KODE GENETIK

Kode genetik adalah kode non-tumpang tindih, dengan masing-masing asam amino
ditambah inisiasi dan terminasi polipeptida yang ditentukan oleh kodon RNA yang terdiri dari tiga
nukleotida.

Sifat-Sifat Kode Genetik

1. Kode genetik terdiri dari kembar tiga nukleotida. Tiga nukleotida dalam mRNA menentukan
satu asam amino dalam produk polipeptida; dengan demikian, setiap kodon mengandung tiga
nukleotida.
2. Kode genetik tidak tumpang tindih. Setiap nukleotida dalam mRNA hanya milik satu kodon
kecuali dalam kasus yang jarang terjadi di mana gen tumpang tindih dan urutan nukleotida
dibaca dalam dua kerangka pembacaan yang berbeda.
3. Kode genetik bebas koma. Tidak ada koma atau bentuk tanda baca lain di dalam wilayah
pengkodean molekul mRNA. Selama penerjemahan, kodon dibaca secara berurutan.
4. Kode genetik mengalami degenerasi. Semua kecuali dua asam amino ditentukan oleh lebih
dari satu kodon.
5. Kode genetik dipesan. Banyak kodon untuk asam amino yang diberikan dan kodon untuk
asam amino dengan sifat kimia yang mirip terkait erat, biasanya berbeda dengan nukleotida
tunggal.
6. Kode genetik berisi kode start dan stop. Tentukan kodon digunakan untuk memulai dan
menghentikan rantai polipeptida.
7. Kode genetik hampir universal. Dengan pengecualian kecil, kodon memiliki arti yang sama
di semua organisme hidup, dari virus hingga manusia.

Pada tahun 1961, Francis Crick dan rekan menerbitkan bukti kuat pertama yang mendukung kode
triplet (tiga nukleotida per kodon). Crick dan rekan kerjanya melakukan analisis genetik mutasi
yang diinduksi pada lokus rII dari bakteriofag T4 oleh ahli kimia. Proflavin adalah agen mutagenik
yang menyebabkan penambahan dan penghapusan pasangan basa tunggal (Bab 13). Mutan fag T4
rII tidak dapat tumbuh dalam sel galur E. coli K12, tetapi tumbuh seperti fag tipe liar dalam sel
galur E. coli B. T4 tipe liar tumbuh sama baiknya pada kedua galur. Crick dan rekan kerjanya
mengisolasi revertan yang diinduksi proflavin dari mutasi rII profl yang diinduksi profl. Revertant
ini terbukti sebagai hasil dari terjadinya mutasi tambahan di lokasi terdekat daripada pembalikan
mutasi asli. Mutasi situs kedua yang mengembalikan wild-type phenotype dalam organisme mutan
disebut supressor mutation karena mereka membatalkan, atau menekan, efek dari mutasi asli.

Jika kembar tiga nukleotida berurutan dalam mRNA menentukan asam amino, maka setiap urutan
nukleotida dapat dikenali atau dibaca selama penerjemahan dengan tiga cara berbeda. Misalnya,
urutan AAAGGGCCCTTT dapat dibaca (1) AAA, GGG, CCC, TTT, (2) A, AAG, GGC, CCT,
TT, atau (3) AA, AGG, GCC, CTT, T. Bingkai bacaan dari mRNA adalah serangkaian triplet
nukleotida yang dibaca (diposisikan di situs A dari ribosom) selama terjemahan. Penambahan atau
penghapusan pasangan basa tunggal akan mengubah kerangka pembacaan gen dan mRNA untuk
bagian gen yang distal terhadap mutasi.

Bukti dari studi terjemahan in vitro segera mendukung hasil Crick dan kolega dan akhirnya
menetapkan sifat triplet dari kode. Beberapa hasil yang lebih penting berikut: (1) Trinukleotida
cukup untuk merangsang ikatan spesifik aminoasil-tRNA dengan ribosom. Misalnya, 5'-UUU-3'
merangsang pengikatan phenylalanyl-tRNAPa dengan ribosom. (2) Molekul mRNA yang
disintesis secara kimiawi yang mengandung urutan dinukleotida berulang mengarahkan sintesis
kopolimer (molekul mirip rantai besar yang terdiri dari dua subunit berbeda) dengan urutan asam
amino bolak-balik. Misalnya, ketika poli (UG) n digunakan sebagai mRNA buatan dalam sistem
terjemahan in vitro, kopolimer berulang (cys-val) m disintesis. (Subskrip n dan m merujuk pada
jumlah nukleotida dan asam amino dalam masing-masing polimer.) (3) Sebaliknya, mRNA dengan
pengulangan urutan trinukleotida mengarahkan sintesis campuran tiga homopolimer (inisiasi
dilakukan secara acak pada mRNA seperti pada sistem in vitro). Misalnya, poli (UUG) n
mengarahkan sintesis campuran polyleucine, polycysteine, dan polyvaline. Hasil ini hanya
konsisten dengan kode triplet. Pada akhirnya, sifat triplet dari kode ditentukan secara pasti dengan
membandingkan sekuens nukleotida gen dan mRNA dengan sekuens asam amino dari produk
polipeptida mereka.

KODE INISIASI DAN KETENTUAN

Tiga kodon — UAG, UAA, dan UGA — menentukan pemutusan rantai polipeptida (Tabel 12.1). Kodon ini
dikenali oleh faktor pelepasan protein, bukan oleh tRNA. Prokariota mengandung dua faktor pelepasan,
RF-1 dan RF-2. RF-1 mengakhiri polipeptida sebagai respons terhadap kodon UAA dan UAG, sedangkan
RF-2 menyebabkan penghentian pada kodon UAA dan UGA. Eukariota mengandung faktor pelepasan
tunggal yang mengenali ketiga kodon terminasi.

KODE DEGENERASI

(1) Degenerasi parsial terjadi ketika basa ketiga dapat berupa salah satu dari dua pirimidin (U atau C) atau,
sebagai alternatif, salah satu dari dua purin (A atau G). Dengan degenerasi parsial, mengubah basa
ketiga dari purin menjadi pirimidin, atau sebaliknya, akan mengubah asam amino yang ditentukan oleh
kodon.

(2) Dalam kasus degenerasi total, salah satu dari empat basa dapat berada pada posisi ketiga dalam kodon,
dan kodon masih akan menentukan asam amino yang sama. Misalnya, valin dikodekan oleh GUU, GUC,
GUA, dan GUG.

Pertanyaan

1. Bagaimana degenerasi parsial bisa terjadi? (Annisah Rachmawati Ariyadi)

Jawab: Degenerasi parsial terjadi ketika asam amino yang sama ditentukan jika basa dalam 3’
nukleotida kodon adalah salah satu dari dua pirimidin atau salah satu dari dua purin.
2.