MAKALAH MIKROBIOLOGI LINGKUNGAN

“EKOLOGI DAN GENETIKA MIKROORGANISME”

Kelompok 7
Nama Anggota :

1. Alfin Sutanto (P21335118004)

2. Azzahra Diah Ayu Amalia (P21335118013)

3. Nadhifa Athira Azis (P21335118040)

Kelas : 2 D-IV A
Dosen Pengajar : Dr. Dra. Syarifah Miftahul El Jannah T.M.Biomed

PRODI D-IV KESEHATAN LINGKUNGAN

POLITEKNIK KESEHATAN KEMENKES JAKARTA II
Jln. Hang Jebat III/F3 Kebayoran Baru Jakarta Selatan, Daerah khusus Ibukota
Jakarta 12120
 KATA PENGANTAR

Puji syukur kami panjatkan kehadirat Tuhan Yang Maha Esa karena dengan rahmat,
karunia, serta taufik dan hidayah-Nya kami dapat menyelesaikan makalah yang berjudul “Ekologi
dan Genetika Mikroorganisme” ini dengan baik meskipun banyak kekurangan didalamnya. Kami
berterima kasih kepada Ibu Dr. Dra. Syarifah Miftahul El Jannah T.M.Biomed selaku dosen mata
kuliah Mikrobiologi Lingkungan yang telah memberikan tugas ini kepada kami.

Kami sangat berharap makalah ini dapat berguna dalam rangka menambah wawasan serta
pengetahuan kita mengenai dasar-dasar mikrobiologi. Kami juga menyadari sepenuhnya bahwa di
dalam makalah ini terdapat kekurangan dan jauh dari kata sempurna. Oleh sebab itu, kami
berharap adanya kritik, saran dan usulan demi perbaikan makalah yang telah kami buat di masa
yang akan datang, mengingat tidak ada sesuatu yang sempurna tanpa saran yang membangun.

Semoga makalah sederhana ini dapat dipahami bagi siapapun yang membacanya.
Sekiranya laporan yang telah disusun ini dapat berguna bagi kami sendiri maupun orang yang
membacanya. Sebelumnya kami mohon maaf apabila terdapat kesalahan kata-kata yang kurang
berkenan dan kami memohon kritik dan saran yang membangun demi perbaikan makalah ini di
waktu yang akan datang.

Jakarta, 05 Oktober 2019

Kelompok 7

i
 DAFTAR ISI

KATA PENGANTAR ............................................................................................................. i

DAFTAR ISI ........................................................................................................................... ii

BAB I PENDAHULUAN ..................................................... Error! Bookmark not defined.

1.1. Latar Belakang ......................................................... Error! Bookmark not defined.

1.2. Tujuan ......................................................................................................................... 1

BAB II PEMBAHASAN ........................................................................................................ 2

2.1. Definisi Umum ........................................................................................................... 2

2.2. Prinsip Ekologi Mikroorganisme dengan Host ........................................................... 3

2.3 Interaksi Mikroorganisme ............................................................................................ 5

2.4 Mikroorganisme pada Tubuh Manusia ......................................................................... 8

2.5 Materi Genetik ............................................................................................................ 11

BAB III PENUTUP .............................................................................................................. 18

3.1. Kesimpulan ............................................................................................................... 18

DAFTAR PUSTAKA ........................................................................................................... 19

ii
 BAB I

PENDAHULUAN

1.1 Latar Belakang

Ekologi mikroba yaitu ilmu yang mempelajari interrelasi atau interaksi antara mikroba
dengan lingkungannya baik lingkungan biotik maupun abiotik. Menurut Winigradsky ada
2 kategori mikroorganisme yang ditemukan dalam ekosistem mikroorganisme otokhton dan
alokhton. Mikroorganisme otokhton asli ada atau selalu ada dalam ekosistem tertentu.
Bakteri otokhton selalu dapat ditemukan dalam tanah, tidak tergantung apakah zat makanan
tertentu dipasok dari luar atau tidak. Keberadaannya didasarkan atas penambahan zat-zat
makanan yang sedikit banyak tetap yang khas untuk ekosistemnya. Dengan
mikroorganisme alokhton atau zimogen dimaksudkan mikroorganisme yang
keberadaannya tergantung dari peningkatan kadar zat makanan yang kadang-kadang terjadi
atau dari adanya zat-zat makanan tertentu. Bakteri-bakteri ini boleh dikatakan asing di
dalam ekosistem, dan terdapat hanya untuk sementara waktu atau bertahan dalam bentuk
stadium istirahat.
Genetika adalah ilmu yang mempelajari tentang hereditas (sifat turun temurun) sifat
induk dan variasi sifat karakteristik mikrobia. Hereditas adalah pengawetan sifat-sifat
struktur dan fungsi pada keturunan-keturunan berikutnya. Perkecualian atau penyimpangan
yang terjadi pada keturunan suatu organism berbeda dalam satu atau beberapa sifat
induknya. Penyimpangan-penyimpangan dan pengawetan sifat-sifat semacam itu dikenal
dengan variasi. Variasi dapat terjadi karena perubahan genetic dan evolusi. Diduga
peristiwa perkawinan tidak terjadi pada bakteri. Mikrobia hanya berkembang biak dengan
mekanisme aseksual melalui peembelahan diri. Maka para ahli menggolongkan mikrobia
bersama-sama dengan algae biru dalam schizophyta.

1.2 Tujuan
Adapun tujuan dalam penulisan makalah yang berjudul Ekologi dan Genetika
Mikroorganisme adalah sebagai bahan pembelajaran dalam mata kuliah Mikrobiologi
Lingkungan tentang Ekologi dan Genetika Mikroorganisme dan pembaca dapat lebih
mengetahui dan memahami mengenai pokok bahasan yang akan dijelaskan dalam makalah
ini.

