BAB II

1.1 Pengantar Mikrobiologi dan Parasitologi

1.2 Pengertian Bakteri

Bakteri, dari kata Latin bacterium (jamak, bacteria), adalah kelompok raksasa dari
organisme hidup. Mereka sangatlah kecil (mikroskopik) dan kebanyakan uniselular
(bersel tunggal), dengan struktur sel yang relatif sederhana tanpa nukleus/inti sel,
cytoskeleton, dan organel lain seperti mitokondria dan kloroplas.
Struktur sel mereka dijelaskan lebih lanjut dalam artikel mengenai prokariota, karena
bakteri merupakan prokariota, untuk membedakan mereka dengan organisme yang
memiliki sel lebih kompleks, disebut eukariota. Istilah "bakteri" telah diterapkan untuk
semua prokariota atau untuk kelompok besar mereka, tergantung pada gagasan mengenai
hubungan mereka.Bakteri adalah yang paling berkelimpahan dari semua organisme.
Mereka tersebar (berada di mana-mana) di tanah, air, dan sebagai simbiosis dari
organisme lain. Banyak patogen merupakan bakteri. Kebanyakan dari mereka kecil,
biasanya hanya berukuran 0,5-5 μm, meski ada jenis dapat menjangkau 0,3 mm dalam
diameter (Thiomargarita). Mereka umumnya memiliki dinding sel, seperti sel hewan dan
jamur, tetapi dengan komposisi sangat berbeda (peptidoglikan). Banyak yang bergerak
menggunakan flagela, yang berbeda dalam strukturnya dari flagela kelompok lain.

1.3 Klasifikasi Bakteri

Bakteri pertama ditemukan oleh Anthony van Leeuwenhoek pada 1674 dengan menggunakan
mikroskop buatannya sendiri. Istilah bacterium diperkenalkan di kemudian hari oleh
Ehrenberg pada tahun 1828, diambil dari kata Yunani βακτηριον yang memiliki arti "small
stick".
Seperti prokariota (organisme yang tidak memiliki selaput inti) pada umumnya, semua
bakteri memiliki struktur sel yang relatif sederhana. Struktur bakteri yang paling penting
adalah dinding sel. Bakteri dapat digolongkan menjadi dua kelompok yaitu Gram positif dan
Gram negatif didasarkan pada perbedaan struktur dinging sel. Bakteri Gram positif memiliki
dinding sel yang terdiri atas lapisan peptidoglikan yang tebal dan asam teichoic. Sementara
bakteri Gram negatif memiliki lapisan luar, lipopolisakarida - terdiri atas membran dan
lapisan peptidoglikan yang tipis terletak pada periplasma (di antara lapisan luar dan membran
sitoplasmik).
Banyak bakteri memiliki struktur di luar sel lainnya seperti flagela dan fimbria yang
digunakan untuk bergerak, melekat dan konjugasi. Beberapa bakteri juga memiliki kapsul
atau lapisan lendir yang membantu pelekatan bakteri pada suatu permukaan dan biofilm
formation. Bakteri juga memiliki kromosom, ribosom dan beberapa spesies lainnya memiliki
granula makanan, vakuola gas dan magnetosom.Beberapa bakteri mampu membentuk
endospora yang membuat mereka mampu bertahan hidup pada lingkungan ekstrim.
D. Struktur dan Morfologi/bentuk bakteri
A. Struktur Bakteri

1. Kapsul

Kapsul adalah lapisan polisakarida yang terletak di luar selubung sel Bakteri, dan dengan demikian
dianggap bagian dari selubung luar sel Bakteri. Ini adalah lapisan yang tersusun dengan baik, tidak
mudah dihilangkan, dan dapat menjadi penyebab berbagai penyakit. Kapsul dianggap sebagai faktor
virulensi Bakteri karena meningkatkan kemampuan Bakteri untuk menyebabkan penyakit (misalnya
mencegah fagositosis). Kapsul dapat melindungi Bakteri agar tidak ditelan oleh sel eukariotik, seperti
makrofage, sehingga sebuah antibodi yang khusus pada kapsul tertentu mungkin diperlukan agar
fagositosis dapat terjadi. Kapsul juga mengandung air yang melindungi Bakteri terhadap pengeringan
dan membantu Bakteri menempel pada permukaan.

2. Dinding Sel

Selubung sel Bakteri terdiri dari membran plasma dan dinding sel. Seperti pada organisme lain,
dinding sel Bakteri memberikan integritas struktural pada sel. Pada organisme Prokariota, fungsi
utama dari dinding sel adalah untuk melindungi sel dari tekanan turgor internal yang disebabkan
oleh konsentrasi protein dan molekul lain yang lebih tinggi di dalam sel dibandingkan dengan
lingkungan eksternalnya. Dinding sel Bakteri berbeda dari semua organisme lain karena adanya
peptidoglikan, yang terbuat dari polisakarida dan residu N-Acetylmuramic acid (NAM) and N-
acetylglucosamine (NAG) dalam jumlah yang sama.

