See discussions, stats, and author profiles for this publication at: https://www.researchgate.

net/publication/309674316

Biomolekuler Untuk Ilmu Kedokteran Dasar

Book · April 2016

CITATIONS READS

0 46,680

1 author:

Abdillah Imron Nasution

Syiah Kuala University
38 PUBLICATIONS   39 CITATIONS   

SEE PROFILE

Some of the authors of this publication are also working on these related projects:

n-HAP View project

All content following this page was uploaded by Abdillah Imron Nasution on 04 November 2016.

The user has requested enhancement of the downloaded file.

 KATA PENGANTAR

Biomolekuler merupakan integrasi antar berbagai ilmu terutama

biologi dan kimia yang diperlukan oleh setiap individu yang
bergerak di bidang kedokteran. Biomolekuler ini penting dalam
proses pembelajaran untuk menjadi profesional yang
berkompeten. Dengan mempelajari buku ini diharapkan
mahasiswa dapat memahami aspek molekuler secara terpadu
yang ditujukan untuk menjelaskan berbagai etiologi, patogenesis,
dan pemeriksaan penunjang sebagai dasar untuk menegakkan
diagnosis, prognosis penyakit dan menyusun rencana terapi.

Dengan materi yang terdapat di buku ini, maka diharapkan akan

lebih memahami penjelasan mengenai upaya sel dan jaringan
tubuh dalam mempertahankan homeostasis serta menjelaskan
mekanisme terjadinya kelainan dengan tidak melupakan
komponen-komponen yang berperan ditinjau dari aspek
biomolekuler. Ilmu-ilmu tersebut diperlukan untuk dapat
digunakan sebagai pola pikir dalam pengembangan pengetahuan
maupun menganalisis masalah-masalah di laboratorium dasar
maupun kasus-kasus yang mungkin ditemukan di klinik di masa
depan.

Banda Aceh, 14 April 2016

Abdillah Imron Nasution

i
 AKNOWLEDGEMENTS

Pada kesempatan ini, penulis mengucapkan terima kasih kepada

berbegai pihak yang telah mendukung terwujudnya buku ini
yaitu: Dekan Fakultas Kedokteran Gigi Universitas Syiah Kuala,
Teman-teman di Departemen Oral Biology, Departemen
Mikrobiologi Fakultas Kedokteran Gigi Universitas Syiah Kuala,
Departemen Radiologi Fakultas Kedokteran Gigi Universitas
Syiah Kuala Departemen Mikrobiologi Fakultas Kedokteran
Hewan Universitas Syiah Kuala, Fakultas Teknik Universitas
Syiah Kuala, Jurusan Fisika dan Kimia Fakultas MIPA
Universitas Syiah Kuala.

Terima kasih pula saya ucapkan atas peran serta mahasiswa

penulis dalam tim riset histopatologi Vivi Aramie danUlfatul
Husna yang sangat membantu penulis dalam menyelesaikan
buku biomolekuler untuk kedokteran dasar ini.

ii
DAFTAR ISI

KATA PENGANTAR ..................................................... i

AKNOWLEDGEMENTS .............................................. ii
DAFTAR ISI ...................................................................... iii
DAFTAR GAMBAR ........................................................ vii
DAFTAR TABEL ............................................................. viii

ASPEK BIOMOLEKULER LUKA DAN INFLAMASI

PENDAHULUAN ............................................... 1
Penyebab Luka ................................................................... 2
Macam-macam Luka ......................................................... 2
A. Luka Akut............................................................. 2
B. Luka Kronis ......................................................... 2
Penyembuhan Luka ........................................................... 3
1. Fase Koagulasi, Fibrinolisis dan Hemostatis .. 3
2. Fase Inflamasi ...................................................... 6
3. Fase Proliferasi .................................................... 7
4. Fase Maturasi ....................................................... 9
Leukosit dan Inflamasi ..................................................... 9
Netrofil dan Penyembuhan Luka ................................... 10
Gambaran Mikroskopis Netrofil ..................................... 12
Bahan Aktif Herbal dan Inflamasi .................................. 13
Hubungan Inflamasi, Imunologi, dan Osteoporosis .... 15
Daftar Pustaka .................................................................... 19

