Induksi dan represi pada eukariot

Gen tertentu seperti tRNA, molekul, protein ribosom, peptida polimer RNA
polimerase (yang merupakan bagian penting dari semua sel hidup). Gen tersebut sering
disebut sebagai gen konstitusional.
Sel E.Coli hanya mensintesis jumlah enzim laktosa yang sangat sedikit. Ketika sel
tersebut dipindahkan ke lingkungan yang mengandung laktosa sebagai satu-satunya sumber
karbon. Sintesis enzim yang dibutuhkan untuk katabolisme laktosa cepat diinduksi. Ketika
trypthopan tidak ada dilingkungan, sel E.Coli mensintesis enzim diperlukan untuk biosintesis
tryptophan. Sintesis enzim biosintesis tryptophan ditekan dengan cepat dimatikan.
Penindasan harus dikhawatirkan dengan penghambatan umpan alik, dimana pengikatan akhir
produk mati enzim pertama dalam jalur biosintesis menghambat aktivitas enzim (tetapi tidak
mempengaruhi sintetisnya).

Model operon
Induksi dan represi ekspresi gen dapat dilakukan dengan mekanisme yang pada
dasarnya sama. Mereka yang aktif pada operons yang represif co-represor. Molekul efektor
ini (termasuk ducer dan co-represoror) bertindak dengan mengikat (atau membentuk
kompleks dengan) represor. Perbedaan penting utama antara inducible operon dan operon
yang dapat ditindas adalah apakah represor telanjang atau kompleks molekul represor-efektor
ini aktif dalam mengikat operator.
- Dalam kasus operon yang dapat diinduksi, represor bebas mengikat operator,
mematikan transkrips. Ketika melepaskan molekul efektor (induser), ia mengikat
represor. Melepaskan represor dari operator hich, yaitu kompresor represor-induser
tidak dapat menyesuaikan diri dengan operator. Dengan demikian, penambahan
induser mengubah atau menginduksi struktur transkripsi gen di operon
- Dalam kasus operon yang dapat diinduksi, represor bebas mengikat operator,
mematikan transkrips. Ketika melepaskan molekul efektor (induser), ia mengikat
represor. Melepaskan represor dari operator hich, yaitu kompresor represor-induser
tidak dapat menyesuaikan diri dengan operator. Dengan demikian, penambahan
induser mengubah atau menginduksi struktur transkripsi gen di operon

Lac, operon yang bisa diinduksi

Model operon telah diperkenalkan oleh Jacob dan Monod terhadap E. coli. Yang
terdiri dari regulator gen serta promoternya, operator, dan Dan tiga gen struktural, z, y, dan a,
pengkodean enzim -galactosidase, -galactosida permease, and -galactoside transacetylase.
-galatctoside memungkinkan "memompa" laktosa ke dalam sel, di mana -galactosidase
memotongnya menjadi glukosa dan galaktosa. Gen regulator lac, menunjuk i gen tersebut,
dengan mengkodekan represor yang terdiri dari 360 asam amino
Bila laktosa memiliki jumlah yang banyak maka akan memecah enzim -galactosidase
sehingga menjadi glukosa dan galaktosa serta akan terjadi pembentukan induksi

Gen lac i, operator, dan promotor awalnya diidentifikasi secara genetis oleh isolasi
mutasi dalam unit genetik yang membuatnya tidak berfungsi. Mutasi dalam gen i dan
operator sering menghasilkan sintesis konstitutif dari enzim laktosa. masing-masing Mutasi
ini ditetapkan i- dan oc Mutasi i- dan oc konstitutif dapat dibedakan tidak hanya oleh posisi
peta, tetapi juga oleh perilaku mer merek imigran tetapi juga oleh perilaku mereka di
merozigot F di mana mereka berada di cis dan trans-konfigurasi relatif terhadap mutasi pada
struktur gen lac.

