KELOMPOK 12

Ketika substansi asing yang disebut antigen (contoh, protein coat virus) masuk ke dalam aliran
darah mamalia, mereka memicu mekanisme pertahanan, respon imun, yang merupakan hasil
sintesis kelompok protein yang sangat penting disebut antibody. Antibody ini mengikat antigen
dengan kekhususan yang luar biasa, yang memfasilitasi pemindahan mereka dari sistem
sirkulasi. Selama decade terakhir, saintis menemukan bahwa sekuen DNA yang mengkode
berbagai antibody yang diproduksi oleh sistem imun mamalia dibentuk selama diferensiasi dari
pembentukan sel antibody dari penataan ulang genome.

Komponen Sistem Imun

Terdapat 3 jenis sel darah putih yag berbeda yang memiliki peran penting pada respon imun
Vertebrata yaitu 1) Limfosit B (disebut sel B karena diproduksi pada sumsum tulang), 2)
Limfosit T (disebut sel T karena diproduksi di dalam kelenjar Thymus), 3) makrofag. Antibody
disintesis oleh limfosit b dan juga disekresikan tetap terikat pada membrane di permukaan sel
B tergantung pada kondisi. Selama respon imun humoral, antibody berikatan dengan antigen
bebas pada sistem sirkulasi dan menggumpalkannya. Hasil kompleks antibody-antigen
kemudian menelan dan mendegradasi makrofag (gambar 16.1, kiri). Limfosit T memediasi
respon imun selular. Sel T menyintesis reseptor antigen yang mengenali permukaan sel dan
memicu lisis sel yang mengandung antigen oleh sel T yang aktif (Fig. 16.1, kanan). Limfosit
T yang lain menunjukkan fungsi yang sedikit berbeda dengan cara yang berbeda.
Bagaimanapun, pada dasarnya, serangan dari sel T pada sel yang membawa antigen
membutuhkan dua dari reseptor sel T spesifik dan satu atau lebih reseptor histokompabilitas
antigen. Mekanisme oleh antibody, reseptor sel T, dan reseptor histokompabilitas antigen
dihasilkan dan di deskripsikan pada bagian bab ini.

Repertoar Antibodi

Aspek yang luarbiasa dari respon imun, setidaknya dari sudut pandang genetik adalah tampak
variasi yang tak terbatas dari antibody yang disintesis pada respon antigen hewan yang
sebelumnya ditemui. Bagaimana dapat organisme menyiapkan sintesis antibody yang didesain
untuk mengikat suatu antigen spesifik tanpa pernah melakukan kontak dengan antigen ? bahkan
bagaimana bisa sebuah organisme cukup menyimpan informasi genetik untuk mengkode
sekuen asam amino dari variasi antibody yang sebenarnya terbatas? Hal ini merupakan
pertanyaan yang berhubungan tentang respon imun yang memiliki teka-teki genetik beberapa
decade.
Kita tidak mengetahui berapa banyak antibody yang berbeda pada tikus atau manusia yang
dapat diproduksi, tapi kita mengetahui bahwa jumlahnya sangat besar, hampir jutaan. Genome
utuh manusia (seperti contoh, satu dari setiap 23 pasang kromosom manusia) mengandung
sekitar 3x109 pasang nukleotida. Jika semua DNA membentuk sekuens koding tanpa hambatan
dari gen setiap 1000 pasang nukleotida (tentu kita tahu banyaknya itu), genome mengandung
maksimum 3 juta genome. Karena kita tahu bahwa banyak kode gen dari RNA yang bervariasi,
enzim, dan protein structural, dan kita tahu bahwa banyak gen mengandung intron non koding,
bagaimana kita dapat menghitung untuk informasi genetik yang diperlukan untuk mengkode
kebanyakan dari antibody yang berbeda?

KELOMPOK 13
Hipotesis: Dasar Genetik Keanekaragaman Antibodi
Upaya-upaya di masa lalu untuk menjelaskan dasar genetik keanekaragaman antibodi
dapat secara kasar dikelompokkan ke dalam tiga hipotesis berbeda.
1. Hipotesis "garis kuman" menyatakan bahwa ada gen garis kuman yang terpisah untuk
setiap antibodi. (Ini sesuai dengan pengetahuan awal kita tentang sintesis protein, tetapi
menyajikan paradoks tentang tidak cukupnya DNA)
2. Hipotesis "mutasi somatik" menyatakan bahwa hanya ada satu atau beberapa gen garis
kuman yang menentukan setiap kelas utama antibodi dan bahwa keanekaragaman
dihasilkan oleh frekuensi tinggi mutasi-mutasi somatik yang terjadi dalam sel somatik
penghasil antibodi atau dalam garis keturunan sel yang mengarah ke sel penghasil
antibodi. (Tidak ada preseden untuk mutasi frekuensi tinggi yang hanya terjadi pada
gen tertentu dan hanya pada tipe sel tertentu. Dengan mekanisme apa hal ini dapat
terjadi, dan bagaimana bisa diatur?)
3. Hipotesa "minigene" menyatakan bahwa keragaman adalah dihasilkan oleh
pengocokan banyak segmen kecil dari beberapa gen menjadi banyak kombinasi yang
mungkin. Pengocokan akan terjadi proses dalam sel somatik. (Ini membutuhkan
mekanisme yang benar-benar baru untuk menata ulang segmen DNA).
lambda, dengan tipe yang ditentukan oleh struktur wilayah konstanta rantai cahaya. Seperti
yang akan kita lihat, antibodi mungkin memiliki spesifisitas pengikatan antigen yang sama,
seperti yang ditentukan oleh daerah variabel dari empat rantai, tetapi fungsi imunologis yang
berbeda, sebagaimana ditentukan oleh daerah konstan dari dua rantai berat.
 Jadi, ketika kita meneliti struktur antibodi, kita melihat bahwa keanekaragamannya
hampir seluruhnya berada dalam wilayah variabel molekul. Jika polipeptida ini disintesis dari
sekuens gen-pasang nukleo pasang-surut colinear, satu gen per rantai pasang polipepP, genom
harus mengandung sederetan gen yang luas dengan sekuens yang sangat bervariasi di satu
ujung dan sekuens yang pada dasarnya identik di ujung lainnya. Namun, ini bukan masalahnya.
Teknik DNA rekombinan telah memungkinkan untuk mengisolasi dan melihat banyak segmen
DNA kromosom tikus dan manusia yang mengkode rantai antibodi. Hasil penelitian ini telah
memberikan penjelasan yang elegan untuk generasi protein dengan keragaman besar di daerah
tertentu dan keteguhan di daerah lain.

