MODUL 3

KUALITAS CITRA MIKRO CT SCAN

Praba Fitra Perdana, Hanani Disi, Mohamad Yusup, M Ilham, Ricky Dwi S
10211108, 10211051, 10211077, 10211078, 10211081
Program Studi Fisika, Institut Teknologi Bandung, Indonesia
E-mail: praba.fitra@gmail.com

Asisten: (Kiagus Aufa Ibrahim/10210024)

Tanggal Praktikum: (24-03-2014)

Abstrak
Mikro CT scan memiliki prinsip yang sama dengan CT scan konvensional, hanya memiliki dimensi alat yang
relatif lebih kecil karena tujuan penggunaannya juga yang diperuntukkan untuk mencitrakan objek ukuran
kecil. Mikro CT scan juga memiliki ukuran pixel yang lebih kecil sehingga memiliki ketelitian dan kontras
yang lebih baik. Pada percobaan ini dilakukan pencitraan menggunakan mikro CT scan terhadap beberapa
phantom dengan komposisi yang berbeda-beda. Parameter yang digunakan dalam percobaan untuk
menentukan kualitas dari citra adalah besaran kV dan mA yang dimana besaran tersebut sebanding dengan
intensitas dari sinar X. Dengan penambahan intensitas sinar X akan menambah kontras citra, memperkecil
ukuran pixel dari citra dan memperbesar SNR (sinyal to noise ratio) sehingga menghasilkan gambar citra
yang lebih baik.
Kata Kunci: CT scan, Resolusi Spasial, Sinar X, SNR

I. Pendahuluan dapat direkonstruksi dari rangkaian gambar

1.1 Tujuan
Tujuan dari praktikum ini adalah untuk
memahami cara untuk melakukan pencitraan
terhadap suatu benda dan menganalisis
berbagai tanggapan yang berbeda yang
ditimbukan dari berbagai macam benda
(phantom).
1.2 Teori Dasar
Secara medikal, CT scan adalah suatu
metode pencitraan dengan menggunakan
sinar X untuk menghasilkan gambar
penampang cross section dari tubuh[1]. Latar
belakang munculnya CT scan adalah karena
tidak semua bagian tubuh dapat diambil
gambarnya dengan baik oleh metode
radiografi sebelum CT scan seperti otak,
mediastinum dan retroperitoneum. Pada awal
penemuannya CT scan dalam dunia medis
secara umum digunakan untuk pasien
neurologis, penderita gangguan pada otak
seperti pendarahan pada intra cranial, atrofi,
hidrocephalus, dan lain-lain.
Mikro CT scan pada prinsip dasarnya
sama dengan CT scan biasa hanya dari
dimensi ukuran alatnya, cara alat bekerja, dan
tujuan penggunaannya yang berbeda. Mikro
CT scan digunakan untuk mendapat gambar
citra dari berbagai objek dengan ukuran kecil.
Beberapa gambar citra sinar X 2 dimensi
ditangkap oleh alat sebari objek diputar
sehingga menghasilkan banyak gambar
dengan setiap sudut. Struktur internal objek
2D yang telah ditangkap sebelumnya.
Kelebihan Mikro CT scan daripada CT scan
biasa adalah dari ukuran pixelnya, yaitu di
orde mikron sedangkan pada CT scan
ordenya adalah mm.
Gambar 1. Proses proyeksi dalam mikro CT
scan[2].
Phantom adalah objek mati yang diamati
dan diambil citranya dalam prosedur CT-scan.
Phantom digunakan biasanya untuk
menentukan kemampuan dari alat CT scan
dan kualitas dari hasil citra CT scan.
Kualitas dari hasil citra CT scan
itentukan dari ketiga faktor penyususn utama
sistem CT scan yaitu sumber, objek dan
detektor. Parameter yang berperan dalam
faktor sumber adalah besar kV dan mAs nya
yang menentukan besarnya energi yang
digunakan dalam pembentukan sinar X. Pada
faktor objek yang berperan adalah kontrasnya.
Sedangkan pada faktor detektor yang
berperan adalah resolusi spasial (dimensi