Berdasarkan struktur dinding selnya, ada Bakteri yang dapat diwarnai dengan pewarnaan Gram,
yang digolongkan menjadi Bakteri Gram positif, dan Bakteri Gram negatif. Bakteri Gram positif akan
menghasilkan noda berwarna ungu, [4] sedangkan Bakteri Gram negatif akan menghasilkan noda
berwarna merah muda.

3. Membran Plasma

Membran plasma atau membran sitoplasma terdiri dari fosfolipid bilayer, bersifat selektif
permeabel, dan memiliki semua fungsi umum dari membran sel seperti mengatur zat-zat ke luar dan
ke dalam sel. [6]

4. Flagela

Mungkin struktur ekstraseluler sel Bakteri yang paling mudah dikenali adalah flagela. Flagela adalah
struktur seperti cambuk yang menonjol dari dinding sel Bakteri dan bertanggung jawab untuk
motilitas (gerakan) Bakteri. Susunan flagela adalah unik untuk tiap spesies yang diamati. Ada 4
golongan Bakteri berdasarkan jumlah dan kedudukan flagela, yaitu:

Monotrik – Satu flagela yang melekat pada salah satu ujung sel (Gb. A)

Lofotrik – Banyak flagela yang melekat pada salah satu ujung sel (Gb. B)

Amfitrik – Satu flagela yang melekat pada kedua ujung sel (Gb. C)

Peritrik – Banyak flagela yang tersebar di beberapa lokasi permukaan sel (Gb. D)

*Atrik – tidak memiliki flagela (golongan ini kadang tidak disertakan)

5. DNA dan Plasmid

Tidak seperti Eukariota, DNA Bakteri tidak tertutup dalam inti sel, melainkan berada di dalam
sitoplasma bakteri. Ini berarti bahwa transfer informasi seluler melalui proses translasi, transkripsi,
dan replikasi DNA semua terjadi dalam ruang yang sama dan dapat berinteraksi dengan struktur
sitoplasma lainnya, terutama ribosom. Selain DNA kromosom, kebanyakan Bakteri juga mengandung
potongan independen kecil dari DNA yang disebut plasmid, yang mengkodekan sifat-sifat yang
menguntungkan, tetapi tidak esensial untuk inangnya. Plasmid dapat dengan mudah diperoleh oleh
Bakteri atau hilang, dan dapat dikirim antar Bakteri sebagai bentuk transfer gen horizontal. Jadi
plasmid dapat digambarkan sebagai DNA kromosom ekstra di dalam sel bakteri.

6. Ribosom

Ribosom tersusun atas protein dan rRNA (ribosomal ribonucleic acid) yang sangat penting untuk
sintesis protein. Dari bobotnya ribosom tersusun atas 60% rRNA and 40% protein. [8]

7. Membran Intraseluler

Meskipun tidak khas pada semua Bakteri, beberapa Bakteri mengandung membran intraseluler
selain (atau sebagai ekstensi dari) membran sitoplasma mereka. Ide awal adalah bahwa Bakteri
mungkin memiliki lipatan membran yang disebut dengan mesosom, meskipun beberapa fungsi
diusulkan untuk struktur ini pada tahun 1960, seperti pusat pembentukan energi dan pembentukan
dinding sel baru, mesosom kemudian dikenali sebagai artefak (sesuatu yang diamati dalam
penyelidikan ilmiah atau percobaan yang tidak terdapat secara alami, tetapi terjadi sebagai akibat
dari prosedur dalam mempersiapkan atau menginvestigasi) pada akhir 1970-an. Mesosom kemudian
tidak lagi dianggap sebagai bagian dari struktur normal sel Bakteri. [9] Contoh lain, kromatofora,
adalah membran intraseluler yang ditemukan pada Bakteri fototrof, yang digunakan terutama untuk
fotosintesis. Kromatofora mengandung pigmen bakterioklorofil dan karotenoid. [6]

8. Endospora

Mungkin bentuk terbaik adaptasi Bakteri pada lingkungan buruk adalah pembentukan endospora.
Endospora adalah struktur pertahanan hidup Bakteri yang sangat tahan terhadap berbagai bentuk
tekanan kimia dan lingkungan. Endospora memungkinkan kelangsungan hidup Bakteri pada
lingkungan yang akan mematikan bagi organisme ini dalam bentuk vegetatif normal mereka. Telah
diusulkan bahwa pembentukan endospora telah memungkinkan kelangsungan hidup beberapa
Bakteri selama ratusan juta tahun (misalnya dalam kristal garam) walaupun publikasi ini masih
dipertanyakan.

