Materi Ujian Akhir Semester

Mata Kuliah Pengantar Aplikasi Komputer 2014

Jurusan Biologi, Fakultas Sains dan Teknologi
Universitas Islam Negeri Maulana Malik Ibrahim
Malang

Nama:leni
setyowati
NIM:13620015
Kelas:A
HP:085749239
809
Tanda tangan:

Ketentuan:

Ujian bersifat take home exam, dikerjakan di rumah.

Cermati perintah pada masing-masing item (nomor), kemudian
baru dijawab.
Jawaban langsung ditaruh di bawah setiap item soal. Item soal
tidak perlu dihapus.
Penyerahan berkas jawaban ujian dalam bentuk tercetak.
Batas akhir penyerahan adalah Rabu, 25 Juni 2014 sampai jam
15.00 WIB di kantor Perpustakaan Pusat oleh ketua kelas
masing-masing.

Gunakan Google Scholar untuk mencari jurnal artikel tentang computational biology.
Pilih 10 artikel jurnal yang Anda yakini paling sesuai dengan topik tersebut. Download
data bibliografinya dengan menggunakan Zotero. Kemudian tunjukkan atau tampilkan
5 artikel jurnal tersebut dalam bentuk daftar pustaka dengan menggunakan model
American Psychological Association 6th edition.
Aluru, S. (2005). Handbook of computational molecular biology. CRC Press. Retrieved
from http://www.google.com/books?hl=en&lr=&id=3Ssws2Zm6IC&oi=fnd&pg=PP1&dq=computational+biology&ots=xUSUGGVyb&sig=khJfWzhjFT5v49CxkEYtmZ2MQmk
Gentleman, R., Carey, V. J., Huber, W., Irizarry, R. A., & Dudoit, S. (2005).
Bioinformatics and computational biology solutions using R and Bioconductor
(Vol. 746718470). Springer. Retrieved from
http://link.springer.com/content/pdf/10.1007/0-387-29362-0.pdf

Gusfield, D. (1997). Algorithms on strings, trees and sequences: computer science and
computational biology. Cambridge University Press. Retrieved from
http://www.google.com/books?
hl=en&lr=&id=6dMhAwAAQBAJ&oi=fnd&pg=PP1&dq=computational+biology&
ots=D_d83_0hN4&sig=a1_u71z6EybdYVIN4Wl7LQ6hxoY
Pachter, L., & Sturmfels, B. (2005). Algebraic statistics for computational biology (Vol.
13). Cambridge University Press. Retrieved from http://www.google.com/books?
hl=en&lr=&id=zjeVawvaA5QC&oi=fnd&pg=PR5&dq=computational+biology&o
ts=F5Sd5O6u6h&sig=XbtbIuzehkfKL8OuJGL8wBTPygY
Waterman, M. S. (1995). Introduction to computational biology: maps, sequences and
genomes. CRC Press. Retrieved from http://www.google.com/books?
hl=en&lr=&id=FHZhIBFl7HUC&oi=fnd&pg=PR13&dq=computational+biology&
ots=VKnsxCCQYZ&sig=ouABsJsnd7DsMrUlxenuDcnfbcA

