DI
OLEH
NIM : B191008
2021
Skrining dan Diagnosis COVID-19
Latar belakang
Virus corona adalah sekelompok virus RNA terkait yang menyebabkan penyakit pada mamalia dan
burung-burung. Di manusia dan burung, mereka menyebabkan infeksi saluran pernafasan yang dapat
berkisar dari ringan hingga mematikan. Ringan penyakit pada manusia termasuk beberapa kasus umum
dingin (yaitu juga disebabkan oleh virus lain, dominan rhinoviruses), sedangkan varietas yang lebih
mematikan dapat menyebabkan SARS, MERS, dan COVID-19. Di sapi dan babi menyebabkan diare,
sedangkan pada tikus menyebabkan hepatitis dan ensefalomielitis.
Struktur Coronavirus
Penularan SARS-Cov-2
Novel: Tidak ada kekebalan kawanan, Tidak ada antibodi yang bereaksi silang
Inkubasi 2-14 hari (outlier 27 hari)
Median onset gejala: Hari 5-6 dari paparan
Waktu penggandaan: 6-7 hari
Pelepasan virus yang tinggi terjadi di awal perjalanan penyakit, bahkan mereka yang memiliki
gejala ringan
Penumpahan berkepanjangan dicatat (tidak mungkin infeksi ulang)
? Hingga 23% dari transmisi karena kasus pra-gejala diShenzen
Kasus asimtotik sejati ternyata hanya 1% per WHO?
Viral load ternyata masih tinggi
Ternyata menular?
Tetesan pernapasan (besar - 3 kaki, sedang - 6 kaki)
Kontak tangan-ke-mukus-membran – menempel pada kulit dengan mudah!
T-zone: mata, hidung, mulut rentan
Dapat bertahan selama 3 hari pada padatan (plastik, porselen, baja); ~24 jam karton, tergantung
juga pada suhu/kelembaban; 3 jam jika aerosol
Airborne – kemungkinan tidak mengudara dengan batuk? Tetapi tentu saja mungkin dengan
intubasi, ventilasi tekanan positif non-invasif, O2 aliran tinggi, nebulizer, pengisapan
?Fekal/oral? – pelepasan virus hadir dalam tinja dan diare adalah umum
Tes molekuler digunakan untuk mendeteksi materi genetik virus yang ada dalam sampel
pernapasan. Tes ini dapat digunakan untuk mendeteksi antigen yang merupakan bagian dari
virus (paku, amplop, membran,dll)
RNA virus terdeteksi oleh NAAT (Uji Amplifikasi Asam Nukleat)/RT-PCR ( sayapengujian
molekuler)
Antigen virus COVID-19
Menggunakan pengurutan untuk mengidentifikasi dan memantau varian SARS-CoV-2 juga dapat
berperan di sejumlah bidang:
a) Mencirikan infeksi setelah riwayat infeksi atau vaksinasi. Menentukanjika varian tertentu atau
mutasi bertanggung jawab untuk kasus-kasus ini dapat menunjukkan bahwa virus telah
berevolusi untuk menghindari kekebalan.
b) Memantau varian baru untuk dampaknya terhadap terapi. Ini akan diperlukan karena bukti awal
menunjukkan bahwa beberapa terapi antibodi monoklonal tidak seefektif melawan yang baru
varian.
c) Memantau dampak terapi pada evolusi virus, untuk memahami apakah terapi mendorong
pemilihan VOC tertentu.
d) Memantau evolusi virus pada mereka yang pengalaman berkepanjangan infeksi, termasuk pada
mereka yang kelainan imun. Ini karena infeksi yang berkepanjangan di mana replikasi terus
berlanjut akan menyebabkan virus mengakumulasi lebih banyak mutasi, beberapa di antaranya
bisa menjadi keuntungan bertahan hidup.