Merozigot (diploid parsial) genotipe F' i+, o+, z+, y+, a+ / i+ o+ z- y- a- atau genotipe F' i+
o+ z- y- a- / i+, o+, z+, y+, a+ dapat diinduksi untuk sampai laktosa sebagai sumber karbon,
seperti jenis haploid (i+ o+ z+ y+ a+) sel . Alel wild-tipe (z+, y+, dan a+) dari tiga gen stuctural
dominan pada alel mutan (z- y- dan a-). Hal ini dapat diharapkan karena alel tipe mutan tidak
menghasilkan enzim atau enzim yang tidak berfungsi (tidak aktif). F 'merozigot yang
memiliki genotipe i+ o+ z+ y+ a+/ i- o+ z+ y+ a+z juga diinduksi oleh lac operon. Sehingga
seperti yang diharapkan, karena i+ menentukan sebuah protein aktif (molekul represor) dan i-
menghasilkan sebuah protein yang tidak aktif.

Merozigot yang memiliki genotype F' i+, o+, z+, y+, a+ / i+ o+ z- y- a- atau genotipe F' i+
o z y a- / i+, o+, z+, y+, a+ dapat diinduksi oleh -galactosidase, -galactosida permease, and
+ - -

-galactoside transacetylase. Beberapa mutasi gen i, yang disebut i-d, dominan pada alel wild-
type. Dominasi ini tampaknya diakibatkan oleh ketidak mampuan heteromultimeric (ingat
bahwa fungsi represor lac sebagai tetramer), yang mengandung polipeptida wild-type dan
mutan, untuk mengikat urutan operator. Mtasi gen i lainnya, yang ditunjuk i-3 (untuk
"menekan kuat), menyebabkan operon lac menjadi tidak dapat diurai. Ketika dipelajari
secara in vitro, polipeptida i-3 mutan dari tetramer yang mengikat DNA operator lac.

Trp, operon repressible

Tryptophan pada E. coli terkenal dengan , operon repressible. Dengan tidak adanya
triptofan(co-represoror), RNA polymerase membungkok ke daerah promoter dan
mentranskripsikan gen struktural operon. Dengan adanya triptofan, kompresor co-represor
mengikat ke operator dan mencegah pengikatan polimer RNA ke promotor. Urutan operator
operon trp terletak seluruhnya di dalam wilayah promoter.
Laju transkrip operon trp pada keadaan derepressed (tidak adanya tryptophan) adalah
70 kali laju yang terjadi pada keadaan tertekan (adanya triptofan). Pada mutan trpR yang
tidak dapat membuat represor, laju sintesis enzyme biosintesis triptofan (produk dari gen
struktural operon trp) masih berkurang sekitar 10 kali lipat dengan penambahan triptofan ke
medium.
Kontrol Positif pada lac Operon dari Cap dan Cyclic AMP.
Kehadiran glukosa, bagaimanapun, telah lama diketahui dapat mencegah infeksi
operon lac, dan juga operon lain yang mengendalikan enzim yang terlibat dalam katabolisme
karbohidrat. Tampaknya telah berevolusi untuk memastikan bahwa glukosa adalah metabolis,
sumber energi.

Represor katabolit dari operon lac sekarang dikenal dimediasi melalui kontrol positif
dari transkripsi oleh protein regulator yang disebut CAP (untuk katabolit Activator Protein)
dan molekul efektor kecil yang disebut siklik AMP (adenosin-3' , 5' fosfat). Kompleks CAP-
cAMP harus terikat pada situs pengikatnya di promotor lac agar operon dapat diinduksi.
CAP-cAMP kompleks memiliki pengendalian positif lebih tinggi melalui transkripsi operon
lac. Hal ini memiliki efek yang berlawanan dengan tekanan represor pada operator. Meskipun
mekanisme yang tepat dimana CAP-cAMP merangsang RNA polimerase untuk mengikat
promotor masih belum pasti, Pengaturan positifnya transkripsi lac operon diperlukan dengan
Eksperimen in vivo dan in vitro.

