Gravitasi Dapat Melibatkan Kalsium dan pH sebagai pembawa pesan kedua

Berbagai eksperimen telah menyarankan bahwa kalsium-kalmodulin diperlukan untuk

gravitropisme akar pada jagung. Beberapa percobaan ini melibatkan EGTA (etilen glikol-bis
(β aminoetiletri) -N, N, N ′, N ′ (asam tetraasetat), senyawa yang dapat mengkelat
(membentuk kompleks dengan) ion kalsium, sehingga mencegah penyerapan kalsium oleh
sel. EGTA melarang Gravitropisme akar dan distribusi auksin asimetris sebagai respons
terhadap gravitasi (Young dan Evans 1994).

Menempatkan blok agar yang mengandung ion kalsium pada sisi tutup akar jagung
yang diorientasikan secara vertikal menginduksi akar untuk tumbuh ke arah samping dengan
blok agar (Gambar 19.35). Seperti dalam kasus [+ H] IAA, 45 Ca2 + diangkut secara polar ke
bagian bawah tutup akar yang distimulasi oleh gravitasi. Namun, sejauh ini tidak ada
perubahan dalam distribusi kalsium intraseluler yang telah terdeteksi dalam sel columella
sebagai respons terhadap stimulus gravitasi.

gambar 19.34 Selama relokasi PIN3 pembawa eflux auksin selama gravitropisme
akar dalam Arabidopsis. (A) Dalam akar yang berorientasi vertikal, PIN3
didistribusikan secara merata di sekitar sel columella. (B) Setelah berorientasi
horizontal selama 10 menit, PIN3 telah dipindahkan ke sisi bawah sel columella. Foto
dalam (B) telah diorientasikan ulang sehingga sisi bawahnya berada di kanan. (Arah
gravitasi ditunjukkan oleh panah.) (Dari Friml et al. 2002, milik Klaus Palme.)

Bukti terbaru menunjukkan bahwa perubahan pH intraseluler adalah perubahan paling

awal yang terdeteksi dalam sel columella yang menanggapi gravitasi. Fasano et al. (2001)
menggunakan pewarna terhadap pH untuk memantau pH intraseluler dan ekstraseluler pada
akar Arabidopsis setelah ditempatkan dalam posisi horizontal.
 gambar 19.35 pembengkokan akar jagung pada blok agar mengandung kalsium yang
diletakkan di tutupnya. (Atas perkenan Michael L. Evans.)

Dalam waktu 2 menit setelah gravistimulasi, pH sitoplasma dari sel columella dari
tutup akar meningkat dari 7,2 menjadi 7,6, dan pH apoplastik menurun dari 5,5 menjadi 4,5.
Perubahan ini didahului setiap kelengkungan tropis yang terdeteksi sekitar 10 menit.

Alkalinisasi dari sitosol dikombinasikan dengan pengasaman apoplast menunjukkan

bahwa aktivasi membran plasma H + -ATPase adalah salah satu peristiwa awal yang
memediasi persepsi gravitasi akar atau transduksi sinyal.

Faktor Pengembangan Auxin

Awalnya ditemukan dalam kaitannya dengan pertumbuhan, auksin mempengaruhi

hampir setiap tahap siklus hidup tanaman dari perkecambahan hingga penuaan. Karena efek
yang dihasilkan oleh auksin tergantung pada identitas jaringan target, respons suatu jaringan
terhadap auksin diatur oleh program genetik yang ditentukan perkembangannya. dan
selanjutnya dipengaruhi oleh ada atau tidak adanya molekul pensinyalan lainnya. Seperti
yang akan kita lihat dalam bab ini dan bab-bab selanjutnya, interaksi antara dua atau lebih
hormon adalah tema yang berulang dalam pengembangan tanaman.

Beberapa proses perkembangan tambahan yang diatur oleh auksin, termasuk dominasi
apikal, absisi daun, pembentukan akar lateral, dan diferensiasi vaskular. Mekanisme utama
aksi auksin sebanding dalam semua kasus, yang melibatkan reseptor yang serupa dan jalur
transduksi sinyal.

Auksin Mengatur Dominasi Apikal

 Pada sebagian besar tanaman yang lebih tinggi, tunas apikal yang tumbuh
menghambat pertumbuhan fenomena budsa lateral (aksila) yang disebut dominasi apikal.
Pengangkatan apeks pucuk (pemenggalan kepala) biasanya menghasilkan pertumbuhan satu
atau lebih tunas lateral. Tidak lama setelah ditemukannya auksin, ditemukan bahwa IAA
dapat menggantikan tunas apikal dalam mempertahankan penghambatan tunas lateral
tanaman kacang (Phaseolus vulgaris). Eksperimen klasik ini diilustrasikan pada Gambar
19.36.

