GENETIKA DAN KESEHATAN LINGKUNGAN

Karena setiap organisme terus-menerus terpapar agen berbahaya di lingkungannya, organisme

telah mengembangkan jalur canggih yang dapat meminimalkan konsekuensi biologis dari paparan
semacam itu. Jalur ini merupakan mesin respon lingkungan.

Gambar ini mewakili hipotesis bahwa kombinasi faktor kerentanan genetik dan paparan lingkungan (dan
bukan faktor genetik atau paparan saja) merupakan penyebab mayoritas dari beban penyakit A.S.
komponen dari mesin respons lingkungan, subjek pada variabilitas genetik, yang dapat dikaitkan
dengan perubahan efisiensi gen produk (biasanya enzim atau protein) dan dengan akhir jalur biologis. Jadi,
risiko seseorang terserang penyakit akibat paparan lingkungan mungkin tergantung pada efisiensi
lingkungannya sendiri dari respons gen.
Dalam upaya untuk mengkarakterisasi interaksi gen - lingkungan, terdapat gambaran yang sangat rumit.
Tidak hanya kombinasi gen yang biasa terlibat tetapi ada juga masalah kombinasi eksposur, periode waktu
berakhir eksposur yang telah terjadi (relatif terhadap perkembangan dan usia fisiologis), dan deteksi serta
identifikasi eksposur kronis tingkat rendah. Dengan bertambahnya usia dan paparan lingkungan dari waktu
ke waktu, demikian juga molekul tanggapan progresif dan perubahan yang terkait dengan patogenesis.
ELSIs
Kebanyakan orang saat ini setidaknya akrab tentang etnis, legal, dan social implication (ELSIs)
genetika, seperti potensi diskriminasi genetik oleh para pengusaha atau perusahaan asuransi, masalah
kerahasiaan, dan sebagainya. Sebagai ilmu pengetahuan dan teknologi dengan kemajuan yang cepat dan
bidang genomik dan kesehatan Lingkungan bersatu, banyak isu yang pelik perlu ditangani dengan terus
terang dalam debat publik.
Program ELSI adalah contoh sukses dari komunitas ilmiah mengambil tanggung jawab kepada
masyarakat dengan serius. Yang berdiri sekarang ini sebagai model untuk inisiatif masa depan (termasuk,
organisasi kebijakan nonprofit genomc) yang dirancang untuk memastikan bahwa kita belajar lebih banyak
tentang interaksi gen-lingkungan dan belajar pengaruh kebijakan publik dan swasta, hak-hak privasi setiap
orang, kebebasan pribadi, dan perlakuan yang adil tidak akan terganggu.

Proyek genom manusia dan selebihnya

Pada akhir dari setengah abad kedua puluh dan tahun-tahun awal abad kedua puluh satu adalah
periode kemajuan yang luar biasa pesat dalam penelitian biomedis. Pada tahun 1953, struktur double helix
DNA dilaporkan (Watson dan Crick, 1953). Hanya lima puluh tahun kemudian, para ilmuwan di Human
Genome Project (HGP) selesai melakukan sekuens (pengurutan) genom, menyediakan roadmap lengkap ke
lokasi dari sekitar 30.000 gen manusia (acara dianggap oleh isu-isu khusus dari alam jurnal [Februari
15,2001] ., and Science [Februari 16,2001] . Sekuens genom manusia mungkin akan berdiri sebagai salah
satu prestasi yang paling signifikan dalam sejarah ilmu pengetahuan, meskipun demikian jelas bahwa
informasi genomik belum lengkap, yang mengakibatkan jawaban atas banyaknya pertanyaan tentang dasar
genetik dari penyakit.

Variasi Genetik

karakterisasi variasi genetik antara individu individu atau kelompok yang akan memberikan
informasi yang paling berguna. Variasi dalam gen atau kelompok gen terkait menghasilkan 'fenotipe'.
Fenotipe dapat menggambarkan ciri-ciri fisik seperti warna rambut, fitur perilaku seperti kecemasan, dan
kepekaan fisiologis atau tanggapan khusus untuk interaksi gen-lingkungan.
Variasi genetik antara individu biasanya karena Single Nucleotide Polymorphism (SNP) dan
Penyisipan dan delesi DNA yang dikenal sebagai 'indels'. Mengidentifikasi rute urutan DNA variasi, dan
karakteristisasi cara mereka menentukan atau pengaruh dari fenotipe, adalah fokus dari sejumlah besar
penelitian saat ini dan merupakan titik awal untuk sampai pada pemahaman yang berguna tentang interaksi
gen-lingkungan dan efek yang tak terhitung terhadap kesehatan manusia.