KELOMPOK 14
Kappa Light Chains
Sintesis rantai cahaya kappa dikendalikan oleh tiga segmen gen yang berbeda: (1) a V, segmen
gen, yang mengkode N-terminal 95 asam amino dari wilayah variabel; (2) a, segmen gen U
untuk segmen fiting) yang mengkode asam amino 13 terakhir (konstan-proksimal) dari wilayah
variabel; dan (3) segmen gen C, yang mengkode untuk wilayah konstan Cterminal. Segmen
gen keempat, L, segmen, kode untuk urutan pemimpin brydropbobic N-terminal panjang 17-
20 asam amino yang sangat penting untuk pengangkutan rantai antibodi melalui membran sel.
Pemimpin urutan dibelah rantai ketika melewati membran, dan dengan demikian bukan bagian
dari antibodi akhir. Susunan segmen gen rantai kappa dalam sel garis kuman (pada
kenyataannya, di semua sel tidak menghasilkan antibodi) ditunjukkan pada Gambar 16.4.
Pada tikus dan manusia, semua segmen gen rantai kappa terletak pada kromosom yang sama
(kromosom 2 pada manusia). Hal yang sama juga berlaku untuk segmen gen lambda (kromo
22 pada manusia) dan segmen gen rantai berat (kromosom 14 pada manusia). Tbere adalah
sejumlah besar, mungkin sekitar 300, dariV. segmen gen masing-masing dengan segmen gen
L terdekat (Gbr. 16.4a). Di sisi lain, hanya ada satu Lima J, segmen gen (salah satunya adalah
non fungsional pada tikus) terletak antara V, segmen gen dan C, segmen gen Dalam sel garis
kuman, lima J, segmen adalah dipisahkan dari segmen V, dengan urutan noncoding yang
panjang (kami belum tahu berapa lama) dan dari segmen C oleh urutan non-coding yang
panjang. Selama pengembangan limfosit B, gen rantai cahaya kappa tertentu yang akan
diekspresikan dalam sel tersebut dirakit menjadi satu Lv, segmen, satu J, segmen, dan segmen
C tunggal dengan proses negara rekombi somatik (Gambar 16.4a dan B). Proses ini bergabung
dengan salah satu dari sekitar 300 segmen L-V dengan salah satu dari lima segmen J, dengan
penghapusan semua DNA yang saling terkait (Gbr. 16.46). Ini menghasilkan V, J, pengkodean
segmen gen menyatu untuk seluruh wilayah variabel rantai kappa. Urutan nonkode antara
segmen gen J. C. sekitar 2000 pasangan nukleotida urutan noncoding panjang. Selama
pengembangan limfosit B, gen rantai cahaya kappa tertentu yang akan diekspresikan dalam sel
tersebut dirakit dari satu segmen Lv, satu Jk, segmen, dan segmen C tunggal melalui proses
negara rekombi somatik (Gambar 16.4a dan B). Proses ini bergabung dengan salah satu dari
sekitar 300 segmen Lk-Vk dengan salah satu dari lima segmen Jk, dengan penghapusan semua
interening DNA (Gambar 16.4b). Ini menghasilkan pengkodean segmen gen VkJk gen untuk
seluruh wilayah variabel rantai kappa. Urutan nonkode antara Jk klaster segmen-gen dan
segmen gen C, dan segmen C proksimal J, jika ada, tetap berada di antara segmen VJ yang
menyatu dan segmen Ce dalam limfosit B yang berdiferensiasi (Gambar 16.4b). Keseluruhan
sekuens DNA ini (L-VJnoncoding-C) ditranskripsikan (Gbr. 16.4c) dan sekuens nonkoding
dipindahkan selama pemrosesan RNA (Gambar 16.4c dan d), seperti sekuen bukan pengkodean
atau intron dari eukariotik lainnya gen.
Rantai Cahaya Lambda
Rantai cahaya lambda juga dipasang dari segmen terpisah selama perkembangan limfosit B.
Diferensiasi mayor merupakan masing-masing segmen gen Jλ yang datang bersama
segmengen Cλ, yaitu genom yang mengatur ulang yang diperlukan dalam sintesis rantai
lambda mengikuti Lλ -Vλ menuju segmen Jλ -Cλ. Tikus mungkin hanya mempunyai empat
segmen Jλ -Cλ, sedangkan manusia mempunyai enam. Korelasi dengan fakta bahwa hanya
lima persen dari antibodi tikus dari tipe lambda, sedangkan 40 persen antibodi manusia
memiliki rantai cahaya lambda.