GAMBAR 19.36 Auksin menekan pertumbuhan aksila tunas dalam tanaman kacang
(Phaseolusvulgaris). (A) Tunas aksila ditekan dalam keadaan utuh karena dominasi apikal. 
(B) Penghapusan tunas terminal melepaskan tunas aksila dari dominasi apikal (panah). (C)
Menerapkan IAA dalam pasta lanolin (terkandung dalam kapsul gelatin) ke permukaan yang
dipotong mencegah pertumbuhan tunas ketiak. (Foto © M. B. Wilkins.)

Hasil ini segera dikonfirmasi untuk banyak spesies tanaman lainnya, yang mengarah
ke hipotesis bahwa hasil pertumbuhan tunas aksila dihambat oleh auksin yang diangkut
secara basipetal dari tunas apikal. Untuk mendukung gagasan ini, cincin penghambat
transport auksin TIBA dalam pasta lanolin (sebagai pembawa) yang ditempatkan di bawah
melepaskan tunas aksila dari penghambatan.

Bagaimana auksin dari apeks pucuk menghambat pertumbuhan tunas lateral? Kenneth
V. Thimann dan Folke Skoog awalnya mengusulkan auksin itu dari apeks pucuk
menghambat pertumbuhan tunas ketiak langsung disebut model hambatan langsung. Menurut
model, konsentrasi auksin optimal untuk pertumbuhan tunas rendah, jauh lebih rendah
daripada konsentrasi auksin yang biasanya ditemukan pada batang. Tingkat auksin yang
biasanya ada dalam batang dianggap menghambat pertumbuhan tunas lateral.

Jika model penghambatan langsung dari dominasi apikal benar, konsentrasi auksin
dalam tunas aksila harus menurun setelah pemenggalan kepala apeks pucuk. Namun,
kebalikannya tampaknya benar. Ini ditunjukkan dengan tanaman transgenik yang
mengandung gen reporter untuk bakteri luciferase (LUXA dan LUXB) di bawah kendali
promotor auksin-responsif (Langridge et al. 1989). Gen reporter ini memungkinkan peneliti
untuk mempelajari tingkat auksin di jaringan yang berbeda dengan memantau jumlah cahaya
yang dipancarkan oleh reaksi yang dikatalisis luciferase.

Ketika tanaman transgenik ini dipotong, ekspresi dari Gen LUX meningkat di dalam
dan sekitar tunas aksila dalam waktu 12 jam. Eksperimen ini menunjukkan bahwa setelah
dipenggal, kandungan auksin dari tunas aksila meningkat.

Pengukuran fisik langsung tingkat auksin pada tunas juga menunjukkan peningkatan
auksin tunas aksila setelah pemotongan kepala. Konsentrasi IAA dalam tunas aksila
Phaseolus vulgaris (kacang merah) meningkat lima kali lipat dalam waktu 4 jam setelah
pemotongan kepala (Gocal et al. 1991). Ini dan hasil serupa lainnya membuatnya tidak
mungkin bahwa auksin dari apeks pucuk menghambat tunas aksila secara langsung.

Hormon lain, seperti sitokinin dan ABA, mungkin terlibat. Penerapan langsung
sitokinin pada tunas aksila merangsang pertumbuhan tunas pada banyak spesies,
mengabaikan efek penghambatan dari apeks pucuk. Auksin membuat pucuk pucuk menjadi
bak cuci bagi sitokinin yang disintesis di dalam akar, dan ini mungkin salah satu faktor yang
terlibat dalam dominasi apikal (lihat Topik Web 19.10).

Akhirnya, ABA telah ditemukan di tunas lateral aktif di tanaman utuh. Ketika apeks
pucuk dihilangkan, level ABA di tunas lateral berkurang. Kadar IAA yang tinggi dalam
pemotretan dapat membantu menjaga kadar ABA tetap tinggi di tunas lateral. Melepaskan
apeks menghilangkan sumber utama IAA, yang memungkinkan tingkat inhibitor
pertumbuhan kuncup turun (lihat Topik Web 19.11).
Auksin Sebagai Pembentukan Lateral dan Akar Adventif

Meskipun perpanjangan akar primer dihambat oleh konsentrasi auksin yang lebih
besar dari 10–8M, inisiasi akar lateral (cabang) dan akar adventif dirangsang oleh tingkat
auksin yang tinggi. Akar lateral umumnya ditemukan di atas zona pemanjangan dan akar
rambut dan berasal dari kelompok kecil sel dalam pericycle (lihat Bab 16). Auksin
merangsang sel pericycle untuk membelah. Sel-sel yang membelah secara bertahap
membentuk menjadi puncak akar, dan akar lateral tumbuh melalui korteks akar dan
epidermis.