1
ukuran detektor), sensitivitas detektor
terhadap sinar X dan resolusi derajat keabuan
(grayscale).
II. Metode Percobaan dan Hipotesa
Percobaan yang dilakukan adalah melihat
hasil citra yang dihasilkan dari proyeksi
phantom. Phantom yang digunakan dalam
percobaan ini adalah sebuah flashdisk.
Flashdisk disimpan pada tempat objek lalu
dimasukkan ke dalam alat mikro CT scan
untuk diambil hasil citranya, gambar citra
yang dihasilkan berupa gambar 2D. Tempat
objek dapat berputar sehingga citra dari
berbagai sudut pengambilan gambar dapat
dihasilkan. Ketika proses proyeksi dimulai
maka sinar X dihamburkan pada objek dan
ditangkap oleh detektor (gambar 1). Segala
pengoperasian mikro CT scan dilakukan di
III. Data dan Pengolahan
komputer, mulai dari menghidupkan sampai
mematikan alat. Setelah proses proyeksi
selesai, dihasilkan banyak gambar 2D dari
citra phantom yang digunakan. Maka
percobaan selanjutnya adalah merekonstruksi
phantom. Dengan menggunakan data gambar
2D yang dihasilkan dari percobaan proyeksi
sebelumnya maka dengan bantuan software
untuk merekonstruksi objek, dan dihasilkan
animasi penampang bagian dalam dari objek.
Diberikan juga data proyeksi dari phantom
yang dimiliki lab untuk diolah. Pengolahan
data dilakukan menggunakan software CTAn
pada komputer, dilakukan analisis kontras,
resolusi spasial dan SNR (signal to noise
ratio).

A. Pengolahan data kontras (phantom angka)

Tabel 1. Data kontras untuk phantom angka dengan 30 kV 100 mA 125 eksposure.
Slice ROI Posisi Mean Standar
Dalam 38,390 0.001 0.002
Slice
mm (line
1 Luar 0.001 0.002
269)
Dalam 45,420 0.002 0.011
Slice
mm (line
2 Luar 0.002 0.011
317)
Dalam 44,009 0.003 0.014
Slice
mm (line
3 Luar 0.003 0.014
309)

Tabel 2. Data kontras untuk phantom angka dengan 30 kV 125 mA 125 eksposure.
Slice ROI Posisi Mean Standar
Dalam 44,241 mm 0 0.005
Slice 1
Luar (line 310) 0 0.005
Dalam 47,524 mm 0 0.005
Slice 2
Luar (line 333) 0 0.005
Dalam 50,093 mm 0 0.006
Slice 3
Luar (line 351) 0 0.006

Tabel 3. Data kontras untuk phantom angka dengan 60 kV 100 mA 125 eksposure.
Slice ROI Posisi Mean Standar
Dalam 44,241 mm 0 0.00126
Slice 1
Luar (line 310) 0 0.00126
Dalam 47,524 mm 0 0.00136
Slice 2
Luar (line 333) 0 0.00136
Dalam 50,093 mm 0 0.00135
Slice 3
Luar (line 351) 0 0.00135

2
 B. Pengolahan data resolusi spasial (phantom grid)

Data profil bar phantom grid :

Tabel 4. Data profil bar untuk phantom grid dengan 30 kV 100 mA 125 eksposure.
Slice 1 Slice 2 Slice 3
21,693 mm 23,405 mm 25,546 mm
Posisi (mm)
(line 152) (line 164) (line 179)
Sudut 100,27° 104,24° 104,85°
Panjanggaris
52.57 50.569 49.953
(mm)
Jumlah
345 352 348
Pixel
Ukuran 1
0.152376812 0.143661932 0.143543103
Pixel (mm)

Tabel 5. Data profil bar untuk phantom grid dengan 30 kV 125 mA 125 eksposure.
Slice 1 Slice 2 Slice 3
27,544 mm 29,256 mm 30,969 mm
Posisi (mm)
(line 193) (line 205) (line 217)
Sudut 65,49° 64,18° 67,02°
Panjanggaris
50.254 50.389 49.664
(mm)
Jumlah
351 360 354
Pixel
Ukuran 1
0.143173789 0.139969444 0.140293785
Pixel (mm)

Tabel 6. Data profil bar untuk phantom grid dengan 60 kV 100 mA 125 eksposure.
Slice 1 Slice 2 Slice 3
27,401 mm 28,971 mm 30,826 mm
Posisi (mm)
(line 192) (line 203) (line 216
Sudut 64,18° 63,07° 65,70°
Panjanggaris
25.195 25.847 24.885
(mm)
Jumlah
180 182 165
Pixel
Ukuran 1
0.139972222 0.142016484 0.150818182
Pixel (mm)