Pembentukan endospora terbatas pada beberapa genus Bakteri Gram positif seperti Bacillus dan
Clostridium. Lokasi yang endospora dalam sel adalah spesifik pada spesies dan dapat digunakan
untuk menentukan identitas Bakteri. Arkeolog telah menemukan endospora yang diambil dari usus
mumi Mesir dan juga dari sedimen yang berusia lebih dari tujuh ribu tahun yang diambil dari
Minnesota Elk Lake.

H. Bentuk Bakteri
Bentuk dasar bakteri terdiri atas bentuk bulat (kokus), batang (basil),dan spiral (spirilia) serta
terdapat bentuk antara kokus dan basil yang disebut kokobasil.
Berbagai macam bentuk bakteri :

1. Bakteri Kokus :

a.    Monokokus yaitu berupa sel bakteri kokus tunggal.

b.    Diplokokus yaitu dua sel bakteri kokus berdempetan.
c.    Tetrakokus yaitu empat sel bakteri kokus berdempetan berbentuk segi empat.
d.    Sarkina yaitu delapan sel bakteri kokus berdempetan membentuk kubus
e.    Streptokokus yaitu lebih dari empat sel bakteri kokus berdempetan membentuk rantai.
f.    Stapilokokus yaitu lebih dari empat sel bakteri kokus berdempetan seperti buah anggur
2. Bakteri Basil :

a.    Monobasil yaitu berupa sel bakteri basil tunggal

b.    Diplobasil yaitu berupa dua sel bakteri basil berdempetan
c.    Streptobasil yaitu beberapa sel bakteri basil berdempetan membentuk rantai
3. Bakteri Spirilia :

c.    Spiral yaitu bentuk sel bergelombang

c.    Spiroseta yaitu bentuk sel seperti sekrup
c.    Vibrio yaitu bentuk sel seperti tanda baca koma.
1.4 Karakteristik Bateri
Karakteristik bakteri :

Bersel Tunggal

Mungkin ciri paling sederhana dari bakteri adalah keberadaan mereka sebagai organisme
bersel tunggal. Sementara sebagian besar bakteri, archaeans dan Eubacteria sama,
menghabiskan seluruh siklus hidup mikroskopis mereka sebagai sel tunggal independen,
beberapa seperti dalam tanah myxobacteria akan membentuk tubuh berbuah multiseluler
sebagai bagian dari siklus hidup mereka.

Tidak Ada Organel

Sel eukariotik, seperti tanaman, hewan dan jamur, memiliki inti yang terikat membran yang
compartmentalizes DNA sel dari sisa sel. Fungsi lain di dalam sel-sel ini juga diserap ke
membran-terikat organel khusus, seperti mitokondria untuk respirasi sel dan kloroplas untuk
fotosintesis. Bakteri  tidak memiliki nukleus dan organel kompleks dalam sel mereka. Ini
bukan untuk mengatakan bahwa bakteri tidak memiliki organisasi internal, DNA mereka
sering diasingkan ke wilayah sel bakteri yang dikenal sebagai nucleoid tersebut. Namun,
penting untuk dicatat bahwa nucleoid tersebut tidak secara fisik dipisahkan dari seluruh sel
dengan membran.
Plasma Membran
Meskipun membran plasma yang umum di seluruh sel hidup lainnya, membran ini bukan
fitur bakteri. Tidak adanya organel internal yang pada akhirnya menurunkan banyak fungsi
yang terjadi dalam sel-sel eukariotik terjadi pada membran plasma bakteri. Misalnya,
infoldings khusus dari membran plasma memungkinkan bakteri fotosintetik untuk melakukan
reaksi tergantung cahaya fotosintesis sehingga fotosintesis eukariota dilakukan pada selaput
thykaloid dalam kloroplas.

Dinding Sel

Sebuah dinding sel peptidoglikan adalah fitur umum di antara Eubacteria. Dinding sel ini
menyelubungi sel bakteri, memberikan kekuatan dan mencegah pecah di lingkungan yang
berubah. Salah satu pengujian yang mendasar dilakukan dalam mengidentifikasi bakteri
adalah pewarnaan Gram, yang mengkategorikan sebagai Eubacteria Gram positif atau Gram
negatif didasarkan pada kemampuan dinding sel untuk mempertahankan kristal violet
pewarna. Dinding sel merupakan target antibiotik pen isilin dan turunannya. Penisilin
menghambat pembentukan dinding sel dan dapat menghancurkan dinding, terutama di cepat
tumbuh dan berkembang biak bakteri. Sekali lagi menggarisbawahi keragaman dalam
kelompok ini, tidak semua Eubacteria memiliki dinding sel peptidoglikan. Dinding sel
klamidia tidak memiliki peptidoglikan. Kurangnya Mycoplasma setiap dinding sel.
Archaeans juga memiliki dinding sel tetapi menggunakan bahan selain peptidoglikan.
DNA

