Enzim

Enzim adalah protein yang mengkatalisis reaksi biokimia. Merupakan katalis biologi yang dapat
mempercepat reaksi biokimia tanpa ikut habis bereaksi
Semua enzim adalah protein. Enzim bekerja efisien dan spesifik dalam kerja katalitiknya.
Kespesifikan disebabkan oleh bentuknya yang unik dan oleh gugus-ugus polar atau non polar
yang terdapat dalam struktur enzim itu. Untuk aktivitas biologis, beberapa enzim memerlukan
gugus prostetik atau kofaktor. Kofaktor ini merupakan bagian non protein dari enzim. Kofaktor
dapat berupa ion logam sederhana seperti tembaga yang menjadi kofaktor bagi enzim asam
askorbat oksidase.
a. Menamai enzim
Kebanyakan enzim diberi nama menurut reaksi yang dikatalisisnya. Biasanya akhiran
untuk nama enzim ialah ase. Nama itu bersifat umum dan merujuk ke suatu kelas enzim
yang mengkatalisis suatu tipe reaksi. Misalnya polymerase adalah enzim yang
mengkatalisis suatu reaksi polimerisasi. Suatu nama enzim dapat juga merujuk ke suatu
enzim spesifik misalnya asam askorbat oksidase yaitu enzim yang mengkatalisis oksidasi
asam askorbat
b. Bagian enzim bekerja
Berdasarkan teori induksi pas (induced fit), enzim diibaratkan dapat melakukan
penyesuaian bentuk untuk berikatan dengan suatu substrat. Hal ini ditujukan untuk
meningkatkan kecocokan dengan substrat dan membuat ikatan antara enzim dan substrat
menjadi lebih reaktif.
E+S E-S E-P E+P
A. Biosintesis Peptida
Biosintesis peptida dan protein dalam suatu sel yang khas dilaksanakan oleh asam
ribonukleat (RNA) dan enzim. Berbagai tipe RNA, seperti RNA pesuruh (mRNA), disintesis
di bawah pengarahan DNA dalam inti sel. Kemudian molekul-molekul RNA ini akan
meninggalkan inti sel untuk melakukan fungsi-fungsinya.
Bila mRNA meninggalkan inti, molekul ini melekat pada ribosom, yakni butiran-
butiran pada sitoplasma sel yang merupakan letak-letak sintesis protein. Suatu Ribosom terdiri
dari 60 % RNA ribosomal (rRNA) dan 40 % protein. Tiap asam amino dibawa ke mRNA dan
ribosomnya sebagai suatu ester dari satu satuan ribosa dalam suatu molekul RNA transfer
(tRNA).
Biosintesis peptida dilaksanakan oleh RNA dan enzim, dengan tahap-tahap sebagai
berikut:
a. DNA mencetak mRNA yang membawa kodon (urutan-urutan 3 basa nitrogen) selanjutnya
mRNA akan ke RNA ribosom untuk dilakukan perakitan asam amino-asam amino menjadi
peptide atau protein.
b. RNAtransfer akan membawa asam-asam amino untuk dirakit di RNAribosom sesuai
dengan codon yang dibawa mRNA.

Gambar 2. Biosintesis suatu peptida

 (a) fMet, atau N-formilmetionina (asam amino pemrakarsa dengan kodon AUG), telah terikat pada arg
(kodon CGA). Asam amino berikut yang akan ditambahkan adalah phe (kodon UUU). Rantai peptida
yang sedang tumbuh itutelah ditransfer ke phe. (c) Ribosom telah bergerak menyusuri rantai mRNA (ke
kanan), sehingga rantai peptida dapat ditransfer ke asam amino berikutnya, lys (kodon AAG).

Klasifikasi protein

Secara kasar protein dapat dikategorikan memuat tipe tugas yang dilaksanakan yaitu :
1. Protein serat (fibrous protein, juga disebut protein structural) yang membentuk kulit, otot,
dinding pembuluh darah, dan rambut. Protein serat terdiri atas molekul panjang mirip benang liat
yang tidak larut.
2. Tipe fungsional lain adalah kelas protein globular, yang bentuknya agak bulat karena rantai-
rantai melipat bertumpukan. Protein globular larut dalam air dan melakukan berbagai fungsi
dalam suatu organisme. Misalnya haemoglobin mengangkut O2 ke sel-sel , insulin membantu
dalam metabolisme karbohidrat, antibodi (antibodies) membuat protein asing menjadi tidak aktif;
fibrinogen (larut) dapat membentuk serat-serat tak larut yang menggumpalkan darah; dan
hormon-hormon membawa nutrisi ke seluruh tubuh.
3. Protein konjugasi (conjugated protein) yang dihubungkan ke suatu bagian non-protein seperti:
gula, melakukan berbagai fungsi dalam seluruh tubuh . suatu cara hubungan yang lazim antara
protein dan non protein ialah dengan suatu rantai samping fungsional dari protein. Misalnya
suatu rantai samping asam dari protein dapat membentuk ester dengan gugus OH molekul gula