Ribuan berbagai jenis mikroba hadir di semua ceruk ekologi Beberapa yang
menguntungkan, yang lain oportunis dan beberapa yang berbahaya.
Hewan adalah sumber infeksi yang penting. Infeksi semacam itu dikenal sebagai
penyakit zoonosis. Penyebaran penyakit ini biasanya dari hewan ke hewan.
Manusia mungkin terinfeksi sebagai tuan rumah akhir seperti pada rabies. Dalam
beberapa kasus, infeksi dapat menyebar dari manusia ke manusia seperti pada
wabah pneumonia.
Tanah juga berperan dalam penularan infeksi. Tanah adalah reservoir untuk spora
spesies Clostridium dan Bacillus anthracis.
Ada lima rute utama yang memungkinkan seorang tuan rumah terinfeksi:
1. Rute pernapasan
2. Saluran pencernaan
3. Saluran genital
4. Kulit dan selaput lender
5. Placenta
Penyakit usus seperti kolera, disentri basiler, demam enterik dan tuberkulosis sapi
terjangkit ketika organisme tertelan. Tetapi dalam kasus infeksi entero virus
(poliomyelitis) dan Hepatitis meskipun organisme masuk melalui sistem gastro
intestinal, efeknya terlihat di tempat lain di tubuh.
Organisme dapat diperoleh dari kulit seperti pada kasus infeksi virus herpes atau
melalui luka seperti pada tetanus. Luka dapat terbentuk dari trauma atau duri duri
atau cedera jarum suntik. Organisme juga dapat diperkenalkan melalui gigitan
hewan seperti pada kasus rabies atau oleh gigitan serangga seperti pada demam
berdarah, malaria, filariasis, dan demam kuning.
Sifilis, gonore, hepatitis B dan AIDS adalah beberapa penyakit menular seksual.
Treponema pallidum, Neisseria gonorrhoeae, Hepatitis B virus dan Human
Immunodeficiency Virus adalah agen etiologi masing-masing.
Faktor Virulensi
1. Pili
Pili berguna untuk lampiran organisme pada sel epitel.
2. Kapsul
Kapsul bawah mengatur sekresi sitokin. Mereka menghambat akumulasi
leukosit. Mereka juga menginduksi sel T penekan dan menghambat
limfoproliferasi
3. Kediaman intraseluler
Mikroorganisme berikut berada intrasel dan mencoba menghindari
mekanisme pertahanan tuan rumah. Mereka adalah M. tuberculosis,
M.leprae, S.typhi, T.gondii, L.donovani, H.capsulatum.
4. Produksi enzim
Beberapa enzim seperti protease, DNA, dan fosfolipase diproduksi dan
mereka membantu dalam gangguan struktur sel dan menghidrolisis jaringan
inang. Di Aspergillus spesies protease membantu dalam invasi.
5. Racun
Bakteri menghasilkan baik eksotoksin dan endotoksin yang berperan penting
dalam patogenesis penyakit
Exotoxin diproduksi oleh beberapa organisme seperti C.diphtheriae,
C.tetani, C.botulinum. Exotoxin yang dihasilkan oleh V.cholerae bekerja
pada usus dan disebut enterotoksin. Toksin yang diproduksi oleh satu jenis
Escherichia coli menyebabkan gastroenteritis akut.
Endotoksin adalah dinding sel lipopolisakarida dari bakteri gram negatif.
Mereka menginduksi produksi sitokin oleh berbagai sel sistem kekebalan.
Sistem koagulasi dan sistem komplemen diaktifkan. Mereka juga
mempengaruhi berbagai organ seperti ginjal, jantung dan paru-paru yang
menyebabkan kegagalan organ.
6. Variasi antigenic
Mikroorganisme menghindari respon imun pejamu dengan mengubah
antigen permukaan mereka. N.gonorrhoeae sangat sering mengubah protein
membran luarnya. Antigenic drift dan shift umum terjadi pada virus
influenza. Trypanosoma brucei ditutupi dengan lapisan protein tebal yang
mengalami perubahan antigen selama infeksi. Beberapa organisme
menghasilkan protein permukaan yang mirip dengan protein inang atau
melapisi diri mereka dengan protein inang yang mereka anggap sebagai
bagian dari inang itu sendiri
Perbedaan antara komensal dan organisme yang terkait dengan penyakit
halus. Definisi flora normal atau patogen berasal dari interaksi kompleks
yang dihasilkan antara organisme dan inangnya.