Dengan Google Book, temukanlah 5 buku tentang ecology. Download data

bibliografinya dengan menggunakan Zotero. Secara manual, lengkapi data
bibliografinya bila Anda anggap kurang. Kemudian tunjukkan atau tampilkan 10 buku
tersebut dalam bentuk daftar pustaka dengan menggunakan model Chicago Manual of
Style (autor-date).
Abedon, Stephen T. 2008. Bacteriophage Ecology: Population Growth, Evolution, and
Impact of Bacterial Viruses. Cambridge University Press.
Alberti, marina. 2007. Advances in Urban Ecology: Integrating Humans and Ecological
Processes in Urban Ecosystems. Springer.
Ayres, Robert U., and Leslie Ayres. 2002. A Handbook of Industrial Ecology. Edward
Elgar Publishing.
Bateson, Gregory. 1972. Steps to an Ecology of Mind: Collected Essays in
Anthropology, Psychiatry, Evolution, and Epistemology. University of Chicago Press.
Begon, Michael. 1996. Ecology: Individuals, Populations and Communities. Blackwell
Science.
Egerton, Frank N. 2012. Roots of Ecology: Antiquity to Haeckel. University of California
Press.
Forman, Richard T. T. 2003. Road Ecology: Science and Solutions. Island Press.
Light, Andrew. 1998. Social Ecology After Bookchin. Guilford Press.
Morton, Timothy. 2007. Ecology Without Nature: Rethinking Environmental Aesthetics.
Harvard University Press.
Peters, Robert Henry. 1991. A Critique for Ecology. Cambridge University Press.

Pilih 5 skripsi jurusan biologi. Masukkan data bibliografinya dalam Zotero. Kemudian
tunjukkan atau tampilkan 5 skripsi tersebut dalam bentuk daftar pustaka dengan
menggunakan model American Psychological Association 6 th edition.
Defi Ratnaningsih, F., & others. (2010). PENGARUH KONSENTRASI ION Cu2+ TERHADAP
ADSORPSI ION Cd2+ DARI LARUTAN Cd (NO3) 2 DAN Cu (NO3) 2 OLEH NATA DE COCO
DENGAN METODE BATCH. SKRIPSI Jurusan Kimia-Fakultas MIPA UM. Retrieved from
http://karya-ilmiah.um.ac.id/index.php/kimia/article/view/9636
Fariha, Y. (2010). Pengaruh Ekstrak Daun Tempuyung (Sonchus arvensis) Terhadap
Daya Hambat Pertumbuhan Bakteri Shigella dysenteriae Dan Escherichia coli Secara In
Vitro. SKRIPSI Jurusan Biologi-Fakultas MIPA UM. Retrieved from http://karyailmiah.um.ac.id/index.php/biologi/article/view/9366

Noor, A. (2010). Penerapan Pembelajaran Berdasarkan Masalah dengan Strategi

Kooperatif Model Numbered Heads Together untuk Meningkatkan Hasil Belajar Biologi
Pokok Bahasan Virus Pada Siswa Kelas X-5 SMA Negeri 7 Malang. SKRIPSI Jurusan
Biologi-Fakultas MIPA UM. Retrieved from http://karyailmiah.um.ac.id/index.php/biologi/article/view/5804
Nurdiana, I. (2009). Penerapan Pembelajaran Kooperatof Model Jigsaw Berbasis
Kecakapan Hidup dalam Upaya Meningkatkan Motivasi Belajar, Aktivitas Belajar dan
Hasil Belajar Siswa Kelas X-4 SMA Negeri 10 Malang. SKRIPSI Jurusan Biologi-Fakultas
MIPA UM. Retrieved from http://karyailmiah.um.ac.id/index.php/biologi/article/view/2955
Rizani, K. Z. (2000). Pengaruh Konsentrasi Gula Reduksi dan Inokulum (Saccharomyces
cerevisiae) pada Proses Fermentasi Sari Kulit Nanas (Ananas comosus L. Merr) untuk
Produksi Etanol. Skripsi, Jurusan Biologi. Fakultas Matematika Dan Ilmu Pengetahuan
Alam, Universtas Brawijaya, Malang.

Sebutkan 5 nama jurnal dalam bidang Biology & Life Sciences yang diterbitkan oleh
MDPI (mdpi.com); dan sebutkan 5 nama jurnal dalam bidang Biotechnology yang
diterbitkan oleh Biomed Central (biomedcentral.com)
Nama Jurnal yang diterbitkan MDPI
1. journal of Developmetal Biology
2. international journal of molecular sciences
3. journal of functional Biomaterials
4. biomolecules
5. biomedicine
nama jurnal yang di terbitkan oleh Biomed central
1. BMC Biochemistry
2. BMC Bioinformatics
3. BMC Biology
4. BMC Biophysics
5. BMC Biotechnology