1
 BAB II

PEMBAHASAN

2.1 Definisi Umum

2.1.1 Ekologi
Ekologi berasal dari Bahasa latin, yaitu dari kata oikos dan logos. Oikos yaitu
berarti habitat dan logos yang berarti ilmu. Ekologi diartikan sebagai ilmu yang
mempelajari baik interaksi antar makhluk hidup maupun interaksi antara makhluk
hidup dan lingkungannya. Istilah ekologi pertama kali dikemukakan oleh Ernst
Haeckel (1834 - 1914). Dalam ekologi, makhluk hidup dipelajari sebagai kesatuan
atau sistem dengan lingkungannya.
Pembahasan ekologi tidak lepas dari pembahasan ekosistem dengan berbagai
komponen penyusunnya, yaitu faktor abiotik dan biotik. Faktor abiotik antara lain
suhu, air, kelembaban, cahaya, dan topografi, sedangkan faktor biotik adalah
makhluk hidup yang terdiri dari manusia, hewan, tumbuhan, dan mikroba. Ekologi
juga berhubungan erat dengan tingkatan-tingkatan organisasi makhluk hidup, yaitu
populasi, komunitas, dan ekosistem yang saling memengaruhi dan merupakan suatu
sistem yang menunjukkan kesatuan.
Ekologi merupakan cabang ilmu yang masih relatif baru, yang baru muncul pada
tahun 70-an. Akan tetapi, ekologi mempunyai pengaruh yang besar terhadap cabang
biologinya. Ekologi mempelajari bagaimana makhluk hidup dapat mempertahankan
kehidupannya dengan mengadakan hubungan antar makhluk hidup dan dengan
benda tak hidup di dalam tempat hidupnya atau lingkungannya.[Ekologi, biologi dan
ilmu kehidupan lainnya saling melengkapi dengan zoologi dan botani yang
menggambarkan hal bahwa ekologi mencoba memperkirakan, dan ekonomi energi
yang menggambarkan kebanyakan rantai makanan manusia dan tingkat tropik.
2.1.2 Mikroba
Mikroba atau mikroorganisme adalah organisme yang berukuran sangat kecil
(biasanya kurang dari 1 mm) sehingga untuk mengamatinya diperlukan alat bantuan.
Mikroorganisme seringkali bersel tunggal (uniselular) meskipun beberapa protista
bersel tunggal masih terlihat oleh mata telanjang dan ada beberapa spesies multisel
tidak terlihat mata telanjang. Ilmu yang mempelajari mikroorganisme disebut
mikrobiologi. Orang yang bekerja di bidang ini disebut mikrobiolog.

2
 Mikroorganisme biasanya dianggap mencakup semua prokariota, protista dan
alga renik. Fungi, terutama yang berukuran kecil dan tidak membentuk hifa, dapat
pula dianggap sebagai bagiannya meskipun banyak yang tidak menyepakatinya.
Kebanyakan orang beranggapan bahwa yang dapat dianggap mikroorganisme adalah
semua organisme sangat kecil yang dapat dibiakkan dalam cawan petri atau
inkubator di dalam laboratorium dan mampu memperbanyak diri secara mitosis.
2.1.3 Genetika
Genetika adalah ilmu yang mempelajari tentang hereditas (sifat turun temurun)
sifat induk dan variasi sifat karakteristik mikrobia. Hereditas adalah pengawetan
sifat-sifat struktur dan fungsi pada keturunan-keturunan berikutnya. Perkecualian
atau penyimpangan yang terjadi pada keturunan suatu organism berbeda dalam satu
atau beberapa sifat induknya. Penyimpangan-penyimpangan dan pengawetan sifat-
sifat semacam itu dikenal dengan variasi. Variasi dapat terjadi karena perubahan
genetic dan evolusi. Diduga peristiwa perkawinan tidak terjadi pada bakteri.
Mikrobia hanya berkembang biak dengan mekanisme aseksual melalui peembelahan
diri. Maka para ahli menggolongkan mikrobia bersama-sama dengan algae biru
dalam schizophyta.
Kemudian timbul pertanyaan kalau mikrobia berkembang dengan mekanisme
yang monoton seperti di atas maka terbentuk individu seragam tetapi pada
kenyataannya tidak, sehingga terjadi variasi mikroba.Sifat mikroba sangat bervariasi
karena masing-masing mikroba mempunyai kemampuan untuk beradaptasi terhadap
pengaruh lingkungan sekitarnya. Mikroba contohnya bakteri mempunyai populasi
yang berkembang cepat dan beraneka ragam variasinya. Bakteri untuk memperoleh
variasi yang beragam dapat melalui mutasi. Peristiwa seksual yang semula diduga
tidak terjadi, dapat dibuktikan oleh para ahli. Bahkan perpindahan bahan genetik
dapat didemontrasikan dari satu mikroba ke mikroba lain

2.2 Prinsip Ekologi Mikroorganisme dengan Host

Habitat ekologi adalah tempat atau lokasi yang pada keadaan normal dihuni oleh
organisme tertentu (individu atau populasi). Di dalam ekosistem tertentu suatu
mikroorganisme pada umunya hanya mempunyai satu habitat. Tetapi suatu mikroorganisme
dapat mempunyai beberapa habitat, masing-masing habitat di dalam ekosistem yang
berlainan. Sebagai contoh Rhizobium tumbuh baik di dalam tanah maupun di dalam

