SEL

BIOANORGANIK

BIOANORGANIK adalah studi tentang elemen anorganik yang digunakan

dalam sistem biologi
SEL adalah unit terkecil dari organisme
o Prokariotik : tidak memiliki membran sel
o Eukoariotik : memiliki membran sel
MEMBRAN SEL berfungsi sebagai lalu lintas molekul dan ion secara dua arah.
BAGIAN-BAGIAN SEL :
Nukleus : Rumah DNA & Pengatur Aktivitas Sel
Mitokondria : respirasi sel
Kloroplas : fotosintesis (hanya dimiliki sel tumbuhan)
Retikulum Endoplasma : Sintesis Protein (RE Halus & RE Kasar)
Badan Golgi : vesikel yang mengandung protein untuk ekspor
Lisosom : membantu ekskresi sel
Peroksisom : menghilangkan racun ( hidrogen peroksida )
KOMPOSISI ZAT ANORGANIK SEL
Unsur-unsur biologis utama : O, H, C, N, P, S, Na, Mg, Ca & K
Semua elemen periode ke-2 dan 3 sebagian besar memiliki fungsi biologis
kecuali Be, Al, dan golongan Gas Mulia

TRANSPORT, TRANSFER DAN TRANSKRIPSI

TRANSPORT AKTIF adalah Proses yang memerlukan energi untuk memompa
molekul dan ion melintasi membran melawan gradien konsentrasi.
TRANSPORT Na & K : Transportasi aktif pertukaran ion natrium dengan ion
kalium.
1. Ion Na+ dari sitoplasma akan berikatan dengan protein pembawa, dalam
keadaan ini protein tersebut mudah sekali berikatan dengan Na + (memiliki
afinitas yang tinggi terhadap Na+).
2. Pengikatan Na+ memicu terjadinya fosforilasi oleh ATP, gugus fosfat akan
menempel pada protein.
3. Fosforilasi menyebabkan perubahan struktur protein, sehingga kehilangan
afinitas terhadap Na+ dan melepaskan ion Na+ ke luar sel.
4. Bentuk baru protein tersebut memiliki afinitas yang tinggi terhadap K +,
sehingga ion K+ dari luar sel berikatan dengan protein pembawa. Ion K+ yang
berikatan memicu dilepaskannya gugus fosfat yang tadinya berikatan.
5. Lepasnya gugus fosfat menyebabkan protein kembali ke bentuk awalnya,
bentuk awal ini memiliki afinitas yang rendah terhadap ion K+.
6. Afinitas yang rendah terhadap K+ menyebabkan ion ini dilepaskan di dalam
sel, dan terjadi pengikatan terhadap ion Na+. Siklus berulang kembali.
TRANSKRIPSI adalah Sintesis RNA dari template DNA, dimana kode genetik
diinterpretasikan sebagai RNA.
SIDEROPHORE adalah adalah ligan polidentat kecil yang memiliki afinitas
sangat tinggi untuk Fe (III).
PELEPASAN Fe DARI TRANSFERIN Sel membutuhkan Fe menghasilkan
sejumlah besar protein yang disebut reseptor transferin (180 kg mol? 1),
yang dimasukkan dalam membran plasma mereka. Protein ini mengikat Feloaded transferin. Mekanisme yang paling disukai untuk penyerapan Fe
melibatkan kompleks reseptor transferin Fe-loaded memasuki sel dengan proses
yang dikenal sebagai endositosis. Dan endositosis, bagian dari membran sel
ditelan oleh dinding, bersama dengan protein terikat membran komponennya,
untuk membentuk vesikel. Rilis berturut-turut sub Fe (III) mungkin terkait