ASPEK BIOMOLEKULER ANGIOGENESIS

DAN PENYEMBUHAN

PENDAHULUAN ............................................... 22
Angiogenesis dan Kanker ................................................ 23
Angiogenesis dan Terapi Gen Kanker............................ 23
Angiostatin Sebagai Antiangiogenesis ............................ 25
Mekanisme Kerja Angiostatin .......................................... 26
1. Adenosine triphosphate (ATP) synthase .................. 27

iii
 2. Angiomotin .......................................................... 29
3. Integrin αvβ3 ....................................................... 30
Daftar Pustaka .................................................................... 33

TERAPI GEN ANTIANGIOGENIK

PENDAHULUAN ............................................... 37
Thrombospondin ............................................................... 37
Endostatin ........................................................................... 37
Tumstatin ............................................................................ 38
Arresten ............................................................................... 38
Canstatin .............................................................................. 39
Vastatin-Restin ................................................................... 39
Prolactin............................................................................... 39
Platelet Factor-4 (PF4) .............................................. 40
Interferon-inducible protein-10 ....................................... 40
Angiopoietins...................................................................... 40
Interleukin-12 ..................................................................... 40
Recombinant IL-12........................................................ 41
Interleukin-18 ..................................................................... 41
Interferons........................................................................... 41
Endothelial-monocyte activating polypeptide-II .......... 42
Tissue Inhibitors of Metalloproteinases ......................... 42
Tumor Necrosis Factor Alpha ......................................... 42
p53 ........................................................................................ 43
Vektor Terapi Gen ........................................................... 43
Daftar Pustaka .................................................................... 45

ASPEK BIOMOLEKULER AMELOBLASTOMA

PENDAHULUAN ............................................... 50
Etiologi dan Patogenesis ................................................... 50
Aspek Molekuler ................................................................ 52
1. Kelainan genetik .................................................. 52

iv
 2.
Acquired Factor (Faktor didapat) ........................ 54
3.
Radiasi ................................................................... 55
4.
Agen Kimia .......................................................... 58
5.
Imunosuppressive ............................................... 59
a. Interleukin..................................................... 59
b. TGF-ß ........................................................... 59
6. Senescence (Penuaan) ............................................. 60
Respon Imun pada Ameloblastoma................................ 61
a. Respon Imun Humoral ...................................... 61
b. Respon Imun Seluler .......................................... 62
1. Cytotoxic T Lymphocytes .......................... 62
2. Sel Thelper .................................................... 62
3. Antibody Dependent Cell
Mediated Cytotoxicity (ADCC)................. 63
4. Destruksi oleh sel NK ................................ 63
5. Destruksi oleh Makrofag ............................ 64
Daftar Pustaka ............................................................ 65

ASPEK BIOMOLEKULER VIRULENSI

Candida abicans

PENDAHULUAN ......................................... 68
Klasifikasi Jamur.............................................................. 69
a. Artrokonidia (artrospora .................................... 69
b. Blastokonidia (kiamidospora ............................. 69
c. Klamidokonidia (klamidospora ........................ 69
Infeksi Mikotik ................................................................... 69
Morfologi C. albicans .......................................................... 70
Sifat Patogen C. albicans.................................................... 70
Faktor Virulensi C. albicans ............................................... 71
A. Adherensi dan Ko-aggregasi ............................. 72
Adherensi ............................................................. 72
Ko-Aggregasi ....................................................... 73
B. Interferensi Sistem Imun ................................... 74

v
 1. Interferensi SIgA .......................................... 74
2. Interferensi Komplemen ............................ 74
3. Interferensi Fagositosis............................... 75
C. Phenotype Switching................................................. 76
D. Faktor Pendukung .............................................. 77
1. Resistensi Antibiotik ................................... 77
2. Faktor lainnya............................................... 77
Daftar Pustaka .................................................................... 78

GLOSSARY ....................................................................... 80
INDEX................................................................................ 87

vi
DAFTAR GAMBAR

Gambar 1. Jalur pembentukan fibrin .............................. 5

Gambar 2. Struktur Mikroskopis Netrofil ..................... 13

Gambar 3. Netrofil dan bahan herbal ........................... 15

Gambar 4. ATPSynthase sebagai reseptor angiostatin .. 27

Gambar 5.
A. Angiostatin menghambat produksi ATP
dengan menghambat influks proton H+
B. Caspase Mitokondria. ........................................... 28