Hanya CAP-cAMP kompleks yang mengikat promotor lac, dengan tidak adanya
cAMP, CAP tidak mengikat. CAMP ini bertindak sebagai molekul efektor yang menentukan
efek konsentrasi CAP sensitif terhadap kadar glukosa atau tidak adanya glukosa. Konsentrasi
tinggi glukosa menyebabkan penurunan tajam pada konsentrasi intraselular cAMP.
bagaimana glucose mengontrol konsentrasi Camp secara jelas. Mungkin glukosa, atau
beberapa metrabolit yang terbentuk dengan adanya konsentrasi glukosa yang cukup,
menghambat aktivitas adencyclase, enzim yang mengkatalisis formasi cAMP dari ATP.
Regulasi Komplek dari ara Operon
Operon lain seperti arabinosa (ara) operon E. coli menunjukkan pola regulasi yang
jauh lebih kompleks yang masih belum sepenuhnya dipahami. Pada operon lac dan trp,
produk gen pengatur, represor, berfungsi dengan cara yang negatif, mematikan transkripseton
operon. Selain itu, komponen peraturan yang mengendalikan transkripsi operon ara
mencakup elemen obne yang bertindak dari jarak lebih dari 200 pasangan nukleotida dari
promotor yang dapat dikendalikannya. Meskipun semua detail sirkuit peraturan opera ara
belum ditetapkan secara jelas.
Operon arabinosa (ara) di E. coli mengandung tiga gen struktural (araB, araA, dan
araD) yang mengkodekan tiga enzim yang terlibat dalam katabolisme arabinoise. Ketiga gen
ini ditranskripsikan pada satu mRNA tunggal yang diberikan pada promotor yang disebut
PBAD. Protein peraturan utama ara operon (araC protein) dihasilkan dari transkrip yang
dimulai pada promotor yang disebut Pc. Promotor Pc hanya sedikit lebih dari 100 pasangan
nukleotida jauh dari PBAD, tetapi dua promotor memulai transkripsi di arah yang berlawanan.
Protein araC bertindak sebagai regulator negatif (represor) dari transkripsi araB, araC, dan
araD gen struktural dari PBAD Dari promoter pbad dalam absensi arabinose dan cyclic AMP
(cAMP).

Control of the trp Operon by attenutation

Represi dan depresi dapat menubah level ekspresi gen struktur dari trp operon
menjadi 70 kali lipat. Terdapat regulasi kedua dari ekspresi trp operon. Pada trpR tidak dapat
membuat repressor, penambahan tripthopan pada kultur jaringan akan menyebabkan
peningkatan rerata sintesis dar enzim biosistematik tripthopan menjadi 8- sampai 10- kali
lipat.
 Gambar. Struktur trpL operon

Regulasi kedua dari trp operon disebut attenuation, yang squncenya terdapat dibagian
bagian gen trpL yang mengontrol peristiwa ini disebut attenuator. Atenuasi muncul sebagai
control terminasi transkripsi di dekat akhir mRNA leader sequence. Terminasi premature ini
hanya bisa terjadi jika terdapat trypthopan pengubah tRNAtrp atau trna yang membawa
tryptophan. Daerah attenuator memiliki pasangan yang mirip dengan unit terminasi pada
kebanyakan bakteri yaitu banyak mengandung pasangan C dan G yang diikuti dengan ikatan
A dan T. Transkripsi dari signal terminasi ini akan menghasilkan RNA yang potensial
membentuk ikatan hydrogen hairpin yang diikuti beberapa urasil (U). hal ini dapat
menyebabkan terjadinya beberapa hal berikut.
Menyebabkan proses transkripsi dan translasi dapat terjadi secara bersamaan pad
prokariot.
Pasangan dari leader trp operon mRNA dengan panjang sequences 162-nucleotide-
long yang membawa sequence dari ikatan basa dari bentuk alternative struktur
sekunder.
Leader sequences membawa kodon translasi dan inisiasi AUG diikuti oleh 13 codon
asam amino yang bergiliran mengikuti kodon traslasi dan inisiasi UGA.

Gambar. Struktur hairpin mRNA leader trp

Transkripsi dari trp operon dapat diregulasi lebih dari 700 kali lipat dengan kombinasi
efek dari represi ( lebih dari 70 kali lipat) dan deprersi (lebih dari 10 kali lipat). Regulasi pada
transkripsi dengan menggunakan attenuation tidaklah baru ke trp operon. Terdapat 6 operon
(trp, thr, ilv, leu, phe, dan his) yang sudah tau regulasi dari attenuation. Dari kesemuanya, trp
dan kemungkinan phe juga diregulasi oleh attenuation.
Ayu maulidya (150342600319)

1. Bagaimana perbedaan adanya penahan yaitu trp (tryptophan) dan tidak adanya trp?
Jawab :
Dengan tidak adanya tryptophan (co-represor/penahan), RNA polimerase
berikatandengan daerah promoter dan mentranskripsi gen struktural operon Tingkat
transkripsioperon trp di daeah tidak ada penahan (tidak adanya triptofan) adalah 70 kali
yang terjadidi daerah yang ditahan (terdapat triptofan). Sedangkan dengan adanya
triptofan, co-represor(penahan) kompleks mengikat wilayah operator dan mencegah
pengikatan RNA polimerase ke promotor.