KELOMPOK 1
Heavy Chains (rantai berat)
Di dalam manusia, terdapat 9 atau 10 gen CH fungsional: CHμ, CHδ, CHγ1, CHγ2, CHγ3, CHγ4, CHε1,
kemungkinan CHε2, CHα1, CHα2.. Gen CH pada manusia juga mengandung 2 gen non fungsional
yang disebut pseudogenes dengan kemiripan stuktur yang tinggi. Pseudogenes adalah duplikasi
parsial dari gen structural yang menyebabkan perubahan sehingga tidak aktif secara biologis
dan biasanya tidak ditranskripsikan. Pseudogenes menjadi sangat umum dalam eukariot.
Padas el punca tikus, terdapat sekitar 300 LH-VH segmen gen, seperti 10-50 D segmen gen, 4
JH segmen gen, dan 8 CH segmen gen, diatur dalam kromosom. Selama perkembangan limfosit
B dari sel punca (sel tubuh yang aktif bermitosis membentuk tipe lain “punca” atau terbentuk
karena pembelahan dan diferensiasi sel), rekombinasi somatic menggabungkan satu segmen
gen LH-VH dengan 1 segmen gen D dan satu segmen gen JH, menghilangkan dua sekuens
penghalang DNA, untuk membentuk satu sekuens DNA yang berkelanjutan (VHDJH) yang
mengkodekan keseluruhan kemungkinan rantai berat
Class switching
Saat sintesis antibodi dimulai dalam perkembangan limfosit B, seluruh gen CH tetap ada,
terpisahkan dari LH, VH, DJH segmen yang baru terbentuk oleh segmen pendek non-coding.
Keseluruhan antibody yang terbentuk mempunyai IgM rantai berat (produk gen CHμ). JIka
antigen dikenali dan terikat pada antibody di permukaan limfosit B yang berkembang, sel akan
terstimulasi untuk berdiferensiasi menjadi sel limfosit B matang. Selama proses diferensiasi,
beberapa limfosit B akan mengganti dari produksi antibody kelas IgM menjadi kelas yang lain.
Fenomena ini disebut pergantian kelas (class switching), termasuk dalam pengaturan ulang
genome, gen CH yang dekat dengan gen LH-VHDJH akan dihilangkan. Kelas antibody yang akan
diproduksi selanjutnya bergantung pada gen apa yang dibawa kebagian proksimal terdekat dari
LH-VHDJH.

KELOMPOK 2
Antibody Diversity: Alternte Pathways Of Transcript Splicing
Tipe lain dari pergantian kelas selama diferensiasi limfosit B terjadi pada tingkat pemrosesan
RNA ("splicing"). Limfosit B matang tertentu menghasilkan antibodi IgM dan IgD. Perlu
ditekankan, bahwa antibodi ini hanya berbeda dalam domain fungsi efektornya; mereka
memiliki domain pengikatan antigen yang identik, yang ditentukan oleh V kJk (atau VλJλ) dan
segmen gen VHDJH yang sama. Dalam sel-sel ini, transkrip primer yang memanjang melalui
segmen gen C dan CHa disintesis. Selama pemrosesan, urutan transkrip VHDJH dapat
disambungkan ke urutan CH atau urutan CH, sehingga kedua jenis rantai berat disintesis dalam
sel yang sama (Gbr. 16.6).
Kompleksitas lebih lanjut yang diamati pada sintesis antibodi adalah produksi sekuensial
bentuk-bentuk yang terikat dan disekresikan dari antibodi yang diberikan. Antibodi pertama
yang muncul dalam mengembangkan limfosit B adalah molekul IgM yang terikat membran.
Selanjutnya, sel-sel ini beralih ke produksi bentuk IgM yang disekresikan. Kedua bentuk IgM
ini hanya berbeda pada bagian terminal C dari rantai berat mereka. Rantai berat bentuk terikat
membran adalah 21 asam amino lebih lama dari bentuk yang disekresikan. Rantai berat yang
terikat membran memiliki 41-asam amino-panjang dengan urutan drophobic di terminal C yang
mungkin bertanggung jawab untuk menjangkarkannya ke permukaan sel. Urutan hidrofobik
ini digantikan oleh urutan bydrophilic 20-amino-asam-panjang dalam bentuk yang
disekresikan
Sekuens pengkodean (ekson) dari segmen gen Ch terputus oleh sekuens nonkoding (intron)
seperti halnya banyak gen eukariotik lainnya (Bab 13, hal. 356-359). Segmen gen Cy
mengandung empat hingga enam ekson dan tiga hingga lima intron (Gbr. 16.7). Pada antibodi
yang terikat mernbrane, daerah konstanta rantai berat diproduksi dengan menyambungkan
keenam ekson secara bersamaan (Gambar 16.7a dan b). Dua kode ekson terakhir untuk ekor
hidrofobik dari rantai berat yang terikat membran. Selama sintesis bentuk terikat-membran,
ekson C, kelima disambungkan ke situs 20 kodon dari ujung ekson keempat (Gambar 16.7b),
sehingga mengubah sifat asam amino dari bagian ini dari daerah konstan rantai berat. Dalam
antibodi yang disekresikan, daerah konstanta rantai berat karenanya merupakan produk dari
empat ekson pertama (Gambar 16.7c)
Penggunaan jalur alternatif transkripsi dan pemrosesan RNA untuk mensintesis ikatan-terikat
dan bentuk disekresikan telah ditetapkan dengan kuat untuk kelas antibodi IgM. Bukti terbaru
menunjukkan bahwa jalur transkripsi dan splicing alternatif yang serupa bertanggung jawab
atas produksi ikatan dan bentuk tersekresi dari kelas imunoglobulin lainnya.
Gambar 16.7 Kontrol genetik IgM yang diikat dengan membran dan disekresikan. Hanya gen
rantai berat dan produk gen yang diperlihatkan karena kedua bentuk memiliki rantai cahaya
yang identik. (After P. Leder, Sci Amer. 246 (5): 102-115,1982