Beberapa, kromosom linier sering diwakili grafis dalam buku teks biologi yang khusus untuk
eukariota. Sebaliknya, baik archaeans dan Eubacteria memiliki kromosom tunggal melingkar
dan sebuah urutan DNA jauh lebih pendek daripada yang ditemukan pada eukariota. Semakin
pendek urutan DNA mungkin sebagian dapat dijelaskan oleh relatif berkurang kompleksitas
sel bakteri tetapi juga hasil dari berkurangnya keberadaan intron – segmen gen yang
dikeluarkan selama terjemahan DNA menjadi protein. Genom bakteri ditambah dengan
fragmen kecil dari DNA yang dikenal sebagai plasmid, meskipun ini tidak unik untuk bakteri
dan juga dapat ditemukan pada eukariota. Plasmid yang direplikasi dalam sel bakteri
independen dari kromosom bakteri dan dapat dipertukarkan antara organisme bakteri yang
berbeda. Plasmid mungkin memberikan atribut ke sel inang seperti resistensi antibiotik.

1.5 Perkembangbiakan dan Perkembangan bakteri:

Bakteri umumnya melakukan reproduksi atau berkembang biak secara aseksual (vegetatif =
tak kawin) dengan membelah diri. Pembelahan sel pada bakteri adalah pembelahan biner
yaitu setiap sel membelah menjadi dua. Reproduksi bakteri secara seksual yaitu dengan
pertukaran materi genetik dengan bakteri lainnya. Pertukaran materi genetik disebut
rekombinasi genetik atau rekombinasi DNA.
Rekombinasi genetik dapat dilakukan dengan tiga cara yaitu:
a.    Transformasi adalah pemindahan sedikit materi genetik, bahkan satu gen saja dari satu
sel bakteri ke sel bakteri yang lainnya.
b.    Transduksi adalah pemindahan materi genetik satu sel bakteri ke sel bakteri lainnnya
dengan perantaraan organisme yang lain yaitu bakteriofage (virus bakteri).

c.    Konjugasi adalah pemindahan materi genetik berupa plasmid secara langsung melalui
kontak sel dengan membentuk struktur seperti jembatan diantara dua sel bakteri yang
berdekatan. Umumnya terjadi pada bakteri gram negatif.

I. Pengaruh lingkungan terhadap bakteri

Kondisi lingkungan yang mendukung dapat memacu pertumbuhan dan reproduksi bakteri.
Faktor-faktor lingkungan yang berpengaruh terhadap pertumbuhan dan reproduksi bakteri
adalah suhu, kelembapan, dan cahaya.
I.1.  Suhu
Berdasarkan kisaran suhu aktivitasnya, bakteri dibagi menjadi 3 golongan:
1.    Bakteri psikrofil, yaitu bakteri yang hidup pada daerah suhu antara 0°– 30°C, dengan
suhu optimum 15°C.
2.    Bakteri mesofil, yaitu bakteri yang hidup di daerah suhu antara 15° – 55°C, dengan suhu
optimum 25° – 40°C.
3.    Bakteri termofil, yaitu bakteri yang dapat hidup di daerah suhu tinggi antara 40° – 75°C,
dengan suhu optimum 25° – 40°C
Pada tahun 1967 di Yellow Stone Park ditemukan bakteri yang hidup dalam sumber air panas
bersuhu 93° – 94°C.
I.2.  Kelembapan
Pada umumnya bakteri memerlukan kelembapan yang cukup tinggi, kira-kira 85%.
Pengurangan kadar air dari protoplasma menyebabkan kegiatan metabolisme terhenti,
misalnya pada proses pembekuan dan pengeringan.
I.3. Cahaya
Cahaya sangat berpengaruh pada proses pertumbuhan bakteri. Umumnya cahaya merusak sel
mikroorganisme yang tidak berklorofil. Sinar ultraviolet dapat menyebabkan terjadinya
ionisasi komponen sel yang berakibat menghambat pertumbuhan atau menyebabkan
kematian. Pengaruh cahaya terhadap bakteri dapat digunakan sebagai dasar sterilisasi atau
pengawetan bahan makanan.
Jika keadaan lingkungan tidak menguntungkan seperti suhu tinggi, kekeringan atau zat-zat
kimia tertentu, beberapa spesies dari Bacillus yang aerob dan beberapa spesies dari
Clostridium yang anaerob dapat mempertahankan diri dengan spora. Spora tersebut dibentuk
dalam sel yang disebut endospora. Endospora dibentuk oleh penggumpalan protoplasma yang
sedikit sekali mengandung air. Oleh karena itu endospora lebih tahan terhadap keadaan
lingkungan yang tidak menguntungkan dibandingkan dengan bakteri aktif. Apabila keadaan
lingkungan membaik kembali, endospora dapat tumbuh menjadi satu sel bakteri biasa. Letak
endospora di tengah-tengah sel bakteri atau pada salah satu ujungnya.
1.6 Penyakit yang disebabkan oleh Bakteri

enyakit Berbahaya yang Disebabkan Infeksi Bakteri

Semua penyakit yang disebabkan oleh bakteri umumnya perlu mendapat
pemeriksaan yang saksama dan penanganan yang tepat dari dokter. Berikut ini
beberapa penyakit yang disebabkan oleh bakteri yang tergolong berbahaya:

 Sepsis

Sepsis adalah komplikasi berat dari infeksi. Pada kondisi ini, bakteri penyebab
infeksi sudah menyebar di aliran darah, sehingga tubuh melepaskan zat antibodi
untuk melawannya. Namun, hal tersebut dapat merusak organ-organ tubuh. Jika
sampai terjadi gangguan fungsi organ atau syok septik, keadaan ini dapat
menimbulkan kematian.
Sepsis bisa terjadi pada siapa saja, namun kondisi ini lebih berisiko terjadi pada
bayi, orang lanjut usia (lansia), dan orang dengan kelemahan sistem kekebalan
tubuh. Sepsis dapat diobati dengan pemberian antibiotik suntikan, obat-obatan untuk
meningkatkan tekanan darah apabila terjadi syok septik, cairan yang cukup,
dan oksigen jika diperlukan. Pada kondisi yang kritis, mungkin akan dilakukan
pemasangan ventilator untuk membantu pernapasan. Penanganan sepsis perlu
disertai pemantauan ketat oleh dokter di rumah sakit.

 Meningitis

Meningitis adalah infeksi pada selaput pelindung otak dan saraf tulang belakang.
Meningitis yang disebabkan bakteri berpotensi merusak otak dan menyebabkan
kematian, sementara yang disebabkan virus umumnya lebih ringan. Meningitis
biasanya terjadi karena adanya infeksi di bagian tubuh lain, seperti telinga, rongga
sinus, atau tenggorokan, yang menyebar ke otak.

 Pielonefritis akut

Pielonefritis akut adalah infeksi ginjal yang terjadi secara mendadak dan kondisinya
parah. Pielonefritis akut yang tidak ditangani dengan baik akan sangat berbahaya
dan dapat mengancam jiwa jika ginjal menjadi bengkak dan rusak secara permanen.
Selain itu, ada juga pielonefritis kronis, yaitu infeksi ginjal yang terjadi secara
berulang, namun lebih jarang terjadi.
Umumnya pielonefritis berawal dari infeksi saluran kemih (ISK). Jika terjadi masalah
pada aliran urine, bakteri bisa masuk ke tubuh melalui saluran kemih, berkembang
biak di kandung kemih, kemudian menyebar hingga ke ginjal.

 Tuberkulosis

Penyakit tuberkulosis atau TB disebabkan oleh bakteri yang utamanya menyerang

paru-paru, namun juga bisa menyerang organ lain seperti tulang, otak, ginjal, dan
kulit. TB adalah penyakit menular dan berpotensi mengancam nyawa.
Penularannya terjadi melalui percikan air liur dari penderita TB saat batuk yang
terhirup orang lain. Penyakit ini bisa disembuhkan, asalkan pasien
menjalani pengobatan TB dengan benar, yaitu minum obat antituberkulosis (OAT)
selama minimal 6 bulan tanpa putus obat. Tujuannya adalah untuk mengobati TB,
mencegah penularan dan kekambuhan TB, serta mencegah terjadinya TB MDR.
  Leptospirosis

Leptospirosis adalah penyakit yang disebabkan oleh bakteri Leptospira, yang dapat

menyerang manusia dan hewan. Cara penularan bakteri ini adalah melalui air atau
tanah yang mungkin terkontaminasi oleh urine hewan yang terinfeksi oleh bakteri
tersebut. Leptospirosis yang tidak diobati dengan tuntas dapat menyebabkan
penyakit berat, seperti meningitis, gagal hati, kerusakan ginjal, serta gagal napas,
hingga kematian.
Tingginya kasus penyakit yang disebabkan oleh bakteri berkaitan erat dengan
sanitasi dan kebersihan lingkungan yang buruk. Karena itu, untuk membantu
mencegah penyakit infeksi, khususnya penyakit yang disebabkan oleh bakteri,
penting untuk membiasakan cuci tangan, menjaga kebersihan lingkungan, menjalani
pola hidup sehat, dan mendapat vaksinasi.

