JURNAL FARMASI UDAYANA

VOLUME IV, NOMOR 1, JULI 2015

VOLUME IV
NOMOR 1
HALAMAN 1 - 103
EDISI JULI 2015

PENERBIT JURUSAN FARMASI FMIPA UNIVERSITAS UDAYANA

BUKIT JIMBARAN - BALI
 JURNAL FARMASI UDAYANA
INFORMASI BAGI PENULIS
DAFTAR ISI

• Deskripsi
• Pembaca
• Editor
• Petunjuk Penulisan

 
DESKRIPSI
Jurnal Farmasi Udayana merupakan jurnal elektronik yang dikelola oleh jurusan
Farmasi FMIPA Udayana. Jurnal ini yang merupakan media publikasi penelitian
dan review article pada semua aspek ilmu farmasi yang bersifat inovatif , kreatif,
original dan didasarkan pada scientific. Artikel yang dimuat dalam jurnal ini
meliputi penemuan obat, sistem penghantaran obat serta pengembangan obat.
Jurnal ini memuat bidang khusus di farmasi seperti kimia medisinal, farmakologi,
farmakokinetika, farmakodinamika, analisis farmasi, sistem penghantaran obat,
teknologi farmasi, bioteknolofi farmasi, obat herbal dan komponen aktif tanaman
serta evaluasi klinik obat.

PEMBACA
Ilmuwan di bidang kimia medisinal, farmasetika dan biofarmasetika,
farmakologi, kimia analisis, farmakologi klinik, mikrobiologi, bioteknologi, kimia
dan statistika

EDITOR
Penanggungjawab : Dr.rer.nat. I M.A.G. Wirasuta, M.Si., Apt
Ketua Dewan Redaksi : Cokorda Istri Sri Arisanti, S.Farm, M.Si., Apt
Wakil Dewan Redaksi : Ni Kadek Warditiani, S.Farm., M.Sc., Apt
Anggota
Ni Nyoman Wahyu Udayani, S.Farm., M.Sc., Apt
Ni Made Widi Astuti, S.Farm., M.Si.
Mitra Bestari:
Ketua : Drs. I N.K. Widjaja , M.Si., Apt
Wakil Ketua : Luh Putu Febryana Larasanty, S.Farm.,M.Sc., Apt
Anggota:
a. Ni PutuAriantari, S.Farm., M.Farm., Apt (Biologi Farmasi)
b. Ni Putu Ayu Dewi Wijayanti, S.Farm., M.Si., Apt (Teknologi Farmasi)
c. I G. N. Agung Dewantara, S.Farm., M.Sc., Apt (Teknologi Farmasi)
d. Rasmaya Niruri, S.Si., M.Farm.Klin., Apt (Biomedik dan Farmakologi)
e. Ni Made Pitri Susanti, S.Farm., M.Si. Apt (Kimia Farmasi)

EMAIL
jurnalfarmasiudayana@gmail.com

INFORMASI UNTUK PENULIS JULI 2015   i 
 
PETUNJUK PENULISAN

PENDAHULUAN

Naskah yang diajukan ke jurnal harus memenuhi persyaratan sebagai berikut: (1)
topik artikel akan melewati proses review terlebih dahulu oleh editor, dan (2)
artikel belum dipublikasikan atau akan dipublikasikan seluruhnya atau sebagian di
jurnal lain atau media publikasi yang lain.

Tipe artikel

Artikel hasil penelitian

Review article

Naskah review article harus memuat: judul, abstrak dan kata kunci (3-6 kata),
pendahuluan, pembahasan khusus oleh penulis, kesimpulan, ucapan terima kasih,
daftar pustaka, gambar dan tabel. Tiap pokok bahasan dari pendahuluan sampai
kesimpulan harus diberi nomor. Sub pokok bahasan juga harus dinomori dengan
1.1., 1.2., 1.3., dan seterusnya. Setiap halaman harus diberi nomor dan judul harus
diberi halaman 1.

FAKTOR YANG HARUS DIPERHATIKAN

Conflict of interest
Semua penulis wajib menghindari terjadinya Conflict of interest yang meliputi
pembiayaan atau hubungan dengan orang lain atau badan paling lama tiga tahun
sebelum pengajuan artikel ke jurnal yang dapat mempengaruhi secara langsung
maupun tidak langsung penelitian yang bersangkutan

Contoh hal yang potensial menyebabkan Conflict of interest antara lain pekerja,
konsultan, kepemilikan bahan, honor, pengajuan registrasi/paten, hibah atau
sumber dana yang lain.

Verifikasi Artikel
Artikel yang diajukan ke Jurnal Farmasi Udayana belum pernah dipublikasikan
sebelumnya (kecuali dalam bentuk abstrak atau sebagai bagian dari skripsi), tidak
dalam posisi akan diterbitkan pada jurnal lain, artikel telah mendapat persetujuan
semua penulis yang tercantum di dalam artikel yang bersangkutan dan secara
eksplisit telah mendapat persetujuan dari tempat dimana penulis melakukan
penelitian dan jika diterima, artikel tidak dipublikasikan di tempat lain dalam
bentuk yang sama dalam bahasa Indonesia atau bahasa lainnya untuk menghindari
plagiarisme

Konstribusi
Semua penulis harus berpartisipasi di dalam penelitian dan atau penyipan naskah,
sehingga fungsi dari masing-masing penulis harus didefinisikan.