KELOMPOK 3

Pengaturan Ulang Urutan Sinyal Govern Genom

Bagaimana pengaturan ulang genom yang terjadi selama pengembangan limfosit B diatur? Apa
yang mengendalikan peristiwa rekombinasi somatik sedemikian rupa sehingga segmen gen V
bergabung ke segmen J dan bukan ke segmen V lain atau langsung ke segmen C? Beberapa
segmen panjang dari DNA kromosom yang membawa kelompok segmen gen V, segmen gen
D, dan segmen gen J dari tikus dan manusia sekarang telah diurutkan, dan urutan pasangan
nukleotida yang dihasilkan menunjukkan adanya VJ, VD, spesifik. dan D bergabung dengan
sinyal. Urutan sinyal yang sama ditemukan berdekatan dengan semua segmen gen V.
Demikian pula, semua segmen gen J memiliki urutan sinyal identik yang terletak berdekatan
dengan urutan pengkodeannya; Namun, urutan sinyal mereka berbeda dari yang berdekatan
dengan segmen gen V. Demikian juga, segmen gen D dan C memiliki urutan sinyal yang
berdekatan.
Urutan sinyal yang mengendalikan penyatuan V-J, V-D, dan D-J mengandung 7-base-pair
(heptamer) - dan 9-base-pair (nonamer) - seguensi panjang yang dipisahkan oleh spacer dengan
panjang yang berbeda, tetapi spesifik. Untuk sambungan Vk-Jk, panjang spacer dalam urutan
sinyal Vk adalah 12 pasangan nukleotida, sedangkan pada urutan sinyal Jk adalah 22 pasangan
nukleotida. Sekuens heptamer dan nonamer terletak "setelah" (di sebelah kanan seperti yang
digambar dalam Gambar 16.4 dan 16.8) segmen gen Vk adalah komplementer (dengan
pengecualian satu pasangan pasangan berbasis) kepada mereka "mendahului" (ke kiri seperti
yang digambarkan dalam Gambar 16.4 dan 16.8) segmen gen Jk. Urutan sinyal ini memiliki
potensi untuk membentuk struktur "batang dan loop" seperti yang diprogram pada Gambar
16.8, sehingga membawa segmen gen Vk dan Jk ke dalam penjajaran untuk bergabung.
Tampaknya, penyatuan akan terjadi hanya ketika satu urutan sinyal mengandung spacer 12-
basis-pasangan dan yang lain berisi spacer 22-basis-pasangan. Persyaratan ini seharusnya
ditegakkan dengan protein spesifik yang memediasi proses penyambungan. Urutan sinyal yang
sangat mirip muncul untuk mengontrol VH-D dan D-JH bergabung, sedangkan urutan sinyal
agak berbeda memediasi perpindahan kelas (lihat P. Leder, Sci. Amer. 246 (5): 102-115, 1982).

Urutan sinyal dan peran yang terjadi dalam gabungan VkJk. Germ line dan DNA limfosit B
ditunjukkan oleh gambar (a) dan (c), secara selektif, serta sekuens heptamer dan nonamer dan
 ukuran spacer ditunjukkan pada gambar (b). Stem dan loop ditunjukkan pada gambar (b)
adalah intermrediet hypothetical.

KELOMPOK 4
Antibody diversity : Variable joining sites and somatic mutations

Perbandingan keanekaragaman sekuens asam amino hadir dalam molekul antibody,

sekuens segmen gen yang mengkodekan antibodi ini mengungkapkan bahwa ada lebih banyak
variasi dalam sekuens asam amino pada persimpangan V daripada yang diperkirakan oleh
sekuens nukleotida. Studi selanjutnya menunjukkan bahwa banyak keragaman tambahan ini
dapat dijelaskan dengan varlation di situs rekombinasi yang tepat selama acara penggabungan
VJ. Contoh penggunaan situs pengganti penggabungan V dan /, segmen gen pada tikus
diilustrasikan pada Gambar 16.9. Selama penggabungan segmen gen rekombinasi V dan Js
telah terbukti terjadi antara empat posisi nukleotida yang berdekatan di lokasi persimpangan.
Seperti yang ditunjukkan pada Gambar. 16.9d, peristiwa rekombinasi menghasilkan empat
urutan nukleotida yang berbeda yang menyandikan tiga asam amino yang berbeda pada posisi
96 dalam rantai cahaya tikus kappa. Karena asam amino 96 terjadi di daerah rantai antibodi
yang terlibat dalam pengikatan antigen, peristiwa pengikatan V-alternatif jenis ini tidak
diragukan lagi berkontribusi signifikan terhadap keragaman besar spesifisitas antibodi yang
diamati pada vertebrata. Dengan demikian, penggunaan rekombinasi alternatif selama
bergabung yang terlibat dalam perakitan gen antibodi dewasa memberikan mekanisme
tambahan untuk menghasilkan keragaman antibodi.

Meskipun beragam keragaman antibodi yang dihasilkan, (1) bergabung dengan segmen
V, D, dan gen dan (2) penggunaan posisi alternatif rekombinasi selama reaksi bergabung, data
yang dapat diperlihatkan menunjukkan bahwa masih ada mekanisme harus terlibat dalam
generasi keragaman antibodi. Ini telah ditetapkan dengan membandingkan (1) urutan
nukleotida-pasangan gen yang diekspresikan dengan urutan segmen gen garis kuman dan (2)
urutan asam amino aktual dari rantai antibodi dengan sekuens asam amino yang diprediksi
dari sekuens nukleotida gen. Sebagai contoh, ketika sekuens asam amino aktual dari rantai A
tikus yang berbeda dibandingkan dengan sekuens asam amino yang diprediksi (berdasarkan
sekuens nukleotida-pasangan segmen gen A1) dari rantai ringan A, rantai ringan, perbedaan
ditemukan pada daerah variabel yang berbeda dari situs persimpangan. Pengamatan serupa
telah dilakukan dalam studi wilayah variabel rantai berat. Pada dasarnya semua kasus,
perubahan telah dihasilkan dari pergantian pasangan nukleotida tunggal. Substitusi semacam
itu dapat mewakili 1-2 persen pasangan nukleotida segmen gen yang mengkodekan daerah
variabel antibodi. Pergantian pasangan nukleotida ini diduga terjadi oleh beberapa mekanisme
mutasi somatik yang ada sekuens DNA yang mengkodekan wilayah variabel rantai antibodi.
Karena perubahan-perubahan dalam gen-gen antibodi ini terjadi pada frekuensi yang
sedemikian tinggi, proses terjadinya mereka sering disebut hipermutasi somatik. Mekanisme
dimana hypermutation somatik terjadi tidak diketahui.

