ASAM NUKLEAT DAN

NUKLEOTIDA

Fransiska Ayuningtyas W.,M.Sc., Apt

Asam nukleat

• Merupakan bagian organisme hidup yg

sangat penting
• Membawa informasi genetika yang akan
diturunkan / ditransfer dr generasi ke
generasi. Semua informasi yg ada dlm sel 
DNA
• Ada 2 macam:
– Asam deoksiribonukleat : AND / DNA
– Asam ribonukleat : ARN / RNA
• Asam nukleat mrpk polimer nukleotida yg
dihubungkan dgn ikatan fosfodiester
• Terdiri dari 2 golongan :
– Ribonukleotida
– Deoksiribonukleotida
• Jenis nukleotida :
– Nama tergantung pada basanya
– Jumlah fosfat yang dimiliki

Adenin AMP, ADP, ATP, dAMP, dADP, dATP

Guanin GMP, GDP, GTP, dGMP, dGDP, dGTP
Sitosin CMP, CDP, CTP, dCTP, dCDP, dCTP
Timin TMP, TDP, TTP, -
Urasil UMP, UDP, UTP, dUMP, dUDP, dUTP
• Satu nukleotida terdiri atas 3 bagian yi gula berkarbon
5 (pentosa), basa organik heterosiklik (mengandung
karbon, nitrogen dan berbentuk datar) dan gugus
fosfat bermuatan negatif, yg membuat polimer bersifat
asam.

• Pada RNA gula pentosanya adalah ribosa,

sedangkan pada DNA gula pentosanya mengalami
kehilangan satu atom O pada posisi C nomor 2’
sehingga dinamakan gula 2’-deoksiribosa
• Nukleotida berbeda dengan nukleosida  karena
nukleosida tdk mempunyai gugus fosfat

• Sehingga kita sering menuliskan nukleotida

sebagai 
– Nukleosida monofosfat
– Nukleosida difosfat
– Nukleosida trifosfat
Tergantung pada jumlah fosfat yg dimiliki

• Deoksiribonukleotida ditulis dng tambahan “d” 

menunjukkan adanya gugus hidroksil pd atom C
nomer 2
DNA (DeoxyriboNucleic Acid )

• Dikenal sebagai materi genetik

• Merupakan komponen kromosom
• Merupakan polimer deoksiribonukleotida
yg dihubungkan dengan ikatan
fosfodiester
• Backbone (rangka) terdiri dr: gugus
fosfat dan gula yg saling berseling
• Memiliki orientasi 5’  3’ jk gugus fosfat
dr C5 berikatan dgn OH C3
• Didalam sel  dalam
jalin ganda (double
helix)
• Dimana gugus fosfat
berada di luar dan
basa nitrogennya di
dalam
•Susunan basa nitrogen pada
jalin ganda DNA  tidak
random

Guanin (G) – Sitosin (C)

Adenin (A) - Timin (T)

Antara basa nitrogen satu

dengan yang lain dihubungkan
dengan ikatan hidrogen

•Watson and Crick : replikasi

 sangat mungkin untuk
suatu DNA diperbanyak dg
informasi yg sama
• DNA di dalam sel
ditemukan  3 bntk
utama
– Bentuk B
– Bentuk A
– Bentuk Z

Perbedaanya ?
• seperti halnya protein, asam nukleat juga
mempunyai struktur primer, sekunder dan tersier
– asam nukleat mempunyai arah sense
- Mempunyai individualitas  ditentukan dari urutan
basa nitrogennya  disebut sebagai struktur primer
- Informasi genetik ada pada struktur primer

A C G T C

3’ 3’ 3’ 3’ ACGTC
3’
P P
P P P P OH
5’ 5’ 5’ 5’
5’
Struktur sekunder

• Double helix
– Watson n Crick  menjawab struktur 3D DNA dgn X-
ray diffraction pattern : hsl penelitian Rosalind
Franklin
– Mampu menyimpulkan bahwa :
• mempunyai struktur double helix
• dengan 10 basa setiap putaran
• putaran 360,
• basa Nitrogen A-T , G – C
• cekukan mayor and minor
• double helix memutar ke kanan
• self replication
Semikonservatif pd Replikasi DNA

Mekanisme pengkopian DNA

 melibatkan pembukaan
double helix
Setiap rantai menjadi pola /
templat untuk pita baru
• X-ray diffraction : ada 2 macam
• Yg telah diterjemahkan struktur 3 D nya : B
form
• Bentuk yang umum adalah B form
• A form  RNA double helix
– Gugus OH pd RNA  tidak
memungkinkan melipat lebih dekat 
membentuk A form yang lebih lebar
Dalam kondisi normal (kondisi fisiologis)  DNA relatif stabil
Kadang menjadi tidak stabil  krn proses2 replikasi,
transkripsi
• Disosiasi double helix DNA  denaturasi
– apabila DNA dipanaskan diatas melting
temperaturnya (Tm) maka double helix
akan terbuka
– Tm  tergantung pada rasio
(G+C)/(A+T)
– G/C content dapat dihitung dengan
(G+C) / (Total Basa N) x 100%
RNA

Ada 4 mcm

• Hn RNA
• mRNA
• rRNA
• tRNA
• snRNA
• hnRNA  heterogeonous nuclear RNA 
merupakan hasil transkripsi langsung dr DNA
• mRNA 
– telah mengalami proses posttranskripsi  menghilangkan
intron
 informasi genetik  dlm btk codon
(urutan 3 nukleotida)
• rRNA 
– Komponen ribosom dimana translasi berlangsung
• tRNA 
– Menerjemahkan kode genetik
– Menghubungkan antara asam nukleat dengan asam amino
 protein
• snRNA 
– Small nuclear RNA  membantu proses splicing dalam post
transkripsi proses
Fungsi biologis

• DNA sebagai
pembawa informasi
genetik
– DNA  komponen dr
kromosom
• Fungsi yang lain:
– Nukleotida sbg
pembawa energi
– Nukleotida sebagi
koensim
– enzim
Enzim...

• Nuklease  degradasi DNA/RNA

• DNA : deoksiribonuklease (Dnase)
• RNA: ribonuklease (Rnase)
• Endonuklease restriksi  bagian dari sistem
kekebalan DNA dalam bakteri  pelindung
masuknya DNA asing mengkatalisis
pemotongan untai ganda  DNA
terlindungi.