil eksperimen,
kolom (2) adalah nilai log 1/C hasil perhitungan menggunakan
regresimultilinier,dankolom(3)adalahselisihkeduanya.
8. Visualisasikan prediksi log 1/C terhadap log 1/C eksperimen.
Klik tombol bertuliskan Residual Analysis pada bagian kiri
bawah layar. Klik tulisan Scatterplots, kemudian klik tombol
bertuliskanPredictedvsObserbed.
9. Simpan grafik yang muncul dengan klik kanan dan klik Save
Graph.
10. Sajikan persamaan garis regresi linier beserta kriteria statistik
(r,r2,Fdans)besertatabelberisidatalog1/Ceksperimen,log
1/C prediksi beserta selisih keduanya, juga grafik plot log 1/C
prediksiterhadaplog1/Ceksperimen.
fauzanzein@yahoo.com

PemodelanDanKomputasiMolekulObat
11. Interpretasikan hasil perhitungan tersebut dengan kaidah
kajianHubunganKuantitatifStrukturAktivitas!

fauzanzein@yahoo.com