APAKAH Z-DNA MEMAINKAN PERAN REGULASI?

Z-DNA ada pada daerah interband kromosom raksasa kelenjar ludah dari Drosophila
melanogaster dan makronukleus aktif bertranskripsi dari silia protozoa Stylonycbia mytilus.
Antibodi . Z-DNA; ini tidak bereaksi dengan B-form DNA. Antibodi Z-DNA-spesifik
mengikat ke daerah interband polytene kromosom dari D. melanogaster . Hal ini diperlukan
menentukan urutan dan pola metilasi DNA di daerah interband kromosom ini polytene.
Keterlibatan Z-DNA ekspresi gen adalah mengatur struktur protein tertentu yang dapat
mengikat dalam alur utama helices double kidal, tapi helices tidak kidal. Pada kenyataannya,
D. B. McKay dan Ta Steitz telah mengusulkan bahwa protein aktivator catabolite
menstabilkan yang mengikat CAP urutan dalam konformasi kidal. Mereka mengusulkan
bahwa transisi ini dalam heliks ganda dua berikatan dengan RNA polimerase . Dengan
demikian dapat mengaktifkan transkripsi gen struktural yang berdekatan. Protein ini menjadi
penekan yang bertindak dalam arah yang berlawanan dalam menstabilkan urutan dalam
bentuk B kidal dan mencegah transkripsi.

STRUKTUR KROMATIN: NUKLEASE SENSITIF BERDEKATAN DENGAN GEN-

GEN AKTIF

Pada tahun 1976, M. Groudine dan H. Weintraub menunjukkan bahwa gen

hemoglobin hadir dalam Kromatin dari sel-sel darah merah ayam berusia 18 hari lebih
sensitif terhadap degradasi oleh pankreas deoxyribonuclease 1 (DNAse 1) daripada gen
ovalbumin (tidak dinyatakan dalam merah sel-sel darah) di Kromatin dari sel-sel yang sama
atau gen hemoglobin dalam Kromatin terisolasi dari fibroblast atau sel-sel otak ayam sama.
Percobaan ini dilakukan menggunakan globin dan ovalbumin cDNAs (DNA urutan disintesis
di vitro oleh transkriptase menggunakan globin dimurnikan dan ovalbumin mRNAs sebagai
template, lihat Bab 13, p exp lu-354) sebagai hibridisasi probe untuk mengukur jumlah globin
dan ovalbumin urutan gen di terisolasi Kromatin sebelum dan sesudah parsial pencernaan
dengan DNase 1. Dalam percobaan ini, lebih dari 50 persen sekuensi DNA transcriptionally
aktif gen telah sudah telah rusak pada waktu Kapan hanya 10 persen dari total DNA telah
dihidrolisis oleh DNase . Studi tentang subsequen telah menunjukkan kepekaan nuclease
transcriptionally active gen dalam beberapa organisme lain. Selain itu, kepekaan nuclease
Gen-gen aktif telah ditemukan tergantung pada kehadiran dua nonhistone protein kromosom
yang disebut HMGi4 dan HMG17 (HMG untuk bigh mobilitas group; kecil protein dengan
mobilitas yang tinggi selama polyacrylamide Elektroforesis) . Ketika protein ini akan dihapus
dari Kromatin aktif, nuclease sensitivitas hilang. Ketika mereka ditambahkan kembali,
kepekaan kembali.

MENGENDALIKAN HORMON EKSPRESI GEN

Peptida hormon seperti insulin dan hormon steroid seperti estrogen dan testosteron
mewakili dua jenis sistem sinyal yang dimanfaatkan dalam interselular komunikasi. Pada
hewan tingkat tinggi, hormon disintesis di berbagai khusus sekresi sel dan dilepaskan ke
dalam bioodstream. Peptida hormon tidak biasanya memasuki sel karena ukurannya yang
relatif besar lainHormon steroid, di sisi lain, adalah molekul kecil yang mudah masuk sel
melalui selaput plasma. Reseptor protein hadir hanya dalam sitoplasma sel target (contoh
diferensiasi sel pada tingkat molekuler).

