Transkripsi pada Prokariotik

Segmen DNA yang ditranskripsi pada Prokariotik untuk menghasilkan satu molekul
RNA disebut Unit transkripsi. unit transkripsi mungkin setara dengan gen individual, atau
mungkin termasuk beberapa gen yang berdekatan. transkrip besar yang membawa urutan
coding dari beberapa gen yang umum di bakteri.

Proses transkripsi dapat dibagi

menjadi tiga tahap:

1. inisiasi rantai RNA baru,

2. pemanjangan rantai, dan
3. terminasi transkripsi dan pelepasan
molekul RNA yang baru lahir.

(sumber: Snustad dan Simmons, 2012)

RNA polimerase E. coli memiliki berat molekul sekitar 480.000 dan terdiri dari lima
polipeptida. Dua di antaranya adalah identik. Dengan demikian, enzim berisi empat polipeptida yang
berbeda. Molekul RNA polimerase lengkap. Molekul RNA polimerase lengkap, holoenzyme,
memiliki komposisi 2. Subunit terlibat dalam perakitan inti tetrameric ( 2) dari RNA
polimerase. Subunit berisi trifosfat situs pengikatan ribonucleoside, dan subunit mengikat DNA
wilayah. Faktor sigma () merupakan sebuah subunit yang hanya terlibat pada tahap inisiasi
dan tidak memiliki peran dalam pemanjangan rantai. Faktor berfungsi untuk mengenali dan
mengikat DNA polymerase untuk melakukan transkripsi dalam DNA. Enzim inti yang tidak
mengandung akan dikatalis oleh sintesis RNA di dalam DNA template sedangkan enzim yang
tidak mengandung akan diinisiasi oleh rantai RNA secara acak dalam DNA.
 Proses Inisiasi rantai-rantai RNA terlibat dalam tiga tahap: (1) ikatan polimerase
holoenzim untuk wilayah promotor di DNA; (2) terbukanya 2 untai DNA local oleh RNA
polimerase; (3) pembentukan ikatan fosfodiester antara beberapa ribonukleotida pada rantai
RNA yang baru dibentuk. Urutan nukleotida yang diprediksikan pada inisiasi disebut sebagai
upstream sequences dan yang mengikuti inisiasi disebut downstream sequences.
Pemanjangan rantai RNA dikatalisis oleh RNA polimerase enzim inti, ini terjadi
setelah melepas subunit (sigma). Molekul RNA polimerase terdiri atas DNA yang
terbuka dan aktivitas DNA yang melilit segmen DNA lokal yang terbuka. RNA baru yang
dihasilkan dipindahkan dari untai cetakan DNA sebagai RNA polimerase yang bergerak
sepanjang molekul DNA.
Proses Elongasi rantai RNA dikatalisis oleh enzim inti RNA polimerase
setelah subunit rilis. Perpanjangan kovalen rantai RNA berlangsung dalam
gelembung transkripsi. Molekul RNA polimerase mengandung DNA unwinding
dan DNA rewinding. RNA polimerase terus terurai menjadi DNA helix ganda
menjelang polimerisasi dan menggulung untaian DNA komplementer dibalik
situs polimerisasi ketika bergerak sepanjang helix ganda. Pada E. coli, panjang
rata-rata gelembung transkripsi adalah 18 pasang nukleotida, dan sekitar 40
ribonucleotides dimasukkan ke dalam rantai RNA tumbuh per detik. Rantai RNA
yang baru lahir dipindahkan dari untai DNA template sebagai bergerak RNA
polymerase sepanjang molekul DNA.
 Proses elongasi pada E.coli

Sumber: Snustad dan Simmons, 2012

Proses terminasi rantai DNA terjadi ketika RNA polymerase bertemu dengan
sebuah sinyal terminal. Ketika terminasi terjadi, transkripsi menghasilkan molekul RNA baru.
Terdapat dua jenis terminal transkripsi pada E. coli, yaitu rhodependent terminators dan
rho-independent terminators. Rhodependent terminators adalah terminator yang
melibatkan tprotein . Rho-independent terminators merupakan terminator yang tidak terdapat
keterlibatan . Struktur hairpin DNA segera setelah disintesis dan akan memperlambat
pergerakan molekul RNA polymerase sepanjang DNA. Pergerakan molekul RNA polymerase
ini dapat menyebabkan jeda di rantai yang diperpanjang. Rantai RNA yang disintesis terbaru
dari DNA template dibebasankan kerena jeda yang dibuat oleh RNA polymerase. Pada
prokariota, translasi dan degradasi molekul mRNA sering dimulai sebelum sintesis
(transkripsi) selesai. Sejak molekul mRNA disintesis, ditranslasi, dan didegradasi pada
arah ujung 5 ke 3. Pada prokariotik sintesis polipeptida tidak dipisahkan oleh selubung
nukleus dari tempat selubung mRNA.

Rujukan
Snustad, D.P. & Simmons M. J.. 2012. Principle of Genetics. United States of America: John
Wiley & Sons, Inc.

Pertanyaan

1. Apakah perbedaan transkripsi yang terjadi antara eukariot dan prokariot?

Jawab:

Transkripsi yang terjadi pada eukariot dan prokariot memiiki ciri yang sama, perbedaannya
terletak pada detailnya. Hal ini membuat para peneliti menggunakan RNA polymerase E.
coli untuk mempelajari perbedaan transkripsi yang terjadi antara eukariot dan prokariot.