Akar adventif (akar yang berasal dari jaringan non akar) dapat muncul di berbagai
lokasi jaringan dari kelompok sel dewasa yang memperbaharui

aktivitas pembelahan sel . Sel-sel pembagi ini berkembang menjadi meristem apikal
akar dengan cara yang sejalan dengan pembentukan akar lateral. Dalam hortikultura, efek
stimulasi auksin pada pembentukan akar adventif sangat berguna untuk perbanyakan
vegetatif tanaman dengan pemotongan

Aseries dari mutan Arabidopsis, bernama alf (pembentukan akar lateral yang
menyimpang), telah memberikan beberapa wawasan tentang peran auksin dalam inisiasi akar
lateral. Mutan alf1 menunjukkan proliferasi ekstrim akar adventif dan lateral, ditambah
dengan peningkatan 17 kali lipat dalam auksin endogen (Gambar 19.37).

Mutan lain, alf4, memiliki fenotip yang berlawanan: Ia benar-benar tanpa akar lateral.
Analisis mikroskopis akar alf4 menunjukkan bahwa primordia akar-lateral tidak ada. Fenotip
alf4 tidak dapat dibalik dengan aplikasi IAA eksogen.

Namun mutan lain, alf3, rusak dalam pengembangan primordia akar-lateral menjadi
akar lateral matang. Akar utama dicakup dengan primordia roo yang ditangkap yang tumbuh
sampai keluar melalui lapisan sel epidermis dan kemudian berhenti tumbuh. Pertumbuhan
yang ditangkap dapat dikurangi dengan aplikasi IAA eksogen.

Atas dasar fenotipe mutan alf, model di mana IAA diperlukan untuk setidaknya dua
langkah dalam pembentukan akar lateral telah diusulkan (Gambar 19.38) (Celenza et al.
1995):

1. IAA yang diangkut secara acropetally (ke ujung) di prasasti diperlukan untuk
memulai pembelahan sel dalam perisikel.
 2. AA diperlukan untuk meningkatkan pembelahan sel dan mempertahankan viabilitas
sel di akar lateral yang berkembang.

Auksin Menghambat Timbulnya Penyisihan Daun

Penumpahan daun, bunga, dan buah-buahan dari yang hidup tanaman dikenal sebagai
absisi. Bagian-bagian ini menghilang di daerah yang disebut zona absisi, yang terletak di
dekat pangkal tangkai daun. Pada sebagian besar tanaman, pengurangan daun didahului oleh
diferensiasi lapisan sel yang berbeda, lapisan absisi, dalam zona absisi. Selama penuaan daun,
dinding sel-sel di lapisan absisi dicerna, yang menyebabkan menjadi lunak dan lemah. Daun
akhirnya pecah pada lapisan absisi sebagai akibat dari tekanan pada dinding sel yang
melemah.

Gambar 19.37 Akar morfologi bibit Arabidopsis (A-C) tipe liar dan alf1 (D – F) pada
media bebas hormon. Perhatikan proliferasi primoridia akar yang tumbuh dari perisikel di
bibit alf1 (D dan E). (Dari Celenza et al. 1995, milik J. Celenza.)

Kadar auksin tinggi pada daun muda, semakin menurun daun dewasa, dan relatif
rendah pada daun tua ketika proses absissi dimulai. Peran auksin dalam penyisihan daun
dapat dengan mudah ditunjukkan dengan eksisi bilah dari daun dewasa, meninggalkan
tangkai daun utuh pada batang. Sedangkan penghapusan bilah daun mempercepat
pembentukan lapisan absisi di tangkai daun, penerapan IAA dalam pasta lanolin ke
 permukaan potongan tangkai daun mencegah pembentukan lapisan absisi. (Pasta Lanolin saja
tidak mencegah absisi.)

Hasil ini menyarankan yang berikut:

• Auksin yang diangkut biasanya mencegah absisi.

• Pembatalan dipicu selama penuaan daun, saat auksin tidak lagi diproduksi.

GAMBAR 19.38 untuk pembentukan akar lateral, berdasarkan alf mutan

Arabidopsis. (Setelah Celenza et al. 1995.)