Variabilitas genetik dan Kerentanan terhadap Toksisitas Timbal

Ilmuwan kesehatan lingkungan telah menentukan bahwa polimorfisme gen tertentu dapat membuat
beberapa individu jauh lebih rentan terhadap bahaya dari efek keracunan timah dengan mempengaruhi
penyerapan, akumulasi, dan transportasi toksin. Varian gen yang mengkode asam dehidratase β-
aminolevulinic (ALAD), enzim yang terlibat dalam heme biosintesis. Polimorfisme reseptor vitamin D
(VDR) gen telah terlibat dalam peningkatan akumulasi timbal dalam tulang. Juga varian dari koding gen
hemochromatosis untuk protein HFE, yang terlibat dalam transportasi zat besi dalam tubuh, juga dapat
mempengaruhi penyerapan timbal dan transportasi.
Identifikasi haplotipe dalam beberapa kasus dapat meniadakan kebutuhan untuk
mendokumentasikan individu SNPSs, sebagai haplotipe yang dianggap unit fungsional warisan yang pada
akhirnya mempengaruhi fisiologi.
Generasi Baru dalam Penelitian Kesehatan Lingkungan

Polimorfisme gen respon lingkungan individu dapat memodifikasi risiko penyakit yang disebabkan
lingkungan. Untuk mencapai pemahaman tentang hubungan dan implikasinya dalam interaksi gen-
lingkungan, Institut Nasional Kesehatan meluncurkan sebuah inisiatif pada tahun 1997 disebut Genome
Project Lingkungan (EGP, 2005). Dengan resekuens gen kandidat yang dipilih dalam satu set DNA sampel
mewakili populasi di luar AS, proyek ini bertujuan untuk menemukan SNP dan varian lainnya yang relevan
dengan respons lingkungan, dan akhirnya untuk menghasilkan pengetahuan yang akan memiliki implikasi
untuk kebijakan kesehatan lingkungan dan regulasinya.

Kasus EGP

Gen mengatur produksi enzim paraoxanase (PON1), yang memetabolisme organofosfat beracun
dan beberapa agen farmasi, seperti obat statin penurun kolesterol. Furlong menemukan bahwa SNP tertentu
mempengaruhi aktivitas PON1, mengubah produksi enzim. Status PON1 juga diduga terlibat dalam
kerentanan terhadap sindrom Gulf War (sindrom Parkinson), meskipun penelitian lain yang telah
menunjukkan hasil yang bertentangan. Faktor genetik juga memainkan peran penting, terutama di jalur
perbaikan DNA dan kerusakan DNA oksidatif.
Siklus sel dan pembelahan sel gen mengatur kemampuan sel untuk berkembang biak dan tumbuh.
Perubahan dalam perkembangan sel melalui siklus sel dapat meningkatkan kemampuan sel untuk bertahan
hidup. Sel sinyal dan jalur ekspresi gen memiliki efek pada semua fungsi sel, termasuk proliferasi
dandiferensiasi sel. Jalur metabolik merupakan penentu penting dari hasil paparan. Senyawa berbahaya
dapat dimetabolik diubah menjadi spesies reaktif yang menyebabkan kerusakan sel. Gen perbaikan DNA
dapat mempengaruhi hasil dari paparan agen lingkungan yang menyebabkan kerusakan DNA. Sel yang
rusak berat sering mati oleh proses yang dikenal sebagai apoptosis, atau sel mati terprogram.
Pentingnya polimorfisme individu dapat dijelaskan oleh penelitian berbasis populasi, di mana
sejumlah besar orang yang disaring untuk varian dan data dianalisis untuk menentukan hubungan antara
polimorfisme, kerentanan penyakit, dan eksposur. Efek dari polimorfisme gen soliter diyakinirelatif lemah,
dan penyakit yang disebabkan lingkungan yang diteliti diyakini poligenik, yang melibatkan interaksi dari
beberapa varian genetik dan eksposur.