Data analisis resolusi spasial phantom grid :

Tabel 7. Data resolusi spasial untuk phantom grid dengan 30 kV 100 mA 125 eksposure.
ResolusiSpasial
Slice Posisi (mm)
pixel mm
21,693 mm
Slice 1 14 2.133275362
(line 152)
23,405 mm
Slice 2 14 2.011267045
(line 164)
25,546 mm
Slice 3 15 2.153146552
(line 179)

3
 Tabel 8. Data resolusi spasial untuk phantom grid dengan 30 kV 125 mA 125 eksposure.
ResolusiSpasial
Slice Posisi (mm)
pixel mm
27,544 mm
Slice 1 9 1.288564103
(line 193)
29,256 mm
Slice 2 12 1.679633333
(line 205)
30,969 mm
Slice 3 3 0.420881356
(line 217)

Tabel 9. Data resolusi spasial untuk phantom grid dengan 60 kV 100 mA 125 eksposure.
ResolusiSpasial
Slice Posisi (mm)
pixel mm
27,401 mm
Slice 1 9 1.25975
(line 192)
28,971 mm
Slice 2 6 0.852098901
(line 203)
30,826 mm
Slice 3 6 0.904909091
(line 216

C. Pengolahan data SNR (phantom homogen)

Tabel 10. Data SNR untuk phantom homogen dengan 30 kV 100 mA 125 eksposure.
Posisi
Slice Mean StandarDeviasi SNR
(mm)
21,693
Slice
mm (line 0.001 0.002 0.5
1
152)
23,405
Slice
mm (line 0.002 0.011 0.181818182
2
164)
25,546
Slice
mm (line 0.003 0.014 0.214285714
3
179)

Tabel 11. Data SNR untuk phantom homogen dengan 30 kV 125 mA 125 eksposure.
Posisi
Slice Mean StandarDeviasi SNR
(mm)
27,544
Slice
mm (line 0 0.005 0
1
193)
29,256
Slice
mm (line 0 0.005 0
2
205)
30,969
Slice
mm (line 0 0.006 0
3
217)

Tabel 12. Data SNR untuk phantom homogen dengan 60 kV 100 mA 125 eksposure.
Posisi
Slice Mean StandarDeviasi SNR
(mm)
Slice 27,401
0 0.00126 0
1 mm (line

4
 192)
28,971
Slice
mm (line 0 0.00136 0
2
203)
30,826
Slice
mm (line 0 0.00135 0
3
216)

Tabel 3. Data kontras untuk phantom flashdisk dengan 80 kV 29 mA 125 eksposure .

Posisi Standar
Slice ROI (mm) Mean Deviasi
Dalam 18.828 0.024 0.01
Slice (Line
1 Luar 169) 0.003 0.002
Dalam 25.624 0.023 0.013
Slice (Line
2 Luar 230) 0.004 0.003
Dalam 42.447 0.029 0.015
Slice (Line
3 Luar 381) 0.005 0.004

D. Hasil Citra

(a) (b)

Gambar 2. Citra rekonstruksi dari phantom 1 (30

kV 100 mA). (c)
Gambar 4. Phantom grid 1 (a) Slice 1 (b) Slice
2(c) Slice 3.

(a) (b)
(a) (b)

(c)
Gambar 3. Phantom angka 1 (a) Slice 1 (b) Slice2
(c) Slice 3. (c)
Gambar 5. Phantom homogen 1 (a) Slice 1 (b)
Slice 2(c) Slice 3.

5
 (c)
Gambar 9. Phantom homogen 2 (a) Slice 1
(b)Slice 2 (c) Slice 3.

Gambar 6. Citra rekonstruksi dari phantom 2 (30

kV 125 mA).

Gambar 10. Citra rekonstruksi dari phantom 3

(a) (b) (60 kV 100 mA).

(c)
Gambar 7. Phantom angka 2 (a) Slice 1 (b) Slice2 (a) (b)
(c) Slice 3.

(c)
Gambar 11. Phantom angka 3 (a) Slice 1 (b)
(a) (b) Slice2(c) Slice 3.

(c)
Gambar 8. Phantom grid 2 (a) Slice 1 (b) Slice (a) (b)
2(c) Slice 3.