Auksin Transportasi Mengatur Perkembangan Tunas Flora

Memperlakukan tanaman Arabidopsis dengan inhibitor transport auksin NPA

menyebabkan perkembangan bunga abnormal, menunjukkan bahwa transpor auksin polar
dalam meristem perbungaan diperlukan untuk perkembangan bunga normal. Dalam
Arabidopsis, pin1 mutan “pin-shaped”, yang tidak memiliki pembawa eflux auksin dalam
jaringan pucuk, memiliki bunga abnormal yang mirip dengan tanaman yang dirawat NPA
(lihat Gambar 19.14A). Rupanya perkembangan meristem bunga tergantung pada auksin
yang diangkut ke sana dari jaringan subapikal. Dengan tidak adanya pembawa eflux,
meristem kelaparan untuk auksin, dan phyllotaxis normal dan perkembangan bunga
terganggu (Kuhlemeier dan Reinhardt 2001).

Auksin Meningkatkan Perkembangan Buah

Banyak bukti menunjukkan bahwa auksin terlibat dalam regulasi pengembangan

buah. Auksin diproduksi dalam serbuk sari dan dalam endosperma dan embrio dari benih
yang sedang berkembang, dan stimulus awal untuk pertumbuhan buah dapat dihasilkan dari
penyerbukan.

Penyerbukan yang berhasil memulai pertumbuhan ovula, yang dikenal sebagai buah.
Setelah pembuahan, pertumbuhan buah mungkin tergantung pada auksin yang dihasilkan
dalam pengembangan benih. Endosperma dapat berkontribusi auksin selama tahap awal
pertumbuhan buah, dan embrio berkembang.dapat mengambil alih sebagai sumber auksin
utama selama nanti tahapan.

Gambar 19.39 menunjukkan pengaruh auksin yang diproduksi oleh achenes stroberi
terhadap pertumbuhan wadah stroberi.

Auksin Menginduksi Diferensiasi Vaskular

Jaringan pembuluh darah baru berdiferensiasi langsung di bawah tunas yang sedang tumbuh
dan daun muda yang tumbuh (lihat Gambar 19.5), dan pengangkatan daun muda mencegah
diferensiasi vaskular (Aloni 1995). Kemampuan tunas apikal untuk merangsang diferensiasi
vaskular dapat ditunjukkan dalam kultur jaringan. Ketika tunas apikal dicangkokkan ke
rumpun sel yang tidak berdiferensiasi, atau kalus, xilem dan floem berdiferensiasi di bawah.

Jumlah relatif xilem dan floem yang terbentuk diatur oleh konsentrasi auksin:
Konsentrasi auksin yang tinggi menginduksi diferensiasi xilem dan floem, tetapi hanya floem
yang berdiferensiasi pada konsentrasi auksin yang rendah. Demikian pula, Percobaan pada
jaringan batang telah menunjukkan bahwa konsentrasi auksin yang rendah menginduksi
diferensiasi floem, sedangkan IAA lebih tinggi level menginduksi xilem (Aloni 1995).

Regenerasi jaringan vaskular setelah luka juga dikendalikan oleh auksin yang
diproduksi oleh daun muda tepat di atas lokasi luka (Gambar 19.40). Pengangkatan daun
mencegah regenerasi jaringan pembuluh darah, dan auksin yang diaplikasikan dapat
menggantikan daun dalam merangsang regenerasi. Diferensiasi vaskular bersifat polar dan
terjadi dari daun ke akar. Dalam tanaman keras kayu, auksin diproduksi oleh tunas yang
tumbuh di musim semi merangsang aktivasi kambium di arah basipetal. Babak baru
pertumbuhan sekunder dimulai dari ranting terkecil dan bergerak ke bawah menuju ujung
akar.
GAMBAR 19.39 (A) "Buah" stroberi sebenarnya adalah wadah yang bengkak yang
pertumbuhannya diatur oleh auksin yang dihasilkan oleh "biji," yang sebenarnya mencapai b
buah-buahan. (B) Ketika achene dihilangkan, wadah gagal untuk berkembang secara normal.

(C) Menyemprot wadah tanpa rasa sakit dengan IAA mengembalikan pertumbuhan dan
perkembangan normal. (Setelah A. Galston 1994.)

GAMBAR 19.40 Regenerasi xilem yang diinduksi IAA di sekitar luka pada jaringan
batang mentimun (Cucumis sativus). (A) Metode untuk melakukan percobaan regenerasi
luka. (B) Mikrograf fluoresensi menunjukkan regenerasi jaringan pembuluh darah di sekitar
luka. (B milik R. Aloni.)