Hypermutation somatik daerah gen antibodi yang mengkodekan situs pengikatan

antigen mungkin sangat bermanfaat bagi organisme. Tanpa mekanisme ini untuk
menghasilkan keragaman antibodi, kisaran spesifisitas antibodi yang tersedia akan diperbaiki
dalam hal urutan hadir dalam genom saat lahir dan kombinasi yang dapat dihasilkan oleh
berbagai tingkat segmen gen yang bergabung reaksi. Virus dan patogen lainnya terus
berevolusi dan memproduksi varian baru dengan penentu antigenik baru. Untuk memberikan
pertahanan yang memadai terhadap perubahan komposisi antigenik dari virus-virus ini dan
komponen lingkungan lainnya, sistem kekebalan tubuh juga harus mampu merespons
perubahan-perubahan ini dengan cepat.

KELOMPOK 5
How Many Combination
Orang dapat dengan mudah melihat bahwa sejumlah besar keragaman dapat dihasilkan
oleh bergabungnya segmen gen antibodi seperti yang baru saja dijelaskan. Sebagai contoh,
pertimbangkan jumlah light chain kappa berbeda yang mungkin ada pada manusia: 300Vk gen
segmen X 5Jk segmen -1500 segmen gen VkJk menyatu. Wilayah variabel heavy chain
memberikan keragaman yang lebih besar karena segmen gen D ganda. Jika ada 300 segmen
gen V, segmen gen 25D, dan 6 segmen gen JH pada manusia sel garis kuman, 45.000 wilayah
variabel heavy chain yang berbeda dapat dirakit. Dengan menggunakan perkiraan ini,
67.500.000 situs pengikat antigen yang berbeda dapat diproduksi hanya menggunakan light
chain kappa. Lambda light chain menghasilkan tingkat keragaman lain.
Jelas, fusi segmen-gen antibodi ini menyediakan sejumlah besar keanekaragaman
antibodi. Kita sekarang tahu, bagaimanapun, bahwa keragaman lebih lanjut dihasilkan di dua
cara tambahan: (1) mutasi somatik dan (2) variabilitas di situs di mana peristiwa V, V-LD, dan
bergabung-D terjadi. Secara total, kisaran kemungkinan keragaman antibodi tampaknya
hampir tidak terbatas.
Regulation Of Transcription: A Tissue Specific Enhancer
Telah dikenal selama beberapa tahun bahwa garis kuman gen antibodi tidak
ditranskripsi atau ditranskripsi pada tingkat yang sangat rendah. Namun, dalam limfosit B yang
memproduksi antibodi, 10 hingga 20 persen molekul mRNA adalah transkrip gen antibodi.
Lalu, apa yang bertanggung jawab untuk aktivasi transkripsi gen antibodi yang menjalani
pengaturan ulang dan menjadi aktif? Dikasus gen heavy chain, jawabannya muncul agar proses
penataan ulang membawa promotor yang terletak di hulu dari segmen gen LH-VH ke dalam
kisaran pengaruh elemen penambah kuat yang terletak di intron antara gen JH
segmen dan segmen gen CHµ (Gbr. 16.10). Setiap segmen L-VH 8ene berisi promotor hulu.
Namun, sebelum peristiwa penataan ulang genomik yang mengarah pada sintesis heavy chain,
penambah ini lebih dari 100.000 pasangan nukleotida dari promotor L-V terdekat (Gbr. 16.10,
atas). Agaknya, penambah ini tidak dapat melakukan transkripsi aktif dari promotor yang
letaknya sangat jauh. Namun, Pengaturan ulang peristiwa yang terjadi selama diferensiasi sel
B (lihat Gambar 16.5) menggerakkan promotor segmen gen Ly-VH terdekat menjadi kurang
dari 2000 pasangan nukleotida dari penambah (Gbr. 16.10, bawah). Enhancer sekarang dapat
mengaktifkan transkripsi dari promotor yang terletak di-Stream dari segmen gen L-V.
Penambah terlibat dalam aktivasi sintesis heavy chain spesifik jaringan; itu mengaktifkan
transkripsi hanya dalam limfosit dan tidak memiliki efek pada sel yang berasal
Jaringan lain. Agaknya, proses aktivasi membutuhkan adanya faktor pengaktif transkripsional
yang disintesis dalam limfosit, tetapi tidak pada jenis sel lainnya.
Unsur penambah serupa telah ditemukan diintron antara gugus light chain Jk segmen
gen dan urutan G Coding. Dengan demikian, nampaknya pergerakan promotor gen antibodi ke
dalam kisaran pengaruh penambah spesifik jaringan dapat menjadi mekanisme umum aktivasi
gen antibodi selama diferensiasi limfosit B.