Melalui DOAJ (doaj.org), carilah artikel yang ditulis oleh Prof. Drs. Sutiman B. Sumitro,
SU., DSc (baik yang ditulis sendiri atau bersama tim). Pilih 3 artikel dan download data
bibliografinya dengan menggunakan Zotero. Kemudian tunjukkan atau tampilkan
dalam bentuk daftar pustaka dengan menggunakan model Chicago Manual of Style
(autor-date).
Arumingtyas, Estri Laras, Sutiman B. Sumitro, and Basuki,Nur. 2012. Identification of
DNA Photolyase Gene of a Drought Tolerance Branching Line of Kenaf
(<i>Hibiscus Cannabinus</i> L.). American Journal of
Plant Sciences 03 (06): 81015. doi:10.4236/ajps.2012.36098.
Paramita, Swandari, Soetomo Soewarto, M. Aris A. Widodo, and Sutiman B. Sumitro.
2010. High Parity and Hormonal Contraception Use as Risk Factors for Cervical Cancer
in East Kalimantan. Medical Journal of Indonesia, November, 268.
doi:10.13181/mji.v19i4.414.
Soeatmadji, Djoko W., Aulanniam Aulanniam, Fatchiyah Fatah, and Sutiman B.
Sumitro. 2005. Detection of GAD65 Autoantibodies of Type-1 Diabetes Using AntiGAD65-Abs Reagent Produced from Bovine Brain Tissue. Medical Journal of Indonesia,
November, 197. doi:10.13181/mji.v14i4.196.

Melalui ProQuest, carilah 3 tesis atau disertasi dalam bidang biologi. Download data
bibliografinya dengan menggunakan Zotero. Kemudian tunjukkan atau tampilkan
dalam bentuk daftar pustaka dengan menggunakan model American Psychological
Association 6th edition.

Apa yang Anda ketahui tentang book section. Berikan 3 contoh book section dengan
menampilkannya sebagai daftar pustaka (menggunakan model American
Psychological Association 6th edition).
Book Section yaitu Buku maupun tulisan ilmiah lain yang dalam satu buku tersebut
terbagi menjadi bagian-bagian
Keiser, S. (1956). Book Section Female Sexuality. Journal of the American
Psychoanalytic Association, 4(3), 563574.
Reiser, S. (1969). Book Section: PsychoanalysisTaught, Learned, and Experienced.
Journal of the American Psychoanalytic Association, 17(1), 238267.
Zetzel, E. R. (1955). Book Section: Recent British Approaches To Problems Of Early
Mental Development. Journal of the American Psychoanalytic Association, 3(3), 534
543.

Apa yang Anda ketahui tentang Google Scholar, BASE, DOAJ, Connecting Repostories,
dan PLoS (Public Library of Science).
Google Schoolar adalah layanan yang memungkinkan pengguna malakukan
pencarian materi-materi pelajaran berupa teks dalam berbagai format publikasi
BASE adalah layanan basis data (database) daring (online)
Direktori of Open Access Journals (DOAJ) adalah situs yang berisi daftar jurnal akses
terbuka dan dikelola oleh Jasa Infrastruktur untuk Open Access (IS4OA).
Connecting Repostories (CORE) adalah suatu proyek bertujuan untuk memfasilitasi
akses dan navigasi di karya ilmiah yang relevan disimpan dalam repositori Open
Access.
PLOS (Public Library of Science) adalah akses terbuka proyek penerbitan ilmiah nirlaba
yang bertujuan untuk menciptakan sebuah perpustakaan dari jurnal akses terbuka dan
literatur ilmiah lainnya di bawah lisensi open content
Pada intinya seluruh program tersebut adalah penyedia jurnal, artikel maupun tulisan
ilmiah yang mudah penggunaannya dan gratis serta efisien