1.7 Peranan Bakteri

Bakteri menguntungkan :
1. Bakteri pengurai
Bakteri saprofit menguraikan tumbuhan atau hewan yang mati, serta sisa-sisa atau kotoran
organisme. Bakteri tersebut menguraikan protein, karbohidrat dan senyawa organik lain
menjadi CO2, gas amoniak, dan senyawa-senyawa lain yang lebih sederhana. Oleh karena itu
keberadaan bakteri ini sangat berperan dalam mineralisasi di alam dan dengan cara ini bakteri
membersihkan dunia dari sampah-sampah organik.
2. Bakteri nitrifikasi
Bakteri nitrifikasi adalah bakteri-bakteri tertentu yang mampu menyusun senyawa nitrat dari
amoniak yang berlangsung secara aerob di dalam tanah. Nitrifikasi terdiri atas dua tahap
yaitu:
Oksidasi amoniak menjadi nitrit oleh bakteri nitrit. Proses ini dinamakan nitritasi.

Oksidasi senyawa nitrit menjadi nitrat oleh bakteri nitrat. Prosesnya dinamakan nitratasi.

Dalam bidang pertanian, nitrifikasi sangat menguntungkan karena menghasilkan senyawa

yang diperlukan oleh tanaman yaitu nitrat. Tetapi sebaliknya di dalam air yang disediakan
untuk sumber air minum, nitrat yang berlebihan tidak baik karena akan menyebabkan
pertumbuhan ganggang di permukaan air menjadi berlimpah.
3. Bakteri nitrogen
Bakteri nitrogen adalah bakteri yang mampu mengikat nitrogen bebas dari udara dan
mengubahnya menjadi suatu senyawa yang dapat diserap oleh tumbuhan. Karena
kemampuannya mengikat nitrogen di udara, bakteri-bakteri tersebut berpengaruh terhadap
nilai ekonomi tanah pertanian. Kelompok bakteri ini ada yang hidup bebas maupun simbiosis.
Bakteri nitrogen yang hidup bebas yaitu Azotobacter chroococcum, Clostridium
pasteurianum, dan Rhodospirillum rubrum. Bakteri nitrogen yang hidup bersimbiosis dengan
tanaman polong-polongan yaitu Rhizobium leguminosarum, yang hidup dalam akar
membentuk nodul atau bintil-bintil akar. Tumbuhan yang bersimbiosis dengan Rhizobium
banyak digunakan sebagai pupuk hijau seperti Crotalaria, Tephrosia, dan Indigofera. Akar
tanaman polong-polongan tersebut menyediakan karbohidrat dan senyawa lain bagi bakteri
melalui kemampuannya mengikat nitrogen bagi akar. Jika bakteri dipisahkan dari inangnya
(akar), maka tidak dapat mengikat nitrogen sama sekali atau hanya dapat mengikat nitrogen
sedikit sekali. Bintil-bintil akar melepaskan senyawa nitrogen organik ke dalam tanah tempat
tanaman polong hidup. Dengan demikian terjadi penambahan nitrogen yang dapat menambah
kesuburan tanah.
4. Bakteri usus
Bakteri Entamoeba coli hidup di kolon (usus besar) manusia, berfungsi membantu
membusukkan sisa pencernaan juga menghasilkan vitamin B12, dan vitamin K yang penting
dalam proses pembekuan darah. Dalam organ pencernaan berbagai hewan ternak dan kuda,
bakteri anaerobik membantu mencernakan selusosa rumput menjadi zat yang lebih sederhana
sehingga dapat diserap oleh dinding usus.

5. Bakteri fermentasi
Beberapa makanan hasil fermentasi dan mikroorganisme yang berperan:
No.    Nama produk atau makanan    Bahan baku    Bakteri yang berperan
1.    Yoghurt    susu    Lactobacillus bulgaricus dan Streptococcus thermophilus

2.    Mentega    susu    Streptococcus lactis

3.    Terasi    ikan    Lactobacillus sp.

4.    Asinan buah-buahan    buah-buahan    Lactobacillus sp.

5.    Sosis    daging    Pediococcus cerevisiae

6.    Kefin    susu    Lactobacillus bulgaricus dan Srteptococcus lactis

6. Bakteri penghasil antibiotik

Antibiotik merupakan zat yang dihasilkan oleh mikroorganisme dan mempunyai daya hambat
terhadap kegiatan mikroorganisme lain. Beberapa bakteri yang menghasilkan antibiotik
adalah:
1.    Bacillus brevis, menghasilkan terotrisin
2.    Bacillus subtilis, menghasilkan basitrasin
3.    Bacillus polymyxa, menghasilkan polimixin