3
tumbuhan, bakteri metanogen mempunyai habitat di sedimen danau, dalam perut besar dan
di dalam menara pembusukan sebuah instalasi pembersihan.
Komunitas mikroba merupakan hubungan timbal balik yang kompleks antara mikroba
dengan lingkungannya, baik unsur hidup maupun unsur tak hidup. Contohnya yaitu
Rhizobium. Rhizobium mendapatkan nitrogen dari tanah dan tanah menjadi subur.
Relung ekologi mikroba berlainan dengan habitat, relung ekologi ini tidak berhubungan
dengan lokasi dalam ruangan, tetapi berhubungan dengan fungsi suatu organisme atau suatu
populasi. Pada relung ini masing-masing jenis atau populasi memenuhi fungsi tertentu,
yang ditentukan oleh kebutuhannya akan bahan makanan fisiologik, sifat-sifat kinetik,
kemampuan biokimia, keistimewaan-keistimewaan structural dan toleransinya terhadap
kondisi-kondisi lingkungan. Hal ini dapat diperjelas dengan contoh: di dala perut besar
hanya bakteri-bakteri selulotik tertentu saja yang sanggup mempertahankan diri dan
memecahkan selulosa, selulosa dipecahkan secara anaerob dan energi diperoleh dengan
peragian. Lebih lanjut suhu dalam usus besar harus sedemikian sehingga keberadaan asam
lemak, enzim, ammonium, gas, dan produk lain dapat ditoleransi. Akhirnya harus
diusahakan ada pembuangan berlanjut dari produk-produk peragian, misalnya hydrogen.
Untuk dapat berfungsi dalam ekosistem tertentu harus mempunyai kemampuan dan
toleransi yang besar.
Faktor fisik utama yang mempengaruhi interaksi mikroba di lingkungan adalah sebagai
berikut:
a. Suhu
Suhu berpengaruh terhadap ekosistem karena suhu merupakan syarat yang
diperlukan mikroba untuk hidup. Namun, juga ada mikroba yang hanya dapat hidup
pada kisaran suhu tertentu.
b. Sinar matahari
Sinar matahari mempengaruhi ekosistem secara global karena matahari
menentukan suhu.
c. Air
Air berpengaruh terhadap ekosistem karena air dibutuhkan untuk kelangsungan
hidup organisme. Bagi tumbuhan, air diperlukan dalam pertumbuhan,
perkecambahan, dan penyebaran biji; bagi hewan dan manusia, air diperlukan
sebagai air minum dan sarana hidup lain, misalnya transportasi bagi manusia, dan

4
 tempat hidup bagi ikan. Bagi unsur abiotik lain, misalnya tanah dan batuan, air
diperlukan sebagai pelarut dan pelapuk.
d. Tanah
Tanah merupakan tempat hidup bagi organisme. Jenis tanah yang berbeda
menyebabkan organisme yang hidup didalamnya juga berbeda. Tanah juga
menyediakan unsur-unsur penting bagi pertumbuhan organisme,
terutamatumbuhan.
e. Ketinggian
Ketinggian tempat menentukan jenis organisme yang hidup di tempat tersebut,
karena ketinggian yang berbeda akan menghasilkan kondisi fisik dan kimia yang
berbeda.
f. Angin
Angin selain berperan dalam menentukan kelembapan juga berperan dalam
penyebaran biji tumbuhan tertentu.
g. Garis lintang
Garis lintang yang berbeda menunjukkan kondisi lingkungan yang berbeda pula.
Garis lintang secara tak langsung menyebabkan perbedaan distribusi organisme di
permukaan bumi. Ada organisme yang mampu hidup pada garis lintang tertentu
saja. Dilihat dari luasnya, maka ekosistem mikroorganisme amat berbeda-beda.
Misalnya suatu ekosistem dapat mencakup sebuah kolam, sebuah danau atau daerah
akar tumbuhan. Dalam hubungan dengan ekosistem, juga kerap digunakan
pengertian lingkungan. Lingkungan menyangkut hubungan-hubungan organisme
tertentu (populasi tertentu) dengan komponen-komponen biotik dan abiotik
ekosistem sekitarnya.

2.3 Interaksi Mikroorganisme

Di alam jarang sekali ditemukan mikroba yang hidup sebagai biakan murni, tetapi selalu
berada dalam asosiasi dengan jasad-jasad lain. Antar jasad dalam satu populasi atau antar
populasi jasad yang satu dengan yang lain saling berinteraksi. Yang dimaksud dengan
interaksi mikroba di sini adalah hubungan timbal balik antara mikroba dengan mikroba
lainnya maupun dengan organisme yang lebih tinggi.

1. Interaksi dalam Satu Populasi Mikroba

5
 Interaksi antar jasad dalam satu populasi yang sama ada dua macam, yaitu
interaksi positif maupun negatif. Interaksi positif menyebabkan meningkatnya
kecepatan pertumbuhan sebagai efek sampingnya. Meningkatnya kepadatan populasi,
secara teoritis meningkatkan kecepatan pertumbuhan. Interaksi positif disebut juga
kooperasi. Sebagai contoh adalah pertumbuhan satu sel mikroba menjadi koloni atau
pertumbuhan pada fase lag (fase adaptasi). Interaksi negatif menyebabkan turunnya
kecepatan pertumbuhan dengan meningkatnya kepadatan populasi.