Gambar 6. Pembentukan kompleks adhesi sel.............. 31

Gambar 7. Focal Adhesion Kinase dan apoptosis ............. 32

Gambar 8. Gen terapi menggunakan vektor virus ...... 44

Gambar 9. Aspek Molekuler Ameloblastoma ............... 64

vii
DAFTAR TABEL

Tabel 1. Faktor Koagulasi................................................. 4

Tabel 2. Persentase Normal Leukosit ............................. 10

Tabel 3. Netrofil dan Proses Penyembuhan Luka ........ 11

viii
 GLOSSARY

GLOSSARY
Aspartyl proteinase, jenis katalitik dari enzim protease yang
digunakan mengaktivasi ikatan molekul air untuk satu atau lebih
residu aspatat untuk mengkatalisis substrat peptidanya

Astrigen, zat yang membuat jaringan biologis berkontraksi atau

mengkerut.

Bakterisid, zat yang memiliki sifat mampu membunuh

mikroorganisme yang sedang tumbuh

Basic fibroblast growth factor, sejenis faktor pertumbuhan

C3a, Jenis komplemen, bersama C5a yang dilepaskan pada area

peradangan, lihat C5a dan komplemen

C3b, Jenis komplemen, bersama dengan zat aktivator seperti

dinding sel bakteri yang mengaktivasi komplemen pada jalur
alternatif berfungsi opsonin , lihat komplemen

C5a, kemokin yang dapat mengerahkan sel-sel fagosit baik

mononuclear maupun polimorfonuklear ke tempat terjadinya
infeksi (kemoatraktan untuk neutrofil).

Diapedesis, kemampuan leukosit untuk menembus atau keluar

dari dinding pembuluh darah kapiler melewati celah antara dua
endotel,

ECM, komponen paling besar pada kulit normal dan memiliki

dua jenis penyusun: glikosaminoglikans dalam bentuk
proteoglikan dan Fibrous proteins, yang meliputi kolagen,
elastin, fibronektin, dan laminin.

GLOSSARY
80
 GLOSSARY

Ekstravagasi, migrasi sel dari sirkulasi darah menuju ke

jaringan.

Ekspresi gen, rangkaian proses penerjemahan informasi

genetik

Elastin, protein pada kulit dan jaringan tubuh yang membantu

untuk menjaga kulit supaya fleksibel dan kencang

E-selektin, proten transmembran yang diekspresikan oleh sel

endotel y a n g mengikat ke oligosakarida dan diekspresikan
pada permukaan leukosit.

Fab, Fragment antigen binding adalah daerah/ region dari antibody

yang berikatan dengan antigen

Fagosom, atau vakuola, organel dari membran plasma yang

berfungsi menangkap dan memasukkan makanan.

Faktor hageman, faktor koagulasi dengan mengaktifkan faktor

XI.

Fc, Fragment Crystallizable, adalah daerah bawah dari satu

antibody yang berinteraksi dengan reseptor sel permukaan

Fenol, atau asam karbolat atau benzenol, zat kristal tak

berwarna strukturnya memiliki gugus hidroksil (-OH) yang
berikatan dengan cincin fenil.

Fibronectin, lihat ECM

Flavonoid, senyawa polifenol yang mempunyai 15 atom karbon

yang dikenal sebagai salah satu substansi antioksidan dan obat
anti inflamasi.

Gelatinase, enzim untuk mencerna gelatin.

GLOSSARY
81
 GLOSSARY

Granulasi, jaringan penghubung yang baru terbentuk berasal

dari permukaan luka dalam proses penyembuhan.

Homeostasis, keseimbangan

Hormon glukokortikoid, golongan hormon steroid yang

memberikan pengaruh terhadap metabolisme nutrisi.

Hsp, Heat Shock Protein, Protein yang dihasilkan karena

adanya heat stress response

Hyaluronic Acid ( HA ), suatu zat yang terdapat pada seluruh

jaringan tubuh manusia, yang berfungsi mengikat air.

