Diterjemahkan dari bahasa Inggris ke bahasa Indonesia - www.onlinedoctranslator.

com

Identifikasi mikroorganisme (atau patogen) berbahaya yang cepat dan akurat sangat penting
untuk pengobatan penyakit mematikan yang efektif, seperti sepsis, dan pencegahan infeksi lebih
lanjut.1]. Namun, alat deteksi mikroba kontemporer dibatasi oleh kecepatan deteksi yang rendah,
yang biasanya berlangsung selama beberapa hari. Secara umum, metode deteksi berbasis kultur,
termasuk sistem reaksi berantai polimerase (PCR), telah banyak digunakan untuk mendeteksi
dan mengukur mikroorganisme.2-4]. Meskipun PCR mampu mendeteksi berbagai macam jamur
dan bakteri menular, metode ini umumnya memakan waktu dan tenaga. Dalam banyak kasus,
sangat penting untuk mengklasifikasikan jenis patogen sedini mungkin sebelum spesies individu
dibedakan. Oleh karena itu, sangat penting untuk mengembangkan alat diagnosis yang
dengannya kita dapat memanfaatkan sifat fisik yang melekat pada mikroorganisme tanpa
memerlukan prosedur perlakuan awal seperti pelabelan fluoresen dan budidaya sel.
Salah satu pendekatan yang kuat untuk identifikasi dan klasifikasi mikroorganisme adalah
pencitraan mikroskop optik dan elektron dari morfologi dan organel intraselulernya.5,6]. Di sisi
lain, amplifikasi gen dan sekuensing DNA dan RNA telah diadopsi sebagai alat penting untuk
mengklasifikasikan berbagai target bakteri dan jamur. Misalnya, pada akhir 1970-an, sistem tiga
domain diperkenalkan oleh Woese et al. membagi bentuk kehidupan seluler menjadi archaea,
bakteri, dan eukariota (termasuk jamur) berdasarkan analisis RNA ribosom.7,8]. Yang penting,
karena dinding sel unik sehubungan dengan berbagai jenis mikroorganisme, struktur dan
komposisinya dapat berfungsi sebagai target yang sangat baik untuk pengembangan alat
identifikasi selektif baru [9-11]. Misalnya, dalam kasus bakteri, metode pewarnaan Gram telah
diadopsi secara luas untuk membedakan dan mengklasifikasikan spesies bakteri menjadi dua
kelompok besar (Gram-positif dan Gram-negatif) berdasarkan sifat kimia dan fisik dinding
selnya.12,13]. Namun, pewarnaan Gram memerlukan proses pelabelan, dan perbedaan dalam hal
komposisi dinding sel sebagian besar belum dieksplorasi untuk jenis mikroorganisme lain,
seperti jamur dan ragi.
Baru-baru ini, metamaterial THz telah muncul sebagai alat yang sensitif dan real-time untuk
mendeteksi mikroorganisme yang hidup dan layak.14-16]. Karena penginderaan metamaterial
adalah penginderaan dielektrik, memperoleh informasi tentang konstanta dielektrik dari zat
target adalah langkah utama untuk aplikasi praktis dari sensor [17-23]. Deteksi bebas label telah
diperkenalkan menggunakan perangkat yang difungsikan, misalnya, dengan melapisi substrat
dengan antibodi spesifik untuk analit [24,25]. Namun, penggunaan antibodi mahal dan tidak
bertahan secara umum, sehingga membuat sensor dapat dibuang. Oleh karena itu, pendekatan
baru untuk membedakan jenis mikroba dalam hal sifat intrinsiknya, seperti konstanta dielektrik,
akan memberikan terobosan dalam pengembangan alat identifikasi awal.
Dalam karya ini, kami melakukan spektroskopi domain waktu THz pada mikroorganisme
representatif mulai dari jamur, ragi, dan bakteri, dan menemukan bahwa dimungkinkan untuk
mengklasifikasikan mereka dalam hal konstanta dielektriknya. Kami pertama-tama mengekstrak
konstanta dielektrik dari film mikroba, dari mana kami kemudian memperoleh indeks untuk
spesies individu menggunakan teori medium efektif. Konstanta dielektrik mereka konsisten
dengan hasil penelitian yang dilakukan di lingkungan berair yang mengeksploitasi sensor
metamaterial yang dimasukkan ke dalam saluran fluida. Akhirnya, kami mengungkapkan bahwa
perbedaan dalam struktur seluler, terutama dalam komposisi dinding sel, bertanggung jawab atas
konstanta dielektrik yang berbeda di antara berbagai jenis mikroorganisme.
Pergi ke:

2. Metode

2.1. Persiapan sampel mikroorganisme

Kami menyiapkan mikroorganisme representatif termasuk jamur, bakteri, dan ragi. Mereka
ditanam dengan metode goresan pada medium diikuti dengan inkubasi selama 2 hari, yang
awalnya diperoleh baik dari Korean Agricultural Culture Collection (KACC) atau Korean
Collection for Type Cultures (KCTC). Media kultur dan suhu inkubasi bervariasi dari sampel ke
sampel sebagai berikut: Penicillium chrysogenum (PC; KACC 45971; agar ekstrak malt; 25 °C),
Aspergillus niger (AN; KACC 40280; agar ekstrak malt; 25 °C), Monascus pilosus (MP; KCTC
42430; agar ekstrak malt; 25 °C), Rhizopus oryzae (RO; KCTC 6944; agar kentang dekstrosa; 24
°C), Mucor ambiguous (MA; KCTC 26787; agar ekstrak malt; 25 °C), dan Trichoderma viride
(TV; KACC 44532; agar ekstrak malt; 20 °C) untuk jamur; Escherichia coli (EC; KACC 11598;
agar nutrisi; 37 °C), Alcaligenes faecalis (AF; KCTC 2678; agar nutrisi; 37 °C), Pseudomonas
aeruginosa (PA; KCTC 1750; nutrisi agar; 37 °C), Lactobacillus casei (LC; KCTC 13086; MRS
agar; 37 °C), Bacillus subtilis (BS; KCTC 3725; ekstrak malt agar; 30 °C), dan Staphylococcus
aureus (SA; KCTC 1928; nutrisi agar; 37 °C) untuk bakteri; dan Saccharomyces cerevisiae (SC;
KCTC 27139; agar-agar ekstrak glukosa-pepton-ragi; 25 °C) dan Schizosaccharomyces pombe
(SP; KCTC 27259; agar-agar ekstrak glukosa-pepton-ragi; 25 °C) untuk ragi. Gambar
mikroskopis dan karakteristik umum seperti ukuran dan bentuk dapat ditemukan dalam referensi
yang disertakan dalam agar nutrisi; 37 °C) untuk bakteri; dan Saccharomyces cerevisiae (SC;
KCTC 27139; agar-agar ekstrak glukosa-pepton-ragi; 25 °C) dan Schizosaccharomyces pombe
(SP; KCTC 27259; agar-agar ekstrak glukosa-pepton-ragi; 25 °C) untuk ragi. Gambar
mikroskopis dan karakteristik umum seperti ukuran dan bentuk dapat ditemukan dalam referensi
yang disertakan dalam agar nutrisi; 37 °C) untuk bakteri; dan Saccharomyces cerevisiae (SC;
KCTC 27139; agar-agar ekstrak glukosa-pepton-ragi; 25 °C) dan Schizosaccharomyces pombe
(SP; KCTC 27259; agar-agar ekstrak glukosa-pepton-ragi; 25 °C) untuk ragi. Gambar
mikroskopis dan karakteristik umum seperti ukuran dan bentuk dapat ditemukan dalam referensi
yang disertakan dalamTabel 1. Untuk pengukuran konstanta dielektrik pada film mikroba, kami
menyiapkan film tebal dan padat dengan menumpuk sejumlah besar jamur dan bakteri lapis demi
lapis pada membran selulosa hingga mencapai ketebalan 200–600 m
Meskipun beberapa mikroorganisme patogen telah digunakan dalam studi luas genom untuk
menyelidiki respons ulat sutera terhadap infeksi, setiap studi individu hanya membahas satu
mikroorganisme. Dalam penelitian ini, kami mensurvei respons transkripsi seluruh genom ulat sutera
terhadap empat mikroorganisme berbeda, termasuk tiga jenis patogen alami (bakteri, virus, dan jamur),
dengan analisis microarray. Hasil kami memberikan perbandingan komprehensif profil transkripsi dari
interaksi inang-patogen masing-masing untuk infeksi dengan masing-masing dari empat
mikroorganisme, dan mengungkapkan bahwa respons inang sehubungan dengan perkembangan,
metabolisme basal, patogenesis, dan pertahanan kekebalan mungkin umum atau spesifik. terhadap
mikroorganisme yang berbeda.