2. Interaksi antar Berbagai Macam Mikroba

Apabila dua populasi yang berbeda berasosiasi, maka akan timbul berbagai
macam interaksi. Interaksi tersebut menimbulkan pengaruh positif, negatif, ataupun
tidak ada pengaruh antar populasi mikroba yang satu dengan yang lain. Nama masing-
masing interaksi adalah sebagai berikut:
a. Netralisme
Netralisme adalah hubungan antara dua populasi yang tidak saling mempengaruhi.
Hal ini dapat terjadi pada kepadatan populasi yang sangat rendah atau secara fisik
dipisahkan dalam mikrohabitat, serta populasi yang keluar dari habitat alamiahnya.
Komensalisme hubungan komensalisme antara dua populasi terjadi apabila satu
populasi diuntungkan tetapi populasi lain tidak terpengaruh.
Contohnya adalah:
– Bakteri Flavobacterium brevis dapat menghasilkan ekskresi sistein. Sistein dapat
digunakan oleh Legionella pneumophila.
– Desulfovibrio mensuplai asetat dan H2 untuk respirasi anaerobik
Methanobacterium.
b. Sinergisme
Suatu bentuk asosiasi yang menyebabkan terjadinya suatu kemampuan untuk dapat
melakukan perubahan kimia tertentu di dalam substrat. Apabila asosiasi melibatkan
2 populasi atau lebih dalam keperluan nutrisi bersama, maka disebut sintropisme.
Sintropisme sangat penting dalam peruraian bahan organik tanah, atau proses
pembersihan air secara alami. Contoh sinergisme: Streptococcus faecalis dan
Escherichia coli.
c. Amensalisme
Satu bentuk asosiasi antar spesies mikroba yang menyebabkan salah satu pihak
dirugikan, pihak lain diuntungkan atau tidak terpengaruh apapun. Umumnya
6
 merupakan cara untuk melindungi diri terhadap populasi mikroba lain. Misalnya
dengan menghasilkan senyawa asam, toksin, atau antibiotika.
d. Predasi
Hubungan predasi terjadi apabila satu organisme predator memangsa atau
memakan dan mencerna organisme lain (prey). Umumnya predator berukuran lebih
besar dibandingkan prey, dan peristiwanya berlangsung cepat. Contohnya adalah
Protozoa (predator) dengan bakteri (prey). Protozoa Didinium nasutum (predator)
dengan Paramaecium caudatum (prey).
e. Sintrofisme
Di sini organisme tidak terlalu dekat berhubungan tetapi keduanya memberi
keuntungan secara timbal balik.
f. Kompetisi
Kompetisi adalah interaksi antara mikroorganisme yang merupakan persaingan
akibat keterbatasan zat makanan serta energi yang tersedia. Ada pula organisme
yang menghasilkan berbagai substansi yang menghambat mikroorganisme lain.
g. Simbiosis
Hubungan yang dekat antara dua bentuk kehidupan, berlangsung lama atau sebentar
dan memerlukan kontak fisik. Pada endosimbiosis suatu organisme berada di dalam
organisme yang lain, sedangkan pada ektosimbiosis organisme berada di
permukaan yang lain. Terdapat tiga jenis simbiosis, yaitu mutualisme,
komensalisme dan parasitisme.
1. Mutualisme
Mutualisme adalah asosiasi antara dua populasi mikroba yang keduanya saling
tergantung dan sama-sama mendapat keuntungan. Mutualisme sering disebut
juga simbiosis. Simbiosis bersifat sangat spesifik (khusus) dan salah satu
populasi anggota simbiosis tidak dapat digantikan tempatnya oleh spesies lain
yang mirip. Contohnya adalah Lactobacillus acidophilus yang terdapat di
vagina berperan dalam menjaga keseimbangan pH vagina
2. Parasitisme
Parasitisme terjadi antara dua populasi, populasi satu diuntungkan (parasit) dan
populasi lain dirugikan (host / inang). Umumnya parasitisme terjadi karena
keperluan nutrisi dan bersifat spesifik. Ukuran parasit biasanya lebih kecil dari
inangnya. Terjadinya parasitisme memerlukan kontak secara fisik maupun

7
 metabolik serta waktu kontak yang relatif lama. Contohnya adalah bakteri
Bdellovibrio yang memparasit bakteri E. coli. Jamur Trichoderma sp.
memparasit jamur Agaricus sp.
3. Komensalisme
Pada bentuk interaksi ini satu organisme mendapat keuntungan, sedangkan
yang lain tidak dirugikan ataupun mendapat keuntungan. Sebagai contoh adalah
Stapbylococcus epidermidis yang hidup sebagai komensal pada kulit manusia,
Staphylococcus albus di kulit manusia Bakteri ini biasanya terdapat pada
saluran pernapasan atas dan kulit pada individu sehat biasanya hanya berperan
sebagai karier.
4. Oportunis
Simbiosis ini pada awalnya bersifat komensalisme, namun berubah menjadi
parasitisme. Contoh : Gatal yang disebabkan karena gigitan nyamuk, kemudian
digaruk hingga timbul luka. Hal tersebut menyebabkan bakterii Staphylococcus
masuk ke dalam luka tersebut dan mengakibatkan bisul pada kulit.

2.4 Mikroorganisme Pada Tubuh Manusia

Sebenarnya mikroorganisme yang terdapat pada tubuh manusia tak dapat digolongkan
dengan tegas apakah ia suatu komensal atau suatu spesies yang patogen bagi manusia
tersebut. Flora dalam tubuh manusia dapat menetap atau fiansient. Mikroba normal yang
menetap tersebut dapat dikatakan tidak menyebabkan penyakit dan mungkin
menguntungkan bila ia berada di lokasi yang semestinya dan tanpa adanya keadaan
abnormal. Mereka dapat menyebabkan penyakit bila karena keadaan tertentu berada di
tempat yang tak semestinya atau bila ada faktor predisposisi. Sebagai contoh, flora normal
di saluran pencernaan berperan dalam sintesis vitamin K dan membantu absorpsi zat
makanan tertentu. Pada mukosa dan kulit, flora normal dapat mencegah kolonisasi bakteri
patogen melalui bacterial interference. Streptococcus oiridans, bakteriyang tersering
ditemukan di saluran napas atas, bila masuk ke aliran darah setelah ekstraksi g1g1 atau
tonsilektomi dapat sampai ke katup jantung yang abnormal dan mengakibatkan subacute
bacterial endocarditis Bacteroides yang normal terdapat di kolon dapat menyebabkan
peritonitis mengikuti suatu trauma.