INFORMASI UNTUK PENULIS JULI 2015   ii 
 
Kepemilikan artikel
Semua penulis harus memiliki peran penting pada setiap tahap pengajuan artikel
yang meliputi: (1) konsep dan desain penelitian, pengolahan data atau
menganalisis atau menginterpretasi data, (2) memperbaiki naskah, (3) menyetujui
draf akhir yang akan dipublikasikan

Perubahan penulis
Pada jurnal ini dimungkingkan untuk menambahkan, pengurangi, mengubah
urutan penulis untuk naskah yang diterima. Hal-hal yang perlu dilakukan antara
lain: membuat permintaan untuk dapat menambahkan, mengurangi atau
mengubah urutan penulis kepada pengelola jurnal yang diajukan oleh
corresponding author yang dicantumkan di dalam naskah yang diajukan dan
meliputi: (a) alasan mengapa nama penulis harus ditambahkan, dikurangi atau
diubah susunannya (b) konfirmasi tertulis (e-mail, fax, surat) dari semua penulis
yang menyatakan persetujuan dengan perubahan tersebut di atas

Bahasa
Penulisan menggunakan bahasa Indonesia sesuai ejaan yang disempurnakan.

PERSIAPAN
Penggunaan program miscrosoft word. File dibuat dalam format asli
menggunakan program miscrosoft word. Teks harus dibuat dalam format satu
kolom, huruf font Times new roman 11, 1 spasi, ditulis dalam kertas ukuran A4.

Struktur Artikel
Sub pokok bahasan-penomoran
Artikel dibagi menjadi pokok bahasan dengan penomoran yang jelas. Sub pokok
bahasan harus diberi nomor 1.1 (kemudian 1.1.1, 1.1.2,...), 1.2 dan seterusnya.
Abstrak tidak dimasukkan dalam sistem penomoran.

Pendahuluan
Nyatakan tujuan dan landasan penelitian, hindari tinjauan pustaka yang terperinci
atau kesimpulan dari hasil penelitian

Bahan dan metode

Ungkapkan bahan dan metode secara terperinci untuk kemungkinan keterulangan
penelitian. Metode yang umum digunakan cukup menunjukkan sumber pustaka,
hanya modifikasi yang relevan yang harus dideskripsikan

Hasil
Pengungkapan hasil harus jelas dan ringkas

Pembahasan
Bagian ini harus merupakan kajian mendalam dari hasil penelitian, jangan
mengulang pengungkapan hasil. Hindari kutipan dan pembahasan yang berlebihan
dari penelitian sebelumnya

INFORMASI UNTUK PENULIS JULI 2015   iii 
 
Kesimpulan
Kesimpulan utama dari penelitian sebaiknya ditampilkan dalam kalimat yang
singkat dan jelas, yang dapat menjadi bagian tersendiri di dalam pokok bahasan
kesimpulan atau menjadi bagian dari pembahasan atau hasil

Appendik

Jika apendik lebih dari satu maka harus dibuat sebagai A, B dan seterusnya.
Persamaan matematika harus diberi nomor terpisah: Pers. (A.1), Pers. (A.2) dan
seterusnya. Hal yang sama juga berlaku untuk tabel dan gambar: Tabel A.1;
Gambar. A.1

Informasi penting dalam struktur artikel

Judul
Ringkas, jelas dan informatif. Jika dimungkinkan hindari pencantuman persamaan
matematika dan singkatan

Nama penulis dan institusi

Ungkapkan institusi tempat bekerja (tempat dimana penelitian dilakukan) di
bawah nama penulis. Tunjukkan institusi penulis dengan supercript di belakang
nama penulis dan didepan nama institusi. Tuliskan alamat lengkap termasuk kode
pos dan nama kota, jika perlu disertakan alamat email masing-masing penulis

Alamat korespondensi
Tunjukkan dengan jelas siapa yang bertanggung jawab terhadap korespondensi
semua tahap dari pengajuan, revisi, publikasi maupun sampai pasca publikasi.
Cantumkan nomor telepon disamping alamat email, kode pos. Kontak terperinci
harus tetap diperbaharui oleh korespondensi penulis

Alamat penulis
Jika alamat penulis berbeda dibandingkan dengan tempat penelitian semula, maka
alamat terbaru atau tetap penulis sebagai catatan kaki dari nama penulis. Alamat
dimana penelitian semula dilakukan oleh penulis tetap digunakan sebagai alamat
utama. Penulisan catatan kaki untuk alamat terbaru maupun alamat tetap
menggunakan supercrip dengan penomoran Arabic

Abstrak
Dibutuhkan abstrak yang jelas, ringkas dan sesuai fakta penelitian. Abstrak harus
menunjukan tujuan penelitian secara tegas, hasil yang penting dan kesimpulan
umum. Untuk memenuhi persyaratan abstrak ini, disarankan untuk tidak
menyertakan tinjauan pustaka, tetapi jika sangat diperlukan wajib mengutip nama
penulis dan tahun. Disamping itu dihindari pencantuman singkatan yang tidak
umum tetapi jika sangat diperlukan maka harus dijelaskan pada awal abstrak itu
sendiri