IgE, immunoglobulin E, antibody yang berperan dalam alergi

IL-1, 5, 6, sejenis sitokin yang memainkan peran penting dalam

regulasi sistem kekebalan dan respon peradangan

Inducible nitric oxide synthase (iNOS), satu dari tiga enzim

utama yang memproduksi NO dari asam amino L-arginine.
Turunannya memainkan peranan penting dalam kesehatan fisik
seperti tekanan darah, peradangan, infeksi, dll.

Inter Celullar Adhesion Molecule (ICAM), reseptor sel

endotel

Interferon-γ (IFN-γ), protein yang diproduksi oleh sistem

kekebalan tubuh

Kemoatraktan, faktor kemotaktik

Keratinocyte Growth Factor, stimulasi mitosis sel epidermal.

GLOSSARY
82
 GLOSSARY

Kinin, salah satu polipeptida struktural terkait,seperti bradikinin

dan kallikrein. Anggota keluarga autacoid.

Kolagen, salah satu protein yang menyusun tubuh manusia.

Komplemen, protein serum darah ( sejumlah 9 protein)yang

bereksi berjenjang sebagai enzim membantu sistim imunologi
seluler dan humoral

Kortikostreroid, senyawa regulator sistem homeostasis tubuh

agar dapat bertahan menghadapi perubahan lingkungan dan
infeksi.

Kolagenase, enzim yang memecah ikatan peptida kolagen

Laktoferin, protein yang dapat mengikat dan mentransfer ion

Fe3+ dan terdapat dalam jumlah tinggi dalam susu dan
kolostrum.

Lamellopodia Struktur khusus pada sel yang bisa melakukan

lokomosi

Leukrotien B4, sebuah mediator pro-inflamasi mediator yang

disintesis dalam sel myeloid dari asam arachidonic.

Macrofag Activation Factor, Faktor pengaktivasi makrofag

Mannoprotein, komponen terbesar penyusun membran sel

fungi

Matrix Metalloproteinase (MMP), enzim penting yang

bertanggungjawab untuk degradasi matriks

Meiloperoksidase, enzim peroksidase jenis hemoprotein yang

banyak terdapat di dalam granulosit netrofil

GLOSSARY
83
 GLOSSARY

Myofibroblas, fibroblast pada luka yang mengalami perubahan

dengan mengekspresikan aktin, dan menyerupai otot polos.

Nikotinamida Adenin Dinukleotida Fosfat (NADPH),

koenzim berupa dinukleotida.

NC1 Kolagen VIII, C-terminal domain non-kolagen yang

membentuk trimer stabil dan merakit kolagen triple helix, serta
supramolekul poligonal struktur.

Osteoprotegerin (opg), sitokin yang dihasilkan oleh osteoblas

dan sel stromal bone marrow, berfungsi sebagai reseptor
penyeimbang dan berkompetisi dengan RANK, mencegah
berikatan dengan RANKL.

Plasminogen, merupakan bentuk proenzim dari plasmin. Plasmin adalah

suatu enzim proteolitik dengan spesifisitas yang tinggi terhadap fibrin
dan dapat memecah fibrin, fibrinogen,F V dan F VIII,
komplemen, hormon, serta protein lainnya. Plasmin disebut juga
fibrinolisin

Phospholipase, enzim yang menghidrolisis fosfolipid ke dalam

bentuk lemak dan substansi lipofilik lainnya

Prostaglandin, asam lemak yang terdiri atas 20 atom C dengan

satu cincin berantai lima, merupakan turunan asam arakidonat
berfugsi pada ketahanan alamiah tubuh

Pleomorfik, berubah ke dalam banyak bentuk

Protease, enzim yang menghidrolisis ikatan peptida pada

molekul protein yang menghasilkan peptida atau asam amino.

Proteoglycans lihat ECM

GLOSSARY
84
 GLOSSARY

Pseudopodia, kaki semu-alat gerak

Polymethylmethacrylate, salah satu polimer sintetik yang biasa

disebut dengan akrilik

RANK (Receptor Activator of Nfkb), reseptor permukaan

dan determinan permukaan sel hematopoietik intrinsik yang
dibutuhkan bagi diferensiasi dan aktivasi osteoklas.