Apa yang Anda ketahui tentang open access. Sebutkan 10 jurnal ilmiah yang bersifat
open access dalam bidang biologi yang diterbitkan di Indonesia. Sebutkan nama jurnal
tersebut, penerbit, dan alamat websitenya.
Open Access atau dapat diterjemahkan sebagai Akses Bebas adalah sebuah
fenomena masa kini yang berkaitan dengan dua hal: keberadaan teknologi digital dan
akses ke artikel jurnal ilmiah dalam bentuk digital. Internet dan pembuatan artikel
jurnal secara digital telah memungkinkan perluasan dan kemudahan akses, dan
kenyataan inilah yang ikut melahirkan Open Access (disingkat (OA), atau lebih

tepatnya Gerakan OA (Open Access Movement). Secara lebih spesifik, OA merujuk

kepada aneka literatur digital yang tersedia secara terpasang (online), gratis (free of
charge), dan meletakkan berbagai berkas, dan setiap berkas itu disediakan untuk
siapa saja yang dapat mengakses. Berdasarkan pengertian itu, maka OA otomatis juga
membebaskan hambatan akses yang biasanya muncul karena biaya (entah itu biaya
berlangganan, biaya lisensi, atau membayar-setiap-melihat alias pay-per-view fees).
1. SIMBIOSIS Journal of Biological Sciences diterbitkan secara berkala oleh S1
Biologi FMIPA UNUD, http://ojs.unud.ac.id/index.php/simbiosis
2. El Hayyah diterbitkan oleh Jurusan Biologi Fakultas Sains dan Teknologi UIN
Maulana Malik Ibrahim Malang, http://ejournal.uin-malang.ac.id/index.php/bio
3. THE JOURNAL OF EXPERIMENTAL LIFE SCIENCE diterbitkan oleh Program
Pascasarjana Universitas Brawijaya, http://jels.ub.ac.id/index.php/jels
4. Jurnal BIOTROPIKA diterbitkan oleh Universitas Brawijaya Malang,
http://biotropika.ub.ac.id/index.php/biotropika
5. Jurnal HPT diterbitkan oleh Universitas Brawijaya Malang,
http://jurnalhpt.studentjournal.ub.ac.id/index.php/jhpt
6. Jurnal BIOTIKA diterbitkan oleh Jurusan Biologi FMIPA, Universitas Padjadjaran,
http://jurnal.unpad.ac.id/biotika
7. Jurnal BIONATURA diterbitkan oleh Lembaga Penelitian dan pengabdian kepada
Masyarakat Universitas Padjadjaran. http://bionatura.unpad.ac.id/
8. Jurnal Prodi BIOEDUKASI diterbitkan oleh mahasiswa Universitas
Muhammadiyah Metro Prodi Pend.Biologi, http://www.ummetro.ac.id/jurnalprodi-2-bioedukasi-(jurnal-pend-biologi)
9. BioEdu diterbitkan oleh UNESA, http://ejournal.unesa.ac.id/index.php/bioedu
10.LenteraBio diterbitkan oleh Jurusan Biologi Fakultas MIPA Unesa,
http://ejournal.unesa.ac.id/index.php/lenterabio/

Melalui search engine, carilah 3 makalah seminar dalam bidang apa saja (bebas).
Anggaplah Anda ingin mengutip ketiga makalah tersebut dalam paper atau tugas
mata kuliah dan memasukkannya dalam daftar pustaka. Buatlah daftar pustaka ketiga
makalah seminar tersebut dengan model American Psychological Association 6 th
edition.
Sugiono, M. (2002). Bioteknologi Untuk Peningkatan Produktivitas dan Kualitas Padi. In
Makalah disampaikan Pada Seminar IPTEK padi Pekan Padi Nasional di Sukamancli_22
Maret.
Suryanto, S. (1991). Prospek Gambut Sebagai Sumberdaya Alam Dalam
Pengembangan Bioteknologi Di Indonesia. In Makalah Seminar Bioteknologi PPI
Perancis.
Yuwono, T. W. (2001). Bioteknologi Modern dan Katastrofi. Makalah seminar.