Gambar
Gambar harus dibuat untuk menyimpulkan isi dari artikel secara jelas untuk dapat
menarik perhatian pembaca yang berasal dari berbagai bidang yang berhubungan

INFORMASI UNTUK PENULIS JULI 2015   iv 
 
dengan farmasi. Gambar harus dibuat dalam bagian terpisah dari artikel. Ukuran
gambar: sediakan gambar dengan minimal setara 531x1328 pixel atau lebih, tetapi
dapat tetap terbaca pada layar 200x500 pixel (pada 91 dpi yang sama dengan 5
x13 cm). Program yang digunakan dapat berupa pdfatau MS Word

Kata kunci
Kata kunci maksimal 6 kata diletakkan langsung di bawah abstrak, hindari
penggunaan frase dan penghubung (dan, dari dan sebagainya)

Singkatan
Deskripsikan singkatan yang tidak umum sebagai catatan kaki pada halaman
pertama artikel. Singkatan yang menjadi keharusan untuk diungkapkan pada
abstrak diwajibkan didefinisikan pada bagian sebelum singkatan tersebut ditulis.
Penulisan singkatan harus konsisten pada seluruh artikel.

Ucapan terima kasih

Cantumkan ucapan terima kasih pada bagian terpisah di bagian akhir artikel
sebelum daftar pustaka, hindari penyertaan ucapan terima kasih pada judul,
sebagai catatan kaki judul atau bagian artikel lainnya. Buatlah rincian orang yang
berkontribusi di dalam penelitian (penerjemah, pengetik atau pembaca dan lain
sebagainya)

Unit
Gunakan satuan internasional (SI). Jika satuan diungkapkan dalam unit yang
berbeda, sebaikknya diungkapkan kesetaraan dengan SI

Tabel
Penomoran tabel diurut berdasarkan urutan munculnya di dalam artikel. Tabel
dibuat dengan tiga garis horisontal, hindari penggunaan garis vertikal dan data
yang diungkapkan di dalam tabel tidak diungkapkan berulang pada bagian lain
dari artikel

Daftar pustaka
Pastikan daftar pustaka tercantum di dalam artikel. Hasil yang belum
dipublikasikan dan personal communication tidak direkomendasikan dimasukkan
di dalam daftar pustaka. Pustaka yang ditandai dengan In Press menunjukan
bahwa artikel tersebut telah disetujui untuk dipublikasikan dan dapat digunakan
sebagai sumber pustaka. Penulisan pustaka mengikuti aturan penulisan pustakan
jurnal ini.

Aturan penulisan pustaka

Daftar pustaka harus diurut berdasarkan alfabetis dan kronologi. Jika terdapat
lebih dari satu sumber yang berasal dari penulis yang sama pada tahun yang sama,
maka harus ditambahkan a, b, c dan seterusnya di belakang tahun terbit.

Penulisan buku
Penulis, A.A., Penulis, B.B., & Penulis, C.C. (tahun terbit). judul buku: sub judul.
(Edisi [jika bukan edisi pertama}). tempat terbit: penerbit

INFORMASI UNTUK PENULIS JULI 2015   v 
 
Contoh:
Buku dengan satu penulis
Nama penulis (tanpa singkatan). (tahun terbit). judul buku. Tempat terbit: penerbit
Reynords Hadi. (2000). Black pioners. Ringwood,Vic: Penguin

Buku dengan banyak penulis

Dua-enam penulis
Dua penulis: kedua penulis. (tahun terbit). judul buku. Tempat terbit: penerbit
Gilbert, R., & Gilbert, P. (1998). Maculinity goes to school. St. Leonards, N.S.W.:
Allen & Unwin
Lebih dari 6 penulis
Setelah nama dan singkatan nama penulis ke-enam gunakan dkk

Buku yang memiliki editor

Broinowski, A. (Ed.) (1990). ASEAN into 1990s. London: Macmillan
Nugent, S.L., Shore, C. (Eds.). (1997). Anthropologyband cultural study. London:
Pluto Press

Buku yang memiliki penulis dan editor

Valery, P. (1957). Oeuvres (J. Hytier, Ed). Paris: Gallimard

Bab yang terdapat di dalam buku

Penulis, singkatan nama penulis. (tahun terbit). judul bab:sub judul. editor. judul
buku. (hal. x-y). tempat terbit: penerbit

Artikel jurnal
Penulis, singkatan nama penulis. (tahun terbit). judul artikel. singkatan jurnal,
volume (issue), halaman

Skipsi/Tesis/Disertasi
Nama penulis, singkatan nama penulis. (tahun terbit). judul. skrispi/tesis/disertasi.
Universitas, kota

Sumber penulisan singkatan jurnal

Index Medicus journal abbreviations: http//www.nlm.nih.gov/tsd/serials/lji.html
List of titlle word abbreviations: http//www.issn.org/2-22661-LTWA-online.php
CAS (Chemical Abstract Service): http//www.cas.org/sent.html