8
 Bagian yang mengandung mikroorganisme adalah mulut, nasofaring, orofaring, tonsil.
Sedangkan laring, trakea, bronkus, bronkiolus, alveolus dan sinus hidung biasanya steril.
a. Mulut
Amat kaya akan mikroorganisme, plrylococcus epidermidis, Staplrylococcus
Aureus) beberapa mikrokokus berpigmen, dan Staphylococcus yang bersifat
anaerob ditemukan di permukaan gigi dan saliva. Dijumpai pula Streptococcus
piridans (grup mitis dan salivarius), Enterococcus, Neisseria berpigmen, Willonella
spp, Corynebacterium anaerob, Actinomyces, Escherichia coli,Klebsiella-
Enterobacter group, Haemopbilus, Bacteroides, Fusobaaerium, Vibrio sputorum
dan beberapa Spirocbaeta (Treponema denticum dan Borrelia refringens).
Streptococcus nogenes dapat dijumpai pada 5 -10o/o mulut normal. Streptococcus
pneumoniae terdapat di permukaan gigi 25 o/o orang dewasa normal. Organisme
yang dominan di saluran napas, terutama di faring adalah Streptokokus
nonhemolitik dan alfahemolitik dan Neisseria.Juga terdapat Staplrylococcus,
Diphteroid, Haemophilus, Pneumococcus, Mycoplasma, dan Bacteroides.
Pemusnahan flora normal faring dengan penisilin dosis tinggi dapat menyebabkan
bakteria negatif Gram seperti Ercbericbia coli, Klebsiella, Proteus, Pseudomona.r
atau jamur.
Daerah saluran pencernaan yang mengandung mikroorganisme adalah usus besar,
meskipun kadang-kadang ditemukan pula organisme usus besar di ileum distal individu
normal. Esofagus dan lambung, kecuali saat penelanan makanan umumnya steril atau
mengandung kurang dari 103 kuman/ml. Hal itu terjadi karena gerakan makanan yang cepat
ke usus kecil serta adanya asam lambung. Usus kecil kecuali ileum distal, hati, empedu,
peritoneum merupakan daerah steril. Kadang – kadang di duodenum dada jejunum
ditemukan Streptococcus, Lactobacilus, dan yeast (terutama Candida) dalam jumlah kecil.
Kurang lebih dua puluh persen massa feses berisi bakteria (104 mikroorganisme/gr berat
basah). Mikroorganisme yang terdapat di kolon adalah Bacteroidcs, Bifidobaaeria,
Eubaaeria, LaCTobaciIIus, bakteria coffirm, Streptococcus, dan beberapa jenis yeast.
Bacteroides yangmerupakan lebih dari sembilan puluh persen flora feses adalah bakteria
anaerob obligat. Eradikasi flora normal dengan antibiotik dapat menyebabkan ooergrorotb
Clostridium dfficile yang menghasilkaN enterotoksin dan menyebabkan kolitis. Pada
neonatus flora usus terbentuk dalam 24 jam setelah lahir. Pada bayi yang disusui
Lactobacillus adalah organisme yang dominan. Bakteria lain yang ditemukan Enterococcus,

9
bakteria coliform dan Staplrylococcus. Feses bayi yang meminum susu buatan berisi
Lactobacillus Bacillus anaerob termasuk Clostridium sp. Lactobacillus lebih banyak
dijumpai pada pemberian susu formula dengan penambahan laktosa 1.2o/o. Flora saluran
pencernaan berperan dalam sintesis vitamin K, konversi pigmen empedu dan asam empedu,
absorpsi zat makanan serta antagonis mikroba patogen.
Flora Normal Traktus Genito-urinarius
Mikroorganisme dapat ditemukan di genitalia eksterna, uretra anterior dan vagina,
sedang di bagian lain umumnya tidak terdapat mikroorganisme yang menetap. Di orifisium
uretra wanita dan pria yang tidak disirkumsisi sering dijumpai Mycobacterium smegrnatis.
Dijumpai pula Streptococcus non hemolitik dan Staplrylococcus epidermidis. Khususnya
pada wanita terdapat bakteria Doderlein, suatu Lactobacillus anaerob. Flora normal pada
vulva wanita amat dipengaruhi oleh kondisi normalnya. Vulva neonatus steril sampai 24
jam kehidupan. Setelah itu berkembang organisme nonpatogen seperti difteroid,
mikrokokus dan Streptokokus nonhemolitik. Setelah 2-3 hari, estrogen ibu menginduksi
deposit glikogen diepitel vagina dan meningkat pertumbuhan Lactobacillus. Setelah
estrogen menurun, Lactobacillus menghilang dan pH menjadi basa. Pada pubertas
Lactobacillus muncul kembali dan terdapat flora yang akan menetap selama masa dewasa
yang terdiri atas difteroid, Lactobacillus, Micrococcus, Stapbylooccus Eidermidis,
Streptococcus mikroaerofilik dan anaerob, Ureaplasma dan yeast. Haemopbilus vaginalis
dan Chlantydia biasanya berhubungan dengan vaginitis simtomatis. Pada wanita hamil 15-
20% dijumpai Streptococcus. Flora pada masa post menopause menyerupai masa
prepubertas.

Flora Normal Kulit, Hidung, Telinga

Bakteri yang tersering ditemukan di kulit adalah Stapbylococcus Eidermidis,
micrococcus, Streptococcus alpba dan non hemolyticus, difteroid aerob dan anaerob dan
Sarcinae. Staphylococcus aureus hanya menetap di hidung dan mungkindi perineum.
Kolonisasi yang transien oleh Staphylococctus aureus dan bakteri lain dapat terjadi di
semua bagian kulit. Hal itu terjadi karena konraknya dengan dunia luar. Dapat dijumpai
pula beberapa jenis jamur dan kadang-kadang Propioni bacterium acnes dan
Mycobacteriwm yang bersifat saprofit. Cuci tangan dapat mengurangi jumlah kuman
sampai 90o/o danjumlah semula akan kembali dalam 8 jam.