AKTIVASI TRANSKRIPSI HESE OLEH HORMON STEROID

Autoradiographic studi menunjukkan bahwa protein kompleks dengan cepat

menumpuk di nuclet sel target. Pada ayam telah dibuktikkan bahwa hormon-reseptor protein
kompleks mengaktifkan transkripsi gen tertentu atau set genes. Penelitian selanjutnya telah
menunjukkan bahwa setidaknya beberapa dari ini hormon-reseptor protein kompleks
promotor daerah Gen-gen aktif mengaktifkan transkripsi gen target dengan mengikat DNA
tertentu. Hormonereceptor protein kompleks berinteraksi dengan non-histone kromosom
protein (non-histone protein spesifik hanya hadir di Kromatin sel target) . Menurut J. Stein, G.
Stein dan L Kleinsmith, Nonhistone kromosom protein dapat mengendalikan keadaan
transcriptional gen tertentu. Jika kromatin dari fase G 1 (masa setelah selesainya mitosis,
tetapi sebelum S) digunakan, tidak ada histone mRNA disintesis. Ketika nonhistones akan
dihapus dari G 1 tahap Kromatin dan diganti dengan nonhistone protein kromosom dari S fase
Kromatin. Di sisi lain, ketika nohistones di dilarutkan Kromatin dari dilabeli G 1 tahap sel dan
DNA dan histones dari ing stu S-tahap sel, histone mRNA tidak disintesis. Hasil ini
menunjukkan bahwa protein nonhistone dalam Kromatin menentukan apakah pengkodean
gen untuk ditranskrip. Protein kromosom nonhistone yang memainkan peran penting dalam
regulasi ekspresi gen dalam bersel satu.

PENGATURAN HORMON GLUKOKORTIKOID MELALUI PENAMBAH UNSUR

Mamalia menghasilkan sejumlah hormon steroid yang berbeda menyebabkan

sejumlah perubahan metabolik dalam sel yang berbeda dari berbagai jaringan. Hormon
steroid yang diberikan akan memiliki efek yang berbeda pada sel yang berbeda jenis.
Meskipun mekanisme yang sebagian besar hormon steroid bertindak hormon steroid yang
masih belum diketahui, spesifik seperti glukokortikoid (misalnya kortisol) dan estrogen
(misalnya, B-estradiol) telah ditunjukkan untuk mengaktifkan gen target tertentu oleh
protein-dimediasi. Interaksi dengan urutan peraturan cis-bertindak. Urutan cis-bertindak ini
biasanya disebut Enhancer meskipun mereka berbeda dari Enhancer klasik dalam bahwa
mereka mempengaruhi transkripsi delapan dari promotor terdekat hanya ketika hormon
reseptor protein kompleks terikat kepada mereka.

Hormon glukokortikoid memberikan contoh bestdocumented ekspresi gen diaktifkan

hormon steroid. Efek dari hormon glukokortikoid telah dianalisis dengan menggunakan
hormon sintetis yang disebut dexamchasome. Hormon-reseptor protein kompleks kemudian
terakumulasi dalam mengikat inti sel untuk sekuensi DNA tertentu yang disebut
glukokortikoid menanggapi elemen (GREs). Ketikhadiran menyebabkan sitoplasma protein
mencegah reseptor protein membentuk dimeryang dapat membentuk DNA pengikat reseptor.

ECDYSONE DAN CHROMOSONC "MENARIK" DALAM LALAT

Pada kromosom kelenjar ludah raksasa dari spesies Drosophila dan Chironomus
tentans, individu kromosom band undergostriking mengalami perubahan morfologi pada
waktu tertentu selama proses pengembangan. Band individu memperluas dan menyebarpada
stining struktur disebut "Puff"). Fenomena ini mewakili segmen kromosom yang dalam
keadaan diperpanjang untuk memfasilitasi transkripsi gen. Melalui di situhibridisasi dan
autoradiography (Puff telah ditunjukkan untuk mengandung urutan DNA yang melengkapi
urutan RNA dalam mensintesis sitoplasma mRNA. Selama pengembangan dipteran lalat,
ecdysone hormon steroid dilepaskan dan memicu pergantian kulit. Pola-pola yang sangat
spesifik dari kelenjar ludah kromosom engah terjadi selama molting. Jika larva D.
melanogaster dan C tentans diperlakukan dengan ecdysone pada tahap pembangunan sebelum
atau antara moltings, pola kromosom engah terjadi yang identik dengan yang terjadi selama
moltings alami. Puff diinduksi oleh pola ecdysone berurutan . Efek steroid burmone ekspresi
gen pola engah diamati sangat spesifik dan benar-benar berulang dari percobaan untuk
percobaan. Selain menggambarkan pengaruh hormon steroid ekspresi gen, pola mengepulkan
asapnya diinduksi ecdysone menyediakan bukti bagi keberadaan terprogram pola ekspresi
gen dalam bersel satu.