KELOMPOK 6
Seleksi Klonal
Hingga Saat Ini, Kami Telah Menghindari Pertanyaan Tentang Bagaimana Suatu Organisme
Memulai Sintesis Antibodi Spesifik Terhadap Antigen Yang Sebelumnya Tidak Pernah
Ditemukan. Ini Dijelaskan Dengan Baik Oleh Teori Seleksi Klon. Ingat Bahwa Semua
Antibodi Yang Diproduksi Oleh Lympbocy B Tunggal Memiliki Kekakuan Pengikatan
Antigen Yang Sama. Tetapi Sel-Sel Yang Berbeda Dalam Populasi Limfosit B Akan
Mengalami Kisaran Genom Belakang Yang Berbeda Yang Mengarah Pada Produksi Antibodi
Dengan Spesifisitas Yang Berbeda. Dengan Demikian, Populasi Limfosit B Pada Manusia
Atau Tikus Akan Menghasilkan Berbagai Antibodi Yang Sangat Besar. Teori Seleksi Klon
Menyatakan Bahwa Pengikatan Antigen Foretgn Tertentu Dengan Antibodi Pada Permukaan
Limfosit B Menstimulasi Sel Untuk Membelah, Menghasilkan Sejumlah Besar Limfosit B
Khusus Ini ("Klon" Sel Identik) Dan Dengan Demikian Sejumlah Besar Antibodi Tertentu
Yang Mengenali Antigen Asing (Gbr. 16.11)
Allelic Exclusion
Pertimbangkan Satu Poin Terakhir Tentang Kontrol Genetik Antibodi. Mengapa? Sel Mamalia
Diploid; Mereka Membawa Dua Set Kode Informasi Genetik Untuk Masing-Masing Rantai
Antibodi. Tetapi Hanya Satu Penataan Ulang Genom Produktif Dari Urutan Pengkodean
Rantai Ringan Dan Satu Penataan Ulang Genom Produktif Dari Urutan Pengkodean Rantai
Berat Terjadi Di Setiap Limfosit B! Fenomena Ini Disebut Allelic Exclusion Karena Salah
Satu "Alel" Dikecualikan Dari Yang Diungkapkan. Bagaimana? Mengapa / Saat Ini, Kita
Masih Belum Tahu. Jelas, Harus Ada Beberapa Jenis Mekanisme Umpan Balik Yang
Menangkap Proses Rekombinasi Yang Terlibat Dalam Penyusunan Ulang Gen Antibodi Ini
Setelah Pengaturan Ulang Yang Produktif Terjadi Dan Sel Telah Mulai Mensintesis Antibodi
Fungsional. Mekanisme Paling Sederhana Akan Melibatkan Penghambatan Proses Ini Oleh
Antibodi Dewasa Itu Sendiri. Namun, Pekerjaan Lebih Lanjut Akan Diperlukan Untuk
Membangun Mekanisme Dimana Allelic Exclusion Terjadi.

KELOMPOK 7
VARIABILITAS RECEPTOR SEL T
Tlymphocytes memediasi respon imun seluler (lihat Gambar 16.1). Sel T mengenali antigen
pada permukaan sel dan membunuh sel pembawa antigen ini. Seperti antibodi yang diproduksi
oleh limfosit B, sel T dapat mengenali dan menghancurkan sel yang membawa berbagai macam
antigen yang menakjubkan. Dengan demikian, respons sel T juga menunjukkan tingkat
spesifisitas yang fenomenal. Bagaimana spesifisitas ini dihasilkan? Jawabannya adalah bahwa
sel T menghasilkan reseptor yang terikat membran yang sangat mirip dengan antibodi yang
diproduksi oleh limfosit B. Selain itu, keragaman spesifisitas reseptor sel T dihasilkan oleh
penyusunan kembali genom yang analog dengan mereka yang terlibat dalam produksi antibodi
(lihat bagian sebelumnya dari bab ini). Tetapi bagaimana limfosit T menghindari interaksi
dengan antigen bebas untuk menghindari duplikasi fungsi sel B dalam respon imun? Ternyata,
sel-sel T harus secara bersamaan mengenali antigen yang menyinggung pada permukaan sel
dan protein lain yang terjadi hanya melekat pada permukaan sel. Protein permukaan sel kedua
yang harus dikenali oleh sel T ini adalah produk dari salah satu dari banyak gen dalam
kompleks bistokompatibilitas utama (MHC). Lokus MHC (lihat bagian berikut) mengkodekan
kelompok protein kompleks yang ada pada semua sel dalam tubuh manusia (atau tikus).
Dengan demikian, sel T dapat mengenali dan menghancurkan sel apa pun yang menghasilkan
antigen tertentu (mis., Protein selubung virus) di jaringan tubuh mana pun. Interaksi reseptor
sel T dengan dua jenis antigen permukaan sel (antigen yang menyinggung dan antigen
histokompatibilitas) diilustrasikan pada Gambar 16.1.

Reseptor sel T terdiri dari dua rantai poli peptida, a dan B, masing-masing dikodekan oleh
segmen gen L-V, D, J, dan C seperti rantai antibodi. Polipeptida a dan B, seperti rantai
antibodi, mengandung daerah variabel yang membentuk situs pengikatan antigen dan daerah
konstan yang melabuhkan reseptor pada permukaan sel (Gambar 16.12a). Daerah variabel dari
reseptor sel T dikodekan oleh beberapa segmen gen L-V, D, dan J; daerah konstan dikodekan
oleh sejumlah kecil segmen gen C. Gen reseptor sel T dirakit oleh penataan ulang genom yang
terjadi selama diferensiasi limfosit T dari sel-sel induk seperti halnya pada kasus gen antibodi
dalam mengembangkan limfosit B. Gambar 16.12b menunjukkan segmen dari polipeptida
reseptor sel a dan B yang dikodekan oleh segmen gen L-V, DJ, dan C. Protein reseptor A dan
B dikodekan oleh segmen gen yang berbaris dalam kelompok pada kromosom yang mirip
dengan rantai antibodi pengkodean. Pada manusia, kelompok segmen gen a dan B masing-
masing terletak pada kromosom 14 dan 7. (Segmen segmen gen lain menyandikan tipe ketiga
dari reseptor sel T polipeptida yang ditunjuk y yang hadir pada tipe spesifik dari sel T. Ada
beberapa tipe berbeda dari sel T yang melakukan fungsi berbeda selama respon imun.)