10
 Flora liang telinga luar biasanya merupakan gambaran flora kulit. Dapat dijumpai
Streptococcus pneurnoniae, batang gram negatif termasuk Pseudomonas Staphyloococcus
aureus dan kadang-kadang fuIycobacteria saprofit. Telinga bagian tengah dan dalam
biasanya steril

Bakteria di Darah dan Jaringan

Pada keadaan normal darah dan jaringan adalah steril. Kadang-kadang karena
manipulasi sederhana seperti mengunyah, menyikat gigi, ekstraksi gigi, flora komensal dari
mulut dapat masuk ke jaringan atau darah. Dalam keadaan normal mikroorganisme tersebut
segera dimusnahkan oleh sistem kekebalan tubuh. Hal seperti itu dapat terjadi pula dengan
flora faring, saluran cerna dan saluran kemih. Pada keadaan abnormal seperti adanya katup
jantung buatan, katup jantung abnormal, atau protesa lain, bakteremia di atas dapat
mengarah pada pembentukan koloni dan infeksi.

2.5 Materi Genetika

Material genetik bakteri terdiri atas kromosom dan plasmid. Keduanya terdiri atas DNA.
Dua fungsi utama materi genetik adalah replikasi dan ekspresi. Material genetik harus
bereplikasi secara akurat sehingga dihasilkan 2 replikan (anakan) yang identik dengan
induknya. Materi genetik juga terekspresi dalam bentuk karakter terobservasi atau fenotip.

1. Kromosom
Kromosom bakteri mempunyai beratnya 2-3% dari berat kering satu sel, pada sel haploid
(prokariot) bersifat kromosom tunggal dan tidak berpasangan. Berbentuk sirkuler,
panjangnya ± 1mm, beratnya 2-3% dari berat kering satu sel, disusun sekitar 4 juta kpb
DNA, makromolekul yang sangat banyak ini dikemas agar tidak berubah dalam bentuk
superkoil (± 70-130 superkoil domain) (Syahrurachman, 1994). Kebanyakan gen prokariota
terdapat pada kromosom, yang terletak dalam suatu bagian pusat sitoplasma, yang
dinamakan daerah nuklear atau nukleoid untukn membedakannya dari membran-pengikat
nukleus pada sel eukariotik. Jumlah nukleoid dalam sel bakteri dapat lebih dari satu,
tergantung kecepatan pertumbuhan dan ukuran sel. Nukleoid berisi gen yang penting untuk
pertumbuhan bakteri.

11
2. Plasmid
Plasmid adalah material genetik ektrakromosomal. Ukuran plasmid lebih kecil daripada
kromosom. Plasmid biasanya mengkode polipeptida yang tidak penting bagi pertumbuhan
secara langsung. Plasmid berbentuk sirkuler, tetapi terdapat plasmid berbentuk linier seperti
terlihat pada Borrelia dan Streptomyces. Plasmid dibedakan menjadi 2, yaitu plasmid
konjugatif dan non-konjugatif. Plasmid konjugatif adalah plasmid yang mampu didonorkan
ke resepien, sedangkan plasmid non-konjugatif tidak dapat didonorkan. Plasmid non-
konjugatif biasanya berukuran kurang dari 7,5 kbp dan biasanya berjumlah banyak (10-20
perkromosom). Plasmid didistribusikan secara acak ke sel anakan.
Meskipun plasmid tidak berperan langsung dalam pertumbuhan, tetapi plasmid memiliki
fungsi penting secara medis. Fungsi penting plasmid secara medis, yaitu kemampuan
plasmid mengkode polipeptida resistensi antibiotik, toksin, struktur permukaan sel untuk
perlekatan dan kolonisasi. Plasmid yang berperan dalam resistensi antibiotika disebur
plasmid R atau faktor R.

STRUKTUR DNA DAN RNA

1. DNA (ASAM DEOKSIRIBONUKLEAT)
DNA/ Kromosom bakteri lebih banyak diteliti dari pada kromosom organisme lain.
DNA bakteri mampu mengkode 1000-3000 polipeptida yang berbeda-beda. DNA
bakteri merupakan molekul berantai ganda yang sirkuler. Struktur Dna bakteri tidak
merupakan bentuk sederhana tetapi merupakan belitan yang tidak teratur dalam
sitoplasma. James Watson dan Francis Crick (1953) telah menemukan struktur DNA
yang berupa dua untai pita DNA terpilin. Penemuan ini merupakan titik awal revolusi
biologi karena merupakan penemuan struktur DNA ini sangat penting untuk
mempelajari dan memahami bagaimana informasi genetik dapat dipindahkan dari satu
generasi ke generasi berikutnya serta bagaimana DNA dapat mengendalikan
replikasinya.
Replikasi informasi herediter di dalam sel melibatkan sintesis molekul DNA baru yang
mempunyai urutan nukleotida sama seperti genom sel inangnya. Molekul DNA adalah
makromolekul yang mempunyai informasi herediter suatu sel. DNA ini tersusun oleh
sub unit-sub unit yang disebut dengan nukleotida atau deoksiribonukleotida. Urutan
nukleotida menentukan kespesifikan suatu informasi herediter dan berisi mekanisme
untuk mengendalikan eksperi genetik.

12
 Masing-masing deoksiribonukleotida terdiri dari basa nitrogen (asam nukleat), gula
deoksiribosa, dan gugus fosfat. Basa asam nukleat terdiri dari basa purin terdiri : Adenin
(A) dan guanin (G) yang mempunyai dua cincin. Dan pirimidin terdiri atas : timin (T)
dan sitosin (C) yang hanya mempunyai satu cincin. Purin dan pirimidin merupakan
molekul heterosiklis karena mengandung dua macam atom C dan N. Basa asam nukleat
menempel pada deoksiribosa membentuk deoksiribonukleosida. Deoksiribonukleosida
ini bergabung dengna gugus fosfat pada atom C5 membentuk subunit
deoksiribonukleotida DNA.
2. RNA (ASAM RIBONUKLEAT)
Asam nukleat lainnya yang dijumpai secara alamiah ialah asam ribonukleat
(RNA). Bedaanya dari DNA ialah :
o Biasanya berutasan tunggal
o Komponen gula pada nukloetida yang membentuk RNA adalah ribosa, dan
bukan deoksiribose. Ribose adalah sama dengan deoksiribose kecuali adanya
gugusan hidroksil pada atom karbon nomor 2
o Basa bernitrogen pirimidin yang dijumpai pada nukleotida yang membentuk
RNA ialah urasil bukan timin.