Submission checklist
Daftar isian di bawah ini dapat digunakan untuk memudahkan pemeriksaan akhir
sebelum artikel dikaji oleh editor.
Satu orang penulis ditunjuk sebagai corresponding author:
• alamat email
• kode pos
• nomor telepon atau fax
Semua file yang dibutuhkan telah diupload
• Kata kunci
• Gambar

INFORMASI UNTUK PENULIS JULI 2015   vi 
 
 • Tabel (termasuk judul, deskrispi, catatan kaki)
Hal selanjutnya yang harus diperhatikan
• Gunakan penomoran baris (tiap 5 baris) untuk memudahkan pengkajian
naskah
• Naskah telah dicek tata bahasa dan pengucapannya
• Pustaka telah ditulis sesuao format di dalam jurnal ini
• Semua pustaka yang ditulis di dalam daftar pustaka disinggung di dalam
teks
• Izin telah didapat dari untuk materi yang memiliki hak cipta yang berasal
dari sumber lain (termasuk web)

SETELAH ARTIKEL DITERIMA

Perbaikan
Naskah yang telah dikoreksi akan dikirimkan kembali dalam bentuk pdf kepada
corresponding author (melalui alamat email) sehingga penulis dapat mengunduh
untuk keperluan pribadi. Gunakan perbaikan ini untuk mengecek urutan
penulisan, mengedit, menyempurnakan dan memperbaiki tulisan, tabel dan
gambar. Pengiriman naskah yang telah diperbaiki menyertakan koreksi pertama
dari editor ini. Perubahan signifikan dari artikel yang disetujui untuk
dipublikasikan dalam jurnal ini harus mendapat persetujuan dari penerbit. Kami
akan berusaha untuk mempublikasikan artikel anda akurat dan cepat sehingga
diharapkan kami menerima hasil koreksi anda paling lambat 5 hari kerja. Sangat
penting koreksi artikel dilakukan dalam satu kali komunikasi sehingga cermati
hal-hal yang harus dikoreksi sebelum dikirimkan kembali ke editor jurnal.

Naskah yang dipublikasikan

Artikel akan diberikan kepada corresponding author dalam bentuk pdf melalui
email. Penulis akan menerima artikel sesuai format yang terbit di dalam jurnal dan
disertai dengan cover jurnal.

INFORMASI UNTUK PENULIS JULI 2015   vii 
 
DAFTAR ISI

hal
Halaman Judul …………………………………………………………………………..... i
Deskripsi Jurnal Farmasi Udayana .................................................................................... i
Petunjuk Penulisan ........................................................................................................... ii
Daftar Isi ………………………………………………………………………………….. viii
Lembar Abstrak …………………………………………………………………………. ix

1 Isolasi dan Identifikasi Bakteri Asam Laktat Pada Teh Kombucha Lokal Bali ……… 1
2 Pengaruh Waktu Sentrifugasi Krim Santan Terhadap Kualitas Virgin Coconut Oil
(VCO) ………………………………………………………………………………… 4
3 Anti Aterosklerosis Andrografolid dari Sambiloto melalui Mekanisme Antiinflamasi
secara In Silico………………………………………………………………………. 8
4 Uji Aktivitas Chelating Logam Ion Besi Minuman Gambir Kombucha Lokal Bali
Secara In Vitro yang Berpotensi Untuk Pengobatan Alzheimer ……………………… 13
5 Pengaruh Pemberian Ekstrak Etanol Kulit Kacang Tanah Dengan Metode Maserasi
Terhadap Profil Lipid Pada Tikus Sprague Dawley Diet Lemak Tinggi …………… 18
6 Pengaruh Madu Jamur Terhadap Penurunan Kadar Glukosa Darah Mencit Jantan … 26
7 Data Tanaman Dan Pengobatan Pada Lontar Usada Rare ………………………… 29
8 Uji Aktivitas Vermisidal Ekstrak Etanol Biji Lamtoro (Leucaena leucocephala
(Lam.) de Wit) Pada Cacing Gelang Babi (Ascaris suum Goeze) Secara In Vitro …… 33
9 Pengaruh Karakteristik Responden Terhadap Minat Beli Produk Sampo Anjing
Pengunjung Pet Shop Wilayah Badung ……………………………………………. 38
10 Uji Iritasi Gelling Agent Semi Sintetik HPMC pada Kelinci ………………………… 42
11 Pengaruh Kombinasi Asam Oleat dan Minyak Atsiri Bunga Kamboja Cendana
(Plumeria alba) sebagai Permeation Enhancer terhadap Karakter Fisik dan
Pelepasan Ketoprofen dari Matriks Patch Transdermal ……………………………. 46
12 Suplementasi Probiotik Terhadap Konsistensi Feses, Frekuensi dan Durasi Diare
Akut pada Anak di RSUP Sanglah …………………………………………………. 55
13 Pengaruh Pemberian Ekstrak Etanol 70% Daun Singkong (Manihot utilissima Pohl)
terhadap Kadar Gula Darah Mencit Jantan Galur Balb/C yang Diinduksi Aloksan … 61
14 Pemberian Ekstrak Etanol Daun Kedondong Hutan Meningkatkan Berat Ginjal
Mencit Jantan Galur Balb/c ………………………………………………………… 65
15 Pengaruh Pemberian Ekstrak Etanol Daun Spondias pinnata terhadap Berat Badan
Mencit Betina Galur Balb/c selama Kebuntingan ………………………………… 68
16 Angka Kejadian Anemia pada Pasien Anak Penderita HIV/AIDS di RSUP Sanglah 72
Denpasar ……………………………………………………………………………..
17 Potensi lactobacillus sp. yang Diisolasi dari Susu Kuda Sumbawa dalam Mengontrol
Candida albicans Penyebab Kandidiasis …………………………………………. 78
18 Uji Aktivitas Vermisidal Ekstrak Etanol Daun Lamtoro (Leucaena leucocephala
(Lam.) de Wit) Pada Cacing Gelang Babi ………………………………………….. 83
19 Hasil Skor Indeks Iritasi Primer Natrium Lauril Sulfat 1% sebagai Bahan Baku
Deterjen Sintetik …………………………………………………………………… 87
20 Identifikasi Mutasi Gen rpoB Pada Daerah Hulu RRDR Mycobacterium Tuberculosis
Multidrug Resistent Isolat P10 ……………………………………………………… 90
21 Uji Aktivitas Anti Cacing dengan Ekstrak Etanol Buah Mengkudu (Morinda
citrifolia linn.) pada Cacing Gelang Babi …………………………………………… 95
22 Profil Stabilitas Fisika Kimia Masker Gel Peel-Off Ekstrak Kulit Buah Manggis
(Garcinia mangostana L.)…………………………………………………………… 99