Bakteri merugikan :
1. Bakteri perusak makanan
Beberapa spesies pengurai tumbuh di dalam makanan. Mereka mengubah makanan dan
mengeluarkan hasil metabolisme yang berupa toksin (racun). Racun tersebut berbahaya bagi
kesehatan manusia. Contohnya:
1.    Clostridium botulinum, menghasilkan racun botulinin, seringkali terdapat pada makanan
kalengan
2.    Pseudomonas cocovenenans, menghasilkan asam bongkrek, terdapat pada tempe
bongkrek
3.    Leuconostoc mesenteroides, penyebab pelendiran makanan
2. Bakteri denitrifikasi
Jika oksigen dalam tanah kurang maka akan berlangsung denitrifikasi, yaitu nitrat direduksi
sehingga terbentuk nitrit dan akhirnya menjadi amoniak yang tidak dapat dimanfaatkan oleh
tumbuhan. Contoh bakteri yang menyebabkan denitrifikasi adalah Micrococcus denitrificans
dan Pseudomonas denitrificans.
3. Bakteri patogen
Merupakan kelompok bakteri parasit yang menimbulkan penyakit pada manusia, hewan dan
tumbuhan.
Bakteri penyebab penyakit pada manusia:
No.    Nama bakteri    Penyakit yang ditimbulkan
1.    Salmonella typhosa
Tifus
2.    Shigella dysenteriae
Disentri basiler
3.    Vibrio comma
Kolera
4.    Haemophilus influenza
Influensa
5.    Diplococcus pneumoniae
Pneumonia (radang paru-paru)
6.    Mycobacterium tuberculosis
TBC paru-paru
7.    Clostridium tetani
Tetanus
8.    Neiseria meningitis
Meningitis (radang selaput otak)
9.    Neiseria gonorrhoeae
Gonorrhaeae (kencing nanah)
10.    Treponema pallidum
Sifilis atau Lues atau raja singa
11.    Mycobacterium leprae
Lepra (kusta)
12.    Treponema pertenue
Puru atau patek

Bakteri penyebab penyakit pada hewan:

No.    Nama bakteri    Penyakit yang ditimbulkan
1.    Brucella abortus
Brucellosis pada sapi
2.    Streptococcus agalactia
Mastitis pada sapi (radang payudara)
3.    Bacillus anthracis
Antraks
4.    Actinomyces bovis
Bengkak rahang pada sapi
5.    Cytophaga columnaris
Penyakit pada ikan

Bakteri penyebab penyakit pada tumbuhan:

No.    Nama bakteri    Penyakit yang ditimbulkan
1.    Xanthomonas oryzae
Menyerang pucuk batang padi
2.    Xanthomonas campestris
Menyerang tanaman kubis
3.    Pseudomonas solanacaerum
Penyakit layu pada famili terung-terungan
4.    Erwinia amylovora
Penyakit bonyok pada buah-buahan