Menghubungkan Gen dan Eksposur Lingkungan

Penyakit manusia yang paling dapat dipahami melibatkan interaksi kompleks antara
kecenderungan genetik (karena variangenetik), paparan lingkungan (baik yang akut dan kronis, baik jangka
pendek dan jangka panjang), dan penuaan atau perkembangan fisiologis.
Pendekatan tradisional untuk penilaian paparan lingkungan, bekerja dari pelepasan racun ke dalam
lingkungan umum untuk paparan dosis internal untuk efek biologis dan akhirnya terhadap penyakit, telah
terbukti menjadi kerangka kerja yang sangat efektif untuk penelitian kesehatan lingkungan.
Throughput yang tinggi alat-alat analisis bersama dengan alat komputasi yang diperlukan untuk
menafsirkan sejumlah besar data yang memungkinkan pengembangan paradigma ilmiah dikenal sebagai
'sistem biologi'. Dalam sistem biologi tujuannya adalah untuk memahami fungsi dan tanggapan dari seluruh
organisme dengan informasi terpadu tentang unsur-unsurnya (seperti gen dan protein) dengan pengetahuan
tentang keterkaitan elemen. Banyak para laboran menggunakan alat Throughput yang tinggi untuk
memperoleh pemahaman tentang bagaimana sistem beroperasi, sementara menyempurnakan informasi
tentang hubungan dosis-respons.
 Untuk memahami hubungan antara penyakit dan paparan lingkungan, beberapa kategori yang
berbeda dari informasi harus dicari secara bersamaan, seperti pengukuran polutan umum atmosfer dan
racun, nasib dan transportasi agen berbahaya dalam ekosistem, beban tubuh manusia dan metabolisme agen
tersebut , dan biomarker paparan.

Teknologi omics
Banyak kemajuan yang signifikan yang terlihat pada ilmu-ilmu kesehatan lingkungan beberapa
tahun terakhir ini yang telah difasilitasi oleh ketersediaan pada peningkatan kotak perkakas ilmiah:
peningkatan seluler dan model hewan; baru, lebih tepatnya metode eksperimental; bhan, dan alat-alat
komputasional; dan yang paling penting dari semuanya, spesialis-spesialis ilmiah baru yang dikenal ssecara
kolektif sebagai teknologi-teknologi –omics. Genomwide screenings, dimana dokumen yang gen itu
dinyatakan dalam respon terhadap tertentu paparan , dapat melepaskan cahaya pada jalur dan jarigan sinyal
yang terikat dengan hasil. Karena dengan meningkatnya jumlah genom hewan yang telah mensekuen ,
seperti mouse , tikus , ragi , ikan zebra ,nematoda , genom dan lainnya, para peneliti juga melakukan
penyelidikan di bidang yang dikenal sebagai comparative toxicogenomics. Membandingkan respon
genomik terhadap eksposur yang identic di antara spesies hewan dan manusia adalah sebuah metode yang
bermanfaat dari menemukan dan menjelaskan mekanisme seluler dalam respon mekanisme lingkungan
hidup.
Untuk tujuan dari bab ini adalah garis besar dari genomic dan kesehatan lingkungan, dua
penambahan bidang-bidang –omics harus dijelaskan: proteomik dan metabolomik (juga disebut sebagai
metabonomics dan metabolic profiling). Proteomics adalah pembelajaran pada proteome, ekspresi global
pada protein-protein di dalam sel. Poin proteomics adalahuntuk mendapatkan informasi tentang yang
protein diekspresikan oleh yang gen, kapan dan di mana dan pada apa yang di dalam sel tingkat , dan dalam
menanggapi rangsangan apa. Proteomics juga dimaksudkan untuk klasifikasi perbedaan pada ekspresi
protein diantara sample yang telah diketahui.
Functional proteomics berusaha untuk menemukan fungsi dari protein dan bagian dari protein pada
penjelasan interaksinya dan fungsi pentingnya dalam jaringan, mekanisme penyakit, dan berbagai proses
biologis lainnya. Structural proteomics melibatkan pemetaan struktur tiga dimensi pada protein ketika
mereka ada didalam arsitektur sel. Informasi tersebut dapat menjelaskan keadaan penyakit dan fungsi
selular dan juga dapat menunjuk strategi untuk desain terapi agen.
Metabolomics merupakan langkah lain pada penyakit terhadap paparan, atau sebaliknya. Enzim
mengatur produksi metabolit, yang mana sering kali endopoin biokimia dalam proses reaksi. Metabolomics
melibatkan identifikasi dari metabolit, di dalam cairan tubuh mereka berhubungan untuk respon khusus.
Semua kegiatan -omics memainkan peranan penting pada grand design untuk mencapai sebuah
pemahaman pada sistem biologi dan sistem toxiologi. Sebagai eksperimental teknologi yang terus maju,
bersama dengan alat bioinformatika yang dibutuhkan untuk ilmu pengetahuan yang bermanfaat dari
besarnya set data yang dihasilkan, bidang ilmu kesehatan lingkungan harus makin mirip dengan
pemahaman tentang seluruh rentang interaksi gene-environment, di kedua sisi dari gen X lingkungan ini.