INFORMASI UNTUK PENULIS JULI 2015   viii 
 
 Anti Aterosklerosis Andrografolid dari Sambiloto melalui Mekanisme Antiinflamasi secara In Silico
(Susanti, N. M. P., Laksmiani, N. P. L., Warditiani, N. K., Sunariyani, P. E. A.)

Anti Aterosklerosis Andrografolid dari Sambiloto melalui Mekanisme

Antiinflamasi secara In Silico

Susanti, N. M. P.1, Laksmiani, N. P. L.1, Warditiani, N. K.1, Sunariyani, P. E. A.1

1
Jurusan Farmasi Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Udayana

Korespondensi: Putu Eka Ayu Sunariyani

Jurusan Farmasi Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Udayana
Jalam Kampus Unud-Jimbaran, Jimbaran-Bali, Indonesia 80364 Telp/Fax: 703837
Email: eka.sunariyani37@gmail.com

ABSTRAK
Andrografolid merupakan senyawa yang banyak terkandung dalam sambiloto (Andrographis
paniculata (Burm.f Ness) yang memiliki aktivitas antiinflamasi. Adanya respon inflamasi kronis pada
sel endotel yang mampu menimbulkan pembentukan dan penebalan plak di dinding pembuluh darah
disebut aterosklerosis, yang merupakan penyebab penyakit kardiovaskuler. Salah satu mekanisme
menghambat aktivitas inflamasi pada aterosklerosis dapat dilakukan terhadap protein nuclear factor-
κappa Beta (NF-κß).
Docking molecular dilakukan dengan menggunakan program Autodock 4.2 yang meliputi
penyiapan database protein dan struktur 3D andrografolid, preparasi protein, validasi metode docking
molecular, optimasi struktur 3D andrografolid, docking molecular andrografolid terhadap protein NF-
κß dengan parameter energi ikatan. Semakin rendah energi ikatan, maka ikatan antara andrografolid
dengan protein semakin kuat dan stabil.
Hasil yang diperoleh andrografolid memiliki aktivitas antiinflamasi karena mampu
menghambat protein NF-κß dengan energi ikatan -6,49 kkal/mol yang membentuk ikatan hidrogen
pada asam amino Arg416, Cys533. Energi ikatan andrografolid yang mendekati dengan energi ikatan
native ligand BLZ sebesar -8,58 kkal/mol pada protein NF-κß menunjukkan andrografolid mampu
berikatan dengan protein NF-κß, sehingga andrografolid dapat mencegah pembentukan plak di
pembuluh darah pada aterosklerois.