RANKL (Receptor Activator of Nfkb Ligan), ligan untuk

RANK

Reactive Oxygen Species (ROS), jenis molekul dan radikal

yang berasal dari molekul oksigen (O2) yang digunakan dalam
pernapasan.

Saponin, senyawa aktif permukaan yang kuat dan menimbulkan

busa bila dikocok dengan air dan bekerja sebagai antimikroba.
Jenis: glikosida triterpenoid dan glikosida struktur steroid

sIgA, Secretory Immunoglobulin A, yang banyak terkandung di

dalam secret mukosa saliva, trakeobrankial, kolustrum? ASI, dan
urogenital

Sitokin, kelompok protein sebagai mediator dan pengatur

immunitas, inflamasi dan hematopoesis

Sitotoksisitas, kualitas menjadi racun bagi sel

Sel T, sel di dalam salah satu grup sel darah putih yang diketahui
sebagai limfosit dan memainkan peran utama pada kekebalan
selular.

Sterol, dikenal juga sebagai alkohol steroid yang banyak

terkandung di dalam tanaman, hewan dan jamur yang berfungsi
sebagai prekursor vitamin dan hormon steroid
GLOSSARY
85
 GLOSSARY

Strain, galur, koloni mikrobia atau hasil biakannya yang

memiliki sifat fisiologis yang sama sebagai hasil proses isolasi
atau rekayasa untuk memurnikan sifat tersebut

Tannin, antioksidan berjenis polifenol (yang mencegah atau

mentralisasi efek radiakl bebas yang merusak).

TNF-α, sitokin yang banyak disekresi oleh makrofaga dan

memiliki banyak peran metabolisme seperti proliferasi sel,
differensiasi, apoptosis, metabolisme lipid, dan koagulasi

TRAF6, TNF-reseptror-associated factor 6 sejenis faktor

pertumbuhan

Ulkus Dekubitus, nekrosis jaringan lokal yang terjadi ketika

jaringan lunak tertekan diantara tonjolan tulang dengan
permukaan eksternal dalam jangka waktu yang lama. Gangguan
ini sering terjadi pada individu yang berada diatas kursi, tempat
tidur, individu yang mengalami kesulitas makan sendiri, serta
mengalami gangguan pada tingkat kesadaran

VEGF (Vascular Endothelial Growth Factor), sinyal kimia

yang diproduksi oleh sel-sel yang merangsang pertumbuhan
pembuluh darah baru.

Venula, pembuluh darah tipis yang terus-menerus menerima

darah dari kapiler.

Zymogen, prekursor enzim

GLOSSARY
86
 INDEX

INDEX
Angiogenesis, 4, 8, 22, 23, 24, 25, 29

Antibodi, 41, 61, 63, 64

Antigen, 41, 54, 59, 61, 62, 63, 64, 74, 76

Antingiogenesis, 28, 29, 40

Apoptosis, 16, 18, 26, 28, 30, 31, 32, 38, 39, 43, 52, 53, 59

Endotel, 6, 11, 12, 13, 14, 15, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29,
30, 37, 38, 39, 61

Enzim, 9, 13, 16, 22, 23, 26, 27, 54, 58, 61, 64, 77

Fagositosis, 9, 10, 12, 14, 61, 72, 74, 75

Fibrinolisis, 3

Hifa, 69,70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77

Inflamasi, 2, 3, 6, 7, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 16, 17, 18

IL-1, 6, 17, 18

Immunoglobulin, 7, 74

Kanker, 22, 23, 24, 25, 26, 30, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 58

Koagulasi, 3, 4, 11

Kolagen, 5, 8, 9, 13, 18, 37, 38, 39, 60, 71

Luka, 2, 10, 11, 12

INDEX
87
 INDEX

Matriks, 6, 26, 27, 30, 31, 52, 60, 61, 71

Mitokondria, 26-27, 28, 53

Netrofil, 3, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12

Osteoporosis, 2, 16, 17

Penyembuhan, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 12,

Radiasi, 55,56,57,58

TNF-α, 6, 17-18, 42

Virulensi, 68, 71, 72, 75

INDEX
88
View publication stats