4. Dekomposisi
Bakteri bekerja secara terstruktur dalam proses degradasi organisme atau proses pembusukan
mayat. Proses pembusukan berawal dari mikroorganisme, misalnya bakteri-bakteri yang
hidup di dalam usus besar manusia. Bakteri tersebut mulai mendegradasi protein yang
terdapat dalam tubuh. Jika seluruh jenis ikatan protein sudah terputus, beberapa jaringan
tubuh menjadi tidak berfungsi. Proses ini disempurnakan bakteri yang datang dari luar tubuh
mayat, bisa berasal dari udara, tanah, ataupun air. Seluruh jenis bakteri ini menyerang hampir
seluruh sel di tubuh dengan cara menyerang sistem pertahanan tubuh yang tidak lagi aktif,
menghancurkan jaringan otot, atau menghasilkan enzim penghancur sel yang disebut
protease. Kemudian dengan berbagai jenis metabolisme, mikroorganisme mulai memakan
jaringan mati dan mencernanya. Tak jarang kerja proses ini dibantu reaksi kimia alami yang
terjadi dalam organisme mati.
5. Bakteri heterotrof
Tidak semua mikroorganisme mampu mendegradasi mayat. Kebanyakan mereka berasal dari
jenis bakteri heterotrof. Bakteri ini membutuhkan molekul-molekul organik dari organisme
lain sebagai nutrisi agar ia dapat bertahan hidup dan berkembang biak. Berbeda dengan
bakteri autotrof yang mampu menghasilkan makanan sendiri dengan CO2 sebagai nutrisi
makro serta bantuan dari cahaya matahari atau sumber energi kimia lainnya.
Jenis bakteri heterotrof biasanya hidup dan berkembang biak pada organisme mati. Mereka
mendapatkan energi dengan menguraikan senyawa organik pada organisme mati. Molekul-
molekul besar seperti protein, karbohidrat, lemak, atau senyawa organik lain didekomposisi
metabolisme tubuh bakteri tersebut menjadi molekul-molekul tunggal seperti asam amino,
metana, gas CO2, serta molekul-molekul lain yang mengandung enam nutrisi utama bakteri,
yaitu senyawa-senyawa karbon (C), hidrogen (H), nitrogen (N), oksigen (O), fosfor (P), serta
sulfur (S).
6. Kumpulan unsur organik
Tubuh mayat adalah tempat hidup, sumber makanan, serta tempat berkembang biak bakteri-
bakteri tersebut, karena tubuh terdiri dari kumpulan protein, karbohidrat, lemak, atau
senyawa organik dan anorganik lain. Secara biologis, tubuh makhluk hidup (khususnya
manusia) kumpulan dari unsur-unsur organik seperti C, H, N, O, P, S, atau unsur anorganik
seperti K, Mg, Ca, Fe, Co, Zn, Cu, Mn, atau Ni. Keseluruhan unsur tersebut dibutuhkan
bakteri heterotrof sebagai sumber nutrisi alias makanan utama mereka. Sementara cairan-
cairan dengan pH (tingkat keasaman suatu larutan) tertentu yang berada dalam tubuh manusia
adalah media kultur (lingkungan) pertumbuhan yang baik bagi bakteri-bakteri tersebut.
7. Bau busuk
Bau busuk dari tubuh mayat tidak hanya mengganggu, namun juga membahayakan.
Pembusukan dimulai dengan pemutusan ikatan protein-protein besar pada jaringan tubuh oleh
bakteri fermentasi menggunakan enzim protease. Kumpulan hasil pemutusan ikatan protein
yang disebut asam amino ini dicerna berbagai jenis bakteri, misalnya bakteri acetogen.
Bakteri ini mereaksikan asam amino dengan oksigen dalam tubuhnya untuk menghasilkan
asam asetat, hidrogen, nitrogen, serta gas karbon dioksida. Produk asam asetat ini
menimbulkan bau.
Asam asetat yang dihasilkan ini diproses kembali oleh bakteri jenis methanogen, misalnya
Methanothermobacter thermoautotrophicum yang biasa hidup di lingkungan kotor seperti
selokan dan pembuangan limbah (septic tank). Asam asetat direaksikan dalam sel
methanogen dengan gas hidrogen dan karbon dioksida untuk menghasilkan metana, air, dan
karbon dioksida. Metana dalam bentuk gas juga menghasilkan bau busuk.
Selain asam asetat dan gas metana, beberapa bakteri menghasilkan gas hidrogen sulfida yang
baunya seperti telur busuk. Lebih dari itu, bau busuk mayat di lautan yang bercampur dengan
uap garam bersifat racun, karena mampu mereduksi konsentrasi elektrolit dalam tubuh.
Produk berbahaya selain gas yang dihasilkan adalah cairan asam dan cairan lain yang
mengandung protein toksik. Jika cairan-cairan ini sempat menginfeksi kulit yang luka atau
terkena makanan, bukan hanya produk beracun yang dapat masuk ke dalam tubuh tetapi juga
bakteri heterotrof patogen seperti clostridium.
Bakteri serta produk beracun ini dapat menginfeksi manusia lewat kontaminasi makanan,
minuman, atau luka di kulit. Karena adanya saluran masuk ini, maka berbagai penyakit
seperti malaria, diare, degradasi sel darah merah, lemahnya sistem pertahanan tubuh, infeksi
pada luka (tetanus), bengkak, atau infeksi pada alat kelamin menjadi ancaman yang serius.
Cara mengatasi serangan mikroorganisme ini adalah dengan menjaga makanan dan minuman
tetap steril, yaitu dengan dipanaskan. Mencuci tangan dan kaki dengan sabun antiseptik cair
sebelum makan. Menjaga lingkungan agar steril dengan cara menyemprotkan obat pensteril.
Bakteri-bakteri tersebut juga dapat dicegah pertumbuhannya dengan cara meminum obat
antibiotik atau suntik imunitas. Sifat-sifat inilah yang harus dipahami dengan cara mengikuti
prosedur standar penanganan mayat. Antara lain menggunakan masker standar minimal
WHO (tipe N-95), memakai sarung tangan khusus, serta mencuci tangan sebelum dan
sesudah mengangkat satu mayat. Langkah terbaik adalah segera menguburkan mayat.
 DAFTAR PUSTAKA
Alcamo IE (2001). Fundamentals of microbiology. Boston: Jones and Bartlett. ISBN 0-7637-
1067-9.
Atlas RM (1995). Principles of microbiology. St. Louis: Mosby. ISBN 0-8016-7790-4.
Martinko JM, Madigan MT (2005). Brock Biology of Microorganisms, 11th ed., Englewood
Cliffs, N.J: Prentice Hall. ISBN 0-13-144329-1.
Holt JC, Bergey DH (1994). Bergey's manual of determinative bacteriology, 9th ed.,
Baltimore: Williams & Wilkins. ISBN 0-683-00603-7.
Hugenholtz P, Goebel BM, Pace NR (1998). "Impact of culture-independent studies on the
emerging phylogenetic view of bacterial diversity". J Bacteriol 180 (18): 4765–74.
Funke BR, Tortora GJ, Case CL (2004). Microbiology: an introduction, 8th ed,, San
Francisco: Benjamin Cummings. ISBN 0-8053-7614-3.
http://id.wikipedia.org/wiki/Bakteri"