dengan koordinasi karbonat, yang sinergis dalam arti bahwa perlu untuk
mengikat Fe tetapi tidak stabil pada pH rendah. Vesikel kemudian membagi dan
kompleks TF-reseptor dikembalikan ke membran plasma oleh eksositosis, dan Fe
(III), mungkin sekarang dikomplekskan oleh sitrat, dilepaskan ke sitoplasma.
FERITIN (Tempat Penyimpanan Fe) Feritin adalah toko utama non-haem Fe
pada hewan (sebagian Fe ditempati di bin haemoglo- dan mioglobin) dan, ketika
terisi penuh, mengandung 20 persen Fe oleh massa. Hal ini terjadi di semua
jenis organisme, dari mamalia untuk prokariota. Pada mamalia, ditemukan
terutama di limpa dan darah. Ferritins memiliki dua komponen, sebuah 'mineral'
inti yang berisi hingga 4500 atom Fe (feritin mamalia) dan shell protein.
MIYOGLOBIN adalah besi dan oksigen mengikat protein yang ditemukan
dalam jaringan otot vertebrata pada umumnya dan di hampir semua mamalia.
Pada manusia, mioglobin hanya ditemukan dalam aliran darah setelah cedera
otot. Mioglobin milik globin superfamili protein, dan seperti globins lainnya,
terdiri dari delapan heliks alfa dihubungkan dengan loop. Globin manusia
mengandung 154 asam amino.
HAEMOGLOBIN Mioglobin milik globin superfamili protein, dan seperti globins
lainnya, terdiri dari delapan heliks alfa dihubungkan dengan loop. Globin
manusia mengandung 154 asam amino. Terdapat beberapa bentuk
haaemoglobin : tipe fetal (HbF) dan dua bentuk utama haemoglobin dewasa
(HbA1 dan HbA2). Haemoglobin membawa oksigen, sebagian karbondioksida
dan mendapat perubahan pH.
TRANSPOR ELEKTRON adalah tahapan terakhir dari reaksi respirasi aerob.
Transpor elektron sering disebut juga sistem rantai respirasi atau sistem
oksidasi terminal. Transpor elektron berlangsung pada krista (membran dalam)
dalam mitokondria. Molekul yang berperan penting dalam reaksi ini adalah
NADH dan FADH2, yang dihasilkan pada reaksi glikolisis, dekarboksilasi
oksidatif, dan siklus Krebs.
SITOKROM diidentifikasi bertahun-tahun yang lalu sebagai pigmen sel. Mereka
berisi sebuah kelompok porfirin Fe dan istilah 'sitokrom' dapat merujuk pada
sebuah protein UAL individ- dan subunit enzim yang lebih besar yang berisi
kofaktor tersebut.

SIKLUS BIOLOGI

SIKLUS NITROGEN melibatkan banyak senyawa yang bersifat racun dan

berbahaya untuk lingkungan. Amonia adalah senyawa yang sangat penting
untuk biosintesis asam amino dan NO3- digunakan sebagai oksidan. Seluruh
proses siklus nitrogen biologis melibatkan semua jenis organisme dan berbagai
macam enzim logam (metalloenzyme).

Nitrogenase mengkatalis reaksi berikut.

Nitrat oksida mengikat

haem Fe guanylyl cyclase, yang mengkatalis
pembentukan siklik regulator guanosine monophosphate (cGMP) dari guanosine
triphosphate.
Protein pengikat NO lainnya yaitu nitrophorin yang ditemukan dalam parasit
penghisap darah.
Nitrophorin mengikat NO dengan kuat sampai disuntikkan ke korbannya, dimana
perubahan pH yang menyebabkan terlepasnya NO.
NO yang bebas menyebabkan pelebaran pada pembuluh darah, yang
menyebabkan korbannya menjadi pendonor yang baik.
SIKLUS HIDROGEN
Diperkirakan 99% makhluk hidup memanfaatkan hidrogen. Hampir seluruhnya
adalah mikroba. Hampir semua bakteri dan archaea memiliki metalloenzymes
sangat aktif, yang dikenal sebagai hidrogenase, yang menkatalis interkonversi
H2 dan H+ (sebagai air). Hidrogenase merupakan enzim yang sangat
aktif.Hidrogenase dibagi menjadi tiga kelas berdasarkan sisi aktifnya. Semuanya
mengandung Fe dan ada beberapa juga yang mengandung Ni. Sisi aktif [NiFe]
hidrogenase dan [Fefe]-hidrogenase bereaksi dengan O2, biasany ireversibel,
dan sensitivitas ini adalah faktor pembatas dalam pengembangkan dan
pemanfaatkan produksi H2 terbarukan oleh mikroorganisme.