Bukti lebih lanjut untuk peran auksin dalam diferensiasi vaskular berasal dari studi di
mana konsentrasi auksin dimanipulasi oleh transformasi tanaman dengan gen biosintesis
auksin melalui penggunaan plasmid Ti dari Agrobacterium. Ketika gen biosintesis auksin
diekspresikan berlebih pada tanaman petunia, jumlah elemen tracheary xilem meningkat.
Sebaliknya, ketika tingkat IAA bebas dalam tanaman tembakau dikurangi melalui
transformasi dengan kode gen untuk enzim yang mengkonjugasikan IAA ke asam amino
lisin, jumlah elemen kapal menurun dan ukurannya meningkat (Romano et al. 1991). Dengan
demikian tingkat auksin bebas muncul untuk mengatur jumlah elemen tracheary, serta
ukurannya.

Dalam kultur sel mesofil Zinnia elegans, auksin diperlukan untuk diferensiasi sel
trakearik, tetapi sitokinin juga berperan, mungkin dengan meningkatkan sensitivitas sel
terhadap auksin. Sedangkan auksin diproduksi di pucuk dan diangkut ke bawah ke akar,
sitokinin diproduksi oleh ujung akar dan diangkut ke atas ke pucuk. Kedua hormon ini
mungkin terlibat dalam regulasi aktivasi kambium dan diferensiasi vaskular (lihat Bab 21).

Auksin sintesis memiliki berbagai kegunaan komersial

Auksin telah digunakan secara komersial di bidang pertanian dan hortikultura selama
lebih dari 50 tahun. Penggunaan komersial awal termasuk pencegahan penurunan buah dan
daun, promosi pembungaan dalam nanas, induksi buah parthenocarpic, penipisan buah, dan
rooting stek untuk perbanyakan tanaman. Rooting ditingkatkan jika pemotongan daun atau
batang dicelupkan ke dalam larutan auksin, yang meningkatkan inisiasi akar adventif pada
ujung yang dipotong. Ini adalah dasar dari senyawa rooting komersial, yang terutama terdiri
dari auksin sintetis dicampur dengan bedak.

Pada beberapa spesies tanaman, buah-buahan tanpa biji dapat diproduksi secara alami,
atau dapat diinduksi oleh perawatan bunga yang tidak dicabut dengan auksin. Produksi buah
tanpa biji tersebut disebut parthenocarpy. Dalam merangsang pembentukan buah
parthenocarpic, auksin dapat bertindak terutama untuk menginduksi himpunan buah, yang
pada gilirannya dapat memicu produksi auksin endogen oleh jaringan buah tertentu untuk
menyelesaikan proses perkembangan.

 Etilen juga terlibat dalam pengembangan buah, dan beberapa efek auksin pada buah
dapat dihasilkan dari promosi sintesis etilen. Kontrol etilen dalam penanganan komersial
buah dibahas dalam Bab 22.

 Selain aplikasi ini, auksin saat ini banyak digunakan sebagai herbisida. Bahan kimia
2,4-D dan dicamba (lihat Gambar 19.4) mungkin merupakan auksin sintetis yang paling
banyak digunakan. Auksin sintetis sangat efektif karena tidak dimetabolisme oleh tanaman
secepat IAA. Karena jagung dan monokotil lainnya dapat dengan cepat menonaktifkan auksin
sintetis dengan konjugasi, auksin ini digunakan oleh petani untuk mengendalikan gulma
dikotil, juga disebut gulma berdaun lebar, di ladang sereal komersial, dan oleh pekebun
rumah untuk mengendalikan gulma seperti dandelion dan aster di halaman.

Kalsium Dan pH Dan Intraseluler Adalah Zat Antara Memungkinkan

Kalsium memainkan peran penting dalam transduksi sinyal pada hewan dan diduga
terlibat dalam aksi hormon tanaman tertentu. Peran kalsium dalam aksi auksin tampak sangat
kompleks dan, pada saat ini, sangat tidak pasti. Namun demikian, beberapa bukti
eksperimental menunjukkan bahwa auksin meningkatkan kadar kalsium bebas dalam sel.

Perubahan pH sitoplasma juga dapat berfungsi sebagai pembawa pesan kedua pada
hewan dan tumbuhan. Pada tanaman, auksin menginduksi penurunan pH sitosol sekitar 0,2
unit dalam waktu 4 menit aplikasi. Penyebab penurunan pH ini tidak diketahui. Karena pH
sitosol normalnya sekitar 7,4, dan pH optimum membran plasma H + ATPase adalah 6,5,
penurunan pH sitosol 0,2 unit dapat menyebabkan peningkatan yang nyata dalam aktivitas
membran plasma H + -ATPase. Penurunan pH sitosol juga dapat menjelaskan peningkatan
kalsium intraseluler yang diinduksi auksin, dengan mempromosikan disosiasi bentuk terikat.