PERATURAN OLEH JALUR ALTERNATIF TRANSKRIP PENYAMBUNGAN

 Peraturan transcriptional memainkan peran penting dalam mengontrol pembangunan
di bersel satu. Peraturan terjadi dengan mengubah stabilitas transkrip, diferensial transportasi
ke sitoplasma dan oleh diferensial terjemahan dari olahan transkrip. Salah satu contoh paling
umum adalah mode-mode alternatif transkrip splicing terjadi dalam kasus tropomyosin gen
Drosophila dan hewan vertebrata. Tropoomyosins erat terkait protein yang menengahi aktin
diantara interacations dan troponin. Dengan demikian dapat membantu muntuk engatur
kontraksi otot. Pada jaringan yang berbeda, otot dan nonmuscle ditandai dengan kehadiran
tropomyosin isoforms yang berbeda. Banyak dari isoforms yang menghasilkan gen yang
sama oleh penyambungan alternatif. Tropomyosin transkrip splicing pola yang muncul untuk
menjadi lebih kompleks di Mamalia, setidaknya da 10 sioforms yang berbeda berasal dari gen
tunggal.

PERATURAN SIRKUIT KOMPLEKS EKSPRESI GEN DALAM BERSEL SATU

Menurut Britten-Davidson, gen tertentu mewakili situs-situs pengikatan urutan

(analog dengan CAP-CAMP mengikat situs dalam E. coli lac promotor) yang menanggapi
sinyal tertentu seperti hormon-reseptor proteir complexes). Ketika gen sensor menerima
sinyal yang tepat, mereka mengaktifkan transkripsi gen yang berdekatandengan integrator.
Produk gen integrator kemudian berinteraksi secara khusus dengan receptorgenes . Britten
dan Davidson berpendapat bahwa integrator gen-produk adalah aktivator RNA yang
berinteraksi langsung dengan gen reseptor untuk memicu transkripsi gen produser berdekatan
dengan analog struktural gen dalam prokariotik operons. Namun, mereka menunjukkan
bahwa, secara formal, itu akan membuat tidak adanya perbedaan antara produk-gen aktif
integrator molekul RNA atau protein.

Davidson-Britten mneyebutkan bahwa , ekspresi gen diatur di RNA. Menurut model

yang disuungnya ini, sebagian besar gen struktural berada di konstitutif transkripsi unit, yang
ditranskripsi pada tingkat basal dalam semua sel. Transkrip konstitutif ini diproses, namun,
hanya dalam sel-sel yang berisi sesuai untuk dapat mengintegrasikan peraturan transkrip"
yang ditranskripsi secara spesifik sel dan harus ada sebelum transkrip konstitutif dari
struktural gen yang dapat diolah menjadi mRNAs. Perbedaan utamanya adalah bahwa
peraturan terjadi posttranscriptionally selama RNA pengolahan di model Davidson Britten
baru, bukan transcriptionally seperti model asli

QUESTION AND ANSWER

Yunaida Dwi Permata (150342607628)

1. Mengapa gen konstitusif diekspresikan secara terus menerus ?

Pada Pengaturan Ekspresi Gen Telah diketahui dengan pasti bahwa ekspresi
gena diketahui oleh transkripsi DNA menjadi mRNA yang selanjutnya
ditranslasi menjadi molekul protein. Gena yang ekspresinya diatur,
dikelompokkan dalam keluarga gena - diatur, sedang gena yang ekspresinya
tidak diatur, dikelompokkan dalam kelurga gen konstitutif. Gen konstitutif
akan diekspesikan secara terus menerus karena tidak terpengaruh oleh
mekanisme pengaturan, seperti misalnya oleh faktor lingkungan atau faktor
perkembangan. Sebagai contoh adalah gen untuk histon atau komponen
ribosom diekspresikan secara terus-menerus

2. Bagaimana elemen regulator dalam memodulasi trakskripsi pada eukariot ?

Elemen regulator terdiri dari enhancer dan silencer. Enhancer berfungsi untuk
meningkatkan transkripsi dan silencer berfungsi untuk mengurangi transkripsi.
Enhancer merupakan elemen yang tergolong besar, bekerja untuk
menyelesaikan keseluruhan atau bagian khusus dari jaringan tertentu, maka
dari itu enhancer hanya akan meningkatkan transkripsi dari gen-gen target
yang bersifat kebutuhan spesisfik. Contoh : Enhancer terletak diantar gen -
hemoglobin dan gen -hemoglobin; enhancer tersebut merangsang transkripsi
gen -globin selama perkembangan embrionik dan merangsang tranksripsi gen
-globin saat dewasa