Struktur Cluster gen reseptor sel T sangat mirip pada manusia dan pada tikus. Organisasi garis
kuman dari segmen gen yang menyandikan reseptor sel B-polipeptida T ditunjukkan pada
Gambar. 16.13a. Organisasi gen B-polipeptida yang disusun ulang fungsional ditunjukkan
pada Gambar. 16.13b. Sekuens sinyal heptamer dan nonamer yang sangat mirip dengan
sekuens yang mengendalikan penataan ulang gen antibodi juga hadir di lokasi yang pada
dasarnya sama di kluster gen reseptor sel T. Kehadiran mereka dalam kedua jenis kluster gen
menunjukkan bahwa mekanisme yang sama dari penggabungan segmen gen digunakan selama
penyusunan ulang kedua gen antibodi dan gen reseptor sel T. Mungkin ada variabilitas total
yang agak kurang pada reseptor sel T daripada pada antibodi. Daerah variabel reseptor sel T
dikodekan oleh hanya sekitar 30 segmen gen V, sedangkan ada sekitar 300 segmen gen V untuk
rantai ringan kappa dan rantai antibodi berat. Namun, ada lebih banyak segmen gen J dalam
kelompok gen reseptor sel T. Sebagai contoh, ada 12 segmen gen J fungsional untuk
polipeptida reseptor B (Gambar 16.13). Selain itu, kami masih belum tahu apakah segmen
variabel gen reseptor sel T mengalami hipermutasi somatik. Dalam setiap kasus, jelas bahwa
reseptor sel T menunjukkan sejumlah besar keanekaragaman, dan bahwa keragaman ini
dihasilkan oleh penataan ulang genom selama diferensiasi limfosit T dengan cara yang
dianalogikan dengan yang terlibat dalam produksi keragaman antibodi dalam limfosit B.

Seperti yang disebutkan sebelumnya, ada beberapa jenis limfosit T yang berbeda dan mereka
memainkan peran yang berbeda dalam respon imun seluler. Untuk diskusi yang sangat baik
tentang berbagai jenis sel T dan fungsinya, pembaca disebut Bab 24, "Kekebalan," Biologi Sel
Molekuler oleh J. Darnell, H. Lodish, dan D. Baltimore.

Gambar 16.12. Diagram menunjukkan (a) struktur reseptor sel T yang berlabuh di membran
sel dan (b) daerah protein reseptor a dan B yang dikodekan oleh masing-masing segmen gen
L-V, D, J, dan C. (Setelah M. K. Davis, Y. Chien, N. R. J. Gascoigne, dan S. M. Hedrick,
Immunol. Rev 8: 235-258, 1984.)

Gambar 16.13 Organisasi lokus kompleks pada tikus yang mengkodekan polipeptida reseptor
sel T. (a) Organisasi jalur benih. (B) Struktur gen yang dirakit dalam limfosit T matang yang
menghasilkan B-polipeptida tertentu. Susunan lokus rantai-B reseptor pada manusia sangat
mirip dengan yang ada pada tikus, namun hanya 12 dari 14 segmen gen yang berfungsi pada
manusia. Segmen gen C masing-masing mengandung tiga intron; mereka tidak ditampilkan
untuk meminimalkan kompleksitas. Intron besar antara segmen J dan segmen C dari gen yang
dirakit dihapus selama pemrosesan transkrip primer seperti tiga intron dalam segmen C dari
gen. Gugus gen a-polipeptida reseptor sel T memiliki organisasi yang serupa, namun, gugus
gen a-polipeptida mengandung 18 segmen gen J dan hanya satu urutan Ca tunggal. (Setelah
A. Winoto, S. Mjolsness, dan L. Hood, Nature 316: 832-836, 1985.)

KELOMPOK 8
Kompleks Histocompatibility Utama
Respon imun pada mamalia adalah proses yang sangat kompleks yang melibatkan
sejumlah besar makromolekul dan tipe sel yang berbeda. Diskusi kami untuk titik ini telah
dibatasi pada kontrol genetik sintesis rantai antibodi dan protein reseptor sel T. Banyak
komponen lain dari respon imun, seperti antigen transplantasi yang bertanggung jawab lebih
besar untuk penolakan jaringan asing dalam operasi transplantasi, dikendalikan oleh kompleks
multigene yang disebut kompleks bistokompatibilitas utama (MHC). Dalam gimana, protein
MHC dikodekan oleh lokus HLA (untuk kompleks antigen leukosit manusia) pada kromosom
6, pada tikus, lokus MHC ditetapkan sebagai H-2 (lokus Histokompatibilitas 2) dan pada
kromosom 17. Pada kedua tikus dan manusia, lokus MHC sangat besar (> 2 X 106 nukleotida-
pasangan) dan mengandung sejumlah besar gen. Selain itu, ada sejumlah besar alel yang
berbeda untuk banyak gen ini sehingga probabilitas setiap individu yang identik untuk semua
gen MHC sangat kecil. Gen MHC dikatakan sangat polimorfik karena sejumlah besar alel gen
individu yang biasanya terpisah dalam populasi tertentu.
Gen MHC menyandikan tiga kelas protein berbeda yang terlibat dalam berbagai aspek
respons imun. Struktur lokus MHC manusia (HLA) dan lokasi relatif gen yang mengkodekan
berbagai kelas histokompatibilitas anti gen diperlihatkan dalam gambar. 16.14. Gen kelas i
menyandikan antigen transplantasi yang disebutkan. Protein kelas I ada sebagai glikoprotein
yang ditambatkan sebagai protein membran integral dengan penentu antigenik yang terpapar
pada sel luar. Mereka hadir pada semua sel dari organisme apa pun dan memungkinkan limfosit
T untuk membedakan "diri" dari "asing". Protein MHC kelas I adalah antigen yang biasanya
bertanggung jawab atas penolakan jaringan asing dalam transplantasi jaringan dan organ.
Seperti diilustrasikan dalam gambar. 16.1, antigen ini memainkan peran kunci dalam
pengenalan dan penghancuran sel yang membawa antigen asing oleh limfosit T sitotoksik.
Sebuah reseptor sel T tunggal diyakini mengenali antigen asing dan sponsor
histokompatibilitas kelas I.