MAP kinase (lihat Bab 14 di situs web) yang berperan dalam transduksi sinyal oleh
protein fosforilasi dalam kaskade yang akhirnya mengaktifkan faktor transkripsi juga terlibat
dalam respons auksin. Ketika sel-sel tembakau dicabut dari auksin, ditangkap pada akhir fase
G1 atau G2 dan berhenti membelah; jika auksin ditambahkan kembali ke media kultur, siklus
sel dilanjutkan (Koens et al. 1995). (Untuk penjelasan tentang siklus sel, lihat Bab 1.) Auksin
tampaknya memberikan efeknya pada siklus sel terutama dengan merangsang sintesis protein
kinase (CDK) dependen-cyclin utama: Cdc2 (siklus pembagian sel 2) (lihat Bab 14 di situs
web).

Gen yang Diinduksi Auksin terbagi dalam dua Kelas: Awal dan Akhir

Salah satu fungsi penting dari transduksi sinyal jalur dimulai ketika auksin berikatan
dengan reseptornya adalah aktivasi sekelompok faktor transkripsi terpilih. Faktor transkripsi
yang diaktifkan memasuki nukleus dan mempromosikan ekspresi gen tertentu. Gen yang
ekspresinya distimulasi oleh aktivasi faktor transkripsi yang sudah ada sebelumnya disebut
gen respons primer atau gen awal.
  Definisi ini menyiratkan bahwa semua protein diperlukan ekspresi gen awal yang
diinduksi auksin hadir dalam sel pada saat terpapar hormon; demikian, ekspresi gen awal
tidak dapat diblokir oleh inhibitor sintesis protein seperti cycloheximide. Sebagai
konsekuensi, waktu yang dibutuhkan untuk ekspresi gen awal bisa cukup pendek, mulai dari
beberapa menit hingga beberapa jam (Abel dan Theologis 1996).

Secara umum, gen respons primer memiliki tiga fungsi utama: (1) Beberapa gen awal
mengkode protein yang mengatur transkripsi gen respons sekunder, atau gen lanjut, yang
diperlukan untuk respons jangka panjang terhadap hormon. Karena gen yang terlambat
membutuhkan sintesis protein de novo, ekspresinya dapat dihambat oleh inhibitor sintesis
protein. (2) Gen awal lainnya terlibat dalam komunikasi antar sel, atau pensinyalan sel-ke-sel.
(3) Kelompok gen awal lainnya terlibat dalam adaptasi

Lima kelas utama gen auksin-responsif awal memiliki telah diidentifikasi:

 Gen yang terlibat dalam pertumbuhan dan perkembangan yang diatur auksin:
1. Gen AUX / IAA
2. Gen SAUR
3. Gen GH3
 Gen respons :
1. Gen yang mengkode glutathione S-transferases
2. Gen yang mengkode 1-aminocyclopropane-1-car-boxylic acid (ACC) synthase, enzim
kunci dalam jalur biosintesis etilen (lihat Bab 22)

Gen awal untuk pertumbuhan dan perkembangan. Gen AUX / IAA mengkodekan faktor
transkripsi berumur pendek yang berfungsi sebagai penekan atau penggerak ekspresi gen
yang terlambat diinduksi auksin. Ekspresi sebagian besar gen AUX / IAA dirangsang oleh
auksin dalam penambahan hormon selama 5 hingga 60 menit. Semua gen mengkode
polipeptida hidrofilik kecil yang memiliki motif pengikatan DNA yang mirip dengan yang
ada pada represi bakteri. memiliki waktu paruh pendek (sekitar 7 menit), yang menunjukkan
bahwa berbalik dengan cepat.

Gen SAUR disebutkan sebelumnya dalam bab ini terkait dengan tropisme. Auksin
merangsang ekspresi gen SAUR dalam waktu 2 hingga 5 menit perawatan, dan responsnya
tidak sensitif terhadap sikloheksimid. Lima gen SAUR kedelai dikelompokkan bersama, tidak
mengandung intron, dan menyandikan polipeptida yang sangat mirip dengan fungsi yang
tidak diketahui. Karena kecepatan respon, ekspresi gen SAUR telah terbukti nyaman
menyelidiki transportasi lateral auksin selama fototropisme dan gravitropisme.