Kata kunci : andrografolid, anti aterosklerosis, mekanisme, antiinflamasi, NF-κß

1. PENDAHULUAN selektin (Endotelial Selektin) yang akan

Aterosklerosis atau pembentukan plak di
dinding pembuluh darah, merupakan faktor
resiko terjadinya PJK (Penyakit Jantung
Koroner). Aterosklerosis diawali dengan
masuknya low density lipoprotein (LDL) ke
dalam lapisan pembuluh darah (lapisan
intima). Adanya LDL pada bagian intima akan
menyebabkan sel endotel mengalami inflamasi
kronis sehingga homeostatis sel endotel akan
hilang, sehingga endotel akan teraktivasi
menghasilkan proinflamasi sitokin[3].
Proinflamasi sitokin meliputi monosit,
makrofag, interferon-ɣ, interleukin-1,
interleukin-6, nitrat oksida dan tumor necrosis
factor-a (TNF-a) yang mampu mengaktifkan
jalur protein NF-κß (Francis and Pierce, 2011;
Tedgui and Mallat, 2006)
Teraktivasi jalur NF-κß akan meningkatkan
ekspresi gen proinflamasi seperti VCAM-1
(Vascular cell adhesion molecule-1), ICAM-1
(Intercellular Adhesion Molecule-1) dan E-
menimbulkan inflamasi(Warboys, 2011).
Dengan adanya respon inflamasi akan memicu
leukosit untuk menempel pada sel endotel
sehingga permeabilitas sel endotel akan
meningkat. Meningkatnya permeabilitas sel
endotel menyebabkan monosit akan bermigrasi
ke daerah intima dan berdiferensiasi menjadi
makrofag untuk menfagositosis LDL yang ada
pada sel endotel, kemudian membentuk sel
busa. Terbentuknya sel busa akan
mengaktivasi sel otot polos halus bermigrasi
dari bagian media ke intima dan berproliferasi
menjadi jaringan fibrous, sehingga akan
terbentuk plak di pembuluh darah[5].
Sambiloto (Andrographis paniculata
(Burm.f) Ness) adalah tanaman banyak
dimanfaatkan untuk pengobatan.
Andrografolid adalah salah satu senyawa
golongan diterpen lakton yang kandungannya
besar pada tanaman sambiloto (Sundowo and
Kardono, 2002). Beberapa penelitian telah

8
Anti Aterosklerosis Andrografolid dari Sambiloto melalui Mekanisme Antiinflamasi secara In Silico
(Susanti, N. M. P., Laksmiani, N. P. L., Warditiani, N. K., Sunariyani, P. E. A.)
menunjukkan aktivitas andrografolid yakni
andrografolid secara signifikan mampu
menghambat agregasi platelet yang
menginduksi trombin dengan menghambat
protein ERK1, ERK2 (Extracellular signal-
regulated kinase1/2) (Chao, 2010).
Docking molecular adalah suatu metode
yang digunakan dalam kimia komputasi dan
desain obat dengan bantuan komputer.
Tujuannya untuk memprediksi orientasi ikatan
ligan dan afinitas ikatan di dalam interaksi
ligan-protein pada struktur 3 dimensinya
(Morris, 2007). Keuntungan penelitian desain
obat dengan menggunakan metode docking
molecular secara in silico adalah bahwa proses
ini secara fisik lebih dekat dengan apa yang
terjadi pada kenyataan (farmakodinamik),
ketika protein dan ligan mendekati satu sama
lain setelah pengikatan molekul (Mukesh and
Rakesh, 2011).
Berdasarkan latar belakang tersebut, pada
penelitian ini akan dilakukan docking
molecular andrografolid dari Andrographis
paniculata terhadap protein yang memicu
pembentukan plak di pembuluh darah pada
aterosklerosis untuk mengetahui mekanisme
dan afinitas andrografolid dengan protein NF-
κß menggunakan program komputasi
Autodock 4.2, melalui proses docking secara
in silico.
2. BAHAN DAN METODE
2.1 Program yang digunakan
Cygwin, Autodock 4.2, Hyperchem 8 dan
chimera 1.10.1.
2.2 Preparasi Protein NF-κß
Konformasi protein NF-ĸß dicari dari
protein database. Native ligand dihilangkan
dengan program Chimera 1.10.1 untuk
menyediakan ruang (pocket/cavity), sehingga
diketahui bentuk pocket, koordinat pocket,
binding site center dan radius cavity sebagai
bahan docking.
2.3 Optimasi senyawa uji Sambiloto
(Andrografolid)
Struktur senyawa uji dioptimasi dengan
menggunakan program Hyperchem 8.
Optimasi juga dilakukan pada struktur tiga
dimensi senyawa lengkap dengan atom
hidrogennya.
2.4 Validasi metode docking molecular
Validasi metode docking molecular
dilakukan menggunakan program Autodock
9
4.2 dengan men-docking-kan kembali native
ligand pada protein.
2.5 Docking Andrografolid pada NF-ĸß
Senyawa uji andrografolid di-docking-kan
pada protein menggunakan program Autodock
4.2. Hasil analisis akan menunjukkan senyawa
dengan konformasi yang mana yang memiliki
energi terendah untuk berikatan dengan
protein target.
2.6 Analisis Data
Analisis dilakukan terhadap energi ikatan
yang dihasilkan dari docking molecular.
Nilai energi ikatan menunjukkan kekuatan
ikatan antara senyawa dan reseptor. Semakin
rendah energi ikatan, maka ikatannya
semakin kuat dan stabil. Sebaliknya, semakin
tinggi energi ikatan, maka ikatannya semakin
lemah dan tidak stabil. Jika energi ikatan
antara andrografolid dengan NF-κß semakin
kecil, maka semakin besar interaksi yang
terjadi kuat ikatan antara andrografolid
dengan NF-ĸß, sehingga andrografolid
berpotensi sebagai penghambat aksi NF-kB
dalam proses inflamasi harapannya dapat
mencegah penumpukan plak-plak lemak
pada ateroskerosis
3. HASIL
3.1 Preparasi Protein NF-κß
Protein NF-κß diunduh dari
http://www.rcsb.org/pdb/home /home.do
dengan ID 4IDT. Struktur 3 dimensi protein
NF-κß ID 4IDT ditampilkan pada gambar 1.
Preparasi dilakukan dilakukan dengan
menggunakan program Chimera 1.10.1.
sehingga diperoleh protein tanpa ligan dan
native ligand yang ditampilkan pada gambar 2.
Gambar 1. Struktur 3 dimensi protein NF-κß
ID 4IDT
 Anti Aterosklerosis Andrografolid dari Sambiloto melalui Mekanisme Antiinflamasi secara In Silico
(Susanti, N. M. P., Laksmiani, N. P. L., Warditiani, N. K., Sunariyani, P. E. A.)