KELOMPOK 9
SUMMARY

Sistem kekebalan hewan vertebrata melindungi mereka dari invasi oleh

mikroorganisme patogen dan zat asing lainnya. Respons imun sangat kompleks. Ini melibatkan
tiga jenis sel darah putih: 1) B. limfosit yang menghasilkan antibodi, 2) T. limfosit yang
menghasilkan reseptor sel T dan menggunakannya untuk mencari dan menghancurkan sel yang
membawa antigen asing, dan 3) makrofag yang melakukan fagositosis dari kompleks antigen
antibodi, virus bakteri dan sebagainya. Selain itu, pengenalan sel T dari sel yang memproduksi
antigen asing membutuhkan keberadaan antigen histokompabilitas spesifik yang dikodekan
oleh kompleks histokompatibilitas utama (lokus HLA pada manusia).

Ciri yang luar biasa dari respons imun adalah variasi antibodi dan protein sel T yang
tampaknya tidak terbatas yang dapat disintesis sebagai respons terhadap antigen yang belum
pernah dijumpai sebelumnya oleh hewan. Kami sekarang mengerti bagaimana keragaman
fenomenal spesifisitas antibodi dan spesifisitas reseptor sel T ini diproduksi. Pengkodean
Informasi Genetik untuk rantai antibodi disimpan dalam beberapa set segmen gen, dan segmen
tersebut disatukan dalam urutan yang sesuai oleh penataan ulang genom yang terjadi selama
pengembangan sel-sel penguat antibodi (B. limfosit). Mekanisme yang sama digunakan untuk
menghasilkan variabilitas dalam spesifisitas antigen reseptor sel T. DNA garis kuman
mengandung gen yang mengkode protein reseptor sel yang disimpan dalam bentuk set gen
segmen yang berkumpul menjadi gen fungsional selama diferensiasi limfosit T dari sel induk.

Antibodi terdiri dari dua rantai ringan (baik kappa atau lambda) dan dua rantai berat.
Setiap rantai antibodi berisi wilayah variabel yang membentuk situs pengikatan antigen dan
wilayah konstan yang menempelkan antibodi ke permukaan sel dalam kasus antibodi yang
terikat membran. Daerah variabel antibodi dikodekan oleh dua segmen gen (rantai ringan) atau
tiga (rantai berat) yang ada dalam genom hanya dalam satu atau satu salinan tampilan per sel.
Gen rantai cahaya Kappa di assamble oleh penataan ulang genomik yang terjadi selama
diferensiasi sel B dari sekitar 300 segmen gen Lk-Vk, 5 segmen gen Jk, dan satu segmen gen
CK. Gen rantai berat fungsional serupa disatukan dari sekitar 300 segmen gen LH-VH, segmen
gen 10 D, segmen gen 4 JH, dan 8 segmen gen CH. Penggunaan situs alternatif segmen gen
yang bergabung selama acara penataan ulang genom dan hipermutasi somatik dalam segmen
gen wilayah variabel berkontribusi pada produksi keragaman antibodi tambahan.

Antibodi terdiri dari lima kelas imunoglobulin yang berbeda: IgM, IgD, IgG, IgE, dan
IgA. Kelas antibodi ditentukan oleh daerah konstanta rantai beratnya, yang pada gilirannya
ditentukan oleh segmen gen C yang diekspresikan selama sintesisnya. Pergantian kelas terjadi
ketika limfosit B berhenti mensintesis satu kelas antibodi dan mulai mensintesis kelas antibodi
lain dengan spesifisitas antigen yang sama. Pergantian kelas melibatkan ekspresi segmen gen
region variabel yang sama tetapi segmen gen region konstan rantai berat yang berbeda.
Pergantian kelas paling sering terjadi oleh penataan ulang genom lebih lanjut mirip dengan
yang menghasilkan sintesis rantai antibodi asli. Namun, perpindahan kelas juga dapat terjadi
dengan pola alternatif penyambungan transkrip.

Gen antibodi garis kuman ditranskripsi pada tingkat yang sangat rendah atau tidak sama
sekali. Penataan ulang yang produktif segmen gen antibodi selama diferensiasi sel B
tampaknya mengaktifkan transkripsi gen yang dirakit dengan membawa promotor yang
ditempatkan di hulu dari segmen gen LV ke dalam jangkauan pengaruh penambah spesifik
jaringan yang terletak di intron antara gugus segmen J dan segmen gen C.

Seleksi klon dengan baik menjelaskan produksi sejumlah besar limfosit B yang
semuanya mensintesiskan antibodi yang sama dengan spesifisitas untuk mengikat antigen
tertentu yang ada dalam sistem sirkulasi hewan. Hanya satu penataan ulang rantai genomik
produktif ringan dan satu penataan ulang rantai berat genomik produktif dapat terjadi pada
limfosit B tertentu. Ini dikenal sebagai pengecualian allelic dan, jelas, harus dikontrol oleh
beberapa jenis mekanisme umpan balik. Namun, dasar molekuler eksklusi alel masih belum
diketahui.