PROSES KATALISIS

Peran enzim adalah sebagai katalis sangat selektif untuk reaksi kimia yang
terjadi dalam organisme dan mempertahankan aktivitas kehidupan.
KATALIS ASAM BASA :
1. Enzim Seng (Zn) : Sebuah ion Zn memiliki tingkat pertukaran ligan
dan kekuasaan polarisasi. Dan memiliki kemampuan mengikat kuat
ligan protein, pertukaran ligan yang cepat (H2O terkoordinasi atau
substrat molekul), afinitas elektron yang cukup tinggi, fleksibilitas
geometri koordinasi, dan tidak ada komplikasi kimia redoks. Karena
itulah, Zn cocok untuk menjadi katalis reaksi asam-basa spesifik.
Enzim Zn banyak macamnya antara lain karbonat anhidrase,
carboxypeptidases, alkali fosfatase, beta-lactamase, dan alkohol
dehidrogenase
2. Enzim Magnesium (Mg) : Peran utama Mg dalam katalisis enzim
adalah sebagai Mg-ATP kompleks yang merupakan substrat di kinase,
enzim yang mentransfer gugus fosfat sehingga mengaktifkan senyawa
target atau menyebabkan ia mengubah konformasi. Kinase
dikendalikan oleh kalmodulin dan protein lainnya, sehingga mereka
adalah bagian dari mekanisme signaling pada organisme yang lebih
tinggi.
3. Enzim Besi (Fe): Besi sebagai katalis terdapat pada reaksi fosfatase
asam mengkatalisasi hidrolisis ester fosfat, dengan aktivitas optimal
pada kondisi asam ringan. Mereka terlibat dalam pemeliharaan tulang
dan hidrolisis protein terfosforilasi. Mereka juga mungkin memiliki
fungsi lain, seperti transportasi Fe.
4. Enzim Berkaitan Dengan H2O2 dan H2O :
o Peroksida Haem mengandung peroksidase, seperti yang
dicontohkan oleh horseradish peroksidase (HRP) dan sitokrom
c peroksidase (PKC), mengkatalisis reduksi hidrogen
peroksida:

o Oksida
Sitokrom c oksidase adalah enzim yang terikat
membran yang mengkatalisis reduksi empat elektron dari O2
ke air, menggunakan sitokrom c sebagai donor elektron.
reaksi yang sebenarnya dikatalisis oleh sitokrom c oksidase
adalah:

o Oksigenase Oksigenase mengkatalisis penyisipan atom satu

atau kedua O dari O2 ke substrat, sedangkan dengan Fe2+
dan Cu2+ mengandung oksidase kedua atom O berakhir
sebagai H2O.
FOTOSINTESIS (PRODUKSI OKSIGEN) : Fotosintesis adalah produksi molekul
organik menggunakan energi matahari. Fotosintesis dibagi menjadi reaksi
cahaya (proses dimana energi elektromagnetik terjebak) dan reaksi gelap (di
mana energi yang diperoleh dalam reaksi cahaya digunakan untuk
mengkonversi CO2 dan H2O menjadi karbohidrat).
REAKSI COBALT (Co) DENGAN ENZIM : Kompleks kobalt macrocycle adalah
kofaktor pada enzim yang mengkatalisis reaksi transfer metil dan mereka juga
penting untuk dehalogenasi dan penyusunan ulang radikal berbasis (misalnya,
isomerizations).
TRANSFER OKSIGEN ATOM OLEH MOLIBDENUM DAN TUNGSTEN ENZIM
Molibdenum dan tungsten adalah elemen yang lebih berat hanya dikenal sejauh
memiliki fungsi tertentu dalam biologi. Molibdenum tersebar luas di semua
bentuk kehidupan, dan bagian ini berkaitan dengan kehadirannya di enzim
selain nitrogenase.
Sebaliknya, W telah sejauh ini hanya ditemukan di prokariota. Enzim
molibdenum mengkatalisis oksidasi dan reduksi molekul kecil, terutama spesies
anorganik. Reaksi termasuk oksidasi sulfit, arsenit, xanthine, aldehida, dan
karbon monoksida, dan pengurangan nitrat dan dimetil sulfoksida (DMSO).