Ayu maulidya (150342600319)

2. Mengapa lac operon tidak terinduksi ketika jumlah glukosa intrasel meningkat?
Jawab:
Pada saat jumlah glukosa meningkat, molekul glukosa akan menghambat kerja dari
enzimadenylcyclase untuk mengubah ATP menjadi cAMP sehingga jumlah cAMP
menurun.Menurunnya jumlah cAMP menyebabkan CAP tidak mampu berikatan ke sisi
promoterlac operon, dan juga tidak terbentuknya kompleks CAP-cAMP. Hal tersebut
akhirnyamenyebabkan RNA polymerase tidak mampu berikatan dengan sisi promoter lac
operon sehingga lac operon pun tidak terinduksi.

Nuurul Muchlishiin (150342607001)

1. Mengapa pada Kontrol Positif lac Operon dari Cap dan Cyclic AMP dengan
banyaknya glukoasa yang tersimpan maka operonlac akan terhindar dari infeksi?
Jawab:
Adanya glukosa dengan konsentrasi yang tnggi dapat menghindarkan operon
lac dari infeksi karena operon lain yang mendapatkan glukosa akan mengendalikan
enzim yang dapat mencegak infeksi operon lac dan glukoas dapat dijadikan sebagai
sumber energi.

Nuurul Muchlishiin (150342607001)

2. Mengapa Alel wild-tipe (z+, y+, dan a+) dari tiga gen stuctural dominan pada alel
mutan (z- y- dan a-)?
Jawab :
Karena alel tipe mutan tidak menghasilkan enzim atau enzim yang tidak
berfungsi (tidak aktif). F 'merozigot yang memiliki genotipe i+ o+ z+ y+ a+/ i- o+ z+ y+
a+z juga diinduksi oleh lac operon. Sehingga seperti yang diharapkan, karena i +
menentukan sebuah protein aktif (molekul represor) dan i- menghasilkan sebuah
protein yang tidak aktif.
Edi Ramdani (150342600087)

1. Bagaimanakah kenampakan dan sebab terjadinya mutasi pada daerah operator (O)?
Jawab :
Mutasi yang terjadi pada daerah organizer (Oc) hanya akan nampak pada
ekspresi. Jika bakteri E. coli yang memiliki plasmid F yang melakukan konjugasi, jika
terjadi konjugasi maka akan menyebabkan diploid atau terbentuknya merozigot ( I+,
P+, O+, Z+, Y+, A+/ F - I+, P+, Oc, Z-, Y-, A- ). Mutasi yang terjadi pada gen Z-, Y-, A-
menyebabkan tidak terbentuknya enzim sehingga enzim tidak dihasilkan oleh gen-gen
tersebut. I+ tidak memiliki kemampuan untuk berdifusi sehingga kejadian mutasi ini
tidak Nampak, hal ini disebabkan oleh sifat molekul regulator dari ekspresi I+ .

Edi Ramdani (150342600087)

2. Bagimanakah peran tryptophan dalam kontrol trp operon ?

Jawab :
Ada atau tudaknya triptofan berpegaruh pada fold dari bagian 2 3 dari
mRNA , disaat tidak ada triptofan maka ribosom akan mentranslasi bagian teresebut
hingga mencapai bagian UGG UGG dimaa pada bagian ini tanpa kehadiran dari
tRNAtrp maka ribosom tidak dapat meneruskan translasi dan terjadi pemutusan dini
rantai leader peptide namun ketika triptofan ditambahkan ke medium maka akan
terjadi penambahan gugus triptofan ke tRNA menyebabkan tersedianya tRNAtrp, hal
ini menyebabkan diteruskannya proses translasi saat melalui UGG UGG, kemudian
ribosom akan mencapai kodon stop. Hal ini akan berdampak dan berpengaruh
terhadap bentuk hairpin antara bagian 2 dan 3 menyebabkan pembukaan ikatan dan
menjadikan ikatan antara bagian 3 dan 4.