A B 3.4 Docking Andrografolid pada NF-ĸß

Docking andrografolid dilakukan pada
protein NF-ĸß dengan menggunakan program
Autodock 4.2, dan pengaturan koordinat
dilakukan sesuai dengan koordinat native
ligand. Hasil docking andrografolid dengan
protein NF-ĸß ditampilkan pada tabel 2.
Tabel 2. Hasil Validasi docking molecular NF-
ĸß dengan andrografolid

Gambar 2. Struktur protein tanpa ligan (A) dan Protein Konfor Energi Ikatan
native ligand (B) masi Ikatan(kkal/mol) Hidrogen
3.2 Optimasi senyawa uji Sambiloto 1 -6,18 Arg416
(Andrografolid) Cys533
Struktur 3 dimensi senyawa andrografolid 2 -6,49 Arg416
diunduh dari https://pubchem.ncbi.nlm.nih. Cys533
gov/com- pound /5318517. 3 -5,06 Leu406
4 -6,15 Cys533
NF-ĸß 5 -4,89 Leu406
6 -5,18 Leu406
7 -5,78 Cys533
8 -4,73 Leu472
9 -6,09 Arg416
10 -4,79 Leu406

Gambar 3. Struktur 3 dimensi andrografolid

teroptimasi
3.3 Validasi metode docking molecular
Validasi metode docking molecular
dilakukan dengan me-redocking-kan kembali
protein tanpa ligan dengan native ligand yang
telah dipreparasi sebelumnya dengan
menggunakan program Autodock 4.2. Hasil
Validasi docking molecular NF-ĸß dengan
native ligand BLZ ditampilkan pada tabel 1.
Hasil menunjukkan nilai Root mean square
distances (RMSD) heavy atoms native ligand Gambar 4. Interaksi andrografolid dengan
< 3 Å yang dibandingkan dengan referensi. protein NF-ĸß
Tabel 1. Hasil Validasi docking molecular NF-
ĸß dengan native ligand BLZ 4. PEMBAHASAN
Protein Konfor RMSD Energi Ikatan Preparasi protein NF-ĸß bertujuan untuk
masi Ikatan(kkal/mol) Hidrogen memisahkan protein dan native ligandnya agar
1 0,40 -8,54 Glu470 tersedia ruang (pocket/cavity) saat proses
2 0,33 -8,50 Glu470 docking. Pada preparasi protein dilakukan
3 0,47 -8,58 Glu470 penghilangan terhadap molekul air (H2O) dan
4 0,61 -8,47 Glu470 native ligandnya bertujuan untuk menyisakan
5 0,57 -8,53 Glu470 asam amino protein agar tidak menghalangi
NF-ĸß 6 0,57 -8,52 Glu470 penambatan senyawa uji yang ingin di-
7 0,40 -8,50 Glu470 docking-kan (Francis and Pierce, 2011;
8 0,44 -8,57 Glu470 Mukesh and Rakesh, 2011).
9 0,33 -8,50 Glu470 Optimasi senyawa uji andrografolid
dilakukan dengan menggunakan metode
10 0,42 -8,57 Glu470
semiempiris AM1 pada program Hyperchem

