Molecular Effects of Doxycycline Treatment on Pterygium as Revealed by Massive

Transcriptome Sequencing

Abstrak

Pterigium adalah lesi pada permukaan mata yang melibatkan proliferasi sel, migrasi,
angiogenesis, fibrosis, dan remodelling matriks ekstraselular. Operasi adalah metode yang
disetujui untuk mengobati gangguan ini, namun tingkat kekambuhannya tinggi. Baru-baru
ini, telah ditunjukkan dalam model tikus bahwa pengobatan dengan doksisiklin
mengakibatkan pengurangan lesi pterigium. Disini kita mempelajari mekanisme aksi dari
doksisiklin yang mencapai hasil ini, menggunakan teknik sekuensing masif. Pembedahan
pterigium dari 10 pasien berturut-turut ditetapkan dalam jangka pendek dan terpapar 0
(kontrol), 50, 200, dan 500 mg/ml doksisiklin selama 24 jam, mRNA mereka dimurnikan,
reverse ditranskrip dan sequencing melalui protokol sekuensing masif Illumina. Data yang
diperoleh dinilai ke dalam normalisasi kuantil dan dianalisis menggunakan software Plugin
cytoscape untuk menjelajahi jalur yang terlibat. Metode False Discovery Rate (FDR)
digunakan untuk mengidentifikasi 332 gen yang dimodifikasi ekspresi mereka tergantung
dosis pada paparan doksisiklin. Jalur selular yang lebih mewakili termasuk semua gen
mitokondria, respon stres retikulum endoplasma, integrin dan komponen matriks
ekstraselular, serta faktor pertumbuhan. Sebuah korelasi yang tinggi diperoleh ketika
membandingkan data ultrasequencing dengan hasil qRTPCR dan ELISA. Doksisiklin secara
signifikan mengubah ekspresi jalur seluler yang penting dalam sel pterigium, dengan cara
yang konsisten dengan efikasi yang diamati dari antibiotik ini untuk mengurangi lesi
pterigium dalam model tikus. Uji klinis sedang dilakukan untuk menunjukkan apakah ada
manfaat bagi pasien manusia.