REPLIKASI DNA
Replikasi DNA berarti penggandaan. Ada 3 model replikasi DNA yaitu :
1. Model konservatif.
Model ini menyatakan bahwa 2 rantai DNA bereplikasi tanpa memisahkan rantai-
rantainya.
2. Model semi konservatif.
Model ini menyatakan bahwa 2 rantai DNA berpisah kemudian bereplikasi.
3. Model dispersi.
Model ini menyatakan bahwa DNA terpecah menjadi potongan-potongan yang
kemudian bereplikasi.
Meselson dan Stahl membuktikan bahwa DNA bereplikasi sesuai model semi-
konservatif.Replikasi model semi konservatif dimulai pada suatu situs tertentu yang sudah
pasti pada kromosom bakteri yang disebut titik pangkal kedua utas DNA memisah pada
situs ini membentuk struktur berbentuk Y. Titik persimpangannya disebut titik
tumbuh.Replikasi bergerak berurutan dari titik tumbuh, baik pada satu arah atau dua

13
arah.Titik asal dan titik tumbuh terikat pada membran sel dan situlah kedua utusan tersebut
diduplikasikan.Masing-masing utasan mempunyai urutan basa yang komplementer
terhadap urutan basa pada utasan-utasan DNA yang mula-mula (Pelczar, 2009).
Enzim DNA polymerase nemanbahkan nukleotida pada ujung hidroksil-3' utasan atau
utasan–utasan DNA yang sedang berreplikasi, jadi mensintenis utasan-utasan DNA dengan
arah 5' ke 3'.Sejauh ini belum ditemukan polymerase yang mereplikasi dengan arah 3' ke
5'.Sintesis DNA bersifat sinambung.Selain mekanisme replikasi DNA yang baru saja
diuraikan, inisiasi (pengawwalan) replikasi DNA membutuhkan suatu pancing atau pemula
yaitu sepotong pendek RNA yang disentesis oleh RNA polymerase dan komplementer
terhadap DNA.Dengan adanya pemula ini, DNA polymerase dapat mulai mensisntesis
duoksiribonukleotida.Sekali pancingan mengena, DNA polymerase lalu mencerna RNA
tersebut dapat menggantikannya dengan DNA. Berpartisipasinya RNA sebagai pancing
tampaknya ekstensif karena setiap fragmen okazaki juga mengandung sebagian RNA
sebagai pancing (Micheal Pelczar, 2009).
Bila titik-titik tumbuh telah bergerak di seluruh panjang molekul DNA, maka terbentuk
dua molekul DNA yang lengkap.Setiap molekul berutasan ganda mengandung salah satu
dari utasan asli atau satu utasan baru(Micheal Pelczar, 2009).

EKSPRESI GEN
Transkripsi
Transkripsi adalah langkah pertama dalam ekspresi genetis.DNA ditranskripsi menjadi
RNA. Pita DNA yang menjadi cetakan disebut DNA template. Karena RNA hasil
transkripsi membawa “pesan” untuk ditranslasi, maka RNA tersebut disebut RNA
messenger (mRNA). Urutan basa mRNA sama dengan urutan basa DNA non-template,
kecuali timin diganti urasil. Enzim yang berperan dalam sintesis mRNA adalah enzim RNA
polimerase. Urutan DNA yang ditranskrip dapat terdiri atas 1 gen atau lebih. Transkripsi
yang multigen terjadi pada gen-gen yang terekspresi dalam suatu paket fungsional.
Transkripsi DNA terdiri atas 3 tahap, yaitu inisiasi, pemanjangan, dan penghentian. Inisiasi
melibatkan pengikatan RNA polimerase ke DNA template. Elongasi adalah proses sintesis
mRNA oleh RNA polimerase. Penghentian meliputi penghentian pemanjangan dan
pelepasan mRNA dari DNA template.

14
 Translasi
Translasi, yaitu langkah berikut nya didalam ekspresi gan adalah proses pengarahan
sintensis protein oleh informasi genetis yang sekarang ada pad molekul mRNA.
Bila keempat basa yang berbeda-beda pada nukleotida-nukleodtida mRNA itu ditata dalam
suatu deretan, maka setiap deret yang terdiri dari 3 basa disebut kodon, mampu
menetapakan suatu amino tertentu. Karena ada empat macam basa yang berbeda-beda,
jumlah deret berbasa tiga tersebut yang mungkin terbentuk adalah 43, atau 64 macam.
Triplet-triplet basa ini masing-masing menetapkan suatu asam amino tertentu, merupakan
sandi genetis.Sandi ini mungkin bersifat universal bagi semua spesies organisme hidup.