Gen awal untuk adaptasi stres. Seperti disebutkan sebelumnya dalam bab ini, auksin
terlibat dalam respons stres, seperti melukai. Beberapa gen yang mengkode glutathione-S-
transferases (GSTs), suatu kelas protein yang distimulasi oleh berbagai kondisi stres,
diinduksi oleh peningkatan konsentrasi auksin. Demikian juga, ACC sintase, yang juga
diinduksi oleh stres dan merupakan langkah pembatas laju dalam biosintesis etilen (lihat Bab
22), diinduksi oleh auksin tingkat tinggi.
Untuk diinduksi, promotor gen auksin awal harus mengandung elemen respons yang
mengikat faktor transkripsi yang menjadi diaktifkan dengan adanya auksin. Jumlah yang
dibatasi dari elemen-elemen respons ini tampaknya diatur secara serempak di dalam
promotor berbagai gen yang diinduksi auksin.

Domain responsif Auksin adalah Struktur Komposit

Elemen respons auksin yang dikonservasi (AuxRE) di dalam promotor gen auksin
awal, seperti GH3, biasanya dikombinasikan dengan elemen respons lain untuk membentuk
domain respons auksin (AuxRDs). Sebagai contoh, promotor gen GH3 dari kedelai terdiri
dari tiga AuxRD yang bekerja secara sendiri(masing-masing mengandung beberapa AuxRE)
yang berkontribusi secara bertahap terhadap daya tahan auksin yang kuat dari promotor.

Gen Auksin Awal Diatur oleh Faktor Respons Auksin

Seperti disebutkan sebelumnya, gen auksin awal secara definitif tidak peka terhadap
inhibitor sintesis protein seperti sikloheksimida. Alih-alih dihambat, ekspresi banyak gen
auksin awal telah ditemukan dirangsang oleh sikloheksimid.
Stimulasi cycloheximide ekspresi gen dicapai baik oleh aktivasi transkripsi dan oleh
stabilisasi mRNA. Aktivasi transkripsional gen oleh inhibitor sintesis protein biasanya
menunjukkan bahwa gen sedang ditekan oleh protein represor berumur pendek atau oleh jalur
regulasi yang melibatkan protein dengan tingkat pergantian tinggi.
faktor respons auksin (ARF) berfungsi sebagai aktivator transkripsional dengan
mengikat elemen respons auksin TGTCTC, yang terdapat pada promotor GH3 dan gen
respons auksin awal lainnya. Mutasi pada gen ARF menghasilkan cacat perkembangan yang
parah. Untuk mengikat AuxRE secara stabil, ARF harus membentuk dimer. Telah diusulkan
bahwa dimer ARF mempromosikan transkripsi dengan mengikat dua AuxRE yang diatur
dalam palindrom (Ulmasov et al. 1997).

Studi terbaru juga menunjukkan bahwa protein yang dikodekan oleh keluarga gen
AUX / IAA (itu sendiri salah satu keluarga gen respon auksin awal) dapat menghambat
transkripsi gen respon auksin awal dengan membentuk heterodimer tidak aktif dengan GGA.
Heterodimer tidak aktif ini dapat bertindak untuk menghambat pengikatan ARF-AuxRE,
sehingga menghambat aktivasi atau represi gen. Protein AUX / IAA dapat berfungsi sebagai
inhibitor ARF. Sekarang dipercaya bahwa auksin menginduksi transkripsi

dari gen respons awal dengan mempromosikan proteolitik degradasi protein AUX /
IAA penghambatan sehingga dimer ARF aktif dapat terbentuk. Mekanisme pasti yang
menyebabkan auksin menyebabkan pergantian AUX / IAA tidak diketahui, meskipun
diketahui melibatkan ubiquitinasi oleh ligase dan proteolisis ubiquitin oleh kompleks
proteasome 26S yang besar (lihat Bab 14 di situs web) (Gray et al. 2001; Zenser et al. 2001).
Perhatikan bahwa loop umpan balik negatif dimasukkan ke jalur berdasarkan fakta bahwa
salah satu keluarga gen yang dihidupkan oleh auksin adalah AUX / IAA, yang menghambat
respons.