SENSOR

METALLOPROTEIN : : istilah untuk protein yang mengandung kofaktor ion

logam(metal). Sejumlah metalloprotein digunakan untuk mendeteksi dan
mengukur keberadaan molekul kecil seperti O2, NO, dan CO
PROTEIN Fe SEBAGAI SENSOR : contoh : Fe Cluster, Koordinasi FeS Cluster
dengan berbagai belahan protein mengendalikan struktur tersier protein.
Sensivitas Cluster untuk Oksigen, Potensial elektrokimia, atau konsentrasi Fe
dan S membuat FeS Cluster menjadi perangkat sensorik yang penting.
PROTEIN SENSING LEVEL Cu & Zn : Tingkat Cu dalam sel sangat ketat,
hingga tidak ada Cu yang tidak terkomplekskan. Tingkat Cu yang dirasakan dan
dikonversi ke sinyal sel berasal dari studi pada sistem E. coli, yang melibatkan
faktor transkripsi yang disebut CueR . Untuk Zn hampir sama seperti Cu
dibutuhkan bantuan dari bakteri, Perbedaan utamanya dengan Cu adalah
meskipun Zn juga dikoordinasikan (terutama) oleh cysteine-thiolates,
geometrinya adalah tetrahedral bukan linier.

MEDIS

THERAPI KHELASI : Therapi khelasi berguna untuk mengobati Iron overload

atau kelebihan besi adalah penyakit berlebihannya kadar zat besi dalam tubuh
yang dikarenakan oleh berbagai sebab. Fe sangat beracun, berlebih saat

bereaksi dengan O2 akan menghasilkan radikal bebas yang berbahaya.

Pengobatan yang paling banyak dipakai untuk terapi khelasi besi adalah
Desferrioxamine (Desferral).
PENGOBATAN KANKER : Prinsip penemuan pengobatan kanker adalah untuk
menerapkan obat yang dapat menghancurkan sel-sel kanker secara selektif. Cis[PtCl2(NH3)2] (cisplatin) adalah obat kemoterapi yang digunakan untuk
mengobati berbagai macam kanker. Di dalam sel-sel kanker diduga dua ligan Cl
pada cisplatin disubsitusikan oleh dua molekul air membentuk ion kompleks cisdiaminadiaquaplatina(II), cis-[Pt(NH3)2(H2O)2]2+.
Cis-[Pt(NH3)2(H2O)2]2+, setelah melepaskan dua molekul H2O yang diikatnya,
membentuk ikatan dengan dengan atom nitrogen pada basa nitrogen guanine
(G) yang terdapat dalam DNA.
OBAT ANTI ARTHRITIS : Artritis reumatoid adalah peradangan kronis pada
sendi dan bisa berdampak pada jaringan di sekitar persendian. Perandangan
muncul karena kerja enzim hidrolitik dalam lisosom yang berasosiasi dengan
badan golgi. Pengobatan artritis rheumatoid dengan menggunakan pengobatan
emas. Pengobatan ini memiliki mekanisme dengan cara Au terkumpul di
lisosom, ada kemungkinan Au mencegah enzim hidrolitik ini.