10
 Anti Aterosklerosis Andrografolid dari Sambiloto melalui Mekanisme Antiinflamasi secara In Silico
(Susanti, N. M. P., Laksmiani, N. P. L., Warditiani, N. K., Sunariyani, P. E. A.)
8. Energi yang diperoleh dengan
meminimalisasi geometri yakni -5509,50
kkal/mol. Energi menunjukkan kekuatan
ikatan yang dibutuhkan untuk memutuskan
satu mol ikatan suatu spesi dalam keadaan gas.
Semakin rendah total energi molekul
andrografolid, maka semakin stabil struktur 3
dimensi andrografolid tersebut, karena
semakin besar energi yang dilepaskan ke
lingkungan sehingga reaksi berlangsung secara
eksoterm (Azam, 2012).
Validasi docking molecular bertujuan untuk
mengetahui metode docking yang digunakan
valid. RMSD (Root Mean Square Deviation)
adalah parameter yang menyatakan suatu
metode docking molecular valid. RMSD
merupakan suatu ukuran yang digunakan
untuk memprediksi perbedaan nilai antara
struktur kristalografi dengan ligan
eksperimental yang di-docking-kan pada
protein. Nilai RMSD sebesar 1-3 Å
menyatakan bahwa struktur kristal
eksperimental menyerupai dengan kristalografi
native ligand pada PDB (Protein Data Bank)
sehingga metode docking molecular sudah
valid dan akurat. Untuk mendapatkan keadaan
optimum dari ikatan hidrogen terhadap protein
dilakukan penambahan valensi molekul
dengan atom hidrogen (Fitriasari, 2009)
Suatu molekul post-docking dinyatakan
baik bila memenuhi syarat: mempunyai energi
ikatan paling rendah dan molekul berada
dalam active site yang sama dengan native
ligand protein (Diyah, 2013). Andrografolid
memberikan nilai energi ikatan yang lebih
besar dibandingkan dengan native ligand BLZ
terhadap protein NF-ĸß. Active site yang
terbentuk antara andrografolid dengan NF-ĸß
dan native ligand dengan NF-ĸß juga berbeda
dengan native ligand yaitu pada asam amino
Glu470. Namun, jika dilihat dari energi ikatan
yang terbentuk antara andrografolid dengan
protein NF-ĸß yaitu sebesar -6,49 kkal/mol
dan membentuk ikatan hidrogen pada asam
amino Arg416, Cys533 membuktikan bahwa
andrografolid mampu menghambat protein
NF-ĸß. NF-ĸß merupakan pemberi respon
inflamasi di sel endotel, sehingga
andrografolid dapat mencegah pembentukan
plak di pembuluh darah pada aterosklerosis
melalui mekanisme antiinflamasinya.
11
5. KESIMPULAN
Andrografolid mampu menghambat protein
NF-ĸß, sehingga andrografolid dapat
mencegah pembentukan plak di pembuluh
darah pada aterosklerosis melalui mekanisme
antiinflamasinya.
6. UCAPAN TERIMAKASIH
Penulis mengucapkan terimakasih kepada
DITJEN DIKTI atas bantuan biaya pada
penelitian ini, juga terima kasih kepada Evi,
Maitri, Indra, Redika, Andre dan tim analisis
forensik Unud atas bantuan teknis dalam
mempersiapkan program docking.
PUSTAKA
Azam, F., A. M. Madi, H. I. Ali. 2012.
Molecular Docking and Prediction of
Pharmacokinetic Properties of Dual
Mechanism Drugs that Block MAO-B and
Adenosine A2A Receptors for the
Treatment of Parkinson’s Disease. Journal
of Young Pharmacists, Volume 4, No 3.
Chao W.W., Y.H. Kuo, B.F. Lin. 2010.
Isolation and Identification of Bioactive
Compounds in Andrographis paniculata
(Chuanxinlian). Chinese Medicine 2010,
5:17.
Diyah, N. W., Siswandono, S. Hardjono, B. T.
Purwanto. 2013. Pemodelan Molekul dan
Hubungan Kuantitatif Struktur-Aktivitas
Sitotoksisk Turunan Benzoilurea sebagai
Antitumor. Berkala Ilmiah Kimia Farmasi,
Volume. 2 No. 2.
Fitriasari, A., N. K. Wijayanti, N. Ismiyati, D.
Dewi, W. Kundarto, B. S. A. Sudarmanto
dan E. Meiyanto. 2008. Studi Potensi
Kurkumin dan Analognya sebagai Selective
Estrogen Receptor Modulators (SERMs):
Docking Pada Resepto Esrogen ß.
Pharmacon, Volume. 9, No. 1.
Francis, A. A., and G. N Pierce. 2011. An
Integrated Approach for the Mechanisms
Responsible for Atherosclerotic Plaque
Regression. Experimental & Clinical
Cardiology, volume 16 No 3.
Morris, G.M. 2007. I get very high Reference
RMSD values in my DLG; what went
wrong?. Faq Autodock. Available at :
http://autodock.scripps.edu/faqs-help /fa
q/i-get-very-high-rms-ref-values-what-we
ntwrong/?searchterm= rmsd. Opened at :
20th April 2015.
Anti Aterosklerosis Andrografolid dari Sambiloto melalui Mekanisme Antiinflamasi secara In Silico
(Susanti, N. M. P., Laksmiani, N. P. L., Warditiani, N. K., Sunariyani, P. E. A.)

Mukesh, B. And K. Rakesh. 2011. Molecular Tedgui, A. and Z. Mallat.2006. Cytokines in

Doking: A Review. International Journal Atherosclerosis: Pathogenic and
of Research in Ayurveda & Pharmacy, Regulatory Pathways. Physiol Review,
volume 2 (6). volume 86.
Sundowo, S., Dewi, P., dan Kardono.2002. Warboys, C.M., N. Amini, A. de Luca and
Cara Mudah Isolasi Senyawa Paul C. 2011. The Role of Blood Flow in
Andrografolid dari Daun Sambiloto Determining the Sites of Atherosclerotic
(Andrographis paniculata).Prosiding Plaques. F1000 Medicine Reports, 3:5.
Seminar Tantangan DuniaKimia: 193-
198.Serpong.

12