Sebuah model untuk regulasi auksin dari gen respons awal berdasarkan temuan yang
dijelaskan di sini ditunjukkan pada Gambar 19.41.
1. Dengan tidak adanya IAA, faktor transkripsi, ARF, membentuk heterodimer tidak
aktif dengan protein AUX / IAA.
2. Heterodimer yang tidak aktif memblokir transkripsi gen auksin awal. Tidak ada
respons auksin.
3. Dengan adanya auksin, protein AUX / IAA ditargetkan untuk dihancurkan oleh ligase
ubiquitin teraktivasi.
4. Protein AUX / IAA ditandai dengan ubiquitin dan terdegradasi oleh proteasome 26S.
5. Degradasi protein AUX / IAA yang diinduksi oleh AA memungkinkan homodimer
ARF aktif terbentuk.
6. ARF aktif homodimer mengikat Auxre palindromik di promotor dari gen awal,
mengaktifkan transkripsi.
7. transkripsi gen awal memicu respons auksin
8. stimulasi gen AUX / IAA memperkenalkan umpan balik negatif.
GAMBAR 19.41 Model untuk regulasi auksin aktivasi transkripsi dari gen respons awal oleh
auksin. (Setelah Gray et al. 2001.)

auksin mana yang menyebabkan pergantian AUX / IAA tidak diketahui, meskipun
diketahui melibatkan ubiquitinasi oleh ligase dan proteolisis ubiquitin oleh kompleks
proteasome 26S yang masif (lihat Bab 14 di situs web) (Gray et al. 2001; Zenser et al. 2001 ).
Perhatikan bahwa loop umpan balik negatif dimasukkan ke jalur berdasarkan fakta bahwa
salah satu keluarga gen yang dihidupkan oleh auksin adalah AUX / IAA, yang menghambat
respons.

Sebuah model untuk regulasi auksin dari gen respons awal berdasarkan temuan yang
dijelaskan di sini ditunjukkan pada Gambar 19.41.

RINGKASAN

Auksin adalah hormon pertama yang ditemukan pada tanaman dan merupakan salah
satu dari daftar agen pensinyalan kimia yang mengatur perkembangan tanaman. Bentuk
auksin yang paling umum terjadi secara alami adalah asam indol-3-asetat (IAA). Salah satu
peran paling penting auksin pada tanaman tingkat tinggi adalah regulasi pertumbuhan
perpanjangan batang muda dan koleoptil. Tingkat rendah auksin juga diperlukan untuk
pemanjangan akar, meskipun pada konsentrasi yang lebih tinggi auksin bertindak sebagai
penghambat pertumbuhan akar.

Pengukuran akurat jumlah auksin dalam jaringan tanaman sangat penting untuk
memahami peran hormon ini dalam fisiologi tanaman. Bioassay berbasis koleoptil awal telah
digantikan oleh teknik yang lebih akurat, termasuk metode fisikokimia dan immunoassay.

egulasi pertumbuhan pada tanaman mungkin sebagian bergantung pada jumlah auksin
bebas yang ada dalam sel, jaringan, dan organ tanaman. Ada dua kumpulan utama auksin
dalam sel: sitosol dan kloroplas. Tingkat auksin bebas dapat dimodulasi oleh beberapa faktor,
termasuk sintesis dan pemecahan IAA terkonjugasi, metabolisme IAA, mentasi
kompartemen, dan transportasi auksin kutub. Beberapa jalur telah terlibat dalam biosintesis
IAA, termasuk jalur tryptophan-dependen dan tryptophan-independen. Beberapa jalur
degradatif untuk IAA juga telah diidentifikasi.

IAA disintesis terutama di tunas apikal dan diangkut secara polar ke akar.
Transportasi kutub diperkirakan terjadi terutama dalam sel parenkim yang terkait
denganjaringan pembuluh darah. Transportasi kutub auksin dapat dibagi menjadi dua proses
utama: masuknya IAA dan penghabisan IAA. Sesuai dengan model chemiosmotic untuk
transportasi kutub, ada dua mode masuknya IAA: oleh pasif yang tergantung-pH
pengangkutan bentuk yang tidak terkait, atau dengan H aktif mekanisme transpor didorong
oleh membran plasma H + -ATPase.

penghabisan auksin diduga terjadi secara istimewa pada ujung basal sel pengangkut
melalui pembawa anion efflux dan digerakkan oleh potensial membran yang dihasilkan oleh
membran plasma H + -ATPase. Auksin inhibitor (ATI) dapat mengganggu transportasi
auksin secara langsung dengan bersaing dengan auksin untuk pori saluran eflux atau dengan
mengikat protein pengatur atau struktural yang terkait dengan saluran eflux. Auksin dapat
diangkut secara nonpolar di floem.

Pemanjangan sel yang diinduksi auksin dimulai setelah jeda waktu sekitar 10 menit.
Auksin meningkatkan pertumbuhan pemanjangan terutama dengan meningkatkan
ekstensibilitas dinding sel. Pelonggaran dinding yang diinduksi auksin memerlukan input
metabolisme yang terus menerus dan sebagian ditiru dengan pengobatan dengan buffer asam.