MUTASI
Mutasi adalah perubahan spontan pada gen suatu makhluk hidup/bakteri. Sebagai contoh
yang sederhana adalah adanya koloni bakteri Serratia marcescens yang berwarna putih
diantara koloni yang berwarna merah. Jika koloni putih tersebut diisolasi dan kemudian
diteliti sifat-sifatnya serta dibandingkan dengan bakteri dari koloni merah, maka sifat-sifat
selain pigmentasinya sama. Bakteri dari koloni putih tersebut dikatakan mutan kadang-
kadang mutan putih tersebut dapat kembali menjadi merah. Peristiwa ini dinamakan mutasi
balik
Perubahan-perubahan karena mutasi dapat dibedakan dengan modifikasi (perubahan
tidak menurun) yang disebabkan karena faktor lingkungan. Dalam hal modifikasi semua sel
akan mengalami perubahan fenotif, sedangkan pada mutasi hanya sebgian kecil dari
populasi. Ada dua macam mutasi yaitu mutasi selektif dan mutasi tidak selektif Mutasi
selektif ialah mutasi yang menguntungkan bagi kelangsungan hidup bakteri tersebut.
Mutasi ini terjadi pada keadaan lingkungan tertentu misalnya adanya antibiotika.Mutan
tersebut dapat tumbuh dengan adanya antibiotika dalam dosis tertentu yang dapat
menghambat dan membunuh sel induknya.Mutasi ini dinamakan juga mutasi buatan.Mutasi
tidak selektif ialah mutasi yang tidak mempunyai sifat yang lebih menguntungkan atau
merugikan dibandingkan dengan pertumbuhan sel induknya.Mutasi ini disebut juga mutasi
alami, tanpa campur tangan manusia.
Mekanisme terjadinya mutasi (mutagenesis).Sel yang mengalami mutasi (mutan)
mengalami perubahan urutan nukleotida dari DNA nya.Bagian DNA yang mengalami
perubahan tersebut dinamakan muton. Perubahan ini akan mempengaruhi sebagian dari

15
aktivitas sel, misalnya susunan asam amino dari polipeptida/ protein. Ditinjau dari
perubahan nukleotida atau basa DNA maka dapat dikenal macam-macam perubahannya,
yaitu mutasi titik. Pertukaran, pengurangan, pengisian, pembalikan
Mutasi titik adalah mutasi yang disebabkan perubahan-perubahan atau pengurangan satu
basa DNA saja.Misalnya adenin diganti dengan guanin atau timin diganti dengan
sitosis.Pengaruh dari perubahan tersebut tergantung dari letak basa DNA pada gen.
Perubahan tersebut dapat tidak dipengaruhi produksi protein atau mempengaruhi urutan
asam amino dari protein atau tidak menghasilkan protein tertentu. Jika perubahan basa DNA
tidak mempengaruhi produksi protein atau gejala fenotif lain maka mutasi inya dinamakan
mutasi bisu. Mutasi ini kemungkinan karena perubahan kodon yang terjadi tetap mengkode
asam amino yang samaProses pertukaran, pengurangan, penambahan dan pembalikan dapat
berlangsung secara sederhana artinya meliputi satu atau beberapa basa DNA saja atau
mencakup beratu-ratus DNA.Mutagenesis dapat terjadi karena adanya senyawa mutagen,
sinat ultra violet, cat akredin dan sebagianya.Ada beberapa macam mekanisme mutasi
yaitu:
1. Mutasi Spontan
Mutasi spontan dapt terjadi setiap 108-109 pasangan DNA dan diperoleh satu
mutan. Mutasi ini disebabkan karena terjadi kerusakan fisik pada DNA, terjadi
perpindahan posisi DNA , kesalahan oleh enzim pada waktu terjadi replikasi.
Sehingga urutan DNA, maupum pasangan basa berubah atau berbeda bentuk yaitu
dari bentuk amino menjadi imine, yang disebut tautomer.
2. Mutagenesis dengan basa analog
Basa analog adalah senyawa yang mirip dengan basa pada DNA, tetapi
susunannya berdeda.
3. Mutagenesisi kimia
Senyawa mutagen adalah agenesia yang mampu meningkatkan frekuensi
mutasi.Karena senyawa mutagen bereaksi dengan satu basa atau lebih basa
DNA.Senyawa mutagen dapat berupa asam nitrit, hidroksilamin, etil, sulfonat, dan
lain-lain.
4. Mutagenesisi karena perubahan pola pembacaan (reading frame shiff)
Akredin merupakan cat yang dapat menyebabkan terjadinya mutasi karena
senyawa akredin mempunyai bentuk sama dengan basa DNA, sehingga molekul ini

16
 dapat disisipkan diantara dua pasangan basa DNA dan menghilangkan sebagian basa,
lalu akan terjadi pola pembacaan.
5. Mutagenesis karena radiasi
Mikrobia bila ditumbuhkan dalam kondisi alam dan terkena sinar ultra violet
dapat menyebabkan perubahan DNA, sehingga menimbulkan mutasi

17
 BAB III

PENUTUP

1.1 Kesimpulan
Ekologi dan genetika mikroorganisme dipengaruhi beberapa faktor. Untuk ekologi
sendiri faktor yang mempengaruhi berkembang biaknya mikroorganisme tersebut
tergantung dari kondisi lingkungan seperti suhu, keadaan tanah, kelembaban dsb. Serta
hubungan dari mikroorganisme ini juga berperan pada beberapa bagian didalam tubuh
manusia seperti mulut, paru paru, usus dsb. Untuk genetika mikroorganisme sendiri
dipengaruhi dari DNA dan RNA, serta Ekspresi Gen.

18
 DAFTAR PUSTAKA
Staf pengajar Mikrobiologi Fakultas Kedokteran. Buku ajar Mikrobiolgi Kedokteran.
Universitas Indonesia: Jakarta
Pelczar, Michael dan Chan. 2010. Dasar - dasar Mikrobiologi. Jakarta: UI Press.
Suharni, Tri Theresia, dkk. 2008. Mikrobiologi Umum. Yogyakarta: Universitas Atma Jaya
Syahrurachman, Agus. 1994. Mikrobiologi kedokteran ed.revisi. Jakarta: Bina Rupa Aksara
http://cahscient.files.wordpress.com/2008/08/textbook-mikrobiologi8.doc
https://id.wikipedia.org/wiki/Ekologi
http://kesehatanlingkungansby.blogspot.com/2010/12/ekologi-mikroba-referensi-
tugas.html
https://id.wikipedia.org/wiki/Mikroorganisme

19