(c)
Gambar 12. Phantom grid 3 (a) Slice 1 (b) Slice
(a) (b) 2(c) Slice 3.

6
 (a) (b)
(c)
Gambar 13. Phantom homogen 3 (a) Slice 1
(b)Slice 2 (c) Slice 3.
Gambar 14. Phantom flashdisk Slice 1.
Gambar 15. Phantom flashdisk Slice 2.
IV. Pembahasan
Berdasarkan hasil citra phantom dengan
berbagai nilai besaran kV dan mA terlihat
bahwa dengan penambahan besaran kV akan
menambah kontras dari citra objek (bisa
langsung diamati oleh mata telanjang
terhadap hasil citra rekonstruksi phantom
angka pada gambar 2, 6, 10 dan gambar
angka-angka pada phantom itu sendiri pada
gambar 3, 7, 11), hasil citra semakin jelas
dengan penambahan besaran kV. Sedangkan
untuk besaran mA pengaruhnya cukup
terlihat juga jika dilihat dari perbandingan
7
Gambar 16. Phantom flashdisk Slice 3.
Gambar 17. Citra phantom flashdisk.
gambar 2 dan 6, dengan penambahan besaran
mA bisa menambah kontras dari citra
walaupun tidak sebesar pengaruh
penambahan besaran kV. Besaran kV dan
mA ini sebanding dengan intensitas sinar X,
maka dapat disimpulkan kontras dari citra
sebanding dengan intensitas sinar X yang
digunakan.
Pada hasil pengolahan resolusi spasial
terlihat bahwa dengan penambahan besaran
kV dan mA akan memperkecil ukuran dari
pixel gambar citra. Semakin kecil ukuran
pixelnya maka gambar citranya akan semakin
jelas, karena semakin kecil ukuran pixelnya
akan membuat detektor lebih peka terhadap
perbedaan warna dan kontras antara pixel
satu dengan lainnya.
Pada pengolahan SNR dihasilkan nilai
SNR yang kecil mendekati nol dengan
bertambahnya intensitas sinar X, tetapi
sebanding dengan nilai mean dan standar
deviasinya yang mendekati nol juga, ini
menunjukan bahwa perbandingan mean dan
standar deviasinya hampir sebanding. Nilai
SNR yang dihasilkan sebenarnya membesar
terlihat dari pembaginya yang semakin kecil.
Nilai SNR yang bisa dibilang membesar ini
menyebabkan sinyal yang terukur di detektor
semakin besar dan noise yang terukur
semakin kecil sehingga gambar citra akan
semakin bagus.
Jika dilihat dari percobaan yang
dilakukan maka penambahan kV dan mA
akan memperbagus gambar hasil citra maka
VI. Pustaka
[1]
http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/ency/art
[2] www.xviewct.com , diakses pada 27-03-
2014 10:00
[3]
http://www.lf2.cuni.cz/info2lf/ustavy/kzm/en
g/predn/ct.pdf , diakses pada 27-03-2014
20:00
[4]
http://nardinurses.files.wordpress.com/2008/
01/konsep-ct-scan-mri.pdf , diakses pada 27-
03-2014 20:00
jika diimplementasikan pada phantom
flashdisk yang terlihat pada gambar 14, 15
dan 16 masih terlihat noise dan artefak, maka
dengan penambahan nilai kV dan mA akan
memberikan hasil yang lebih bagus.
V. Simpulan
Besaran kV dan mA sebanding dengan
intensitas dari sinar X yang digunakan.
Dengan bertambahnya intensitas yang
digunakan dalam metode CT ini akan
memberikan gambar hasil citra yang lebih
baik dimana faktor penilainya adalah dari
kontrasnya, resolusi spasialnya dan SNR nya.
Maka berdasarkan percobaan bisa
disimpulkan dengan pertambahan intensitas
sinar X akan menaikkan kontras,
memperkecil ukuran pixel (resolusi spasial)
dan memperbesar SNR.
icle/003330.htm , diakses pada 27-03-2014
08:00
[5]
http://micro.magnet.fsu.edu/primer/java/digit
alimaging/processing/spatialresolution/ ,
diakses pada 27-03-2014 21:00
[6]
https://www.microphotonics.com/microct-
skyscan-1172 , diakses pada 27-03-2014
21:00